Doublet Group distance statistics: 50745

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.018, 0.052, 0.086, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.052 std_dev=0.034
O4	A	0, 0.046, 0.154, 0.261, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.154 std_dev=0.108
O4'	A	0, 0.044, 0.164, 0.284, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.164 std_dev=0.120
C2'	A	0, 0.051, 0.212, 0.372, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.212 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.115, 0.312, 0.510, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.312 std_dev=0.198
C4'	A	0, 0.044, 0.254, 0.464, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.254 std_dev=0.210
C3'	A	0, 0.095, 0.310, 0.525, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.310 std_dev=0.215
N3	B	0, 0.207, 0.440, 0.673, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.440 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.197, 0.440, 0.684, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.440 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.248, 0.496, 0.744, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.496 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.243, 0.495, 0.748, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.495 std_dev=0.253
C6	B	0, 0.265, 0.541, 0.818, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.541 std_dev=0.277
N1	B	0, 0.267, 0.555, 0.842, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.555 std_dev=0.288
O5'	A	0, 0.170, 0.477, 0.783, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.477 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.134, 0.442, 0.749, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.442 std_dev=0.308
C5'	A	0, 0.140, 0.485, 0.830, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.485 std_dev=0.345
N9	B	0, 0.146, 0.508, 0.870, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.508 std_dev=0.362
N7	B	0, 0.218, 0.591, 0.965, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.591 std_dev=0.373
N6	B	0, 0.256, 0.656, 1.056, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.656 std_dev=0.400
C8	B	0, 0.180, 0.604, 1.028, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.604 std_dev=0.424
P	A	0, 0.222, 0.674, 1.126, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.674 std_dev=0.452
C1'	B	0, 0.115, 0.573, 1.031, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.573 std_dev=0.458
OP2	A	0, 0.207, 0.666, 1.125, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.666 std_dev=0.459
C2'	B	0, 0.152, 0.651, 1.149, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.651 std_dev=0.498
O2'	B	0, 0.160, 0.759, 1.358, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.759 std_dev=0.599
C3'	B	0, 0.205, 0.816, 1.427, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.816 std_dev=0.611
O4'	B	0, 0.178, 0.794, 1.409, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.794 std_dev=0.615
OP1	A	0, 0.366, 1.000, 1.633, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.000 std_dev=0.634
C4'	B	0, 0.185, 0.899, 1.612, 2.377 max_d=2.377 avg_d=0.899 std_dev=0.714
C5'	B	0, 0.148, 0.997, 1.846, 2.732 max_d=2.732 avg_d=0.997 std_dev=0.849
O3'	B	0, 0.173, 1.033, 1.894, 2.630 max_d=2.630 avg_d=1.033 std_dev=0.860
O5'	B	0, -0.275, 1.074, 2.424, 4.629 max_d=4.629 avg_d=1.074 std_dev=1.350
OP2	B	0, -0.471, 1.238, 2.946, 5.919 max_d=5.919 avg_d=1.238 std_dev=1.709
P	B	0, -0.750, 1.298, 3.347, 6.976 max_d=6.976 avg_d=1.298 std_dev=2.048
OP1	B	0, -0.960, 1.690, 4.340, 9.063 max_d=9.063 avg_d=1.690 std_dev=2.650

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.19	0.18	0.23	0.18
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.06	0.11	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.08	0.09	0.01	0.01	0.12	0.01	0.09	0.08	0.12	0.10
C4	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.03	0.25	0.28	0.35	0.27
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.01	0.03	0.25	0.28	0.33	0.27
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.12	0.05	0.04	0.01	0.17	0.01	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.02	0.22	0.21	0.23	0.21
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.18	0.17	0.19	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.22	0.23	0.30	0.23
O2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.02	0.17	0.17	0.21	0.15
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.12	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.09	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.02	0.14	0.01	0.12	0.04	0.08	0.12	0.04	0.00	0.15	0.01	0.18	0.15	0.18	0.17
O4	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.03	0.26	0.32	0.39	0.30
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.16	0.09	0.12
O5'	0.10	0.19	0.05	0.09	0.25	0.01	0.25	0.01	0.22	0.18	0.22	0.17	0.05	0.18	0.26	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.18	0.06	0.08	0.28	0.08	0.28	0.12	0.21	0.17	0.23	0.17	0.04	0.15	0.32	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.11	0.12	0.35	0.05	0.33	0.04	0.23	0.19	0.30	0.21	0.09	0.18	0.39	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.06	0.10	0.27	0.02	0.27	0.02	0.21	0.15	0.23	0.15	0.05	0.17	0.30	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.23	0.24	0.26	0.22	0.35	0.30	0.49	0.34	0.27	0.30	0.19	0.40	0.34	0.20	0.64	0.16	0.38	1.17	2.00	1.31	1.72
C2	0.19	0.28	0.16	0.26	0.22	0.27	0.23	0.36	0.28	0.23	0.31	0.24	0.29	0.21	0.20	0.48	0.15	0.30	1.04	1.99	1.12	1.54
C2'	0.21	0.23	0.32	0.35	0.21	0.48	0.32	0.64	0.38	0.26	0.33	0.17	0.48	0.37	0.19	0.56	0.25	0.47	1.35	2.30	1.48	1.95
C3'	0.19	0.12	0.35	0.37	0.14	0.50	0.27	0.64	0.30	0.27	0.22	0.08	0.40	0.38	0.14	0.60	0.30	0.49	1.32	1.96	1.37	1.82
C4	0.28	0.23	0.25	0.35	0.25	0.29	0.16	0.24	0.12	0.24	0.17	0.27	0.15	0.18	0.26	0.38	0.29	0.29	0.76	1.50	0.77	1.10
C4'	0.12	0.10	0.31	0.29	0.13	0.43	0.26	0.58	0.27	0.29	0.19	0.05	0.37	0.37	0.14	0.70	0.22	0.44	1.17	1.63	1.29	1.63
C5	0.33	0.18	0.27	0.41	0.24	0.36	0.16	0.31	0.11	0.28	0.15	0.24	0.10	0.19	0.30	0.54	0.36	0.36	0.73	1.32	0.73	1.03
C5'	0.14	0.09	0.29	0.30	0.10	0.43	0.21	0.56	0.19	0.32	0.11	0.09	0.27	0.35	0.16	0.71	0.28	0.44	0.96	1.10	0.98	1.23
C6	0.28	0.19	0.23	0.36	0.24	0.35	0.23	0.36	0.20	0.32	0.19	0.21	0.20	0.28	0.29	0.64	0.30	0.38	0.88	1.48	0.89	1.24
N1	0.20	0.23	0.19	0.28	0.23	0.31	0.27	0.39	0.28	0.27	0.26	0.22	0.30	0.28	0.23	0.59	0.19	0.34	1.04	1.84	1.11	1.51
N3	0.21	0.27	0.18	0.28	0.23	0.25	0.18	0.27	0.17	0.24	0.25	0.26	0.13	0.21	0.22	0.39	0.19	0.26	0.91	1.81	0.96	1.34
O2	0.17	0.33	0.17	0.24	0.21	0.29	0.23	0.42	0.34	0.22	0.38	0.25	0.40	0.20	0.18	0.46	0.12	0.31	1.13	2.20	1.26	1.69
O2'	0.24	0.29	0.35	0.39	0.24	0.56	0.36	0.75	0.45	0.27	0.40	0.21	0.58	0.38	0.21	0.55	0.30	0.52	1.44	2.50	1.73	2.14
O3'	0.29	0.15	0.41	0.51	0.16	0.66	0.29	0.82	0.34	0.26	0.26	0.13	0.47	0.39	0.18	0.52	0.47	0.61	1.47	2.10	1.64	2.08
O4	0.32	0.27	0.33	0.39	0.29	0.33	0.24	0.24	0.25	0.27	0.23	0.32	0.32	0.25	0.29	0.27	0.34	0.32	0.65	1.38	0.66	0.96
O4'	0.16	0.18	0.26	0.24	0.20	0.33	0.28	0.46	0.30	0.31	0.24	0.15	0.36	0.36	0.20	0.75	0.20	0.37	1.06	1.65	1.20	1.54
O5'	0.12	0.19	0.26	0.28	0.13	0.36	0.18	0.45	0.17	0.32	0.17	0.17	0.21	0.31	0.16	0.73	0.26	0.37	0.76	0.85	0.70	0.94
OP1	0.20	0.39	0.35	0.30	0.23	0.34	0.18	0.43	0.21	0.24	0.31	0.37	0.20	0.25	0.16	0.71	0.36	0.30	0.41	0.14	0.36	0.40
OP2	0.12	0.41	0.18	0.32	0.18	0.32	0.16	0.38	0.26	0.23	0.38	0.33	0.24	0.17	0.10	0.69	0.34	0.24	0.26	0.22	0.21	0.24
P	0.09	0.30	0.24	0.23	0.14	0.29	0.14	0.38	0.17	0.28	0.25	0.26	0.17	0.25	0.12	0.74	0.26	0.27	0.45	0.34	0.41	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.23	0.00	0.33	0.88	0.25	0.45
C2	0.03	0.00	0.22	0.10	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.30	0.14	0.43	1.19	0.32	0.61
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.10	0.03	0.05	0.18	0.08	0.16	0.16	0.22	0.07	0.12	0.03	0.00	0.03	0.03	0.42	0.53	0.33	0.40
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.10	0.08	0.09	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.25	0.08	0.08
C4	0.02	0.00	0.10	0.05	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.23	0.07	0.51	1.29	0.39	0.71
C4'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.11	0.06	0.09	0.05	0.10	0.03	0.11	0.05	0.01	0.01	0.36	0.07	0.11
C5	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.20	0.04	0.64	1.57	0.53	0.93
C5'	0.05	0.10	0.18	0.02	0.11	0.00	0.16	0.00	0.15	0.22	0.11	0.09	0.18	0.23	0.12	0.07	0.15	0.02	0.01	0.20	0.10	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.21	0.06	0.63	1.59	0.54	0.93
C8	0.01	0.01	0.16	0.10	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.27	0.16	0.10	0.70	1.62	0.59	1.00
N1	0.03	0.00	0.16	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.26	0.10	0.53	1.41	0.43	0.78
N3	0.03	0.00	0.22	0.09	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.30	0.14	0.39	1.08	0.28	0.54
N6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.23	0.19	0.04	0.70	1.75	0.63	1.05
N7	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.27	0.16	0.07	0.74	1.76	0.65	1.09
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.19	0.02	0.52	1.27	0.40	0.72
O2'	0.01	0.32	0.00	0.02	0.16	0.11	0.19	0.07	0.21	0.27	0.25	0.32	0.23	0.27	0.12	0.00	0.10	0.06	0.40	0.47	0.32	0.40
O3'	0.23	0.30	0.03	0.01	0.23	0.05	0.20	0.15	0.21	0.16	0.26	0.30	0.19	0.16	0.19	0.10	0.00	0.17	0.13	0.30	0.10	0.19
O4'	0.00	0.14	0.03	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.10	0.14	0.04	0.07	0.02	0.06	0.17	0.00	0.29	0.90	0.30	0.45
O5'	0.33	0.43	0.42	0.08	0.51	0.01	0.64	0.01	0.63	0.70	0.53	0.39	0.70	0.74	0.52	0.40	0.13	0.29	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.88	1.19	0.53	0.25	1.29	0.36	1.57	0.20	1.59	1.62	1.41	1.08	1.75	1.76	1.27	0.47	0.30	0.90	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.32	0.33	0.08	0.39	0.07	0.53	0.10	0.54	0.59	0.43	0.28	0.63	0.65	0.40	0.32	0.10	0.30	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.45	0.61	0.40	0.08	0.71	0.11	0.93	0.01	0.93	1.00	0.78	0.54	1.05	1.09	0.72	0.40	0.19	0.45	0.00	0.01	0.01	0.00