Doublet Group distance statistics: 50746

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.002, 0.017, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.002, 0.024, 0.047, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.014, 0.039, 0.065, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.001, 0.080, 0.160, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.080 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.053, 0.250, 0.447, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.250 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.068, 0.315, 0.562, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.315 std_dev=0.247
N6	B	0, 0.064, 0.313, 0.562, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.313 std_dev=0.249
C2'	A	0, 0.057, 0.316, 0.575, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.316 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.066, 0.362, 0.657, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.362 std_dev=0.296
C3'	A	0, 0.062, 0.404, 0.746, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.404 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.043, 0.391, 0.739, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.391 std_dev=0.348
O5'	A	0, 0.067, 0.448, 0.830, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.448 std_dev=0.382
O2'	A	0, 0.089, 0.481, 0.872, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.481 std_dev=0.392
N7	B	0, 0.051, 0.455, 0.859, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.455 std_dev=0.404
N1	B	0, 0.048, 0.488, 0.928, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.488 std_dev=0.440
O3'	A	0, 0.036, 0.477, 0.919, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.477 std_dev=0.442
C5'	A	0, 0.108, 0.580, 1.052, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.580 std_dev=0.472
C8	B	0, 0.031, 0.513, 0.996, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.513 std_dev=0.483
C4	B	0, -0.012, 0.476, 0.964, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.476 std_dev=0.488
P	A	0, 0.088, 0.604, 1.120, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.604 std_dev=0.516
N9	B	0, 0.004, 0.530, 1.055, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.530 std_dev=0.526
OP1	A	0, 0.084, 0.637, 1.190, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.637 std_dev=0.553
OP2	A	0, 0.131, 0.689, 1.246, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.689 std_dev=0.557
C2	B	0, -0.013, 0.597, 1.208, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.597 std_dev=0.611
N3	B	0, -0.055, 0.584, 1.224, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.584 std_dev=0.639
C1'	B	0, 0.030, 0.689, 1.349, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.689 std_dev=0.659
C2'	B	0, 0.064, 0.745, 1.426, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.745 std_dev=0.681
C4'	B	0, 0.084, 0.769, 1.455, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.769 std_dev=0.686
O4'	B	0, 0.032, 0.724, 1.415, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.724 std_dev=0.691
O2'	B	0, 0.157, 0.884, 1.611, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.884 std_dev=0.727
C3'	B	0, 0.102, 0.859, 1.616, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.859 std_dev=0.757
C5'	B	0, 0.086, 0.850, 1.614, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.850 std_dev=0.764
O5'	B	0, 0.040, 0.949, 1.858, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.949 std_dev=0.909
O3'	B	0, 0.237, 1.154, 2.071, 1.974 max_d=1.974 avg_d=1.154 std_dev=0.917
P	B	0, 0.078, 1.275, 2.472, 2.698 max_d=2.698 avg_d=1.275 std_dev=1.197
OP1	B	0, 0.102, 1.362, 2.622, 2.847 max_d=2.847 avg_d=1.362 std_dev=1.260
OP2	B	0, 0.089, 1.419, 2.749, 3.002 max_d=3.002 avg_d=1.419 std_dev=1.330

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.08	0.22	0.13	0.13
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.13	0.01	0.04	0.07	0.27	0.19	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.12	0.02	0.14	0.04	0.03	0.11	0.00	0.02	0.04	0.00	0.06	0.24	0.07	0.12
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.14	0.02	0.14	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.15	0.11	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.27	0.22	0.14
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.12	0.14	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.02	0.28	0.22	0.14
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.10	0.00	0.12	0.00	0.09	0.04	0.07	0.03	0.01	0.04	0.12	0.00	0.00	0.10	0.02	0.03
C6	0.03	0.01	0.14	0.14	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.04	0.02	0.29	0.21	0.15
N1	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.07	0.28	0.19	0.16
N3	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.05	0.27	0.20	0.15
O2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.22	0.02	0.05	0.09	0.25	0.17	0.15
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.09	0.21	0.00	0.02	0.04	0.00	0.07	0.27	0.07	0.13
O3'	0.07	0.13	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.05	0.11	0.22	0.02	0.00	0.04	0.07	0.13	0.14	0.17	0.13
O4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.07	0.02	0.25	0.22	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.00	0.07	0.07	0.00	0.10	0.11	0.13	0.10
O5'	0.08	0.07	0.06	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.09	0.07	0.13	0.02	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.22	0.27	0.24	0.15	0.27	0.06	0.28	0.10	0.29	0.28	0.27	0.25	0.27	0.14	0.25	0.11	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.19	0.07	0.11	0.22	0.02	0.22	0.02	0.21	0.19	0.20	0.17	0.07	0.17	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.12	0.11	0.14	0.02	0.14	0.03	0.15	0.16	0.15	0.15	0.13	0.13	0.13	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.09	0.07	0.10	0.04	0.16	0.08	0.20	0.11	0.05	0.11	0.05	0.14	0.07	0.03	0.12	0.40	0.32	0.19	0.31	0.24	0.05
C2	0.16	0.09	0.13	0.16	0.03	0.20	0.03	0.28	0.09	0.15	0.11	0.04	0.12	0.06	0.11	0.04	0.39	0.32	0.27	0.30	0.21	0.04
C2'	0.08	0.07	0.06	0.07	0.05	0.11	0.10	0.13	0.11	0.06	0.10	0.04	0.14	0.10	0.02	0.14	0.42	0.28	0.12	0.31	0.23	0.03
C3'	0.01	0.12	0.04	0.04	0.10	0.04	0.12	0.05	0.14	0.08	0.14	0.10	0.15	0.12	0.06	0.16	0.47	0.20	0.05	0.37	0.18	0.08
C4	0.01	0.24	0.01	0.05	0.13	0.09	0.13	0.22	0.20	0.06	0.25	0.19	0.18	0.06	0.04	0.08	0.26	0.13	0.18	0.41	0.04	0.11
C4'	0.04	0.15	0.03	0.09	0.10	0.12	0.12	0.12	0.14	0.05	0.16	0.12	0.16	0.09	0.05	0.10	0.43	0.25	0.12	0.36	0.24	0.11
C5	0.15	0.31	0.12	0.09	0.24	0.07	0.22	0.14	0.25	0.10	0.29	0.28	0.21	0.13	0.17	0.20	0.27	0.06	0.08	0.48	0.02	0.18
C5'	0.04	0.18	0.05	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.16	0.07	0.18	0.16	0.17	0.10	0.08	0.07	0.36	0.21	0.13	0.38	0.25	0.14
C6	0.12	0.23	0.10	0.06	0.19	0.05	0.19	0.14	0.21	0.12	0.23	0.21	0.20	0.14	0.15	0.21	0.31	0.12	0.10	0.43	0.09	0.11
N1	0.07	0.13	0.05	0.09	0.07	0.15	0.10	0.23	0.14	0.02	0.15	0.09	0.16	0.05	0.01	0.09	0.36	0.28	0.20	0.33	0.20	0.02
N3	0.12	0.13	0.10	0.13	0.04	0.16	0.05	0.27	0.12	0.16	0.16	0.07	0.13	0.10	0.10	0.03	0.34	0.25	0.26	0.33	0.14	0.01
O2	0.24	0.03	0.19	0.22	0.09	0.24	0.04	0.30	0.04	0.22	0.06	0.05	0.09	0.12	0.18	0.11	0.46	0.38	0.31	0.25	0.27	0.10
O2'	0.17	0.08	0.14	0.10	0.09	0.13	0.09	0.15	0.09	0.10	0.08	0.09	0.11	0.10	0.12	0.21	0.40	0.31	0.16	0.27	0.26	0.09
O3'	0.04	0.07	0.10	0.08	0.06	0.04	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.05	0.10	0.08	0.05	0.23	0.52	0.18	0.05	0.38	0.14	0.08
O4	0.01	0.25	0.03	0.07	0.10	0.09	0.10	0.23	0.17	0.11	0.25	0.18	0.15	0.11	0.03	0.04	0.21	0.10	0.19	0.41	0.02	0.12
O4'	0.06	0.17	0.05	0.12	0.11	0.16	0.12	0.19	0.16	0.02	0.18	0.14	0.17	0.07	0.05	0.08	0.42	0.29	0.19	0.36	0.26	0.12
O5'	0.05	0.16	0.02	0.03	0.11	0.07	0.10	0.11	0.12	0.06	0.15	0.14	0.11	0.07	0.07	0.13	0.27	0.18	0.11	0.34	0.23	0.12
OP1	0.22	0.07	0.22	0.22	0.15	0.22	0.18	0.18	0.15	0.24	0.10	0.09	0.17	0.23	0.21	0.25	0.06	0.28	0.11	0.34	0.11	0.07
OP2	0.07	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.14	0.23	0.11	0.09	0.31	0.15	0.10
P	0.07	0.08	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.01	0.05	0.04	0.13	0.14	0.12	0.06	0.32	0.18	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.00	0.06	0.28	0.12	0.06
C2	0.02	0.00	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.13	0.32	0.11	0.12	0.10
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.03	0.07	0.07	0.08	0.11	0.15	0.05	0.05	0.01	0.00	0.11	0.04	0.13	0.06	0.27	0.16
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.07	0.06	0.12	0.14	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.07	0.30	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.07	0.23	0.19	0.13	0.06
C4'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.21	0.18	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.19	0.02	0.25	0.16	0.13	0.07
C5'	0.03	0.24	0.07	0.02	0.18	0.00	0.19	0.00	0.23	0.11	0.25	0.21	0.24	0.15	0.11	0.05	0.12	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.06	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.29	0.11	0.13	0.08
C8	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.36	0.06	0.15	0.23	0.13	0.05
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.09	0.32	0.09	0.13	0.10
N3	0.01	0.00	0.15	0.14	0.00	0.06	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.15	0.28	0.17	0.13	0.07
N6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.02	0.30	0.09	0.14	0.09
N7	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.31	0.04	0.20	0.19	0.14	0.06
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.25	0.01	0.15	0.24	0.13	0.05
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.05	0.08	0.16	0.13	0.16	0.08	0.13	0.04	0.00	0.19	0.02	0.14	0.07	0.32	0.22
O3'	0.27	0.14	0.11	0.00	0.14	0.06	0.19	0.12	0.14	0.36	0.11	0.12	0.17	0.31	0.25	0.19	0.00	0.18	0.29	0.27	0.56	0.40
O4'	0.00	0.13	0.04	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.09	0.15	0.02	0.04	0.01	0.02	0.18	0.00	0.12	0.48	0.07	0.23
O5'	0.06	0.32	0.13	0.08	0.23	0.01	0.25	0.01	0.29	0.15	0.32	0.28	0.30	0.20	0.15	0.14	0.29	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.11	0.06	0.07	0.19	0.21	0.16	0.13	0.11	0.23	0.09	0.17	0.09	0.19	0.24	0.07	0.27	0.48	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.12	0.12	0.27	0.30	0.13	0.18	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.32	0.56	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.16	0.16	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.10	0.07	0.09	0.06	0.05	0.22	0.40	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00