Doublet Group distance statistics: 50748

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.019
C1'	A	0, -0.002, 0.029, 0.059, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.029 std_dev=0.030
C2	A	0, -0.001, 0.030, 0.061, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O4	A	0, 0.003, 0.037, 0.070, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.037 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.008, 0.068, 0.128, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.068 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.005, 0.074, 0.143, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.074 std_dev=0.069
O2	A	0, -0.009, 0.073, 0.155, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.073 std_dev=0.082
C3'	A	0, -0.019, 0.181, 0.382, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.181 std_dev=0.201
O2'	A	0, 0.031, 0.270, 0.509, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.270 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.018, 0.259, 0.499, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.259 std_dev=0.241
O3'	A	0, -0.035, 0.221, 0.478, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.221 std_dev=0.256
N3	B	0, 0.033, 0.305, 0.576, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.305 std_dev=0.272
C4'	A	0, -0.016, 0.281, 0.579, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.281 std_dev=0.298
C5	B	0, 0.009, 0.323, 0.637, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.323 std_dev=0.314
C2	B	0, 0.020, 0.345, 0.671, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.345 std_dev=0.325
O3'	B	0, 0.050, 0.411, 0.772, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.411 std_dev=0.361
N1	B	0, -0.029, 0.382, 0.794, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.382 std_dev=0.411
C6	B	0, -0.036, 0.380, 0.796, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.380 std_dev=0.416
N9	B	0, 0.019, 0.438, 0.858, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.438 std_dev=0.420
C3'	B	0, -0.001, 0.509, 1.020, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.509 std_dev=0.511
N7	B	0, -0.065, 0.462, 0.988, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.462 std_dev=0.526
C8	B	0, -0.041, 0.503, 1.048, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.503 std_dev=0.544
C5'	A	0, -0.045, 0.508, 1.062, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.508 std_dev=0.553
O5'	B	0, -0.067, 0.503, 1.073, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.503 std_dev=0.570
C5'	B	0, -0.040, 0.553, 1.145, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.553 std_dev=0.593
C4'	B	0, -0.080, 0.523, 1.125, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.523 std_dev=0.602
C1'	B	0, -0.017, 0.595, 1.206, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.595 std_dev=0.611
O5'	A	0, -0.052, 0.571, 1.193, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.571 std_dev=0.622
N6	B	0, -0.136, 0.551, 1.237, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.551 std_dev=0.687
O4'	B	0, -0.115, 0.636, 1.387, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.636 std_dev=0.751
C2'	B	0, -0.083, 0.750, 1.583, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.750 std_dev=0.833
P	A	0, -0.067, 0.832, 1.730, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.832 std_dev=0.899
P	B	0, -0.100, 0.808, 1.716, 2.285 max_d=2.285 avg_d=0.808 std_dev=0.908
OP2	A	0, -0.083, 0.941, 1.965, 2.500 max_d=2.500 avg_d=0.941 std_dev=1.024
OP1	B	0, -0.126, 0.927, 1.979, 2.639 max_d=2.639 avg_d=0.927 std_dev=1.052
O2'	B	0, -0.059, 1.058, 2.176, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.058 std_dev=1.118
OP1	A	0, -0.096, 1.066, 2.227, 2.869 max_d=2.869 avg_d=1.066 std_dev=1.162
OP2	B	0, -0.162, 1.128, 2.419, 3.222 max_d=3.222 avg_d=1.128 std_dev=1.290

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.10	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.04	0.10	0.05
C2	0.05	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.02	0.16	0.02	0.02	0.00	0.00	0.13	0.08	0.02	0.04	0.26	0.28	0.41	0.29
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.05	0.06	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.12	0.10	0.01	0.02	0.15	0.04	0.02	0.05	0.04	0.03
C4	0.03	0.01	0.06	0.14	0.00	0.15	0.01	0.33	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.02	0.43	0.54	0.67	0.53
C4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.15	0.00	0.18	0.01	0.17	0.08	0.10	0.09	0.02	0.01	0.17	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
C5	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.18	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.02	0.03	0.44	0.52	0.62	0.52
C5'	0.03	0.16	0.01	0.01	0.33	0.01	0.37	0.00	0.31	0.17	0.24	0.10	0.00	0.04	0.36	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.00	0.02	0.03	0.11	0.01	0.17	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.03	0.35	0.36	0.40	0.36
N1	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.07	0.03	0.02	0.23	0.23	0.31	0.24
N3	0.04	0.00	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02	0.03	0.36	0.42	0.56	0.42
O2	0.10	0.00	0.11	0.10	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.19	0.10	0.01	0.10	0.20	0.20	0.35	0.22
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.09	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.13	0.19	0.00	0.01	0.10	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03
O3'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.14	0.01	0.14	0.04	0.11	0.07	0.11	0.10	0.01	0.00	0.15	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01
O4	0.04	0.02	0.07	0.15	0.01	0.17	0.02	0.36	0.02	0.03	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.04	0.47	0.62	0.76	0.60
O4'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.10	0.06	0.02	0.04	0.00	0.06	0.08	0.05	0.08
O5'	0.06	0.26	0.04	0.02	0.43	0.00	0.44	0.01	0.35	0.23	0.36	0.20	0.03	0.01	0.47	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.28	0.05	0.05	0.54	0.02	0.52	0.05	0.36	0.23	0.42	0.20	0.03	0.04	0.62	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.41	0.06	0.04	0.67	0.01	0.62	0.02	0.40	0.31	0.56	0.35	0.05	0.04	0.76	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.29	0.04	0.03	0.53	0.01	0.52	0.01	0.36	0.24	0.42	0.22	0.03	0.01	0.60	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.29	0.34	0.11	0.10	0.17	0.14	0.21	0.06	0.34	0.29	0.15	0.01	0.34	0.22	0.72	0.30	0.22	0.33	0.66	0.92	0.62
C2	0.10	0.22	0.19	0.06	0.06	0.07	0.11	0.15	0.03	0.20	0.17	0.14	0.12	0.22	0.12	0.59	0.28	0.12	0.39	0.68	0.92	0.62
C2'	0.19	0.30	0.32	0.09	0.10	0.17	0.20	0.23	0.06	0.39	0.29	0.15	0.15	0.42	0.23	0.64	0.29	0.20	0.31	0.58	0.83	0.56
C3'	0.46	0.12	0.62	0.35	0.29	0.41	0.36	0.35	0.12	0.64	0.17	0.08	0.13	0.63	0.47	0.91	0.48	0.48	0.09	0.38	0.64	0.36
C4	0.18	0.19	0.23	0.07	0.14	0.11	0.09	0.13	0.13	0.10	0.19	0.17	0.14	0.06	0.15	0.73	0.29	0.17	0.45	0.77	1.01	0.69
C4'	0.54	0.12	0.72	0.44	0.31	0.51	0.35	0.44	0.07	0.68	0.19	0.10	0.04	0.63	0.52	1.05	0.55	0.57	0.05	0.34	0.61	0.32
C5	0.32	0.22	0.43	0.15	0.18	0.23	0.13	0.21	0.23	0.23	0.28	0.18	0.31	0.12	0.26	0.91	0.33	0.29	0.41	0.78	1.06	0.72
C5'	0.83	0.06	1.05	0.74	0.51	0.80	0.49	0.71	0.16	0.91	0.07	0.31	0.03	0.80	0.76	1.37	0.79	0.88	0.28	0.14	0.43	0.12
C6	0.30	0.24	0.44	0.16	0.15	0.24	0.11	0.23	0.20	0.31	0.31	0.15	0.27	0.22	0.26	0.88	0.33	0.29	0.37	0.74	1.02	0.69
N1	0.21	0.25	0.32	0.10	0.10	0.16	0.11	0.19	0.08	0.29	0.27	0.13	0.05	0.27	0.20	0.73	0.31	0.21	0.37	0.70	0.96	0.64
N3	0.08	0.18	0.14	0.08	0.08	0.04	0.06	0.13	0.03	0.11	0.13	0.14	0.05	0.11	0.09	0.57	0.28	0.10	0.43	0.71	0.94	0.64
O2	0.03	0.21	0.14	0.09	0.02	0.02	0.14	0.15	0.11	0.20	0.10	0.15	0.26	0.25	0.08	0.48	0.27	0.06	0.39	0.64	0.87	0.58
O2'	0.11	0.41	0.22	0.03	0.08	0.11	0.17	0.23	0.07	0.36	0.34	0.26	0.21	0.41	0.16	0.50	0.23	0.13	0.32	0.56	0.78	0.54
O3'	0.49	0.11	0.65	0.39	0.32	0.46	0.42	0.41	0.18	0.72	0.14	0.09	0.24	0.72	0.52	0.89	0.51	0.53	0.17	0.28	0.49	0.27
O4	0.15	0.19	0.13	0.07	0.15	0.05	0.14	0.12	0.14	0.10	0.15	0.20	0.15	0.13	0.14	0.67	0.27	0.14	0.50	0.81	1.02	0.72
O4'	0.32	0.25	0.49	0.21	0.13	0.28	0.15	0.26	0.10	0.42	0.30	0.11	0.12	0.36	0.30	0.88	0.35	0.33	0.27	0.65	0.91	0.60
O5'	0.97	0.22	1.18	0.84	0.64	0.90	0.57	0.78	0.21	1.00	0.08	0.47	0.08	0.85	0.88	1.51	0.87	1.00	0.32	0.15	0.47	0.12
OP1	1.44	0.47	1.67	1.35	0.96	1.46	0.83	1.38	0.40	1.41	0.26	0.78	0.13	1.15	1.29	1.91	1.29	1.55	0.95	0.46	0.16	0.48
OP2	1.38	0.53	1.66	1.26	0.91	1.29	0.69	1.12	0.30	1.23	0.28	0.81	0.20	0.89	1.21	1.97	1.21	1.40	0.57	0.05	0.44	0.08
P	1.25	0.38	1.50	1.15	0.81	1.22	0.67	1.10	0.27	1.20	0.18	0.67	0.11	0.94	1.11	1.81	1.11	1.31	0.60	0.09	0.27	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.00	0.13	0.17	0.23	0.14
C2	0.01	0.00	0.10	0.05	0.02	0.06	0.03	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.35	0.39	0.13	0.31	0.37	0.61	0.36
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.11	0.06	0.07	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.06	0.02	0.18	0.27	0.29	0.21
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.12	0.01	0.21	0.03	0.18	0.34	0.09	0.06	0.24	0.33	0.17	0.02	0.01	0.01	0.34	0.39	0.43	0.36
C4	0.00	0.02	0.06	0.12	0.00	0.04	0.01	0.20	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.28	0.17	0.07	0.36	0.47	0.64	0.45
C4'	0.03	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.10	0.19	0.06	0.06	0.14	0.19	0.08	0.22	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.00	0.03	0.04	0.21	0.01	0.11	0.00	0.31	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.31	0.03	0.06	0.53	0.73	0.92	0.69
C5'	0.05	0.17	0.11	0.03	0.20	0.01	0.31	0.00	0.33	0.34	0.26	0.13	0.39	0.39	0.20	0.13	0.19	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.10	0.01	0.33	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.35	0.08	0.09	0.53	0.74	0.97	0.71
C8	0.01	0.03	0.07	0.34	0.02	0.19	0.01	0.34	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.23	0.26	0.04	0.62	0.80	0.89	0.76
N1	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.06	0.03	0.26	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.37	0.26	0.12	0.42	0.56	0.81	0.54
N3	0.01	0.01	0.10	0.06	0.01	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.31	0.40	0.12	0.24	0.28	0.49	0.27
N6	0.01	0.01	0.05	0.24	0.01	0.14	0.01	0.39	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.37	0.03	0.08	0.62	0.90	1.15	0.86
N7	0.01	0.04	0.05	0.33	0.02	0.19	0.01	0.39	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.29	0.22	0.00	0.67	0.93	1.10	0.89
N9	0.00	0.02	0.02	0.17	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.18	0.07	0.01	0.37	0.48	0.58	0.44
O2'	0.02	0.35	0.00	0.02	0.28	0.22	0.31	0.13	0.35	0.23	0.37	0.31	0.37	0.29	0.18	0.00	0.14	0.18	0.26	0.33	0.31	0.27
O3'	0.22	0.39	0.06	0.01	0.17	0.04	0.03	0.19	0.08	0.26	0.26	0.40	0.03	0.22	0.07	0.14	0.00	0.14	0.40	0.64	0.53	0.49
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.09	0.04	0.12	0.12	0.08	0.00	0.01	0.18	0.14	0.00	0.08	0.08	0.06	0.09
O5'	0.13	0.31	0.18	0.34	0.36	0.01	0.53	0.01	0.53	0.62	0.42	0.24	0.62	0.67	0.37	0.26	0.40	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.37	0.27	0.39	0.47	0.03	0.73	0.13	0.74	0.80	0.56	0.28	0.90	0.93	0.48	0.33	0.64	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.61	0.29	0.43	0.64	0.02	0.92	0.07	0.97	0.89	0.81	0.49	1.15	1.10	0.58	0.31	0.53	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.14	0.36	0.21	0.36	0.45	0.02	0.69	0.02	0.71	0.76	0.54	0.27	0.86	0.89	0.44	0.27	0.49	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00