Doublet Group distance statistics: 50750

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.030, 0.052, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.013, 0.038, 0.064, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.009, 0.036, 0.062, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.008, 0.035, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.035 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.040 std_dev=0.028
N1	A	0, 0.014, 0.050, 0.085, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.009, 0.063, 0.116, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.063 std_dev=0.053
O4	A	0, 0.042, 0.113, 0.184, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.113 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.027, 0.111, 0.194, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.111 std_dev=0.083
C2'	A	0, -0.009, 0.171, 0.351, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.171 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.092, 0.323, 0.553, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.323 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.077, 0.353, 0.629, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.353 std_dev=0.276
O2'	A	0, 0.065, 0.355, 0.645, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.355 std_dev=0.290
C5'	A	0, 0.147, 0.512, 0.877, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.512 std_dev=0.365
N6	B	0, -0.027, 0.403, 0.833, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.403 std_dev=0.430
O3'	A	0, 0.127, 0.559, 0.991, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.559 std_dev=0.432
C6	B	0, -0.009, 0.424, 0.858, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.424 std_dev=0.433
O5'	A	0, 0.188, 0.627, 1.065, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.627 std_dev=0.438
C5	B	0, 0.078, 0.521, 0.965, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.521 std_dev=0.444
N7	B	0, 0.144, 0.599, 1.054, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.599 std_dev=0.455
N1	B	0, -0.027, 0.429, 0.885, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.429 std_dev=0.456
C2	B	0, 0.055, 0.534, 1.013, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.534 std_dev=0.479
C4	B	0, 0.091, 0.581, 1.071, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.581 std_dev=0.490
N3	B	0, 0.094, 0.600, 1.105, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.600 std_dev=0.506
C8	B	0, 0.147, 0.667, 1.186, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.667 std_dev=0.519
N9	B	0, 0.119, 0.662, 1.205, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.662 std_dev=0.543
C2'	B	0, 0.193, 0.767, 1.340, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.767 std_dev=0.574
P	A	0, 0.163, 0.744, 1.325, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.744 std_dev=0.581
C3'	B	0, 0.186, 0.786, 1.386, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.786 std_dev=0.600
OP2	A	0, 0.166, 0.773, 1.380, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.773 std_dev=0.607
O3'	B	0, 0.219, 0.836, 1.454, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.836 std_dev=0.617
C1'	B	0, 0.093, 0.737, 1.380, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.737 std_dev=0.644
OP1	A	0, 0.120, 0.781, 1.441, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.781 std_dev=0.661
O2'	B	0, 0.194, 0.869, 1.544, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.869 std_dev=0.675
O4'	B	0, 0.057, 0.812, 1.567, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.812 std_dev=0.755
C4'	B	0, 0.089, 0.890, 1.691, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.890 std_dev=0.801
O5'	B	0, 0.056, 0.869, 1.682, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.869 std_dev=0.813
C5'	B	0, 0.131, 1.062, 1.994, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.062 std_dev=0.931
P	B	0, 0.030, 0.994, 1.957, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.994 std_dev=0.964
OP1	B	0, 0.093, 1.059, 2.026, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.059 std_dev=0.966
OP2	B	0, -0.223, 1.456, 3.135, 4.267 max_d=4.267 avg_d=1.456 std_dev=1.679

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.07	0.06	0.04
C2	0.02	0.00	0.08	0.13	0.03	0.08	0.02	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.02	0.09	0.08	0.12	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.07	0.03
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.02	0.06	0.06	0.13	0.19	0.00	0.01	0.13	0.01	0.08	0.03	0.10	0.07
C4	0.02	0.03	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.13	0.00	0.03	0.14	0.18	0.26	0.20
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.10	0.14	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03
C5	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.02	0.03	0.03	0.09	0.08	0.01	0.03	0.08	0.11	0.21	0.14
C5'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.13	0.01	0.08	0.00	0.04	0.05	0.15	0.16	0.04	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.03	0.08	0.07	0.01	0.02	0.04	0.05	0.15	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.10	0.03	0.15	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.16	0.02	0.02	0.15	0.18	0.22	0.19
O2	0.06	0.01	0.14	0.19	0.03	0.14	0.03	0.16	0.03	0.03	0.02	0.00	0.12	0.20	0.03	0.05	0.13	0.08	0.05	0.07
O2'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.04	0.09	0.04	0.08	0.03	0.05	0.12	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.13	0.01	0.08	0.02	0.07	0.06	0.16	0.20	0.02	0.00	0.16	0.02	0.16	0.06	0.16	0.12
O4	0.02	0.03	0.07	0.13	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.16	0.00	0.04	0.18	0.25	0.32	0.26
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.12	0.12	0.09	0.09
O5'	0.05	0.09	0.02	0.08	0.14	0.02	0.08	0.01	0.04	0.03	0.15	0.13	0.05	0.16	0.18	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.08	0.04	0.03	0.18	0.07	0.11	0.09	0.05	0.03	0.18	0.08	0.04	0.06	0.25	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.12	0.07	0.10	0.26	0.03	0.21	0.02	0.15	0.10	0.22	0.05	0.07	0.16	0.32	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.03	0.07	0.20	0.03	0.14	0.02	0.08	0.06	0.19	0.07	0.05	0.12	0.26	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.16	0.22	0.09	0.15	0.08	0.22	0.16	0.26	0.24	0.24	0.07	0.31	0.24	0.21	0.41	0.08	0.18	0.52	0.46	0.90	0.51
C2	0.11	0.18	0.16	0.15	0.04	0.16	0.13	0.37	0.17	0.14	0.16	0.14	0.23	0.18	0.05	0.29	0.15	0.02	0.47	0.41	1.11	0.54
C2'	0.23	0.15	0.20	0.07	0.13	0.04	0.18	0.18	0.22	0.20	0.21	0.08	0.27	0.20	0.18	0.40	0.08	0.15	0.45	0.42	0.82	0.41
C3'	0.16	0.18	0.17	0.08	0.07	0.05	0.12	0.21	0.19	0.12	0.22	0.09	0.23	0.11	0.10	0.35	0.11	0.07	0.35	0.37	0.61	0.25
C4	0.21	0.27	0.25	0.20	0.20	0.24	0.10	0.47	0.09	0.06	0.20	0.26	0.09	0.01	0.16	0.34	0.21	0.14	0.37	0.30	1.34	0.54
C4'	0.19	0.23	0.18	0.08	0.13	0.06	0.17	0.10	0.22	0.18	0.25	0.14	0.25	0.17	0.15	0.36	0.08	0.13	0.39	0.46	0.50	0.28
C5	0.24	0.29	0.24	0.12	0.19	0.13	0.08	0.35	0.04	0.08	0.18	0.28	0.12	0.06	0.18	0.38	0.15	0.12	0.44	0.31	1.31	0.57
C5'	0.10	0.25	0.10	0.07	0.11	0.04	0.12	0.10	0.19	0.10	0.24	0.18	0.20	0.09	0.06	0.26	0.09	0.06	0.28	0.45	0.28	0.14
C6	0.25	0.17	0.22	0.07	0.14	0.04	0.10	0.27	0.11	0.14	0.02	0.21	0.22	0.15	0.18	0.40	0.10	0.14	0.49	0.37	1.20	0.58
N1	0.22	0.09	0.20	0.08	0.08	0.04	0.14	0.25	0.17	0.18	0.12	0.10	0.25	0.20	0.15	0.38	0.10	0.11	0.50	0.41	1.08	0.55
N3	0.17	0.20	0.23	0.21	0.14	0.26	0.07	0.47	0.10	0.00	0.14	0.21	0.16	0.08	0.11	0.31	0.22	0.14	0.39	0.33	1.25	0.53
O2	0.04	0.26	0.13	0.20	0.15	0.22	0.18	0.40	0.21	0.18	0.23	0.23	0.24	0.22	0.07	0.24	0.17	0.11	0.47	0.46	0.97	0.51
O2'	0.24	0.25	0.18	0.10	0.22	0.07	0.26	0.14	0.30	0.24	0.30	0.19	0.33	0.26	0.23	0.37	0.11	0.18	0.44	0.43	0.71	0.38
O3'	0.15	0.19	0.15	0.10	0.09	0.07	0.13	0.23	0.20	0.11	0.23	0.11	0.23	0.10	0.10	0.33	0.13	0.05	0.27	0.33	0.45	0.13
O4	0.24	0.30	0.28	0.27	0.25	0.34	0.19	0.58	0.19	0.15	0.26	0.29	0.07	0.12	0.21	0.33	0.28	0.23	0.28	0.32	1.41	0.51
O4'	0.24	0.23	0.21	0.11	0.14	0.11	0.21	0.13	0.24	0.24	0.25	0.11	0.28	0.24	0.20	0.41	0.08	0.19	0.51	0.51	0.74	0.46
O5'	0.23	0.12	0.27	0.07	0.08	0.04	0.09	0.11	0.07	0.23	0.10	0.07	0.10	0.17	0.18	0.34	0.01	0.14	0.40	0.50	0.51	0.26
OP1	0.05	0.16	0.10	0.01	0.05	0.09	0.03	0.15	0.08	0.12	0.14	0.12	0.07	0.08	0.05	0.12	0.01	0.04	0.17	0.46	0.28	0.23
OP2	0.09	0.21	0.14	0.03	0.13	0.18	0.12	0.33	0.14	0.16	0.21	0.17	0.11	0.13	0.12	0.12	0.02	0.07	0.28	0.44	0.58	0.19
P	0.09	0.17	0.14	0.01	0.06	0.08	0.03	0.16	0.09	0.13	0.16	0.13	0.08	0.08	0.07	0.15	0.01	0.02	0.26	0.47	0.32	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.17	0.19	0.19
C2	0.06	0.00	0.10	0.19	0.02	0.07	0.02	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.23	0.07	0.36	0.22	0.86	0.47
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.33	0.20	0.18
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.01	0.13	0.06	0.18	0.17	0.13	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.33	0.43	0.28	0.23
C4	0.03	0.02	0.06	0.12	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.37	0.22	0.83	0.48
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.06	0.10	0.06	0.12	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.18	0.20	0.06
C5	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.44	0.25	1.16	0.62
C5'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.16	0.00	0.21	0.00	0.24	0.16	0.22	0.13	0.27	0.21	0.11	0.03	0.03	0.01	0.00	0.22	0.07	0.00
C6	0.03	0.02	0.04	0.13	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.02	0.45	0.27	1.26	0.66
C8	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.04	0.07	0.04	0.44	0.24	1.02	0.61
N1	0.05	0.00	0.08	0.18	0.02	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.21	0.04	0.41	0.23	1.10	0.57
N3	0.06	0.01	0.10	0.17	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.20	0.07	0.33	0.21	0.69	0.40
N6	0.05	0.02	0.04	0.13	0.03	0.12	0.03	0.27	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.06	0.05	0.05	0.13	0.05	0.51	0.34	1.49	0.77
N7	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.09	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.48	0.27	1.31	0.71
N9	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.34	0.21	0.68	0.42
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.07	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.24	0.25	0.07
O3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.12	0.01	0.09	0.03	0.14	0.07	0.21	0.20	0.13	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.28	0.53	0.21	0.18
O4'	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.10	0.06	0.08
O5'	0.18	0.36	0.25	0.33	0.37	0.01	0.44	0.00	0.45	0.44	0.41	0.33	0.51	0.48	0.34	0.06	0.28	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.17	0.22	0.33	0.43	0.22	0.18	0.25	0.22	0.27	0.24	0.23	0.21	0.34	0.27	0.21	0.24	0.53	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.86	0.20	0.28	0.83	0.20	1.16	0.07	1.26	1.02	1.10	0.69	1.49	1.31	0.68	0.25	0.21	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.47	0.18	0.23	0.48	0.06	0.62	0.00	0.66	0.61	0.57	0.40	0.77	0.71	0.42	0.07	0.18	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00