Doublet Group distance statistics: 50755

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.000, 0.032, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.000, 0.076, 0.151, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.076 std_dev=0.076
C4'	A	0, 0.000, 0.158, 0.316, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.158 std_dev=0.158
O2'	A	0, 0.000, 0.304, 0.608, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C3'	A	0, 0.000, 0.315, 0.629, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.315 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.000, 0.476, 0.951, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.476 std_dev=0.476
C2	B	0, 0.000, 0.513, 1.026, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.513 std_dev=0.513
N3	B	0, 0.000, 0.540, 1.080, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.540 std_dev=0.540
N1	B	0, 0.000, 0.572, 1.144, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.572 std_dev=0.572
C5'	A	0, 0.000, 0.581, 1.162, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.581 std_dev=0.581
O4'	B	0, 0.000, 0.592, 1.183, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.592 std_dev=0.592
C4	B	0, 0.000, 0.613, 1.226, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.613 std_dev=0.613
C6	B	0, 0.000, 0.653, 1.306, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.653 std_dev=0.653
C4'	B	0, 0.000, 0.666, 1.332, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.666 std_dev=0.666
C5	B	0, 0.000, 0.668, 1.336, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.668 std_dev=0.668
N9	B	0, 0.000, 0.684, 1.368, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.684 std_dev=0.684
N6	B	0, 0.000, 0.731, 1.463, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.731 std_dev=0.731
O3'	A	0, 0.000, 0.743, 1.486, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.743 std_dev=0.743
C1'	B	0, 0.000, 0.752, 1.504, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.752 std_dev=0.752
N7	B	0, 0.000, 0.760, 1.521, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.760 std_dev=0.760
C8	B	0, 0.000, 0.765, 1.529, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.765 std_dev=0.765
C5'	B	0, 0.000, 0.786, 1.572, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.786 std_dev=0.786
C2'	B	0, 0.000, 1.185, 2.371, 2.371 max_d=2.371 avg_d=1.185 std_dev=1.185
P	A	0, 0.000, 1.199, 2.398, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.199 std_dev=1.199
C3'	B	0, 0.000, 1.248, 2.496, 2.496 max_d=2.496 avg_d=1.248 std_dev=1.248
OP1	A	0, 0.000, 1.346, 2.692, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.346 std_dev=1.346
O5'	B	0, 0.000, 1.417, 2.834, 2.834 max_d=2.834 avg_d=1.417 std_dev=1.417
OP2	A	0, 0.000, 1.511, 3.022, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.511 std_dev=1.511
O2'	B	0, 0.000, 1.626, 3.253, 3.253 max_d=3.253 avg_d=1.626 std_dev=1.626
O3'	B	0, 0.000, 1.828, 3.656, 3.656 max_d=3.656 avg_d=1.828 std_dev=1.828
OP2	B	0, 0.000, 2.284, 4.568, 4.568 max_d=4.568 avg_d=2.284 std_dev=2.284
P	B	0, 0.000, 2.332, 4.665, 4.665 max_d=4.665 avg_d=2.332 std_dev=2.332
OP1	B	0, 0.000, 3.083, 6.167, 6.167 max_d=6.167 avg_d=3.083 std_dev=3.083

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.11	0.02	0.00	0.09	0.17	0.47	0.24
C2	0.03	0.00	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.20	0.38	0.73	0.46
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.55	0.27
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.00	0.16	0.10	0.12	0.05	0.00	0.00	0.15	0.01	0.19	0.07	0.13	0.05
C4	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.00	0.00	0.29	0.55	0.73	0.59
C4'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.19	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.18	0.02
C5	0.01	0.02	0.01	0.17	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.00	0.01	0.30	0.51	0.61	0.55
C5'	0.04	0.10	0.09	0.00	0.19	0.01	0.19	0.00	0.16	0.10	0.15	0.06	0.10	0.13	0.21	0.03	0.00	0.01	0.13	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.02	0.25	0.38	0.53	0.44
N1	0.01	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.18	0.32	0.60	0.39
N3	0.02	0.00	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.04	0.00	0.01	0.25	0.49	0.78	0.56
O2	0.04	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.06	0.01	0.05	0.15	0.33	0.73	0.42
O2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.10	0.19	0.05	0.10	0.03	0.06	0.12	0.13	0.00	0.02	0.11	0.10	0.06	0.04	0.52	0.16
O3'	0.11	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.13	0.09	0.01	0.04	0.06	0.02	0.00	0.11	0.11	0.29	0.38	0.08	0.27
O4	0.02	0.01	0.00	0.15	0.00	0.04	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.11	0.00	0.01	0.31	0.61	0.73	0.63
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.11	0.01	0.00	0.04	0.04	0.24	0.08
O5'	0.09	0.20	0.06	0.19	0.29	0.03	0.30	0.00	0.25	0.18	0.25	0.15	0.06	0.29	0.31	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.17	0.38	0.20	0.07	0.55	0.01	0.51	0.01	0.38	0.32	0.49	0.33	0.04	0.38	0.61	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.47	0.73	0.55	0.13	0.73	0.18	0.61	0.13	0.53	0.60	0.78	0.73	0.52	0.08	0.73	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.46	0.27	0.05	0.59	0.02	0.55	0.00	0.44	0.39	0.56	0.42	0.16	0.27	0.63	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.32	0.26	0.18	0.40	0.31	0.41	0.17	0.35	0.46	0.30	0.36	0.31	0.45	0.43	0.37	0.12	0.37	0.06	0.42	0.72	0.32
C2	0.34	0.33	0.08	0.07	0.38	0.28	0.35	0.22	0.30	0.34	0.29	0.37	0.21	0.32	0.36	0.10	0.06	0.38	0.07	0.18	0.51	0.13
C2'	0.47	0.33	0.39	0.33	0.43	0.37	0.45	0.21	0.37	0.52	0.31	0.38	0.34	0.52	0.47	0.48	0.30	0.40	0.00	0.31	0.64	0.24
C3'	0.32	0.22	0.28	0.17	0.28	0.18	0.30	0.04	0.25	0.35	0.21	0.25	0.25	0.35	0.31	0.44	0.19	0.20	0.30	0.70	0.99	0.59
C4	0.29	0.20	0.08	0.10	0.22	0.21	0.11	0.14	0.06	0.12	0.11	0.26	0.01	0.05	0.23	0.05	0.22	0.31	0.08	0.40	0.62	0.31
C4'	0.54	0.32	0.48	0.35	0.44	0.40	0.43	0.18	0.34	0.55	0.29	0.39	0.30	0.51	0.51	0.68	0.37	0.42	0.12	0.60	0.83	0.45
C5	0.37	0.20	0.10	0.03	0.25	0.22	0.16	0.07	0.10	0.21	0.13	0.27	0.03	0.12	0.29	0.35	0.09	0.30	0.22	0.67	0.84	0.53
C5'	0.81	0.51	0.78	0.62	0.66	0.65	0.62	0.40	0.51	0.80	0.46	0.60	0.44	0.72	0.75	1.02	0.67	0.66	0.06	0.52	0.68	0.33
C6	0.42	0.27	0.21	0.08	0.34	0.26	0.28	0.09	0.21	0.35	0.21	0.33	0.13	0.27	0.38	0.42	0.03	0.33	0.19	0.64	0.85	0.50
N1	0.41	0.32	0.19	0.12	0.39	0.29	0.37	0.17	0.30	0.40	0.28	0.36	0.23	0.37	0.41	0.30	0.03	0.37	0.06	0.41	0.70	0.32
N3	0.28	0.27	0.05	0.02	0.30	0.25	0.21	0.22	0.16	0.20	0.20	0.32	0.07	0.15	0.28	0.04	0.18	0.35	0.07	0.17	0.47	0.12
O2	0.32	0.38	0.07	0.11	0.39	0.30	0.40	0.28	0.39	0.35	0.37	0.38	0.32	0.36	0.36	0.03	0.05	0.40	0.18	0.00	0.39	0.02
O2'	0.58	0.54	0.47	0.44	0.61	0.50	0.65	0.38	0.62	0.65	0.55	0.57	0.63	0.68	0.61	0.50	0.38	0.55	0.22	0.04	0.43	0.02
O3'	0.25	0.22	0.22	0.09	0.23	0.08	0.23	0.16	0.22	0.24	0.22	0.23	0.22	0.24	0.23	0.40	0.14	0.11	0.43	0.82	1.17	0.73
O4	0.17	0.11	0.28	0.24	0.09	0.15	0.02	0.13	0.03	0.04	0.03	0.16	0.09	0.09	0.08	0.20	0.39	0.26	0.07	0.37	0.54	0.28
O4'	0.47	0.32	0.32	0.20	0.41	0.32	0.40	0.14	0.33	0.48	0.29	0.37	0.30	0.45	0.45	0.50	0.16	0.38	0.14	0.60	0.84	0.46
O5'	0.82	0.54	0.78	0.56	0.65	0.62	0.57	0.34	0.47	0.72	0.46	0.62	0.37	0.61	0.73	1.09	0.63	0.64	0.05	0.68	0.84	0.48
OP1	1.32	0.89	1.42	1.23	1.05	1.17	0.95	0.85	0.79	1.18	0.79	1.01	0.66	1.01	1.19	1.74	1.39	1.13	0.43	0.29	0.35	0.04
OP2	1.39	1.19	1.35	1.03	1.29	1.07	1.22	0.73	1.11	1.35	1.12	1.26	0.99	1.23	1.36	1.60	1.05	1.16	0.33	0.45	0.56	0.19
P	1.28	0.93	1.30	1.05	1.07	1.07	0.97	0.75	0.84	1.16	0.84	1.04	0.71	1.01	1.18	1.62	1.14	1.08	0.34	0.40	0.48	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.21	0.16	0.11
C2	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.39	0.18	0.16	0.38	0.52	0.11	0.43
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.02	0.02	0.01	0.06	0.11	0.13	0.18	0.03	0.07	0.00	0.01	0.05	0.00	0.09	0.43	0.13	0.19
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.47	0.05	0.14
C4	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.08	0.07	0.10	0.09	0.16	0.08
C4'	0.00	0.10	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.07	0.10	0.00	0.07	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.20	0.11	0.04
C5	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.04	0.36	0.06
C5'	0.03	0.24	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.03	0.26	0.16	0.22	0.02	0.21	0.08	0.03	0.11	0.02	0.01	0.07	0.20	0.00
C6	0.04	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.04	0.08	0.15	0.25	0.09
C8	0.01	0.01	0.11	0.03	0.00	0.10	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.06	0.15	0.39	0.52	0.68	0.47
N1	0.06	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.30	0.12	0.11	0.27	0.41	0.03	0.32
N3	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.10	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.37	0.18	0.17	0.34	0.41	0.09	0.36
N6	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.00	0.00	0.06	0.37	0.00
N7	0.00	0.01	0.07	0.04	0.00	0.07	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.10	0.31	0.39	0.66	0.38
N9	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.11	0.21	0.33	0.16
O2'	0.02	0.39	0.01	0.03	0.18	0.03	0.08	0.03	0.16	0.18	0.30	0.37	0.10	0.11	0.01	0.00	0.13	0.01	0.05	0.42	0.04	0.15
O3'	0.06	0.18	0.05	0.01	0.08	0.03	0.02	0.11	0.06	0.06	0.12	0.18	0.02	0.06	0.03	0.13	0.00	0.00	0.07	0.45	0.32	0.01
O4'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.07	0.00	0.00	0.02	0.04	0.15	0.11	0.17	0.00	0.10	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01
O5'	0.06	0.38	0.09	0.04	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.39	0.27	0.34	0.00	0.31	0.11	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.52	0.43	0.47	0.09	0.20	0.04	0.07	0.15	0.52	0.41	0.41	0.06	0.39	0.21	0.42	0.45	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.16	0.11	0.13	0.05	0.16	0.11	0.36	0.20	0.25	0.68	0.03	0.09	0.37	0.66	0.33	0.04	0.32	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.43	0.19	0.14	0.08	0.04	0.06	0.00	0.09	0.47	0.32	0.36	0.00	0.38	0.16	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00