Doublet Group distance statistics: 50766

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 5, 27, 23, 10, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.018 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.017, 0.040, 0.062, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.040 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.033, 0.104, 0.176, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.104 std_dev=0.072
C5	B	0, 0.178, 0.293, 0.408, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.293 std_dev=0.115
O4'	A	0, 0.008, 0.124, 0.240, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.124 std_dev=0.116
C6	B	0, 0.172, 0.290, 0.407, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.290 std_dev=0.117
C2'	A	0, 0.034, 0.156, 0.279, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.156 std_dev=0.123
N1	B	0, 0.165, 0.293, 0.420, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.293 std_dev=0.128
C4	B	0, 0.156, 0.290, 0.423, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.290 std_dev=0.133
C2	B	0, 0.166, 0.310, 0.454, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.310 std_dev=0.144
N3	B	0, 0.153, 0.303, 0.453, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.303 std_dev=0.150
N4	B	0, 0.166, 0.327, 0.488, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.327 std_dev=0.161
C1'	B	0, 0.165, 0.333, 0.500, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.333 std_dev=0.167
O4'	B	0, 0.178, 0.346, 0.513, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.346 std_dev=0.168
O2	B	0, 0.184, 0.371, 0.558, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.371 std_dev=0.187
C2'	B	0, 0.148, 0.364, 0.580, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.364 std_dev=0.216
C4'	A	0, -0.026, 0.206, 0.439, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.206 std_dev=0.232
C4'	B	0, 0.167, 0.423, 0.678, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.423 std_dev=0.255
C5'	B	0, 0.197, 0.453, 0.708, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.453 std_dev=0.256
C5'	A	0, 0.027, 0.286, 0.545, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.286 std_dev=0.259
O2'	A	0, -0.023, 0.307, 0.636, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.307 std_dev=0.329
O5'	B	0, 0.141, 0.473, 0.805, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.473 std_dev=0.332
O5'	A	0, -0.003, 0.331, 0.665, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.331 std_dev=0.334
P	A	0, 0.229, 0.580, 0.931, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.580 std_dev=0.351
P	B	0, 0.216, 0.592, 0.967, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.592 std_dev=0.376
C3'	A	0, -0.119, 0.264, 0.646, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.264 std_dev=0.382
C3'	B	0, 0.091, 0.480, 0.868, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.480 std_dev=0.389
O2'	B	0, 0.102, 0.497, 0.892, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.497 std_dev=0.395
OP1	B	0, 0.187, 0.676, 1.165, 2.411 max_d=2.411 avg_d=0.676 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.287, 0.852, 1.417, 2.719 max_d=2.719 avg_d=0.852 std_dev=0.565
OP2	A	0, 0.202, 0.917, 1.633, 3.356 max_d=3.356 avg_d=0.917 std_dev=0.715
O3'	B	0, -0.088, 0.662, 1.412, 3.378 max_d=3.378 avg_d=0.662 std_dev=0.750
O3'	A	0, -0.384, 0.377, 1.138, 3.160 max_d=3.160 avg_d=0.377 std_dev=0.761
OP2	B	0, -0.046, 0.737, 1.519, 3.672 max_d=3.672 avg_d=0.737 std_dev=0.782

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.02	0.00	0.11	0.45	0.10	0.14
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.18	0.01	0.04	0.13	0.57	0.37	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.13	0.06	0.02	0.06	0.09	0.00	0.03	0.06	0.01	0.30	0.42	0.24	0.31
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.21	0.00	0.26	0.02	0.24	0.13	0.14	0.06	0.01	0.01	0.23	0.01	0.11	0.14	0.21	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.21	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.06	0.01	0.03	0.24	0.63	0.67	0.27
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.05	0.05	0.04	0.16	0.01	0.09	0.00	0.01	0.16	0.14	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.26	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.16	0.01	0.03	0.26	0.63	0.68	0.27
C5'	0.05	0.06	0.13	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.06	0.09	0.05	0.06	0.12	0.14	0.01	0.01	0.09	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.24	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.13	0.01	0.03	0.22	0.60	0.49	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02	0.01	0.13	0.55	0.32	0.17
N3	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.10	0.01	0.04	0.18	0.61	0.53	0.22
O2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.32	0.01	0.06	0.10	0.54	0.28	0.15
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.21	0.16	0.18	0.06	0.15	0.12	0.21	0.19	0.00	0.04	0.22	0.11	0.26	0.36	0.27	0.28
O3'	0.20	0.18	0.03	0.01	0.06	0.01	0.16	0.12	0.13	0.08	0.10	0.32	0.04	0.00	0.08	0.13	0.14	0.32	0.22	0.16
O4	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.08	0.00	0.04	0.26	0.63	0.76	0.30
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.11	0.13	0.04	0.00	0.05	0.39	0.11	0.14
O5'	0.11	0.13	0.30	0.11	0.24	0.01	0.26	0.01	0.22	0.13	0.18	0.10	0.26	0.14	0.26	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.45	0.57	0.42	0.14	0.63	0.16	0.63	0.09	0.60	0.55	0.61	0.54	0.36	0.32	0.63	0.39	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.37	0.24	0.21	0.67	0.14	0.68	0.24	0.49	0.32	0.53	0.28	0.27	0.22	0.76	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.31	0.09	0.27	0.04	0.27	0.01	0.22	0.17	0.22	0.15	0.28	0.16	0.30	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.12	0.41	0.15	0.22	0.15	0.14	0.16	0.15	0.16	0.16	0.18	0.25	0.61	0.15	0.09	0.39	0.33	0.20
C2	0.15	0.19	0.14	0.35	0.16	0.18	0.15	0.14	0.16	0.16	0.19	0.16	0.21	0.35	0.41	0.14	0.12	0.52	0.50	0.16
C2'	0.16	0.14	0.15	0.48	0.14	0.28	0.14	0.21	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.18	0.67	0.18	0.15	0.38	0.35	0.16
C3'	0.39	0.36	0.42	0.11	0.30	0.18	0.31	0.22	0.36	0.38	0.32	0.26	0.37	0.49	0.36	0.34	0.33	0.39	0.15	0.46
C4	0.19	0.19	0.21	0.27	0.10	0.18	0.12	0.15	0.14	0.17	0.15	0.12	0.25	0.46	0.26	0.16	0.15	0.59	0.39	0.23
C4'	0.21	0.20	0.23	0.21	0.17	0.11	0.18	0.17	0.21	0.20	0.18	0.17	0.21	0.33	0.57	0.19	0.30	0.36	0.19	0.47
C5	0.19	0.17	0.20	0.27	0.11	0.18	0.12	0.15	0.14	0.16	0.14	0.14	0.22	0.45	0.30	0.16	0.16	0.55	0.27	0.27
C5'	0.17	0.18	0.19	0.27	0.16	0.20	0.15	0.21	0.16	0.17	0.18	0.17	0.20	0.26	0.68	0.17	0.30	0.28	0.26	0.41
C6	0.18	0.18	0.16	0.33	0.13	0.18	0.13	0.13	0.16	0.17	0.16	0.13	0.21	0.36	0.42	0.16	0.14	0.50	0.24	0.27
N1	0.16	0.17	0.13	0.37	0.14	0.19	0.15	0.12	0.16	0.16	0.17	0.14	0.20	0.32	0.48	0.14	0.09	0.49	0.36	0.20
N3	0.17	0.20	0.17	0.30	0.14	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.19	0.13	0.24	0.41	0.31	0.15	0.14	0.57	0.49	0.19
O2	0.15	0.19	0.12	0.37	0.19	0.20	0.17	0.16	0.16	0.16	0.21	0.20	0.21	0.32	0.45	0.14	0.16	0.49	0.59	0.13
O2'	0.34	0.34	0.27	0.59	0.34	0.44	0.35	0.36	0.35	0.35	0.34	0.34	0.34	0.20	0.73	0.38	0.37	0.28	0.57	0.15
O3'	0.60	0.42	0.62	0.30	0.27	0.53	0.33	0.63	0.47	0.50	0.32	0.20	0.45	0.65	0.11	0.63	0.70	0.68	0.45	0.87
O4	0.22	0.21	0.24	0.25	0.12	0.19	0.14	0.17	0.15	0.18	0.16	0.16	0.28	0.50	0.24	0.19	0.18	0.62	0.41	0.25
O4'	0.14	0.15	0.13	0.35	0.13	0.18	0.13	0.13	0.14	0.13	0.14	0.14	0.17	0.27	0.64	0.13	0.16	0.37	0.15	0.34
O5'	0.11	0.14	0.14	0.35	0.13	0.28	0.14	0.24	0.14	0.11	0.14	0.14	0.17	0.25	0.73	0.15	0.15	0.23	0.18	0.19
OP1	0.37	0.54	0.36	0.34	0.58	0.26	0.51	0.12	0.45	0.46	0.59	0.61	0.54	0.29	0.67	0.30	0.23	0.16	0.30	0.30
OP2	0.28	0.48	0.33	0.09	0.40	0.20	0.27	0.29	0.24	0.34	0.50	0.41	0.57	0.54	0.52	0.09	0.23	0.44	0.27	0.28
P	0.21	0.17	0.18	0.46	0.20	0.45	0.21	0.35	0.22	0.19	0.19	0.20	0.17	0.09	0.92	0.32	0.12	0.29	0.15	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.18	0.00	0.08	0.44	0.07	0.16
C2	0.02	0.00	0.06	0.11	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.15	0.03	0.12	0.59	0.29	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.11	0.05	0.03	0.06	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.23	0.41	0.15	0.29
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.22	0.00	0.26	0.01	0.23	0.13	0.16	0.24	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C4	0.02	0.02	0.05	0.22	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.21	0.11	0.01	0.20	0.66	0.52	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.11	0.06	0.06	0.10	0.04	0.17	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.26	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.16	0.02	0.23	0.66	0.52	0.20
C5'	0.04	0.06	0.11	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.12	0.06	0.09	0.14	0.06	0.07	0.13	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.23	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.03	0.18	0.62	0.35	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01	0.11	0.56	0.23	0.16
N3	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.21	0.10	0.02	0.16	0.63	0.42	0.18
N4	0.02	0.02	0.06	0.24	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.23	0.13	0.01	0.23	0.67	0.60	0.22
O2	0.03	0.01	0.08	0.07	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.16	0.28	0.04	0.10	0.54	0.22	0.17
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.21	0.17	0.17	0.07	0.13	0.12	0.21	0.23	0.16	0.00	0.03	0.12	0.17	0.31	0.12	0.22
O3'	0.18	0.15	0.02	0.00	0.11	0.02	0.16	0.13	0.13	0.07	0.10	0.13	0.28	0.03	0.00	0.12	0.15	0.28	0.17	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.12	0.00	0.05	0.34	0.06	0.09
O5'	0.08	0.12	0.23	0.04	0.20	0.01	0.23	0.01	0.18	0.11	0.16	0.23	0.10	0.17	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.44	0.59	0.41	0.08	0.66	0.08	0.66	0.10	0.62	0.56	0.63	0.67	0.54	0.31	0.28	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.29	0.15	0.06	0.52	0.11	0.52	0.22	0.35	0.23	0.42	0.60	0.22	0.12	0.17	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.17	0.29	0.04	0.20	0.03	0.20	0.01	0.17	0.16	0.18	0.22	0.17	0.22	0.19	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00