Doublet Group distance statistics: 50767

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 14, 16, 6, 12, 1, 0, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.016, 0.044, 0.073, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.044 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.015, 0.071, 0.127, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.071 std_dev=0.056
C2'	A	0, 0.026, 0.087, 0.147, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.087 std_dev=0.060
O2'	A	0, 0.062, 0.141, 0.220, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.141 std_dev=0.079
C4'	A	0, 0.013, 0.099, 0.184, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.099 std_dev=0.085
O4	A	0, 0.027, 0.115, 0.204, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.115 std_dev=0.088
C3'	A	0, 0.021, 0.118, 0.216, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.118 std_dev=0.097
C5'	A	0, 0.021, 0.160, 0.298, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.160 std_dev=0.138
O5'	A	0, 0.026, 0.182, 0.338, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.182 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.024, 0.182, 0.340, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.182 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.129, 0.304, 0.479, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.304 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.109, 0.285, 0.461, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.285 std_dev=0.176
P	A	0, 0.031, 0.225, 0.419, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.225 std_dev=0.194
C4	B	0, 0.147, 0.344, 0.541, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.344 std_dev=0.197
N1	B	0, 0.103, 0.303, 0.504, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.303 std_dev=0.200
O2	B	0, 0.085, 0.289, 0.494, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.289 std_dev=0.205
OP2	A	0, 0.038, 0.246, 0.454, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.246 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.131, 0.350, 0.568, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.350 std_dev=0.219
O4'	B	0, 0.087, 0.312, 0.537, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.312 std_dev=0.225
C5	B	0, 0.144, 0.371, 0.597, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.371 std_dev=0.227
O5'	B	0, 0.058, 0.290, 0.522, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.290 std_dev=0.232
P	B	0, 0.016, 0.253, 0.490, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.253 std_dev=0.237
N4	B	0, 0.161, 0.399, 0.638, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.399 std_dev=0.239
OP1	A	0, 0.031, 0.271, 0.511, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.271 std_dev=0.240
OP2	B	0, 0.018, 0.266, 0.513, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.266 std_dev=0.248
C4'	B	0, 0.067, 0.319, 0.572, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.319 std_dev=0.253
C5'	B	0, 0.040, 0.301, 0.561, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.301 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.039, 0.326, 0.612, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.326 std_dev=0.287
O3'	B	0, 0.102, 0.394, 0.685, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.394 std_dev=0.291
C3'	B	0, 0.062, 0.362, 0.662, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.362 std_dev=0.300
OP1	B	0, -0.002, 0.328, 0.659, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.328 std_dev=0.331
C2'	B	0, -0.057, 0.397, 0.852, 2.461 max_d=2.461 avg_d=0.397 std_dev=0.454
O2'	B	0, -0.222, 0.502, 1.226, 3.546 max_d=3.546 avg_d=0.502 std_dev=0.724

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.07	0.12	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.07	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.05	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.07	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.03	0.09	0.12	0.16	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.09	0.12	0.15	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.08	0.09	0.12	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.10	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.07	0.09	0.14	0.10
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.03	0.03	0.05	0.06	0.11	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.06	0.03	0.06	0.06	0.04	0.00	0.09	0.01	0.05	0.11	0.07	0.07
O4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.00	0.04	0.10	0.14	0.17	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.07	0.05
O5'	0.03	0.05	0.04	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.03	0.05	0.10	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.07	0.06	0.07	0.12	0.05	0.12	0.04	0.09	0.06	0.09	0.06	0.06	0.11	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.12	0.07	0.05	0.16	0.03	0.15	0.01	0.12	0.10	0.14	0.11	0.05	0.07	0.17	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.05	0.05	0.12	0.02	0.12	0.01	0.09	0.07	0.10	0.07	0.03	0.07	0.13	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.06	0.12	0.08	0.11	0.08	0.15	0.11	0.15	0.07	0.08	0.12	0.13	0.08	0.09	0.08	0.08	0.03	0.06	0.02
C2	0.13	0.09	0.11	0.14	0.13	0.13	0.16	0.14	0.13	0.08	0.10	0.16	0.15	0.13	0.12	0.13	0.10	0.06	0.11	0.06
C2'	0.07	0.08	0.13	0.07	0.09	0.08	0.13	0.11	0.13	0.07	0.08	0.10	0.14	0.07	0.08	0.08	0.09	0.04	0.04	0.03
C3'	0.07	0.08	0.18	0.05	0.09	0.05	0.09	0.06	0.10	0.07	0.10	0.11	0.14	0.12	0.08	0.08	0.05	0.02	0.04	0.01
C4	0.17	0.11	0.14	0.18	0.10	0.15	0.17	0.12	0.17	0.14	0.08	0.13	0.14	0.19	0.12	0.16	0.11	0.11	0.18	0.11
C4'	0.06	0.08	0.18	0.05	0.10	0.05	0.11	0.06	0.11	0.07	0.10	0.13	0.13	0.11	0.08	0.08	0.04	0.04	0.06	0.02
C5	0.13	0.11	0.14	0.14	0.14	0.11	0.18	0.09	0.17	0.13	0.10	0.15	0.14	0.23	0.10	0.13	0.10	0.12	0.19	0.12
C5'	0.08	0.10	0.21	0.07	0.13	0.06	0.13	0.05	0.12	0.09	0.13	0.17	0.12	0.19	0.11	0.09	0.04	0.08	0.08	0.04
C6	0.11	0.10	0.15	0.10	0.13	0.09	0.16	0.08	0.15	0.11	0.10	0.14	0.13	0.19	0.08	0.11	0.09	0.09	0.15	0.09
N1	0.09	0.07	0.11	0.10	0.11	0.10	0.15	0.10	0.14	0.08	0.07	0.13	0.14	0.11	0.09	0.10	0.08	0.04	0.11	0.05
N3	0.17	0.10	0.14	0.18	0.12	0.15	0.15	0.13	0.14	0.12	0.09	0.17	0.15	0.16	0.13	0.16	0.11	0.08	0.15	0.09
O2	0.15	0.12	0.14	0.15	0.17	0.16	0.20	0.18	0.15	0.09	0.14	0.19	0.17	0.20	0.17	0.15	0.13	0.09	0.09	0.08
O2'	0.11	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.16	0.13	0.16	0.11	0.10	0.11	0.16	0.15	0.11	0.11	0.10	0.08	0.04	0.06
O3'	0.08	0.11	0.18	0.05	0.10	0.05	0.08	0.04	0.09	0.08	0.13	0.13	0.16	0.09	0.13	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00
O4	0.23	0.17	0.20	0.25	0.14	0.19	0.21	0.14	0.22	0.20	0.14	0.13	0.18	0.25	0.17	0.20	0.15	0.14	0.22	0.15
O4'	0.07	0.07	0.15	0.07	0.11	0.07	0.14	0.09	0.14	0.08	0.09	0.13	0.13	0.10	0.07	0.08	0.06	0.03	0.06	0.02
O5'	0.12	0.13	0.23	0.11	0.17	0.10	0.16	0.08	0.15	0.13	0.16	0.21	0.14	0.26	0.15	0.13	0.09	0.11	0.13	0.09
OP1	0.15	0.17	0.29	0.11	0.24	0.11	0.21	0.11	0.18	0.16	0.22	0.30	0.15	0.36	0.19	0.14	0.11	0.16	0.12	0.12
OP2	0.17	0.19	0.27	0.15	0.27	0.13	0.26	0.10	0.22	0.20	0.24	0.32	0.16	0.39	0.17	0.17	0.11	0.16	0.14	0.12
P	0.14	0.17	0.26	0.12	0.23	0.11	0.21	0.09	0.18	0.16	0.21	0.27	0.14	0.33	0.17	0.14	0.10	0.14	0.12	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.18	0.00	0.09	0.09	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.11	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.27	0.06	0.07	0.12	0.11	0.15	0.12
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.10	0.12	0.02	0.09	0.05	0.21	0.00	0.02	0.02	0.23	0.24	0.31	0.25
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.18	0.00	0.15	0.01	0.12	0.11	0.18	0.19	0.15	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.25	0.04	0.03	0.13	0.14	0.20	0.14
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.11	0.09	0.15	0.16	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.10	0.15	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.07	0.05	0.09	0.09	0.15	0.09
C5'	0.03	0.11	0.10	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.04	0.04	0.13	0.12	0.16	0.06	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.12	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.07	0.06	0.06	0.11	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.01	0.06	0.06	0.11	0.07
N3	0.03	0.00	0.09	0.18	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.08	0.06	0.15	0.17	0.21	0.16
N4	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.29	0.06	0.04	0.16	0.19	0.25	0.18
O2	0.03	0.00	0.21	0.15	0.02	0.15	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.32	0.12	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.25	0.16	0.13	0.06	0.06	0.13	0.31	0.29	0.32	0.00	0.05	0.09	0.16	0.17	0.35	0.20
O3'	0.18	0.06	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.11	0.08	0.08	0.06	0.12	0.05	0.00	0.11	0.14	0.18	0.14	0.15
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.13	0.09	0.11	0.00	0.05	0.06	0.08	0.06
O5'	0.09	0.12	0.23	0.05	0.13	0.01	0.09	0.01	0.06	0.06	0.15	0.16	0.14	0.16	0.14	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.11	0.24	0.08	0.14	0.05	0.09	0.05	0.06	0.06	0.17	0.19	0.14	0.17	0.18	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.15	0.31	0.07	0.20	0.03	0.15	0.02	0.11	0.11	0.21	0.25	0.14	0.35	0.14	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.25	0.05	0.14	0.01	0.09	0.01	0.07	0.07	0.16	0.18	0.14	0.20	0.15	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00