Doublet Group distance statistics: 50769

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 5, 13, 18, 7, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.007 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.013 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.041, 0.115, 0.189, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.115 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.028, 0.104, 0.180, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.104 std_dev=0.076
O4	A	0, -0.024, 0.055, 0.134, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.055 std_dev=0.079
C4'	A	0, 0.054, 0.167, 0.280, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.167 std_dev=0.113
C3'	A	0, 0.064, 0.187, 0.311, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.187 std_dev=0.124
O2'	A	0, 0.034, 0.175, 0.316, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.175 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.159, 0.308, 0.457, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.308 std_dev=0.149
C2	B	0, 0.174, 0.329, 0.485, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.329 std_dev=0.155
C1'	B	0, 0.147, 0.327, 0.506, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.327 std_dev=0.180
C6	B	0, 0.165, 0.348, 0.531, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.348 std_dev=0.183
O3'	A	0, 0.090, 0.275, 0.461, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.275 std_dev=0.185
C2'	B	0, 0.164, 0.351, 0.538, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.351 std_dev=0.187
O2	B	0, 0.183, 0.374, 0.564, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.374 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.144, 0.352, 0.561, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.352 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.082, 0.291, 0.500, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.291 std_dev=0.209
O5'	A	0, 0.090, 0.316, 0.541, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.316 std_dev=0.226
C5	B	0, 0.131, 0.362, 0.593, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.362 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.105, 0.347, 0.589, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.347 std_dev=0.242
O2'	B	0, 0.094, 0.347, 0.600, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.347 std_dev=0.253
P	A	0, 0.215, 0.499, 0.784, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.499 std_dev=0.285
O4'	B	0, 0.109, 0.422, 0.734, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.422 std_dev=0.313
OP2	A	0, 0.261, 0.583, 0.904, 2.315 max_d=2.315 avg_d=0.583 std_dev=0.322
N4	B	0, 0.052, 0.384, 0.716, 2.522 max_d=2.522 avg_d=0.384 std_dev=0.332
OP1	A	0, 0.259, 0.609, 0.959, 2.397 max_d=2.397 avg_d=0.609 std_dev=0.350
C3'	B	0, 0.049, 0.433, 0.817, 2.683 max_d=2.683 avg_d=0.433 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.060, 0.501, 0.942, 3.126 max_d=3.126 avg_d=0.501 std_dev=0.441
O3'	B	0, -0.101, 0.395, 0.891, 3.645 max_d=3.645 avg_d=0.395 std_dev=0.496
O5'	B	0, 0.101, 0.638, 1.176, 3.987 max_d=3.987 avg_d=0.638 std_dev=0.537
C5'	B	0, 0.044, 0.631, 1.219, 4.081 max_d=4.081 avg_d=0.631 std_dev=0.587
P	B	0, 0.041, 0.782, 1.524, 5.628 max_d=5.628 avg_d=0.782 std_dev=0.742
OP2	B	0, 0.089, 0.850, 1.610, 5.784 max_d=5.784 avg_d=0.850 std_dev=0.761
OP1	B	0, -0.032, 0.777, 1.587, 6.157 max_d=6.157 avg_d=0.777 std_dev=0.810

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.02	0.11	0.11	0.18	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.06	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.02	0.17	0.20	0.27	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.17	0.21	0.26	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.04	0.06	0.02	0.11	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.15	0.16	0.19	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.10	0.11	0.15	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.02	0.14	0.16	0.23	0.17
O2	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.02	0.03	0.09	0.09	0.16	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.03	0.03	0.08	0.10	0.00	0.02	0.09	0.05	0.04	0.07	0.04	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.06	0.07	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.10	0.08	0.06
O4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.00	0.02	0.17	0.23	0.29	0.22
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.06
O5'	0.05	0.11	0.03	0.03	0.17	0.01	0.17	0.01	0.15	0.10	0.14	0.09	0.04	0.05	0.17	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.11	0.05	0.07	0.20	0.03	0.21	0.03	0.16	0.11	0.16	0.09	0.07	0.10	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.18	0.06	0.06	0.27	0.02	0.26	0.01	0.19	0.15	0.23	0.16	0.04	0.08	0.29	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.04	0.04	0.21	0.02	0.21	0.01	0.16	0.12	0.17	0.11	0.04	0.06	0.22	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.15	0.28	0.07	0.26	0.17	0.42	0.17	0.09	0.15	0.12	0.17	0.22	0.15	0.16	0.47	0.54	0.70	0.61
C2	0.09	0.11	0.14	0.18	0.10	0.15	0.19	0.27	0.17	0.08	0.14	0.14	0.20	0.22	0.09	0.09	0.35	0.36	0.53	0.44
C2'	0.13	0.12	0.15	0.31	0.11	0.31	0.18	0.46	0.20	0.12	0.16	0.17	0.15	0.18	0.20	0.21	0.52	0.61	0.74	0.67
C3'	0.10	0.15	0.11	0.27	0.19	0.29	0.15	0.46	0.15	0.11	0.21	0.27	0.17	0.25	0.20	0.18	0.50	0.63	0.74	0.67
C4	0.09	0.14	0.14	0.16	0.14	0.12	0.16	0.21	0.15	0.07	0.17	0.16	0.22	0.22	0.10	0.08	0.27	0.25	0.40	0.31
C4'	0.11	0.14	0.14	0.28	0.15	0.29	0.16	0.48	0.16	0.11	0.18	0.21	0.17	0.28	0.19	0.17	0.47	0.61	0.72	0.64
C5	0.10	0.15	0.15	0.23	0.11	0.20	0.13	0.31	0.14	0.09	0.18	0.14	0.20	0.25	0.12	0.13	0.34	0.32	0.48	0.39
C5'	0.15	0.19	0.18	0.26	0.22	0.29	0.21	0.48	0.20	0.16	0.23	0.27	0.20	0.37	0.19	0.17	0.41	0.58	0.66	0.59
C6	0.10	0.13	0.15	0.27	0.10	0.25	0.13	0.38	0.15	0.08	0.17	0.14	0.19	0.24	0.15	0.15	0.41	0.43	0.59	0.50
N1	0.09	0.12	0.15	0.24	0.07	0.22	0.16	0.36	0.16	0.08	0.15	0.12	0.18	0.23	0.12	0.13	0.41	0.44	0.61	0.52
N3	0.10	0.11	0.14	0.15	0.15	0.11	0.19	0.20	0.16	0.08	0.15	0.18	0.20	0.21	0.12	0.08	0.29	0.27	0.44	0.34
O2	0.11	0.12	0.14	0.17	0.12	0.13	0.21	0.25	0.17	0.09	0.13	0.17	0.21	0.21	0.11	0.10	0.34	0.36	0.54	0.44
O2'	0.17	0.13	0.17	0.33	0.14	0.33	0.24	0.48	0.24	0.17	0.14	0.14	0.15	0.15	0.21	0.26	0.55	0.64	0.75	0.70
O3'	0.10	0.16	0.10	0.26	0.21	0.28	0.16	0.45	0.14	0.12	0.23	0.30	0.18	0.25	0.20	0.18	0.49	0.65	0.70	0.67
O4	0.11	0.19	0.16	0.13	0.20	0.11	0.20	0.17	0.18	0.14	0.22	0.21	0.25	0.20	0.14	0.11	0.25	0.21	0.34	0.26
O4'	0.11	0.11	0.17	0.31	0.09	0.30	0.15	0.48	0.17	0.10	0.15	0.14	0.17	0.26	0.19	0.18	0.47	0.58	0.73	0.63
O5'	0.18	0.23	0.20	0.25	0.27	0.28	0.25	0.47	0.23	0.20	0.28	0.32	0.24	0.41	0.19	0.16	0.37	0.55	0.63	0.55
OP1	0.27	0.30	0.32	0.27	0.34	0.30	0.33	0.48	0.31	0.29	0.33	0.38	0.29	0.52	0.23	0.21	0.27	0.49	0.44	0.44
OP2	0.28	0.31	0.32	0.25	0.34	0.28	0.33	0.45	0.32	0.30	0.34	0.37	0.31	0.54	0.22	0.20	0.25	0.46	0.44	0.41
P	0.24	0.27	0.28	0.25	0.31	0.28	0.30	0.47	0.28	0.26	0.31	0.34	0.27	0.49	0.21	0.19	0.29	0.49	0.50	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.00	0.18	0.18	0.13	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.07	0.14	0.14	0.14	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.07	0.07	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.01	0.01	0.27	0.30	0.21	0.26
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.09	0.05	0.05	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.17	0.07	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.07	0.02	0.18	0.16	0.20	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.05	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.04	0.06	0.24	0.20	0.23	0.24
C5'	0.05	0.12	0.07	0.02	0.19	0.01	0.23	0.00	0.22	0.12	0.15	0.20	0.13	0.05	0.06	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.04	0.08	0.25	0.19	0.21	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.18	0.16	0.15	0.16
N3	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.10	0.05	0.14	0.13	0.16	0.14
N4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.20	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.13	0.07	0.02	0.17	0.17	0.21	0.20
O2	0.02	0.01	0.10	0.04	0.02	0.11	0.02	0.13	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.16	0.16	0.13	0.13	0.15	0.13	0.12
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.08	0.17	0.05	0.16	0.07	0.09	0.13	0.16	0.00	0.04	0.05	0.27	0.33	0.28	0.29
O3'	0.10	0.12	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.06	0.04	0.08	0.10	0.07	0.16	0.04	0.00	0.07	0.06	0.09	0.11	0.06
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.13	0.05	0.07	0.00	0.10	0.10	0.09	0.09
O5'	0.18	0.14	0.27	0.12	0.18	0.01	0.24	0.01	0.25	0.18	0.14	0.17	0.13	0.27	0.06	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.14	0.30	0.17	0.16	0.07	0.20	0.08	0.19	0.16	0.13	0.17	0.15	0.33	0.09	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.14	0.21	0.07	0.20	0.10	0.23	0.17	0.21	0.15	0.16	0.21	0.13	0.28	0.11	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.13	0.26	0.10	0.19	0.03	0.24	0.01	0.23	0.16	0.14	0.20	0.12	0.29	0.06	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00