Doublet Group distance statistics: 50777

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.009, 0.030, 0.050, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.010, 0.032, 0.054, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.005, 0.028, 0.051, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.011, 0.043, 0.076, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.043 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.038, 0.086, 0.134, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.086 std_dev=0.048
O2	A	0, 0.020, 0.070, 0.120, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.070 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.025, 0.081, 0.137, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.081 std_dev=0.056
C4'	A	0, 0.056, 0.120, 0.185, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.120 std_dev=0.064
C5'	A	0, 0.093, 0.210, 0.327, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.210 std_dev=0.117
O2'	A	0, -0.015, 0.191, 0.397, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.191 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.162, 0.376, 0.589, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.376 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.161, 0.410, 0.659, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.410 std_dev=0.249
C3'	A	0, -0.033, 0.218, 0.469, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.218 std_dev=0.251
N4	B	0, 0.152, 0.408, 0.665, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.408 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.207, 0.465, 0.723, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.465 std_dev=0.258
N3	B	0, 0.167, 0.501, 0.834, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.501 std_dev=0.333
OP2	A	0, 0.244, 0.586, 0.929, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.586 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.214, 0.562, 0.909, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.562 std_dev=0.348
O5'	A	0, 0.114, 0.481, 0.847, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.481 std_dev=0.367
O3'	B	0, 0.343, 0.711, 1.080, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.711 std_dev=0.369
O4'	B	0, 0.353, 0.736, 1.119, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.736 std_dev=0.383
C3'	B	0, 0.349, 0.733, 1.117, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.733 std_dev=0.384
C2	B	0, 0.189, 0.580, 0.972, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.580 std_dev=0.391
C4'	B	0, 0.388, 0.784, 1.180, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.784 std_dev=0.396
C1'	B	0, 0.267, 0.714, 1.161, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.714 std_dev=0.447
C5'	B	0, 0.384, 0.851, 1.318, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.851 std_dev=0.467
OP1	B	0, 0.411, 0.929, 1.448, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.929 std_dev=0.519
O2	B	0, 0.192, 0.714, 1.236, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.714 std_dev=0.522
O5'	B	0, 0.291, 0.831, 1.370, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.831 std_dev=0.539
C2'	B	0, 0.205, 0.759, 1.313, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.759 std_dev=0.554
P	A	0, 0.108, 0.713, 1.317, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.713 std_dev=0.605
P	B	0, 0.300, 0.934, 1.569, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.934 std_dev=0.634
O3'	A	0, -0.127, 0.519, 1.166, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.519 std_dev=0.647
OP2	B	0, 0.207, 1.020, 1.833, 2.314 max_d=2.314 avg_d=1.020 std_dev=0.813
O2'	B	0, 0.145, 1.052, 1.959, 2.386 max_d=2.386 avg_d=1.052 std_dev=0.907
OP1	A	0, -0.142, 1.047, 2.236, 3.367 max_d=3.367 avg_d=1.047 std_dev=1.189

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.06	0.03	0.01	0.03	0.08	0.01	0.27	0.04	0.00	0.09	0.36	0.23	0.07
C2	0.04	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.03	0.01	0.00	0.00	0.12	0.15	0.02	0.05	0.10	0.11	0.34	0.25
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.16	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.05	0.02	0.32	0.68	0.21	0.30
C3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.12	0.55	0.35	0.12
C4	0.04	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.16	0.22	0.01	0.05	0.06	0.08	0.27	0.22
C4'	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.27	0.30	0.02
C5	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.02	0.02	0.02	0.14	0.29	0.01	0.04	0.07	0.21	0.20	0.12
C5'	0.06	0.09	0.16	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.08	0.07	0.10	0.11	0.12	0.09	0.09	0.01	0.01	0.09	0.21	0.01
C6	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.11	0.32	0.02	0.03	0.08	0.29	0.21	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.24	0.02	0.01	0.08	0.22	0.25	0.11
N3	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.02	0.10	0.04	0.01	0.00	0.02	0.14	0.15	0.02	0.05	0.08	0.14	0.33	0.29
O2	0.08	0.00	0.09	0.08	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.03	0.02	0.00	0.14	0.12	0.03	0.11	0.16	0.22	0.43	0.36
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.16	0.04	0.14	0.12	0.11	0.09	0.14	0.14	0.00	0.03	0.17	0.03	0.38	0.86	0.29	0.44
O3'	0.27	0.15	0.05	0.01	0.22	0.03	0.29	0.09	0.32	0.24	0.15	0.12	0.03	0.00	0.20	0.20	0.08	0.52	0.43	0.11
O4	0.04	0.02	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.03	0.17	0.20	0.00	0.05	0.06	0.12	0.28	0.28
O4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.11	0.03	0.20	0.05	0.00	0.11	0.12	0.33	0.13
O5'	0.09	0.10	0.32	0.12	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.16	0.38	0.08	0.06	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.11	0.68	0.55	0.08	0.27	0.21	0.09	0.29	0.22	0.14	0.22	0.86	0.52	0.12	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.34	0.21	0.35	0.27	0.30	0.20	0.21	0.21	0.25	0.33	0.43	0.29	0.43	0.28	0.33	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.25	0.30	0.12	0.22	0.02	0.12	0.01	0.08	0.11	0.29	0.36	0.44	0.11	0.28	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.07	0.28	0.30	0.06	0.19	0.02	0.10	0.04	0.09	0.03	0.13	0.14	0.16	0.12	0.11	0.14	0.21	0.20	0.25
C2	0.09	0.10	0.27	0.31	0.18	0.19	0.11	0.13	0.07	0.06	0.20	0.23	0.08	0.20	0.14	0.09	0.17	0.21	0.22	0.27
C2'	0.10	0.02	0.23	0.27	0.06	0.17	0.05	0.12	0.05	0.06	0.04	0.11	0.04	0.28	0.17	0.08	0.18	0.22	0.26	0.29
C3'	0.20	0.08	0.40	0.38	0.09	0.28	0.04	0.19	0.07	0.12	0.05	0.19	0.13	0.17	0.20	0.17	0.16	0.19	0.20	0.22
C4	0.07	0.15	0.09	0.30	0.17	0.13	0.11	0.11	0.09	0.08	0.19	0.18	0.14	0.49	0.19	0.04	0.19	0.25	0.28	0.33
C4'	0.19	0.09	0.39	0.32	0.11	0.24	0.07	0.18	0.08	0.12	0.08	0.19	0.14	0.18	0.20	0.15	0.18	0.22	0.19	0.23
C5	0.06	0.07	0.10	0.33	0.07	0.16	0.05	0.07	0.05	0.07	0.08	0.09	0.09	0.44	0.19	0.10	0.14	0.23	0.23	0.30
C5'	0.23	0.14	0.42	0.32	0.16	0.28	0.13	0.24	0.14	0.17	0.15	0.22	0.16	0.25	0.29	0.21	0.25	0.28	0.26	0.28
C6	0.12	0.12	0.19	0.35	0.08	0.21	0.06	0.08	0.08	0.12	0.10	0.09	0.15	0.31	0.17	0.14	0.11	0.20	0.19	0.25
N1	0.11	0.05	0.25	0.32	0.08	0.19	0.04	0.10	0.04	0.08	0.05	0.14	0.10	0.22	0.12	0.10	0.13	0.20	0.21	0.26
N3	0.10	0.22	0.18	0.29	0.24	0.16	0.15	0.14	0.12	0.12	0.28	0.25	0.21	0.36	0.15	0.09	0.20	0.24	0.26	0.31
O2	0.14	0.15	0.37	0.33	0.22	0.23	0.13	0.18	0.10	0.09	0.25	0.28	0.13	0.10	0.16	0.13	0.17	0.21	0.20	0.23
O2'	0.10	0.04	0.14	0.19	0.09	0.11	0.10	0.16	0.09	0.06	0.05	0.12	0.03	0.47	0.21	0.07	0.27	0.34	0.40	0.42
O3'	0.10	0.18	0.23	0.23	0.39	0.12	0.34	0.17	0.24	0.15	0.31	0.52	0.08	0.20	0.20	0.12	0.31	0.40	0.44	0.47
O4	0.16	0.24	0.12	0.28	0.22	0.11	0.18	0.15	0.18	0.19	0.25	0.20	0.23	0.62	0.24	0.08	0.24	0.28	0.35	0.39
O4'	0.17	0.07	0.36	0.31	0.11	0.22	0.07	0.14	0.06	0.11	0.07	0.21	0.14	0.13	0.15	0.13	0.15	0.20	0.17	0.23
O5'	0.33	0.18	0.55	0.43	0.05	0.42	0.11	0.33	0.19	0.25	0.07	0.09	0.24	0.31	0.20	0.31	0.19	0.22	0.14	0.14
OP1	0.54	0.28	0.78	0.69	0.05	0.71	0.11	0.59	0.27	0.38	0.10	0.18	0.40	0.62	0.50	0.55	0.33	0.37	0.07	0.19
OP2	0.32	0.21	0.54	0.48	0.18	0.46	0.23	0.40	0.27	0.28	0.17	0.16	0.20	0.28	0.37	0.35	0.27	0.36	0.24	0.24
P	0.50	0.31	0.74	0.62	0.17	0.63	0.25	0.54	0.35	0.40	0.19	0.11	0.35	0.52	0.38	0.50	0.33	0.39	0.11	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.31	0.00	0.16	0.20	0.14	0.18
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.16	0.34	0.03	0.15	0.25	0.08	0.21
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.19	0.07	0.02	0.05	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.39	0.34	0.48	0.43
C3'	0.03	0.05	0.01	0.00	0.19	0.00	0.25	0.01	0.23	0.10	0.10	0.21	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.02	0.03
C4	0.03	0.02	0.04	0.19	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.29	0.12	0.04	0.13	0.27	0.04	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.03	0.08	0.08	0.21	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01
C5	0.03	0.02	0.05	0.25	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.31	0.08	0.07	0.13	0.28	0.04	0.22
C5'	0.07	0.09	0.19	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.08	0.12	0.04	0.21	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.23	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.27	0.07	0.08	0.13	0.26	0.05	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.19	0.01	0.15	0.25	0.09	0.22
N3	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.23	0.27	0.02	0.14	0.26	0.04	0.21
N4	0.03	0.03	0.05	0.21	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.31	0.11	0.05	0.13	0.28	0.07	0.21
O2	0.05	0.01	0.08	0.10	0.03	0.08	0.02	0.12	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.05	0.54	0.10	0.18	0.25	0.12	0.21
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.29	0.21	0.31	0.04	0.27	0.17	0.23	0.31	0.05	0.00	0.06	0.12	0.32	0.22	0.59	0.39
O3'	0.31	0.34	0.04	0.00	0.12	0.01	0.08	0.21	0.07	0.19	0.27	0.11	0.54	0.06	0.00	0.19	0.22	0.42	0.24	0.28
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.10	0.12	0.19	0.00	0.05	0.10	0.11	0.03
O5'	0.16	0.15	0.39	0.03	0.13	0.02	0.13	0.01	0.13	0.15	0.14	0.13	0.18	0.32	0.22	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.25	0.34	0.08	0.27	0.07	0.28	0.08	0.26	0.25	0.26	0.28	0.25	0.22	0.42	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.08	0.48	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.09	0.04	0.07	0.12	0.59	0.24	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.21	0.43	0.03	0.21	0.01	0.22	0.01	0.23	0.22	0.21	0.21	0.21	0.39	0.28	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00