Doublet Group distance statistics: 50779

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.018, 0.061, 0.105, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.061 std_dev=0.043
C2'	A	0, 0.023, 0.082, 0.141, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.082 std_dev=0.059
O4	A	0, 0.029, 0.101, 0.173, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.101 std_dev=0.072
O4'	A	0, -0.001, 0.076, 0.152, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.076 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.047, 0.159, 0.272, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.159 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.044, 0.158, 0.272, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.158 std_dev=0.114
O2'	A	0, -0.008, 0.111, 0.230, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.111 std_dev=0.119
O5'	A	0, 0.055, 0.237, 0.418, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.237 std_dev=0.181
O3'	A	0, 0.077, 0.264, 0.451, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.264 std_dev=0.187
C5'	A	0, 0.048, 0.243, 0.439, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.243 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.071, 0.287, 0.502, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.287 std_dev=0.216
N1	B	0, 0.092, 0.344, 0.596, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.344 std_dev=0.252
O2	B	0, 0.084, 0.346, 0.608, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.346 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.062, 0.334, 0.607, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.334 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.065, 0.373, 0.681, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.373 std_dev=0.308
C6	B	0, 0.113, 0.444, 0.775, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.444 std_dev=0.331
C5	B	0, 0.102, 0.445, 0.787, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.445 std_dev=0.343
C1'	B	0, 0.132, 0.487, 0.841, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.487 std_dev=0.355
N4	B	0, 0.056, 0.454, 0.852, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.454 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.168, 0.616, 1.063, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.616 std_dev=0.447
P	A	0, 0.154, 0.630, 1.105, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.630 std_dev=0.476
C2'	B	0, 0.190, 0.678, 1.166, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.678 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.165, 0.685, 1.204, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.685 std_dev=0.520
O2'	B	0, 0.210, 0.772, 1.333, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.772 std_dev=0.562
C3'	B	0, 0.236, 0.824, 1.412, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.824 std_dev=0.588
C4'	B	0, 0.232, 0.825, 1.418, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.825 std_dev=0.593
C5'	B	0, 0.231, 0.831, 1.432, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.831 std_dev=0.601
OP2	A	0, 0.246, 0.937, 1.628, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.937 std_dev=0.691
O3'	B	0, 0.323, 1.116, 1.910, 1.776 max_d=1.776 avg_d=1.116 std_dev=0.794
OP2	B	0, 0.571, 1.950, 3.329, 2.960 max_d=2.960 avg_d=1.950 std_dev=1.379
O5'	B	0, 0.574, 1.960, 3.347, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.960 std_dev=1.386
P	B	0, 0.594, 2.033, 3.472, 3.135 max_d=3.135 avg_d=2.033 std_dev=1.439
OP1	B	0, 0.690, 2.368, 4.046, 3.694 max_d=3.694 avg_d=2.368 std_dev=1.678

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.12	0.05
C2	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.13	0.13	0.04
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.15	0.15	0.07
C4	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.02
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.09	0.07	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.02
C5'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.04
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.04	0.12	0.05
N3	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04
O2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.04	0.06	0.13	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.13	0.05
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.08	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.08	0.01	0.02	0.23	0.21	0.12
O4	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.10	0.03
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.11	0.08
O5'	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01
OP1	0.06	0.05	0.13	0.15	0.02	0.09	0.02	0.05	0.01	0.04	0.05	0.06	0.16	0.23	0.03	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.13	0.13	0.15	0.11	0.07	0.09	0.03	0.10	0.12	0.13	0.13	0.13	0.21	0.10	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.04	0.04	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.12	0.03	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.13	0.21	0.22	0.08	0.17	0.08	0.15	0.09	0.11	0.12	0.05	0.15	0.22	0.28	0.11	0.66	0.71	0.68	0.66
C2	0.16	0.11	0.22	0.24	0.06	0.19	0.09	0.17	0.09	0.11	0.07	0.08	0.13	0.24	0.29	0.13	0.63	0.65	0.63	0.62
C2'	0.11	0.12	0.18	0.18	0.06	0.12	0.04	0.10	0.04	0.09	0.12	0.04	0.15	0.19	0.23	0.07	0.58	0.62	0.62	0.59
C3'	0.07	0.10	0.13	0.13	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.11	0.08	0.13	0.14	0.17	0.03	0.54	0.60	0.60	0.56
C4	0.17	0.11	0.22	0.24	0.06	0.21	0.10	0.19	0.13	0.14	0.08	0.02	0.10	0.22	0.28	0.16	0.67	0.65	0.61	0.63
C4'	0.09	0.11	0.16	0.16	0.08	0.10	0.05	0.08	0.04	0.08	0.12	0.09	0.13	0.17	0.21	0.05	0.60	0.68	0.65	0.62
C5	0.15	0.13	0.18	0.21	0.14	0.19	0.14	0.18	0.15	0.14	0.13	0.12	0.11	0.18	0.25	0.14	0.71	0.73	0.69	0.70
C5'	0.07	0.10	0.13	0.13	0.09	0.07	0.05	0.06	0.04	0.06	0.11	0.11	0.11	0.14	0.18	0.02	0.59	0.68	0.65	0.63
C6	0.14	0.13	0.19	0.21	0.13	0.18	0.12	0.17	0.12	0.13	0.14	0.12	0.13	0.19	0.26	0.13	0.70	0.74	0.71	0.70
N1	0.15	0.13	0.21	0.23	0.08	0.18	0.09	0.16	0.10	0.12	0.11	0.05	0.14	0.22	0.28	0.12	0.67	0.70	0.68	0.66
N3	0.17	0.10	0.23	0.24	0.05	0.20	0.08	0.17	0.10	0.12	0.05	0.08	0.11	0.24	0.29	0.15	0.62	0.62	0.59	0.59
O2	0.15	0.10	0.23	0.24	0.08	0.18	0.09	0.16	0.08	0.10	0.06	0.13	0.12	0.25	0.29	0.13	0.61	0.63	0.61	0.59
O2'	0.12	0.13	0.19	0.19	0.05	0.13	0.03	0.10	0.04	0.09	0.12	0.02	0.17	0.21	0.25	0.07	0.57	0.62	0.61	0.58
O3'	0.05	0.09	0.09	0.08	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.10	0.06	0.12	0.10	0.12	0.05	0.45	0.51	0.51	0.48
O4	0.17	0.07	0.22	0.25	0.03	0.22	0.06	0.19	0.12	0.12	0.04	0.04	0.06	0.21	0.28	0.17	0.63	0.60	0.52	0.57
O4'	0.13	0.12	0.19	0.21	0.09	0.16	0.09	0.14	0.09	0.11	0.12	0.08	0.14	0.21	0.27	0.10	0.68	0.74	0.71	0.69
O5'	0.05	0.09	0.11	0.11	0.10	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.11	0.14	0.09	0.11	0.15	0.02	0.59	0.68	0.65	0.63
OP1	0.02	0.04	0.04	0.09	0.06	0.07	0.01	0.10	0.04	0.01	0.07	0.12	0.04	0.04	0.14	0.06	0.53	0.70	0.64	0.61
OP2	0.12	0.11	0.05	0.07	0.10	0.09	0.12	0.10	0.13	0.12	0.10	0.10	0.11	0.05	0.12	0.14	0.51	0.68	0.60	0.59
P	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.07	0.04	0.02	0.05	0.09	0.03	0.04	0.12	0.07	0.52	0.66	0.59	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.12	0.06	0.11
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.29	0.28	0.29	0.29
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.15	0.14	0.08	0.13
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.07	0.04	0.07	0.08	0.05	0.02	0.00	0.00	0.18	0.17	0.06	0.14
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.44	0.44	0.47	0.45
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.46	0.46	0.47	0.47
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.40	0.37	0.33	0.37
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.28	0.26	0.23	0.27
N3	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.37	0.37	0.39	0.37
N4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.47	0.50	0.54	0.50
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.22	0.21	0.23	0.22
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.00	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.07	0.04	0.08	0.10	0.05	0.06	0.00	0.01	0.10	0.12	0.01	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.06	0.04
O5'	0.12	0.29	0.15	0.18	0.44	0.01	0.46	0.00	0.40	0.28	0.37	0.47	0.22	0.03	0.10	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.28	0.14	0.17	0.44	0.04	0.46	0.07	0.37	0.26	0.37	0.50	0.21	0.06	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.29	0.08	0.06	0.47	0.10	0.47	0.18	0.33	0.23	0.39	0.54	0.23	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.29	0.13	0.14	0.45	0.00	0.47	0.01	0.37	0.27	0.37	0.50	0.22	0.02	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00