Doublet Group distance statistics: 50782

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4	A	0, 0.000, 0.081, 0.163, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.081 std_dev=0.081
O4'	A	0, 0.000, 0.143, 0.286, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.143 std_dev=0.143
O2'	B	0, 0.000, 0.222, 0.445, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.222 std_dev=0.222
C2'	A	0, 0.000, 0.222, 0.445, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.222 std_dev=0.222
C4'	A	0, 0.000, 0.228, 0.457, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.228 std_dev=0.228
C3'	B	0, 0.000, 0.232, 0.464, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.232 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.000, 0.249, 0.498, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.249 std_dev=0.249
O5'	A	0, 0.000, 0.275, 0.550, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.275 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.284 std_dev=0.284
O3'	B	0, 0.000, 0.292, 0.584, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C1'	B	0, 0.000, 0.296, 0.592, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.296 std_dev=0.296
C3'	A	0, 0.000, 0.304, 0.608, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.304 std_dev=0.304
O2'	A	0, 0.000, 0.307, 0.615, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.307 std_dev=0.307
C4'	B	0, 0.000, 0.309, 0.618, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.309 std_dev=0.309
C5'	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
O4'	B	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
C2	B	0, 0.000, 0.340, 0.680, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C4	B	0, 0.000, 0.340, 0.680, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C6	B	0, 0.000, 0.347, 0.695, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.347 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.000, 0.348, 0.696, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.348 std_dev=0.348
P	A	0, 0.000, 0.379, 0.758, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.379 std_dev=0.379
O5'	B	0, 0.000, 0.390, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.390 std_dev=0.390
N4	B	0, 0.000, 0.393, 0.787, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.393 std_dev=0.393
C5	B	0, 0.000, 0.396, 0.791, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.396 std_dev=0.396
OP1	A	0, 0.000, 0.397, 0.794, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.397 std_dev=0.397
O3'	A	0, 0.000, 0.420, 0.840, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C5'	A	0, 0.000, 0.435, 0.869, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.435 std_dev=0.435
O2	B	0, 0.000, 0.454, 0.908, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.454 std_dev=0.454
OP2	B	0, 0.000, 0.471, 0.943, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.471 std_dev=0.471
P	B	0, 0.000, 0.477, 0.955, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.477 std_dev=0.477
OP2	A	0, 0.000, 0.486, 0.972, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.486 std_dev=0.486
OP1	B	0, 0.000, 0.497, 0.993, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.497 std_dev=0.497

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.13	0.05
C2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.06
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.15	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.06	0.09	0.00
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.05	0.04
C4	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.08	0.02
C5'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.07	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.13	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.02	0.13	0.05
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.06
N3	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03
O2	0.05	0.01	0.15	0.12	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.15	0.04	0.02	0.01	0.04	0.15	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01
O3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.02	0.06
O4	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.10	0.04	0.02	0.02
O4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.13	0.06
O5'	0.00	0.01	0.04	0.07	0.08	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.00	0.02	0.06	0.10	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.13	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.13	0.09	0.05	0.07	0.11	0.08	0.13	0.13	0.14	0.10	0.15	0.09	0.02	0.02	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.06	0.03	0.07	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.13	0.15	0.05	0.12	0.02	0.09	0.04	0.09	0.10	0.01	0.14	0.10	0.13	0.10	0.09	0.08	0.04	0.07
C2	0.13	0.15	0.14	0.15	0.10	0.14	0.06	0.11	0.07	0.11	0.15	0.08	0.18	0.10	0.12	0.13	0.12	0.10	0.07	0.10
C2'	0.08	0.09	0.11	0.12	0.03	0.08	0.00	0.05	0.02	0.06	0.08	0.00	0.11	0.10	0.10	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02
C3'	0.03	0.05	0.05	0.06	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03
C4	0.10	0.13	0.13	0.13	0.03	0.12	0.01	0.10	0.03	0.08	0.10	0.00	0.16	0.08	0.11	0.11	0.10	0.08	0.05	0.08
C4'	0.07	0.09	0.09	0.11	0.04	0.07	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.01	0.11	0.05	0.09	0.07	0.04	0.03	0.00	0.03
C5	0.07	0.06	0.11	0.13	0.04	0.10	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.09	0.09	0.05	0.10	0.08	0.08	0.09	0.05	0.08
C5'	0.11	0.14	0.11	0.13	0.09	0.10	0.06	0.08	0.07	0.11	0.13	0.07	0.15	0.07	0.12	0.11	0.08	0.05	0.03	0.05
C6	0.06	0.06	0.10	0.12	0.03	0.09	0.04	0.08	0.00	0.04	0.02	0.08	0.08	0.05	0.10	0.07	0.08	0.08	0.05	0.07
N1	0.10	0.11	0.13	0.14	0.05	0.12	0.03	0.10	0.05	0.09	0.10	0.01	0.13	0.09	0.12	0.11	0.10	0.10	0.07	0.09
N3	0.12	0.16	0.14	0.14	0.09	0.13	0.05	0.11	0.06	0.11	0.15	0.06	0.20	0.10	0.11	0.13	0.11	0.09	0.06	0.09
O2	0.15	0.18	0.15	0.15	0.14	0.15	0.09	0.12	0.09	0.14	0.19	0.13	0.20	0.12	0.13	0.15	0.13	0.11	0.08	0.11
O2'	0.10	0.11	0.14	0.15	0.03	0.10	0.01	0.07	0.03	0.08	0.09	0.00	0.13	0.14	0.13	0.08	0.05	0.05	0.00	0.03
O3'	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.05	0.07	0.10	0.07
O4	0.10	0.13	0.11	0.11	0.02	0.10	0.02	0.07	0.00	0.07	0.09	0.00	0.19	0.07	0.09	0.10	0.07	0.05	0.01	0.05
O4'	0.08	0.10	0.10	0.12	0.04	0.09	0.00	0.07	0.02	0.07	0.09	0.00	0.12	0.06	0.11	0.08	0.07	0.06	0.03	0.05
O5'	0.07	0.05	0.05	0.02	0.11	0.07	0.16	0.09	0.13	0.08	0.06	0.15	0.02	0.09	0.03	0.08	0.09	0.10	0.12	0.10
OP1	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.08	0.03	0.06	0.02	0.02	0.09	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04
OP2	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.06	0.01	0.09	0.02	0.03	0.00	0.05	0.08	0.10	0.08
P	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.03	0.05	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.04	0.01	0.03	0.05	0.07	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
C2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01
C5	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01
C5'	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00
C6	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
N4	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02
O2	0.04	0.00	0.11	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04
O3'	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03
O4'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01
O5'	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01
P	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00