Doublet Group distance statistics: 50783

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.000, 0.052, 0.103, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.052
O4	A	0, 0.000, 0.112, 0.225, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.112 std_dev=0.112
O4'	A	0, 0.000, 0.147, 0.295, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.147 std_dev=0.147
O2'	A	0, 0.000, 0.193, 0.386, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.193 std_dev=0.193
C2'	A	0, 0.000, 0.208, 0.416, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.208 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.000, 0.232, 0.463, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.232 std_dev=0.232
O5'	A	0, 0.000, 0.260, 0.519, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.260 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.000, 0.266, 0.531, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.266 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.000, 0.285, 0.570, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.285 std_dev=0.285
C2	B	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
C6	B	0, 0.000, 0.368, 0.735, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.368 std_dev=0.368
N3	B	0, 0.000, 0.403, 0.807, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.403 std_dev=0.403
C5'	A	0, 0.000, 0.412, 0.824, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.412 std_dev=0.412
O3'	A	0, 0.000, 0.422, 0.843, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.422 std_dev=0.422
C4	B	0, 0.000, 0.448, 0.896, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.448 std_dev=0.448
C5	B	0, 0.000, 0.468, 0.935, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.468 std_dev=0.468
C1'	B	0, 0.000, 0.478, 0.955, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.478 std_dev=0.478
O4'	B	0, 0.000, 0.573, 1.147, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.573 std_dev=0.573
OP2	A	0, 0.000, 0.574, 1.148, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.574 std_dev=0.574
O2	B	0, 0.000, 0.600, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.600 std_dev=0.600
P	A	0, 0.000, 0.637, 1.274, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.637 std_dev=0.637
N4	B	0, 0.000, 0.708, 1.416, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.708 std_dev=0.708
C2'	B	0, 0.000, 0.734, 1.469, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.734 std_dev=0.734
O2'	B	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
C4'	B	0, 0.000, 0.744, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.744 std_dev=0.744
C3'	B	0, 0.000, 0.832, 1.664, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.832 std_dev=0.832
C5'	B	0, 0.000, 0.862, 1.724, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.862 std_dev=0.862
OP1	A	0, 0.000, 0.940, 1.880, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.940 std_dev=0.940
O3'	B	0, 0.000, 0.997, 1.995, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.997 std_dev=0.997
OP1	B	0, 0.000, 1.324, 2.648, 2.648 max_d=2.648 avg_d=1.324 std_dev=1.324
P	B	0, 0.000, 1.355, 2.710, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.355 std_dev=1.355
OP2	B	0, 0.000, 1.401, 2.801, 2.801 max_d=2.801 avg_d=1.401 std_dev=1.401
O5'	B	0, 0.000, 1.464, 2.929, 2.929 max_d=2.929 avg_d=1.464 std_dev=1.464

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.14	0.01	0.05
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.01	0.06	0.19	0.05	0.08
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.00	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.15	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.04
C4	0.03	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.11	0.00	0.03
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00
C5'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01
N1	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.02	0.03	0.15	0.02	0.05
O2	0.04	0.00	0.15	0.15	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.18	0.00	0.01	0.09	0.24	0.08	0.11
O2'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.19	0.02	0.08
O3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.07	0.18	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.18	0.00	0.04
O4	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04
O5'	0.04	0.06	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.09	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00
OP1	0.14	0.19	0.15	0.16	0.11	0.11	0.05	0.09	0.07	0.14	0.15	0.24	0.19	0.18	0.07	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.05	0.11	0.08	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.07	0.17	0.11	0.04	0.15	0.18	0.10	0.21	0.16	0.00	0.06	0.04	0.22	0.05	0.22	0.38	0.49	0.20	0.29
C2	0.11	0.10	0.08	0.02	0.13	0.04	0.17	0.04	0.16	0.13	0.08	0.10	0.07	0.17	0.07	0.13	0.22	0.33	0.00	0.11
C2'	0.16	0.01	0.14	0.13	0.00	0.21	0.23	0.20	0.26	0.14	0.10	0.13	0.08	0.18	0.08	0.26	0.55	0.63	0.39	0.45
C3'	0.16	0.07	0.18	0.21	0.18	0.25	0.08	0.26	0.19	0.10	0.22	0.39	0.12	0.20	0.18	0.27	0.60	0.69	0.44	0.51
C4	0.18	0.20	0.21	0.04	0.04	0.05	0.03	0.08	0.09	0.17	0.12	0.03	0.24	0.29	0.00	0.14	0.10	0.26	0.16	0.00
C4'	0.18	0.01	0.23	0.23	0.15	0.24	0.04	0.21	0.16	0.12	0.15	0.33	0.03	0.26	0.19	0.25	0.50	0.62	0.33	0.42
C5	0.23	0.16	0.29	0.16	0.05	0.13	0.02	0.00	0.10	0.18	0.05	0.16	0.21	0.34	0.11	0.20	0.17	0.33	0.10	0.07
C5'	0.19	0.03	0.28	0.29	0.24	0.26	0.08	0.23	0.08	0.09	0.19	0.45	0.01	0.30	0.28	0.24	0.48	0.61	0.28	0.40
C6	0.22	0.13	0.26	0.17	0.04	0.16	0.04	0.06	0.15	0.18	0.02	0.17	0.15	0.31	0.12	0.22	0.27	0.41	0.03	0.18
N1	0.17	0.10	0.17	0.09	0.04	0.12	0.13	0.04	0.18	0.16	0.03	0.06	0.09	0.24	0.04	0.19	0.29	0.41	0.07	0.19
N3	0.11	0.15	0.08	0.05	0.14	0.00	0.14	0.09	0.13	0.14	0.14	0.11	0.14	0.18	0.10	0.10	0.14	0.27	0.09	0.03
O2	0.08	0.08	0.03	0.06	0.19	0.02	0.23	0.04	0.18	0.12	0.10	0.22	0.02	0.12	0.11	0.12	0.24	0.33	0.04	0.13
O2'	0.19	0.04	0.15	0.14	0.11	0.23	0.31	0.22	0.31	0.19	0.02	0.04	0.05	0.19	0.08	0.30	0.59	0.65	0.44	0.49
O3'	0.13	0.15	0.15	0.21	0.23	0.27	0.08	0.31	0.17	0.06	0.30	0.44	0.21	0.15	0.18	0.26	0.70	0.76	0.58	0.61
O4	0.21	0.28	0.22	0.02	0.09	0.00	0.02	0.15	0.07	0.20	0.20	0.04	0.35	0.32	0.06	0.12	0.00	0.18	0.25	0.08
O4'	0.19	0.06	0.23	0.18	0.06	0.18	0.07	0.12	0.16	0.15	0.04	0.20	0.06	0.28	0.14	0.23	0.37	0.50	0.17	0.29
O5'	0.21	0.01	0.31	0.31	0.27	0.27	0.12	0.23	0.07	0.10	0.18	0.48	0.02	0.32	0.30	0.25	0.46	0.61	0.24	0.38
OP1	0.03	0.27	0.21	0.30	0.60	0.22	0.45	0.24	0.20	0.14	0.49	0.84	0.22	0.20	0.35	0.10	0.45	0.64	0.25	0.39
OP2	0.15	0.09	0.34	0.38	0.44	0.26	0.39	0.21	0.14	0.02	0.29	0.64	0.00	0.33	0.41	0.16	0.34	0.52	0.02	0.24
P	0.13	0.12	0.30	0.34	0.44	0.24	0.34	0.20	0.11	0.02	0.31	0.66	0.04	0.30	0.36	0.16	0.37	0.55	0.11	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.21	0.13	0.02
C2	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.17	0.17	0.16	0.03
C2'	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.25	0.16	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.07	0.08	0.11	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.30	0.17	0.03
C4	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.08	0.00	0.18	0.10	0.18	0.06
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.22	0.19	0.06
C5	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.18	0.08	0.19	0.06
C5'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.16	0.01	0.19	0.00	0.15	0.09	0.12	0.18	0.03	0.07	0.01	0.01	0.00	0.31	0.20	0.00
C6	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.02	0.18	0.12	0.17	0.05
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.17	0.17	0.15	0.03
N3	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.04	0.01	0.18	0.14	0.18	0.05
N4	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.10	0.09	0.00	0.18	0.07	0.19	0.06
O2	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.05	0.00	0.16	0.20	0.15	0.03
O2'	0.01	0.11	0.01	0.03	0.09	0.08	0.03	0.07	0.00	0.04	0.12	0.10	0.17	0.00	0.02	0.08	0.13	0.09	0.26	0.18
O3'	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.02	0.11	0.01	0.09	0.03	0.04	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.18	0.27	0.20	0.07
O4'	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.18	0.18	0.14	0.03
O5'	0.16	0.17	0.02	0.06	0.18	0.01	0.18	0.00	0.18	0.17	0.18	0.18	0.16	0.13	0.18	0.18	0.00	0.03	0.04	0.01
OP1	0.21	0.17	0.25	0.30	0.10	0.22	0.08	0.31	0.12	0.17	0.14	0.07	0.20	0.09	0.27	0.18	0.03	0.00	0.03	0.00
OP2	0.13	0.16	0.16	0.17	0.18	0.19	0.19	0.20	0.17	0.15	0.18	0.19	0.15	0.26	0.20	0.14	0.04	0.03	0.00	0.00
P	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.06	0.03	0.18	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00