Doublet Group distance statistics: 50791

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 4, 9, 6, 3, 1, 3, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.028 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.008, 0.051, 0.093, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.051 std_dev=0.043
C5	B	0, 0.109, 0.295, 0.480, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.295 std_dev=0.185
O4'	A	0, -0.057, 0.142, 0.341, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.142 std_dev=0.199
C2'	A	0, -0.068, 0.149, 0.365, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.149 std_dev=0.216
N7	B	0, 0.135, 0.352, 0.570, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.352 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.076, 0.303, 0.531, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.303 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.110, 0.339, 0.567, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.339 std_dev=0.228
C8	B	0, 0.135, 0.390, 0.645, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.390 std_dev=0.255
N9	B	0, 0.109, 0.384, 0.659, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.384 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.055, 0.339, 0.622, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.339 std_dev=0.284
O6	B	0, 0.043, 0.351, 0.660, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.351 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.093, 0.404, 0.714, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.404 std_dev=0.310
C2	B	0, 0.085, 0.401, 0.717, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.401 std_dev=0.316
C4'	A	0, -0.104, 0.247, 0.598, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.247 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.072, 0.465, 0.859, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.465 std_dev=0.393
O2'	A	0, -0.163, 0.257, 0.678, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.257 std_dev=0.421
N2	B	0, 0.087, 0.514, 0.941, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.514 std_dev=0.427
C5'	A	0, -0.082, 0.355, 0.792, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.355 std_dev=0.437
C2'	B	0, -0.002, 0.451, 0.904, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.451 std_dev=0.453
O4'	B	0, 0.080, 0.543, 1.005, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.543 std_dev=0.462
O5'	A	0, -0.070, 0.400, 0.869, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.400 std_dev=0.469
C3'	A	0, -0.172, 0.308, 0.788, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.308 std_dev=0.480
C3'	B	0, -0.045, 0.472, 0.988, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.472 std_dev=0.517
C4'	B	0, -0.002, 0.543, 1.089, 2.188 max_d=2.188 avg_d=0.543 std_dev=0.546
O5'	B	0, 0.012, 0.588, 1.163, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.588 std_dev=0.576
O2'	B	0, 0.000, 0.623, 1.246, 2.404 max_d=2.404 avg_d=0.623 std_dev=0.623
C5'	B	0, -0.004, 0.627, 1.258, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.627 std_dev=0.631
P	A	0, -0.117, 0.519, 1.156, 2.579 max_d=2.579 avg_d=0.519 std_dev=0.636
OP2	B	0, -0.051, 0.627, 1.305, 2.789 max_d=2.789 avg_d=0.627 std_dev=0.678
P	B	0, -0.041, 0.654, 1.349, 2.641 max_d=2.641 avg_d=0.654 std_dev=0.695
OP2	A	0, -0.162, 0.550, 1.262, 3.350 max_d=3.350 avg_d=0.550 std_dev=0.712
O3'	B	0, -0.120, 0.608, 1.336, 2.820 max_d=2.820 avg_d=0.608 std_dev=0.728
OP1	B	0, -0.038, 0.703, 1.445, 2.784 max_d=2.784 avg_d=0.703 std_dev=0.742
OP1	A	0, -0.134, 0.612, 1.358, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.612 std_dev=0.746
O3'	A	0, -0.340, 0.506, 1.352, 3.316 max_d=3.316 avg_d=0.506 std_dev=0.846

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.01	0.00	0.10	0.11	0.14	0.11
C2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.14	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.06
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.12	0.08	0.02	0.08	0.17	0.00	0.01	0.04	0.01	0.25	0.28	0.33	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.26	0.00	0.30	0.02	0.27	0.15	0.19	0.11	0.02	0.01	0.28	0.02	0.06	0.10	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.03	0.26	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.12	0.00	0.03	0.14	0.14	0.15	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.14	0.07	0.06	0.05	0.19	0.02	0.12	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.30	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.21	0.01	0.06	0.18	0.17	0.17	0.15
C5'	0.04	0.05	0.12	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.12	0.05	0.07	0.06	0.07	0.14	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.27	0.01	0.14	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.17	0.01	0.07	0.13	0.12	0.12	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.01	0.02	0.06	0.07	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.08	0.19	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.07	0.01	0.04	0.09	0.08	0.09	0.08
O2	0.02	0.00	0.17	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.30	0.01	0.08	0.07	0.10	0.10	0.08
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.23	0.19	0.22	0.07	0.19	0.14	0.21	0.20	0.00	0.04	0.24	0.13	0.16	0.19	0.35	0.21
O3'	0.20	0.14	0.01	0.01	0.12	0.02	0.21	0.14	0.17	0.05	0.07	0.30	0.04	0.00	0.15	0.14	0.18	0.29	0.23	0.22
O4	0.01	0.01	0.04	0.28	0.00	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.15	0.00	0.02	0.16	0.17	0.19	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.04	0.08	0.13	0.14	0.02	0.00	0.05	0.06	0.09	0.07
O5'	0.10	0.06	0.25	0.06	0.14	0.01	0.18	0.01	0.13	0.06	0.09	0.07	0.16	0.18	0.16	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.07	0.28	0.10	0.14	0.05	0.17	0.05	0.12	0.07	0.08	0.10	0.19	0.29	0.17	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.08	0.33	0.08	0.15	0.02	0.17	0.01	0.12	0.09	0.09	0.10	0.35	0.23	0.19	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.06	0.28	0.07	0.12	0.02	0.15	0.01	0.10	0.06	0.08	0.08	0.21	0.22	0.15	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.29	0.29	0.17	0.22	0.19	0.09	0.13	0.09	0.14	0.12	0.38	0.32	0.10	0.23	0.50	0.16	0.25	0.11	0.29	0.16	0.24	0.16
C2	0.36	0.21	0.33	0.22	0.22	0.26	0.11	0.22	0.18	0.20	0.12	0.29	0.31	0.15	0.27	0.53	0.20	0.32	0.18	0.36	0.14	0.21	0.18
C2'	0.26	0.33	0.27	0.17	0.20	0.16	0.09	0.10	0.11	0.09	0.19	0.45	0.32	0.10	0.18	0.44	0.16	0.21	0.11	0.29	0.19	0.27	0.17
C3'	0.35	0.41	0.36	0.42	0.34	0.37	0.36	0.40	0.37	0.37	0.36	0.50	0.38	0.41	0.34	0.42	0.41	0.34	0.45	0.48	0.54	0.60	0.52
C4	0.31	0.15	0.31	0.19	0.15	0.20	0.13	0.18	0.22	0.21	0.18	0.21	0.20	0.21	0.23	0.53	0.17	0.25	0.19	0.35	0.17	0.26	0.21
C4'	0.28	0.36	0.29	0.26	0.26	0.23	0.23	0.23	0.25	0.21	0.29	0.46	0.35	0.24	0.24	0.46	0.25	0.23	0.27	0.34	0.38	0.44	0.35
C5	0.26	0.18	0.29	0.17	0.17	0.14	0.13	0.12	0.18	0.18	0.13	0.23	0.23	0.19	0.21	0.50	0.19	0.19	0.16	0.33	0.22	0.29	0.22
C5'	0.30	0.41	0.31	0.29	0.30	0.25	0.26	0.26	0.29	0.23	0.36	0.49	0.38	0.25	0.27	0.48	0.30	0.24	0.30	0.32	0.43	0.46	0.39
C6	0.27	0.23	0.28	0.16	0.20	0.14	0.12	0.11	0.15	0.16	0.12	0.28	0.27	0.16	0.21	0.50	0.17	0.20	0.14	0.33	0.21	0.28	0.20
N1	0.31	0.25	0.30	0.17	0.21	0.19	0.09	0.14	0.13	0.16	0.09	0.32	0.30	0.13	0.24	0.51	0.16	0.26	0.12	0.34	0.16	0.23	0.16
N3	0.37	0.15	0.34	0.23	0.19	0.27	0.13	0.24	0.23	0.22	0.18	0.23	0.25	0.19	0.27	0.55	0.20	0.33	0.21	0.37	0.16	0.23	0.21
O2	0.39	0.22	0.35	0.26	0.24	0.32	0.13	0.27	0.19	0.21	0.14	0.32	0.33	0.16	0.29	0.54	0.26	0.38	0.21	0.34	0.15	0.20	0.20
O2'	0.51	0.53	0.45	0.33	0.48	0.45	0.43	0.43	0.42	0.43	0.44	0.60	0.54	0.42	0.47	0.62	0.33	0.52	0.40	0.45	0.39	0.43	0.41
O3'	0.28	0.38	0.26	0.34	0.28	0.32	0.36	0.41	0.36	0.40	0.31	0.55	0.33	0.48	0.30	0.36	0.28	0.31	0.50	0.54	0.61	0.71	0.61
O4	0.29	0.18	0.32	0.21	0.12	0.21	0.17	0.22	0.25	0.23	0.22	0.23	0.17	0.23	0.21	0.53	0.19	0.25	0.24	0.33	0.20	0.30	0.25
O4'	0.31	0.32	0.30	0.18	0.24	0.18	0.13	0.12	0.13	0.15	0.19	0.41	0.34	0.12	0.24	0.52	0.16	0.24	0.12	0.25	0.21	0.27	0.18
O5'	0.31	0.45	0.31	0.34	0.34	0.28	0.30	0.29	0.34	0.25	0.43	0.52	0.41	0.26	0.29	0.45	0.38	0.26	0.33	0.34	0.46	0.48	0.40
OP1	0.33	0.51	0.33	0.41	0.39	0.35	0.37	0.40	0.44	0.31	0.52	0.58	0.45	0.33	0.34	0.43	0.48	0.32	0.43	0.45	0.60	0.59	0.53
OP2	0.33	0.49	0.32	0.40	0.40	0.33	0.40	0.35	0.47	0.31	0.51	0.52	0.45	0.34	0.34	0.42	0.50	0.30	0.37	0.50	0.53	0.49	0.44
P	0.32	0.48	0.31	0.36	0.37	0.30	0.36	0.32	0.42	0.28	0.48	0.53	0.43	0.30	0.32	0.44	0.43	0.28	0.35	0.43	0.51	0.49	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.08	0.02	0.07	0.11	0.09
C2	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.13	0.07	0.08	0.01	0.09	0.14	0.11
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.06	0.09	0.07	0.11	0.15	0.12	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.16	0.19	0.15
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.19	0.15	0.17	0.13	0.11	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.06	0.21	0.14	0.11	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.04	0.07	0.02	0.09	0.13	0.10
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.07	0.03	0.12	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.03	0.09	0.01	0.11	0.15	0.11
C5'	0.03	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.08	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.05	0.09	0.01	0.13	0.16	0.12
C8	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.03	0.08	0.02	0.10	0.13	0.10
N1	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.07	0.09	0.01	0.11	0.15	0.11
N2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.14	0.08	0.08	0.02	0.09	0.14	0.10
N3	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.07	0.07	0.02	0.08	0.13	0.10
N7	0.01	0.02	0.06	0.17	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.12	0.18	0.02	0.10	0.02	0.12	0.15	0.12
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.12	0.09
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.07	0.12	0.10	0.06	0.10	0.12	0.08	0.09	0.06	0.12	0.07	0.00	0.05	0.08	0.08	0.11	0.12	0.18	0.10
O3'	0.10	0.13	0.01	0.01	0.10	0.02	0.16	0.08	0.18	0.14	0.16	0.14	0.11	0.18	0.06	0.05	0.00	0.08	0.15	0.22	0.31	0.26	0.22
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.08	0.07	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.05	0.04	0.07	0.07
O5'	0.08	0.08	0.14	0.06	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.08	0.07	0.10	0.07	0.08	0.15	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.21	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.22	0.05	0.11	0.00	0.15	0.18	0.14
OP1	0.07	0.09	0.16	0.14	0.09	0.05	0.11	0.03	0.13	0.10	0.11	0.09	0.08	0.12	0.08	0.12	0.31	0.04	0.02	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.14	0.19	0.11	0.13	0.02	0.15	0.01	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.15	0.12	0.18	0.26	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.11	0.15	0.09	0.10	0.01	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.10	0.10	0.12	0.09	0.10	0.22	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00