Doublet Group distance statistics: 50796

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 5, 2, 0, 3, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.039 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.010, 0.032, 0.053, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.030 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.015, 0.065, 0.115, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.065 std_dev=0.050
O4	A	0, 0.046, 0.146, 0.246, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.146 std_dev=0.100
N9	B	0, 0.263, 0.475, 0.688, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.475 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.210, 0.440, 0.669, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.440 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.286, 0.516, 0.746, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.516 std_dev=0.230
C2	B	0, 0.225, 0.459, 0.692, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.459 std_dev=0.234
N2	B	0, 0.273, 0.545, 0.817, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.545 std_dev=0.272
C1'	B	0, 0.447, 0.742, 1.037, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.742 std_dev=0.295
C4'	B	0, 0.351, 0.675, 0.998, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.675 std_dev=0.324
O3'	B	0, 0.409, 0.738, 1.066, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.738 std_dev=0.329
O4'	A	0, 0.337, 0.668, 0.999, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.668 std_dev=0.331
C2'	A	0, 0.410, 0.758, 1.105, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.758 std_dev=0.348
N1	B	0, 0.148, 0.514, 0.880, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.514 std_dev=0.366
C3'	B	0, 0.577, 0.947, 1.316, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.947 std_dev=0.370
C8	B	0, 0.124, 0.529, 0.934, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.529 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.124, 0.561, 0.999, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.561 std_dev=0.438
C3'	A	0, 0.705, 1.158, 1.611, 1.585 max_d=1.585 avg_d=1.158 std_dev=0.453
O5'	A	0, 0.549, 1.005, 1.462, 1.787 max_d=1.787 avg_d=1.005 std_dev=0.457
OP2	A	0, 0.524, 0.996, 1.468, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.996 std_dev=0.472
C4'	A	0, 0.582, 1.067, 1.551, 1.613 max_d=1.613 avg_d=1.067 std_dev=0.485
P	B	0, 0.644, 1.150, 1.655, 1.836 max_d=1.836 avg_d=1.150 std_dev=0.506
C6	B	0, 0.178, 0.689, 1.199, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.689 std_dev=0.511
OP2	B	0, 1.077, 1.598, 2.119, 2.165 max_d=2.165 avg_d=1.598 std_dev=0.521
O5'	B	0, 1.056, 1.592, 2.128, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.592 std_dev=0.536
N7	B	0, 0.174, 0.715, 1.257, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.715 std_dev=0.541
OP1	A	0, 0.555, 1.098, 1.640, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.098 std_dev=0.542
O4'	B	0, 0.334, 0.883, 1.431, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.883 std_dev=0.549
C5'	B	0, 0.964, 1.520, 2.076, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.520 std_dev=0.556
P	A	0, 0.104, 0.668, 1.232, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.668 std_dev=0.564
C2'	B	0, 1.140, 1.773, 2.406, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.773 std_dev=0.633
C5'	A	0, 0.703, 1.349, 1.995, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.349 std_dev=0.646
OP1	B	0, 0.363, 1.010, 1.657, 2.191 max_d=2.191 avg_d=1.010 std_dev=0.647
O2'	A	0, 0.610, 1.281, 1.953, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.281 std_dev=0.672
O6	B	0, 0.312, 1.003, 1.693, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.003 std_dev=0.691
O3'	A	0, 1.173, 1.941, 2.709, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.941 std_dev=0.768
O2'	B	0, 2.215, 3.330, 4.446, 4.290 max_d=4.290 avg_d=3.330 std_dev=1.116

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.30	0.02	0.01	0.22	0.13	0.42	0.13
C2	0.02	0.00	0.19	0.20	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.23	0.02	0.10	0.32	0.18	0.40	0.18
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.08	0.02	0.16	0.20	0.19	0.04	0.14	0.34	0.00	0.04	0.10	0.02	0.55	0.53	0.60	0.50
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.26	0.00	0.23	0.02	0.18	0.15	0.24	0.18	0.02	0.01	0.28	0.02	0.24	0.25	0.27	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.26	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.20	0.00	0.03	0.41	0.24	0.39	0.27
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.06	0.06	0.26	0.03	0.09	0.01	0.02	0.13	0.37	0.10
C5	0.02	0.01	0.16	0.23	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.37	0.18	0.01	0.09	0.44	0.26	0.38	0.28
C5'	0.08	0.12	0.20	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.18	0.12	0.14	0.11	0.08	0.22	0.17	0.02	0.01	0.15	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.19	0.18	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.34	0.15	0.01	0.12	0.41	0.22	0.39	0.24
N1	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.20	0.02	0.01	0.33	0.18	0.40	0.18
N3	0.02	0.01	0.14	0.24	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.21	0.01	0.07	0.37	0.21	0.39	0.23
O2	0.04	0.00	0.34	0.18	0.02	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.25	0.28	0.03	0.17	0.28	0.16	0.39	0.16
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.28	0.26	0.37	0.08	0.34	0.16	0.14	0.25	0.00	0.05	0.30	0.15	0.38	0.41	0.62	0.38
O3'	0.30	0.23	0.04	0.01	0.20	0.03	0.18	0.22	0.15	0.20	0.21	0.28	0.05	0.00	0.22	0.21	0.13	0.20	0.29	0.13
O4	0.02	0.02	0.10	0.28	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.03	0.30	0.22	0.00	0.04	0.42	0.26	0.38	0.28
O4'	0.01	0.10	0.02	0.02	0.03	0.01	0.09	0.02	0.12	0.01	0.07	0.17	0.15	0.21	0.04	0.00	0.13	0.20	0.53	0.23
O5'	0.22	0.32	0.55	0.24	0.41	0.02	0.44	0.01	0.41	0.33	0.37	0.28	0.38	0.13	0.42	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.18	0.53	0.25	0.24	0.13	0.26	0.15	0.22	0.18	0.21	0.16	0.41	0.20	0.26	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.42	0.40	0.60	0.27	0.39	0.37	0.38	0.23	0.39	0.40	0.39	0.39	0.62	0.29	0.38	0.53	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.18	0.50	0.15	0.27	0.10	0.28	0.01	0.24	0.18	0.23	0.16	0.38	0.13	0.28	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.23	0.16	0.17	0.22	0.17	0.30	0.16	0.37	0.26	0.33	0.23	0.19	0.31	0.21	0.27	0.31	0.20	0.31	0.45	0.15	0.25	0.19
C2	0.21	0.23	0.20	0.18	0.24	0.19	0.29	0.18	0.33	0.26	0.30	0.17	0.22	0.29	0.23	0.18	0.32	0.24	0.29	0.37	0.15	0.20	0.15
C2'	0.25	0.25	0.21	0.20	0.33	0.24	0.47	0.29	0.54	0.43	0.41	0.28	0.24	0.51	0.33	0.28	0.35	0.29	0.44	0.68	0.35	0.42	0.38
C3'	0.38	0.48	0.39	0.41	0.36	0.38	0.27	0.35	0.26	0.26	0.38	0.57	0.46	0.22	0.34	0.47	0.50	0.36	0.27	0.21	0.29	0.35	0.27
C4	0.20	0.19	0.16	0.16	0.22	0.16	0.27	0.14	0.28	0.25	0.25	0.16	0.16	0.27	0.22	0.26	0.31	0.20	0.28	0.31	0.14	0.19	0.13
C4'	0.24	0.32	0.24	0.25	0.24	0.24	0.23	0.24	0.25	0.22	0.29	0.39	0.30	0.22	0.23	0.41	0.36	0.24	0.23	0.27	0.22	0.31	0.21
C5	0.18	0.19	0.15	0.17	0.22	0.15	0.31	0.14	0.35	0.27	0.29	0.17	0.14	0.32	0.21	0.42	0.30	0.17	0.31	0.38	0.15	0.25	0.18
C5'	0.26	0.34	0.26	0.23	0.27	0.24	0.26	0.25	0.30	0.24	0.33	0.39	0.31	0.25	0.25	0.53	0.37	0.25	0.24	0.33	0.19	0.26	0.19
C6	0.18	0.21	0.15	0.17	0.23	0.16	0.34	0.15	0.40	0.28	0.34	0.17	0.16	0.34	0.22	0.38	0.30	0.18	0.32	0.45	0.16	0.27	0.20
N1	0.19	0.20	0.16	0.17	0.23	0.16	0.30	0.16	0.36	0.26	0.32	0.16	0.18	0.31	0.22	0.27	0.31	0.20	0.31	0.42	0.15	0.23	0.17
N3	0.22	0.23	0.20	0.18	0.25	0.19	0.28	0.18	0.30	0.26	0.28	0.19	0.22	0.28	0.24	0.16	0.32	0.25	0.28	0.33	0.16	0.18	0.15
O2	0.23	0.26	0.22	0.20	0.26	0.21	0.29	0.20	0.33	0.26	0.31	0.24	0.25	0.29	0.24	0.16	0.33	0.27	0.29	0.36	0.17	0.20	0.16
O2'	0.73	0.88	0.56	0.55	0.90	0.71	1.03	0.79	1.14	0.93	1.09	0.70	0.79	1.03	0.85	0.44	0.58	0.83	0.92	1.21	0.83	0.86	0.89
O3'	0.39	0.47	0.36	0.37	0.40	0.38	0.37	0.37	0.38	0.34	0.45	0.52	0.45	0.33	0.38	0.45	0.50	0.39	0.31	0.36	0.36	0.43	0.35
O4	0.23	0.23	0.15	0.16	0.23	0.17	0.25	0.15	0.26	0.24	0.25	0.23	0.23	0.26	0.23	0.25	0.33	0.23	0.27	0.28	0.16	0.18	0.13
O4'	0.20	0.17	0.22	0.23	0.20	0.21	0.27	0.24	0.30	0.27	0.23	0.21	0.17	0.31	0.22	0.37	0.30	0.21	0.29	0.37	0.27	0.38	0.27
O5'	0.39	0.41	0.41	0.37	0.37	0.36	0.32	0.35	0.33	0.31	0.36	0.44	0.42	0.29	0.36	0.68	0.48	0.36	0.36	0.36	0.29	0.31	0.27
OP1	0.34	0.21	0.40	0.30	0.27	0.32	0.28	0.36	0.23	0.38	0.17	0.24	0.24	0.38	0.33	0.70	0.40	0.32	0.50	0.29	0.34	0.34	0.36
OP2	0.38	0.29	0.42	0.31	0.35	0.33	0.37	0.32	0.37	0.40	0.31	0.27	0.32	0.42	0.38	0.74	0.42	0.35	0.49	0.44	0.26	0.25	0.29
P	0.29	0.19	0.34	0.24	0.23	0.25	0.25	0.25	0.24	0.30	0.18	0.22	0.22	0.31	0.27	0.68	0.36	0.26	0.42	0.32	0.21	0.19	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.14	0.02	0.08	0.27	0.08
C2	0.03	0.00	0.14	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.24	0.08	0.16	0.01	0.06	0.24	0.08
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.12	0.05	0.13	0.10	0.19	0.15	0.10	0.03	0.00	0.03	0.02	0.30	0.06	0.28	0.28	0.21
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.07	0.10	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.15	0.06	0.14	0.20	0.05
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.18	0.04	0.17	0.01	0.07	0.25	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.24	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.15	0.02	0.20	0.01	0.10	0.23	0.10
C5'	0.03	0.06	0.12	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.07	0.04	0.04	0.12	0.03	0.01	0.06	0.11	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.17	0.04	0.20	0.00	0.10	0.21	0.10
C8	0.01	0.01	0.13	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.08	0.05	0.22	0.02	0.11	0.25	0.12
N1	0.03	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.06	0.18	0.01	0.08	0.22	0.09
N2	0.04	0.00	0.19	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.27	0.09	0.14	0.03	0.06	0.25	0.08
N3	0.03	0.00	0.15	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.23	0.08	0.15	0.01	0.06	0.25	0.08
N7	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.09	0.04	0.23	0.02	0.12	0.22	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.14	0.01	0.18	0.02	0.07	0.26	0.09
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.10	0.13	0.17	0.04	0.17	0.23	0.14	0.23	0.15	0.24	0.11	0.00	0.06	0.09	0.27	0.20	0.25	0.31	0.18
O3'	0.17	0.24	0.03	0.01	0.18	0.02	0.15	0.12	0.17	0.08	0.21	0.27	0.23	0.09	0.14	0.06	0.00	0.11	0.12	0.16	0.13	0.23	0.10
O4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.09	0.08	0.04	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.03	0.09	0.31	0.14
O5'	0.14	0.16	0.30	0.15	0.17	0.02	0.20	0.01	0.20	0.22	0.18	0.14	0.15	0.23	0.18	0.27	0.12	0.06	0.00	0.21	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.20	0.16	0.03	0.21	0.00	0.11	0.20	0.11
OP1	0.08	0.06	0.28	0.14	0.07	0.09	0.10	0.11	0.10	0.11	0.08	0.06	0.06	0.12	0.07	0.25	0.13	0.09	0.03	0.11	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.24	0.28	0.20	0.25	0.24	0.23	0.18	0.21	0.25	0.22	0.25	0.25	0.22	0.26	0.31	0.23	0.31	0.02	0.20	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.08	0.21	0.05	0.09	0.06	0.10	0.02	0.10	0.12	0.09	0.08	0.08	0.13	0.09	0.18	0.10	0.14	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00