Doublet Group distance statistics: 50803

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 1, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.015
O4	A	0, 0.019, 0.075, 0.130, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.075 std_dev=0.056
C2'	A	0, 0.138, 0.308, 0.478, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.308 std_dev=0.170
C4	B	0, 0.146, 0.331, 0.516, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.331 std_dev=0.185
O4'	A	0, 0.130, 0.318, 0.506, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.318 std_dev=0.188
N9	B	0, 0.199, 0.391, 0.582, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.391 std_dev=0.192
N3	B	0, 0.161, 0.382, 0.602, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.382 std_dev=0.221
C4'	A	0, 0.198, 0.423, 0.648, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.423 std_dev=0.225
C8	B	0, 0.308, 0.543, 0.777, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.543 std_dev=0.234
C5	B	0, 0.249, 0.484, 0.718, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.484 std_dev=0.235
N7	B	0, 0.322, 0.577, 0.832, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.577 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.199, 0.507, 0.816, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.507 std_dev=0.308
C2	B	0, 0.256, 0.572, 0.888, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.572 std_dev=0.316
C6	B	0, 0.325, 0.657, 0.988, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.657 std_dev=0.331
N1	B	0, 0.325, 0.687, 1.049, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.687 std_dev=0.362
N2	B	0, 0.334, 0.753, 1.173, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.753 std_dev=0.419
O6	B	0, 0.429, 0.849, 1.269, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.849 std_dev=0.420
O4'	B	0, 0.315, 0.737, 1.159, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.737 std_dev=0.422
O5'	A	0, 0.313, 0.762, 1.210, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.762 std_dev=0.448
C3'	A	0, 0.127, 0.626, 1.124, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.626 std_dev=0.499
C2'	B	0, 0.349, 0.856, 1.364, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.856 std_dev=0.508
P	A	0, 0.280, 0.796, 1.312, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.796 std_dev=0.516
O2'	A	0, 0.068, 0.585, 1.102, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.585 std_dev=0.517
C5'	A	0, 0.280, 0.869, 1.459, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.869 std_dev=0.589
C4'	B	0, 0.425, 1.026, 1.627, 2.178 max_d=2.178 avg_d=1.026 std_dev=0.601
O2'	B	0, 0.382, 1.006, 1.629, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.006 std_dev=0.623
OP1	A	0, 0.209, 0.836, 1.462, 2.041 max_d=2.041 avg_d=0.836 std_dev=0.627
C3'	B	0, 0.417, 1.067, 1.716, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.067 std_dev=0.649
OP2	A	0, 0.163, 0.842, 1.521, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.842 std_dev=0.679
O3'	B	0, 0.311, 1.100, 1.889, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.100 std_dev=0.789
C5'	B	0, 0.583, 1.390, 2.196, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.390 std_dev=0.806
O3'	A	0, 0.051, 1.000, 1.950, 2.844 max_d=2.844 avg_d=1.000 std_dev=0.949
O5'	B	0, 0.123, 1.196, 2.270, 3.383 max_d=3.383 avg_d=1.196 std_dev=1.074
OP2	B	0, 0.265, 1.863, 3.460, 4.988 max_d=4.988 avg_d=1.863 std_dev=1.597
P	B	0, 0.110, 1.712, 3.314, 4.888 max_d=4.888 avg_d=1.712 std_dev=1.602
OP1	B	0, 0.376, 2.194, 4.012, 5.853 max_d=5.853 avg_d=2.194 std_dev=1.818

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.26	0.02	0.00	0.09	0.08	0.46	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.24	0.01	0.03	0.22	0.13	0.39	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.18	0.04	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.03	0.02	0.10	0.15	0.52	0.15
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.24	0.00	0.32	0.02	0.30	0.14	0.13	0.10	0.01	0.01	0.25	0.01	0.30	0.23	0.13	0.17
C4	0.02	0.00	0.02	0.24	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.05	0.00	0.03	0.33	0.20	0.33	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.05	0.05	0.02	0.24	0.03	0.08	0.00	0.01	0.06	0.33	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.18	0.01	0.05	0.35	0.20	0.33	0.18
C5'	0.07	0.07	0.18	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.07	0.06	0.17	0.13	0.01	0.01	0.07	0.31	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.30	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.15	0.01	0.05	0.30	0.16	0.39	0.13
N1	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.10	0.02	0.01	0.22	0.12	0.41	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.14	0.01	0.03	0.28	0.17	0.36	0.16
O2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.37	0.44	0.01	0.06	0.17	0.11	0.41	0.10
O2'	0.02	0.31	0.01	0.01	0.28	0.24	0.18	0.06	0.12	0.16	0.33	0.37	0.00	0.04	0.30	0.16	0.22	0.11	0.48	0.04
O3'	0.26	0.24	0.03	0.01	0.05	0.03	0.18	0.17	0.15	0.10	0.14	0.44	0.04	0.00	0.08	0.18	0.33	0.49	0.07	0.30
O4	0.02	0.01	0.03	0.25	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.30	0.08	0.00	0.04	0.35	0.23	0.31	0.22
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.16	0.18	0.04	0.00	0.05	0.06	0.45	0.14
O5'	0.09	0.22	0.10	0.30	0.33	0.01	0.35	0.01	0.30	0.22	0.28	0.17	0.22	0.33	0.35	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.08	0.13	0.15	0.23	0.20	0.06	0.20	0.07	0.16	0.12	0.17	0.11	0.11	0.49	0.23	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.39	0.52	0.13	0.33	0.33	0.33	0.31	0.39	0.41	0.36	0.41	0.48	0.07	0.31	0.45	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.11	0.15	0.17	0.19	0.05	0.18	0.01	0.13	0.10	0.16	0.10	0.04	0.30	0.22	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.14	0.26	0.24	0.12	0.15	0.09	0.25	0.14	0.15	0.16	0.17	0.13	0.11	0.15	0.39	0.38	0.12	0.73	0.18	0.51	0.67	0.70
C2	0.22	0.08	0.31	0.32	0.10	0.20	0.10	0.22	0.13	0.15	0.11	0.13	0.09	0.14	0.15	0.42	0.50	0.16	0.59	0.22	0.44	0.53	0.59
C2'	0.20	0.18	0.24	0.20	0.16	0.12	0.15	0.23	0.18	0.18	0.20	0.20	0.16	0.15	0.18	0.37	0.33	0.13	0.83	0.22	0.68	0.78	0.84
C3'	0.59	0.29	0.66	0.61	0.44	0.53	0.37	0.50	0.23	0.56	0.23	0.27	0.40	0.46	0.55	0.74	0.70	0.53	0.44	0.17	0.28	0.46	0.43
C4	0.28	0.13	0.40	0.42	0.11	0.31	0.11	0.29	0.16	0.15	0.17	0.15	0.11	0.12	0.17	0.49	0.60	0.24	0.34	0.20	0.31	0.27	0.32
C4'	0.24	0.13	0.31	0.26	0.14	0.19	0.11	0.30	0.14	0.19	0.15	0.14	0.14	0.13	0.20	0.47	0.37	0.16	0.72	0.20	0.48	0.67	0.67
C5	0.28	0.13	0.38	0.40	0.11	0.30	0.09	0.33	0.13	0.15	0.15	0.16	0.13	0.11	0.18	0.44	0.54	0.25	0.35	0.16	0.25	0.25	0.29
C5'	0.13	0.23	0.18	0.10	0.20	0.15	0.28	0.37	0.34	0.22	0.30	0.22	0.18	0.30	0.17	0.41	0.19	0.13	0.91	0.40	0.62	0.83	0.83
C6	0.24	0.12	0.32	0.32	0.11	0.24	0.07	0.30	0.12	0.14	0.13	0.14	0.12	0.08	0.16	0.42	0.46	0.20	0.50	0.17	0.28	0.37	0.42
N1	0.22	0.11	0.30	0.29	0.10	0.19	0.06	0.25	0.10	0.14	0.12	0.14	0.11	0.10	0.16	0.40	0.45	0.16	0.61	0.17	0.40	0.52	0.58
N3	0.24	0.07	0.35	0.37	0.11	0.25	0.12	0.23	0.17	0.15	0.15	0.11	0.08	0.14	0.16	0.46	0.56	0.20	0.47	0.24	0.38	0.40	0.47
O2	0.21	0.09	0.30	0.30	0.11	0.17	0.13	0.20	0.16	0.16	0.12	0.14	0.10	0.17	0.15	0.42	0.49	0.15	0.67	0.25	0.53	0.64	0.70
O2'	0.13	0.44	0.12	0.08	0.26	0.11	0.28	0.23	0.44	0.14	0.49	0.49	0.33	0.17	0.16	0.24	0.20	0.15	0.98	0.53	0.83	0.88	0.99
O3'	0.77	0.30	0.81	0.81	0.56	0.80	0.51	0.83	0.29	0.82	0.23	0.23	0.45	0.71	0.73	0.79	0.86	0.80	0.22	0.21	0.25	0.35	0.16
O4	0.32	0.16	0.44	0.48	0.15	0.38	0.13	0.33	0.16	0.17	0.19	0.20	0.15	0.13	0.21	0.55	0.68	0.30	0.24	0.19	0.37	0.21	0.24
O4'	0.17	0.13	0.22	0.19	0.10	0.14	0.11	0.30	0.16	0.14	0.16	0.15	0.11	0.12	0.13	0.39	0.32	0.10	0.77	0.21	0.51	0.70	0.71
O5'	0.46	0.27	0.53	0.47	0.33	0.42	0.24	0.47	0.18	0.35	0.21	0.28	0.34	0.24	0.40	0.66	0.54	0.41	0.40	0.15	0.26	0.40	0.33
OP1	0.28	0.29	0.28	0.20	0.32	0.30	0.37	0.49	0.38	0.37	0.34	0.26	0.27	0.41	0.32	0.48	0.21	0.29	0.84	0.42	0.49	0.62	0.65
OP2	0.23	0.49	0.15	0.19	0.50	0.19	0.64	0.43	0.67	0.55	0.59	0.43	0.42	0.68	0.42	0.44	0.28	0.20	0.55	0.73	0.20	0.31	0.33
P	0.14	0.20	0.17	0.09	0.21	0.16	0.28	0.41	0.31	0.25	0.26	0.18	0.17	0.32	0.18	0.44	0.17	0.11	0.64	0.36	0.29	0.45	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.08	0.12	0.09	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.40	0.04	0.49	0.24	0.38
C2	0.10	0.00	0.16	0.15	0.02	0.13	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.26	0.34	0.14	0.50	0.03	0.62	0.47	0.60
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.07	0.03	0.09	0.06	0.14	0.20	0.15	0.04	0.03	0.00	0.08	0.01	0.32	0.08	0.21	0.39	0.27
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.05	0.12	0.20	0.14	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.24	0.06	0.14	0.33	0.15
C4	0.04	0.02	0.09	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.21	0.07	0.64	0.01	0.68	0.49	0.67
C4'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.12	0.09	0.19	0.13	0.10	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.42	0.19	0.11
C5	0.03	0.01	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.17	0.03	0.82	0.01	0.82	0.68	0.86
C5'	0.03	0.09	0.03	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.13	0.22	0.09	0.13	0.08	0.22	0.11	0.03	0.02	0.01	0.01	0.17	0.34	0.31	0.01
C6	0.05	0.02	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.13	0.22	0.05	0.82	0.01	0.85	0.74	0.90
C8	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.08	0.89	0.02	0.79	0.62	0.83
N1	0.08	0.01	0.14	0.12	0.03	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.21	0.29	0.10	0.67	0.02	0.75	0.62	0.77
N2	0.12	0.00	0.20	0.20	0.02	0.19	0.01	0.13	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.33	0.40	0.18	0.38	0.05	0.54	0.40	0.50
N3	0.09	0.01	0.15	0.14	0.00	0.13	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.24	0.31	0.13	0.45	0.02	0.56	0.38	0.52
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.10	0.06	0.96	0.02	0.89	0.78	0.96
N9	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.00	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.04	0.13	0.01	0.65	0.02	0.65	0.43	0.62
O2'	0.02	0.26	0.00	0.03	0.12	0.02	0.09	0.03	0.13	0.13	0.21	0.33	0.24	0.11	0.04	0.00	0.13	0.01	0.30	0.12	0.15	0.44	0.26
O3'	0.13	0.34	0.08	0.01	0.21	0.01	0.17	0.02	0.22	0.07	0.29	0.40	0.31	0.10	0.13	0.13	0.00	0.06	0.27	0.20	0.28	0.28	0.15
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.10	0.18	0.13	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.40	0.04	0.64	0.11	0.42
O5'	0.40	0.50	0.32	0.24	0.64	0.01	0.82	0.01	0.82	0.89	0.67	0.38	0.45	0.96	0.65	0.30	0.27	0.40	0.00	0.92	0.02	0.01	0.01
O6	0.04	0.03	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.12	0.20	0.04	0.92	0.00	0.95	0.86	1.01
OP1	0.49	0.62	0.21	0.14	0.68	0.42	0.82	0.34	0.85	0.79	0.75	0.54	0.56	0.89	0.65	0.15	0.28	0.64	0.02	0.95	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.47	0.39	0.33	0.49	0.19	0.68	0.31	0.74	0.62	0.62	0.40	0.38	0.78	0.43	0.44	0.28	0.11	0.01	0.86	0.01	0.00	0.00
P	0.38	0.60	0.27	0.15	0.67	0.11	0.86	0.01	0.90	0.83	0.77	0.50	0.52	0.96	0.62	0.26	0.15	0.42	0.01	1.01	0.01	0.00	0.00