Doublet Group distance statistics: 50805

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.017, 0.029, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.019, 0.039, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.039 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.020, 0.072, 0.124, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.072 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.075, 0.210, 0.345, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.210 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.081, 0.229, 0.378, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.229 std_dev=0.149
O2'	A	0, 0.124, 0.304, 0.484, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.304 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.207, 0.422, 0.638, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.422 std_dev=0.215
C3'	A	0, 0.163, 0.397, 0.632, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.397 std_dev=0.235
N3	B	0, 0.345, 0.690, 1.035, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.690 std_dev=0.345
C5'	A	0, 0.369, 0.730, 1.091, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.730 std_dev=0.361
C1'	B	0, 0.427, 0.789, 1.150, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.789 std_dev=0.361
O3'	A	0, 0.260, 0.636, 1.012, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.636 std_dev=0.376
C2	B	0, 0.423, 0.807, 1.192, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.807 std_dev=0.385
C4	B	0, 0.543, 0.940, 1.336, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.940 std_dev=0.396
N2	B	0, 0.501, 0.899, 1.297, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.899 std_dev=0.398
C3'	B	0, 0.329, 0.742, 1.155, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.742 std_dev=0.413
C4'	B	0, 0.347, 0.777, 1.207, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.777 std_dev=0.430
O3'	B	0, 0.262, 0.698, 1.134, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.698 std_dev=0.436
C2'	B	0, 0.477, 0.922, 1.368, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.922 std_dev=0.445
N1	B	0, 0.585, 1.045, 1.505, 1.391 max_d=1.391 avg_d=1.045 std_dev=0.460
N9	B	0, 0.563, 1.028, 1.493, 1.430 max_d=1.430 avg_d=1.028 std_dev=0.465
O4'	B	0, 0.381, 0.859, 1.337, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.859 std_dev=0.478
C5'	B	0, 0.549, 1.092, 1.635, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.092 std_dev=0.543
C5	B	0, 0.700, 1.292, 1.885, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.292 std_dev=0.592
C6	B	0, 0.730, 1.337, 1.944, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.337 std_dev=0.607
O5'	B	0, 0.794, 1.438, 2.082, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.438 std_dev=0.644
OP2	B	0, 0.861, 1.514, 2.166, 2.015 max_d=2.015 avg_d=1.514 std_dev=0.652
P	B	0, 0.817, 1.486, 2.155, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.486 std_dev=0.669
O2'	B	0, 0.349, 1.031, 1.713, 2.381 max_d=2.381 avg_d=1.031 std_dev=0.682
C8	B	0, 0.711, 1.443, 2.174, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.443 std_dev=0.732
OP1	B	0, 0.808, 1.540, 2.272, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.540 std_dev=0.732
O6	B	0, 0.857, 1.648, 2.438, 2.458 max_d=2.458 avg_d=1.648 std_dev=0.790
N7	B	0, 0.794, 1.607, 2.420, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.607 std_dev=0.813
O5'	A	0, 0.875, 1.713, 2.552, 2.771 max_d=2.771 avg_d=1.713 std_dev=0.839
P	A	0, 0.960, 2.202, 3.444, 3.930 max_d=3.930 avg_d=2.202 std_dev=1.242
OP2	A	0, 0.933, 2.183, 3.432, 3.911 max_d=3.911 avg_d=2.183 std_dev=1.249
OP1	A	0, 1.541, 3.290, 5.039, 5.605 max_d=5.605 avg_d=3.290 std_dev=1.749

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.09	0.20	0.15
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.02	0.04	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.01	0.16	0.07	0.25	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.01	0.04	0.03	0.09	0.12	0.00	0.02	0.10	0.01	0.14	0.10	0.19	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.01	0.07	0.06	0.12	0.12	0.01	0.00	0.14	0.02	0.18	0.22	0.19	0.13
C4	0.04	0.02	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.15	0.01	0.04	0.22	0.20	0.34	0.20
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.02	0.07	0.00	0.01	0.10	0.13	0.10
C5	0.04	0.03	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.12	0.02	0.06	0.22	0.21	0.33	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.05	0.07	0.05	0.12	0.01	0.01	0.15	0.12	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.06	0.19	0.11	0.24	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02	0.15	0.05	0.22	0.11
N3	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.03	0.02	0.20	0.15	0.31	0.16
O2	0.02	0.01	0.12	0.12	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.09	0.14	0.04	0.03	0.14	0.05	0.23	0.11
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.07	0.06	0.05	0.07	0.04	0.02	0.07	0.09	0.00	0.03	0.08	0.03	0.05	0.13	0.13	0.11
O3'	0.02	0.12	0.02	0.00	0.15	0.02	0.12	0.05	0.09	0.05	0.15	0.14	0.03	0.00	0.18	0.01	0.16	0.31	0.22	0.17
O4	0.04	0.04	0.10	0.14	0.01	0.07	0.02	0.12	0.01	0.04	0.03	0.04	0.08	0.18	0.00	0.06	0.23	0.24	0.38	0.24
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.11	0.22	0.26	0.25
O5'	0.08	0.16	0.14	0.18	0.22	0.01	0.22	0.01	0.19	0.15	0.20	0.14	0.05	0.16	0.23	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.07	0.10	0.22	0.20	0.10	0.21	0.15	0.11	0.05	0.15	0.05	0.13	0.31	0.24	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.25	0.19	0.19	0.34	0.13	0.33	0.12	0.24	0.22	0.31	0.23	0.13	0.22	0.38	0.26	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.11	0.09	0.13	0.20	0.10	0.21	0.02	0.13	0.11	0.16	0.11	0.11	0.17	0.24	0.25	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.08	0.15	0.18	0.11	0.18	0.21	0.22	0.25	0.20	0.14	0.24	0.12	0.26	0.14	0.28	0.45	0.21	0.29	0.35	0.18	0.24	0.14
C2	0.17	0.13	0.16	0.13	0.20	0.18	0.30	0.20	0.34	0.28	0.27	0.12	0.11	0.34	0.20	0.11	0.41	0.23	0.24	0.39	0.21	0.33	0.19
C2'	0.22	0.16	0.13	0.21	0.11	0.23	0.12	0.28	0.16	0.12	0.09	0.31	0.19	0.16	0.14	0.26	0.51	0.27	0.36	0.25	0.18	0.18	0.12
C3'	0.35	0.34	0.30	0.34	0.26	0.34	0.16	0.41	0.12	0.19	0.19	0.46	0.35	0.15	0.27	0.46	0.61	0.36	0.51	0.15	0.27	0.10	0.23
C4	0.19	0.21	0.16	0.16	0.31	0.18	0.42	0.18	0.44	0.38	0.35	0.11	0.16	0.45	0.28	0.16	0.44	0.21	0.22	0.48	0.21	0.37	0.21
C4'	0.33	0.29	0.33	0.34	0.23	0.32	0.16	0.38	0.12	0.20	0.15	0.41	0.31	0.19	0.25	0.52	0.55	0.31	0.46	0.18	0.29	0.20	0.25
C5	0.20	0.14	0.20	0.24	0.24	0.21	0.42	0.21	0.46	0.35	0.33	0.13	0.10	0.46	0.22	0.46	0.49	0.20	0.25	0.53	0.18	0.30	0.15
C5'	0.45	0.39	0.51	0.48	0.35	0.44	0.27	0.50	0.21	0.31	0.26	0.47	0.42	0.28	0.37	0.71	0.62	0.40	0.58	0.21	0.42	0.34	0.40
C6	0.21	0.11	0.22	0.24	0.17	0.21	0.33	0.22	0.41	0.27	0.28	0.19	0.12	0.38	0.17	0.44	0.48	0.20	0.27	0.50	0.17	0.26	0.13
N1	0.18	0.08	0.14	0.17	0.15	0.18	0.28	0.20	0.34	0.25	0.23	0.18	0.10	0.32	0.16	0.26	0.45	0.20	0.26	0.42	0.18	0.28	0.14
N3	0.18	0.20	0.21	0.13	0.27	0.18	0.36	0.19	0.39	0.33	0.32	0.13	0.16	0.39	0.25	0.11	0.41	0.23	0.23	0.43	0.23	0.37	0.22
O2	0.17	0.14	0.19	0.13	0.19	0.19	0.27	0.21	0.30	0.26	0.24	0.12	0.12	0.31	0.19	0.14	0.40	0.24	0.25	0.35	0.23	0.34	0.20
O2'	0.18	0.14	0.10	0.16	0.10	0.19	0.12	0.24	0.14	0.12	0.09	0.26	0.15	0.15	0.12	0.19	0.45	0.25	0.33	0.20	0.16	0.19	0.10
O3'	0.42	0.44	0.35	0.40	0.37	0.42	0.29	0.51	0.26	0.30	0.35	0.53	0.43	0.26	0.36	0.47	0.67	0.45	0.61	0.20	0.34	0.14	0.32
O4	0.23	0.23	0.24	0.15	0.35	0.20	0.44	0.20	0.43	0.44	0.34	0.13	0.21	0.48	0.34	0.04	0.44	0.23	0.24	0.46	0.26	0.43	0.27
O4'	0.24	0.14	0.24	0.26	0.13	0.23	0.19	0.28	0.22	0.22	0.07	0.29	0.18	0.27	0.18	0.44	0.47	0.23	0.35	0.33	0.25	0.25	0.21
O5'	0.56	0.58	0.62	0.59	0.51	0.56	0.41	0.58	0.39	0.41	0.47	0.62	0.59	0.37	0.50	0.79	0.68	0.52	0.62	0.35	0.45	0.38	0.44
OP1	0.83	0.84	0.85	0.81	0.87	0.87	0.91	0.92	0.91	0.87	0.86	0.79	0.84	0.91	0.86	0.90	0.76	0.86	0.96	0.91	0.87	0.90	0.91
OP2	0.93	0.86	0.92	0.89	0.96	0.95	0.94	0.96	0.84	0.92	0.81	0.79	0.92	0.92	0.95	0.95	0.83	0.96	0.97	0.74	0.82	0.82	0.87
P	0.76	0.72	0.80	0.76	0.77	0.79	0.76	0.83	0.72	0.75	0.69	0.68	0.75	0.76	0.77	0.88	0.73	0.77	0.87	0.68	0.77	0.77	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.21	0.01	0.19	0.02	0.13	0.29	0.11
C2	0.03	0.00	0.12	0.03	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.26	0.13	0.27	0.02	0.09	0.27	0.11
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.19	0.05	0.13	0.07	0.16	0.12	0.10	0.03	0.00	0.04	0.02	0.36	0.07	0.45	0.17	0.28
C3'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.27	0.14	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.22	0.07	0.28	0.02	0.10	0.27	0.10
C4'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.07	0.11	0.08	0.05	0.02	0.11	0.02	0.01	0.03	0.05	0.14	0.25	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.04	0.31	0.01	0.10	0.25	0.11
C5'	0.08	0.14	0.19	0.03	0.15	0.01	0.17	0.00	0.17	0.19	0.16	0.14	0.13	0.20	0.14	0.09	0.12	0.02	0.02	0.18	0.17	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.23	0.06	0.32	0.01	0.11	0.25	0.12
C8	0.01	0.01	0.13	0.03	0.02	0.05	0.02	0.19	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.14	0.08	0.32	0.04	0.09	0.24	0.09
N1	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.25	0.10	0.30	0.01	0.10	0.27	0.11
N2	0.05	0.01	0.16	0.05	0.01	0.11	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.27	0.16	0.24	0.03	0.09	0.28	0.11
N3	0.03	0.00	0.12	0.03	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.26	0.13	0.25	0.02	0.10	0.28	0.10
N7	0.01	0.01	0.10	0.02	0.00	0.05	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.15	0.06	0.32	0.03	0.10	0.23	0.11
N9	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.19	0.01	0.27	0.02	0.10	0.28	0.09
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.08	0.11	0.14	0.09	0.13	0.24	0.12	0.28	0.20	0.23	0.09	0.00	0.05	0.05	0.34	0.17	0.51	0.28	0.32
O3'	0.21	0.26	0.04	0.01	0.22	0.02	0.20	0.12	0.23	0.14	0.25	0.27	0.26	0.15	0.19	0.05	0.00	0.16	0.09	0.22	0.16	0.17	0.08
O4'	0.01	0.13	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.16	0.13	0.06	0.01	0.05	0.16	0.00	0.06	0.06	0.11	0.50	0.28
O5'	0.19	0.27	0.36	0.05	0.28	0.03	0.31	0.02	0.32	0.32	0.30	0.24	0.25	0.32	0.27	0.34	0.09	0.06	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.03	0.02	0.05	0.01	0.18	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.17	0.22	0.06	0.33	0.00	0.13	0.24	0.13
OP1	0.13	0.09	0.45	0.27	0.10	0.14	0.10	0.17	0.11	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.51	0.16	0.11	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.27	0.17	0.14	0.27	0.25	0.25	0.08	0.25	0.24	0.27	0.28	0.28	0.23	0.28	0.28	0.17	0.50	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.11	0.28	0.06	0.10	0.09	0.11	0.02	0.12	0.09	0.11	0.11	0.10	0.11	0.09	0.32	0.08	0.28	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00