Doublet Group distance statistics: 50806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.012, 0.026, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.016, 0.034, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.018
O2	A	0, -0.002, 0.033, 0.068, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.033 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.011, 0.079, 0.148, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.079 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.066, 0.136, 0.206, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.136 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.052, 0.128, 0.203, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.128 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.089, 0.181, 0.273, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.181 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.069, 0.166, 0.263, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.166 std_dev=0.097
P	A	0, 0.101, 0.203, 0.306, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.203 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.096, 0.200, 0.304, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.200 std_dev=0.104
OP2	A	0, 0.125, 0.234, 0.343, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.234 std_dev=0.109
O3'	A	0, 0.110, 0.221, 0.333, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.221 std_dev=0.112
O3'	B	0, 0.065, 0.181, 0.298, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.181 std_dev=0.116
C3'	B	0, 0.073, 0.193, 0.312, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.193 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.094, 0.218, 0.343, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.218 std_dev=0.124
C2'	B	0, 0.124, 0.251, 0.377, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.251 std_dev=0.126
OP1	A	0, 0.086, 0.215, 0.344, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.215 std_dev=0.129
C5'	A	0, 0.110, 0.247, 0.385, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.247 std_dev=0.138
O2'	B	0, 0.139, 0.282, 0.425, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.282 std_dev=0.143
N9	B	0, 0.152, 0.316, 0.481, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.316 std_dev=0.165
C4'	B	0, 0.095, 0.267, 0.439, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.267 std_dev=0.172
C1'	B	0, 0.134, 0.312, 0.491, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.312 std_dev=0.178
C8	B	0, 0.166, 0.346, 0.527, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.346 std_dev=0.181
C4	B	0, 0.141, 0.327, 0.513, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.327 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.171, 0.371, 0.571, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.371 std_dev=0.200
O5'	B	0, 0.211, 0.414, 0.617, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.414 std_dev=0.203
O4'	B	0, 0.157, 0.360, 0.564, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.360 std_dev=0.204
N7	B	0, 0.154, 0.373, 0.592, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.373 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.118, 0.341, 0.565, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.341 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.178, 0.408, 0.637, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.408 std_dev=0.229
N1	B	0, 0.163, 0.406, 0.649, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.406 std_dev=0.243
C6	B	0, 0.136, 0.383, 0.630, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.383 std_dev=0.247
O6	B	0, 0.178, 0.433, 0.687, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.433 std_dev=0.255
N2	B	0, 0.217, 0.485, 0.753, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.485 std_dev=0.268
P	B	0, 0.265, 0.646, 1.026, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.646 std_dev=0.380
C5'	B	0, 0.066, 0.504, 0.942, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.504 std_dev=0.438
OP2	B	0, 0.125, 1.268, 2.411, 3.320 max_d=3.320 avg_d=1.268 std_dev=1.143
OP1	B	0, 0.217, 1.363, 2.509, 3.115 max_d=3.115 avg_d=1.363 std_dev=1.146

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.07	0.06	0.02	0.05	0.15	0.05	0.08
C2	0.04	0.00	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.04	0.05	0.11	0.05	0.05
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.08	0.10	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.12	0.06	0.07
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.11	0.05	0.06
C4	0.05	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.10	0.01	0.08	0.09	0.09	0.08	0.07
C4'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.04	0.12	0.02	0.06
C5	0.04	0.01	0.05	0.05	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.02	0.09	0.11	0.09	0.09	0.08
C5'	0.02	0.04	0.04	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.10	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03
C6	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.08	0.02	0.09	0.09	0.09	0.07	0.05
N1	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.03	0.05	0.05	0.11	0.05	0.05
N3	0.05	0.01	0.08	0.06	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06
O2	0.04	0.01	0.10	0.08	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.03	0.04	0.04	0.12	0.05	0.06
O2'	0.07	0.10	0.01	0.04	0.13	0.02	0.11	0.04	0.09	0.06	0.13	0.11	0.00	0.12	0.14	0.03	0.06	0.11	0.06	0.06
O3'	0.07	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.08	0.03	0.08	0.08	0.11	0.12	0.12	0.00	0.11	0.07	0.06	0.12	0.03	0.07
O4	0.06	0.02	0.07	0.06	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.03	0.02	0.03	0.14	0.11	0.00	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09
O4'	0.02	0.04	0.03	0.02	0.08	0.01	0.09	0.03	0.09	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.09	0.00	0.07	0.21	0.08	0.13
O5'	0.05	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.11	0.02	0.09	0.05	0.07	0.04	0.06	0.06	0.11	0.07	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.15	0.11	0.12	0.11	0.09	0.12	0.09	0.06	0.09	0.11	0.09	0.12	0.11	0.12	0.09	0.21	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.02	0.09	0.03	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.09	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.19	0.11	0.17	0.18	0.19	0.49	0.18	0.21	0.17	0.15	0.17	0.21	0.18	0.19	0.09	0.16	0.13	0.17	0.65	0.91	0.11
C2	0.13	0.14	0.15	0.05	0.15	0.13	0.17	0.50	0.17	0.17	0.16	0.13	0.14	0.19	0.14	0.17	0.04	0.11	0.17	0.18	0.95	0.81	0.12
C2'	0.17	0.17	0.17	0.12	0.18	0.22	0.19	0.49	0.18	0.22	0.18	0.16	0.18	0.22	0.18	0.15	0.09	0.17	0.13	0.17	0.57	0.95	0.14
C3'	0.15	0.15	0.16	0.11	0.16	0.18	0.18	0.36	0.17	0.21	0.17	0.14	0.16	0.21	0.17	0.13	0.08	0.15	0.15	0.17	0.22	1.04	0.27
C4	0.11	0.12	0.10	0.05	0.11	0.12	0.11	0.49	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.11	0.15	0.05	0.10	0.20	0.11	0.90	0.58	0.16
C4'	0.16	0.16	0.18	0.11	0.18	0.14	0.19	0.32	0.18	0.24	0.17	0.15	0.17	0.23	0.19	0.16	0.08	0.14	0.16	0.18	0.18	0.97	0.28
C5	0.12	0.11	0.11	0.06	0.11	0.12	0.11	0.48	0.10	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.13	0.16	0.05	0.10	0.19	0.10	0.74	0.53	0.14
C5'	0.11	0.10	0.12	0.07	0.12	0.10	0.14	0.23	0.13	0.19	0.12	0.09	0.10	0.17	0.14	0.11	0.05	0.10	0.16	0.13	0.29	0.82	0.31
C6	0.12	0.12	0.14	0.03	0.13	0.13	0.13	0.50	0.13	0.16	0.13	0.12	0.13	0.15	0.14	0.17	0.03	0.09	0.15	0.12	0.67	0.61	0.10
N1	0.13	0.14	0.16	0.05	0.15	0.14	0.17	0.51	0.16	0.18	0.15	0.13	0.14	0.19	0.15	0.18	0.04	0.11	0.14	0.16	0.79	0.78	0.09
N3	0.12	0.13	0.13	0.04	0.13	0.11	0.15	0.49	0.16	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.13	0.17	0.04	0.10	0.20	0.16	0.98	0.71	0.14
O2	0.14	0.15	0.16	0.07	0.16	0.14	0.19	0.49	0.19	0.18	0.17	0.14	0.15	0.20	0.16	0.18	0.06	0.13	0.17	0.20	0.99	0.91	0.12
O2'	0.22	0.27	0.20	0.13	0.27	0.22	0.29	0.49	0.28	0.31	0.28	0.26	0.26	0.32	0.26	0.18	0.10	0.22	0.09	0.27	0.85	1.08	0.08
O3'	0.16	0.18	0.17	0.12	0.18	0.20	0.21	0.37	0.21	0.22	0.20	0.16	0.18	0.23	0.18	0.13	0.09	0.17	0.17	0.21	0.30	1.12	0.27
O4	0.10	0.10	0.08	0.07	0.08	0.12	0.06	0.48	0.05	0.07	0.08	0.11	0.10	0.05	0.09	0.13	0.07	0.10	0.22	0.06	0.93	0.54	0.20
O4'	0.23	0.21	0.26	0.16	0.22	0.15	0.22	0.39	0.21	0.26	0.21	0.20	0.22	0.25	0.24	0.26	0.14	0.19	0.17	0.20	0.36	0.92	0.20
O5'	0.09	0.09	0.10	0.06	0.10	0.11	0.12	0.22	0.11	0.17	0.10	0.08	0.09	0.15	0.12	0.09	0.04	0.09	0.15	0.11	0.28	0.63	0.27
OP1	0.10	0.08	0.11	0.07	0.06	0.08	0.08	0.21	0.10	0.13	0.11	0.08	0.06	0.10	0.10	0.13	0.02	0.09	0.18	0.11	0.15	0.43	0.19
OP2	0.09	0.10	0.09	0.04	0.07	0.05	0.08	0.05	0.08	0.14	0.10	0.12	0.09	0.11	0.10	0.10	0.04	0.06	0.16	0.09	0.55	0.44	0.30
P	0.07	0.08	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.12	0.08	0.13	0.09	0.09	0.07	0.10	0.09	0.08	0.01	0.06	0.16	0.08	0.33	0.42	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.14	0.04	0.02	0.07	0.08	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.15	0.04	0.30	0.44	0.13
C2	0.07	0.00	0.07	0.05	0.02	0.07	0.01	0.28	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.08	0.10	0.19	0.01	0.71	0.42	0.17
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.11	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.18	0.07	0.11	0.21	0.03
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.09	0.04	0.08	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.03	0.19	0.04	0.13	0.11	0.12
C4	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.31	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.10	0.04	0.07	0.19	0.02	0.70	0.40	0.18
C4'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.10	0.08	0.09	0.07	0.11	0.06	0.08	0.04	0.01	0.03	0.07	0.16	0.38	0.10
C5	0.03	0.01	0.06	0.04	0.01	0.08	0.00	0.38	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.21	0.01	0.90	0.40	0.21
C5'	0.14	0.28	0.11	0.09	0.31	0.01	0.38	0.00	0.39	0.40	0.34	0.25	0.25	0.43	0.30	0.06	0.07	0.03	0.04	0.41	0.30	0.31	0.05
C6	0.04	0.01	0.07	0.04	0.02	0.07	0.01	0.39	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.13	0.06	0.08	0.21	0.02	0.97	0.42	0.22
C8	0.02	0.03	0.07	0.08	0.01	0.10	0.01	0.40	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.21	0.02	0.79	0.34	0.20
N1	0.07	0.01	0.08	0.06	0.04	0.08	0.02	0.34	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.15	0.08	0.11	0.21	0.02	0.85	0.42	0.19
N2	0.08	0.01	0.07	0.06	0.03	0.09	0.02	0.25	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.17	0.09	0.11	0.19	0.03	0.65	0.44	0.16
N3	0.07	0.01	0.06	0.05	0.01	0.07	0.01	0.25	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.14	0.07	0.10	0.19	0.01	0.60	0.42	0.15
N7	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.11	0.01	0.43	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.08	0.06	0.21	0.02	0.99	0.40	0.23
N9	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.02	0.30	0.03	0.01	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.05	0.18	0.03	0.59	0.39	0.17
O2'	0.03	0.16	0.01	0.03	0.10	0.08	0.10	0.06	0.13	0.06	0.15	0.17	0.14	0.08	0.05	0.00	0.03	0.06	0.12	0.13	0.11	0.30	0.06
O3'	0.04	0.08	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.11	0.08	0.09	0.07	0.08	0.06	0.03	0.00	0.05	0.17	0.05	0.39	0.21	0.22
O4'	0.00	0.10	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.11	0.11	0.10	0.06	0.05	0.06	0.05	0.00	0.09	0.08	0.14	0.55	0.13
O5'	0.15	0.19	0.18	0.19	0.19	0.03	0.21	0.04	0.21	0.21	0.21	0.19	0.19	0.21	0.18	0.12	0.17	0.09	0.00	0.23	0.04	0.03	0.01
O6	0.04	0.01	0.07	0.04	0.02	0.07	0.01	0.41	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.13	0.05	0.08	0.23	0.00	1.08	0.45	0.24
OP1	0.30	0.71	0.11	0.13	0.70	0.16	0.90	0.30	0.97	0.79	0.85	0.65	0.60	0.99	0.59	0.11	0.39	0.14	0.04	1.08	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.42	0.21	0.11	0.40	0.38	0.40	0.31	0.42	0.34	0.42	0.44	0.42	0.40	0.39	0.30	0.21	0.55	0.03	0.45	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.17	0.03	0.12	0.18	0.10	0.21	0.05	0.22	0.20	0.19	0.16	0.15	0.23	0.17	0.06	0.22	0.13	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00