Doublet Group distance statistics: 50807

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.032, 0.057, 0.083, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.057 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.053, 0.099, 0.144, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.099 std_dev=0.045
C3'	A	0, 0.051, 0.117, 0.182, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.117 std_dev=0.065
O4'	A	0, 0.064, 0.131, 0.198, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.131 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.045, 0.136, 0.226, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.136 std_dev=0.091
O3'	A	0, 0.144, 0.260, 0.377, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.260 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.048, 0.164, 0.280, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.164 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.139, 0.301, 0.463, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.301 std_dev=0.162
C5'	A	0, 0.212, 0.400, 0.588, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.400 std_dev=0.188
O5'	A	0, 0.381, 0.662, 0.942, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.662 std_dev=0.280
C6	B	0, 0.434, 0.757, 1.080, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.757 std_dev=0.323
N1	B	0, 0.450, 0.777, 1.104, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.777 std_dev=0.327
C5	B	0, 0.467, 0.799, 1.131, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.799 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.441, 0.777, 1.113, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.777 std_dev=0.336
O6	B	0, 0.389, 0.728, 1.068, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.728 std_dev=0.340
N7	B	0, 0.477, 0.819, 1.161, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.819 std_dev=0.342
P	A	0, 0.359, 0.702, 1.045, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.702 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.451, 0.806, 1.161, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.806 std_dev=0.355
C2	B	0, 0.469, 0.827, 1.184, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.827 std_dev=0.357
C4	B	0, 0.488, 0.850, 1.212, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.850 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.507, 0.884, 1.262, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.884 std_dev=0.377
N3	B	0, 0.482, 0.865, 1.247, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.865 std_dev=0.382
N2	B	0, 0.467, 0.856, 1.245, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.856 std_dev=0.389
OP1	A	0, 0.464, 0.857, 1.249, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.857 std_dev=0.393
N9	B	0, 0.508, 0.905, 1.302, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.905 std_dev=0.397
C3'	B	0, 0.549, 0.991, 1.432, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.991 std_dev=0.442
C1'	B	0, 0.534, 0.993, 1.453, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.993 std_dev=0.460
OP2	A	0, 0.441, 0.949, 1.457, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.949 std_dev=0.508
OP2	B	0, 0.788, 1.388, 1.988, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.388 std_dev=0.600
O5'	B	0, 0.568, 1.172, 1.775, 1.869 max_d=1.869 avg_d=1.172 std_dev=0.603
P	B	0, 0.754, 1.376, 1.997, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.376 std_dev=0.621
O3'	B	0, 0.503, 1.155, 1.806, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.155 std_dev=0.652
C4'	B	0, 0.615, 1.273, 1.932, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.273 std_dev=0.659
O4'	B	0, 0.576, 1.246, 1.916, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.246 std_dev=0.670
OP1	B	0, 0.763, 1.460, 2.158, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.460 std_dev=0.698
C5'	B	0, 0.591, 1.524, 2.457, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.524 std_dev=0.933

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.12	0.16	0.04
C2	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.12	0.09	0.26	0.08
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.12	0.18	0.03
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.16	0.17	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.14	0.17	0.33	0.14
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.16	0.12	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.13	0.19	0.31	0.14
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.04	0.02	0.02	0.10	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.11	0.15	0.27	0.11
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.10	0.09	0.24	0.07
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.14	0.11	0.31	0.11
O2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.11	0.12	0.25	0.07
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.08	0.04	0.01	0.03	0.13	0.19	0.04
O3'	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.08	0.00	0.04	0.02	0.08	0.21	0.14	0.03
O4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.16	0.19	0.34	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.17	0.05
O5'	0.08	0.12	0.04	0.03	0.14	0.02	0.13	0.01	0.11	0.10	0.14	0.11	0.03	0.08	0.16	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.09	0.12	0.16	0.17	0.16	0.19	0.10	0.15	0.09	0.11	0.12	0.13	0.21	0.19	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.26	0.18	0.17	0.33	0.12	0.31	0.16	0.27	0.24	0.31	0.25	0.19	0.14	0.34	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.03	0.04	0.14	0.03	0.14	0.01	0.11	0.07	0.11	0.07	0.04	0.03	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.10	0.16	0.19	0.09	0.17	0.07	0.24	0.05	0.13	0.09	0.13	0.09	0.12	0.12	0.21	0.50	0.15	0.29	0.06	0.13	0.22	0.13
C2	0.11	0.10	0.14	0.20	0.08	0.12	0.06	0.17	0.08	0.09	0.10	0.13	0.10	0.08	0.09	0.21	0.43	0.07	0.31	0.11	0.20	0.24	0.17
C2'	0.15	0.10	0.15	0.16	0.11	0.18	0.11	0.28	0.09	0.17	0.11	0.12	0.10	0.16	0.15	0.18	0.50	0.21	0.28	0.11	0.12	0.21	0.12
C3'	0.16	0.11	0.15	0.16	0.13	0.18	0.13	0.28	0.10	0.19	0.11	0.13	0.11	0.18	0.16	0.18	0.50	0.22	0.28	0.09	0.13	0.21	0.13
C4	0.08	0.14	0.11	0.25	0.07	0.16	0.08	0.23	0.11	0.08	0.14	0.17	0.10	0.08	0.08	0.19	0.44	0.04	0.27	0.12	0.22	0.23	0.15
C4'	0.13	0.11	0.13	0.18	0.10	0.19	0.11	0.31	0.08	0.16	0.10	0.14	0.10	0.16	0.13	0.17	0.53	0.18	0.28	0.08	0.13	0.22	0.12
C5	0.09	0.13	0.13	0.26	0.08	0.24	0.09	0.34	0.12	0.08	0.13	0.15	0.10	0.08	0.08	0.19	0.52	0.15	0.26	0.13	0.18	0.24	0.13
C5'	0.11	0.10	0.10	0.18	0.07	0.22	0.09	0.37	0.06	0.16	0.09	0.14	0.07	0.15	0.11	0.14	0.55	0.20	0.27	0.07	0.11	0.20	0.10
C6	0.11	0.10	0.14	0.23	0.07	0.23	0.07	0.34	0.10	0.09	0.12	0.12	0.08	0.08	0.09	0.19	0.53	0.17	0.27	0.13	0.15	0.24	0.13
N1	0.10	0.09	0.14	0.20	0.06	0.16	0.05	0.24	0.07	0.10	0.10	0.12	0.08	0.08	0.09	0.20	0.49	0.12	0.29	0.10	0.16	0.24	0.14
N3	0.11	0.12	0.13	0.21	0.08	0.12	0.07	0.16	0.10	0.09	0.13	0.15	0.10	0.08	0.09	0.20	0.41	0.06	0.29	0.12	0.22	0.24	0.17
O2	0.12	0.12	0.14	0.18	0.10	0.09	0.09	0.13	0.09	0.10	0.09	0.16	0.13	0.10	0.11	0.21	0.41	0.09	0.32	0.12	0.21	0.24	0.18
O2'	0.19	0.11	0.17	0.17	0.14	0.18	0.14	0.22	0.12	0.20	0.12	0.11	0.12	0.19	0.18	0.20	0.45	0.23	0.29	0.17	0.12	0.18	0.13
O3'	0.23	0.17	0.22	0.18	0.21	0.19	0.22	0.22	0.18	0.26	0.16	0.17	0.18	0.26	0.23	0.26	0.48	0.26	0.27	0.17	0.10	0.18	0.11
O4	0.10	0.16	0.07	0.25	0.10	0.15	0.10	0.22	0.13	0.11	0.16	0.20	0.13	0.10	0.10	0.16	0.41	0.04	0.26	0.13	0.25	0.23	0.16
O4'	0.12	0.10	0.14	0.19	0.08	0.18	0.07	0.29	0.04	0.13	0.09	0.14	0.08	0.12	0.11	0.19	0.53	0.15	0.28	0.05	0.13	0.23	0.13
O5'	0.17	0.07	0.19	0.29	0.12	0.32	0.13	0.46	0.09	0.20	0.06	0.08	0.09	0.18	0.17	0.20	0.67	0.27	0.22	0.08	0.10	0.22	0.09
OP1	0.16	0.08	0.11	0.17	0.12	0.28	0.15	0.49	0.14	0.21	0.11	0.09	0.07	0.21	0.16	0.12	0.64	0.27	0.17	0.18	0.26	0.29	0.19
OP2	0.20	0.29	0.21	0.19	0.21	0.16	0.17	0.29	0.19	0.14	0.26	0.35	0.27	0.13	0.18	0.28	0.37	0.09	0.50	0.16	0.29	0.21	0.31
P	0.08	0.09	0.05	0.16	0.07	0.21	0.08	0.40	0.06	0.13	0.07	0.13	0.07	0.13	0.09	0.10	0.55	0.17	0.28	0.07	0.15	0.20	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.26	0.03
C2	0.03	0.00	0.21	0.20	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.34	0.05	0.26	0.01	0.20	0.22	0.15
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.02	0.05	0.03	0.09	0.11	0.16	0.26	0.21	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.24	0.07	0.32	0.23	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.03	0.14	0.21	0.17	0.25	0.19	0.18	0.09	0.01	0.00	0.01	0.33	0.15	0.42	0.23	0.30
C4	0.02	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.24	0.03	0.27	0.00	0.19	0.22	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.07	0.09	0.07	0.13	0.06	0.07	0.04	0.00	0.03	0.11	0.14	0.24	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.27	0.03	0.36	0.01	0.26	0.25	0.23
C5'	0.05	0.11	0.03	0.03	0.14	0.01	0.21	0.00	0.22	0.24	0.17	0.09	0.09	0.27	0.14	0.06	0.16	0.01	0.01	0.26	0.11	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.14	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.30	0.04	0.38	0.00	0.28	0.28	0.27
C8	0.01	0.01	0.11	0.21	0.00	0.14	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.24	0.03	0.36	0.01	0.24	0.23	0.19
N1	0.02	0.00	0.16	0.17	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.33	0.05	0.33	0.01	0.25	0.25	0.22
N2	0.03	0.00	0.26	0.25	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.38	0.06	0.23	0.02	0.18	0.22	0.13
N3	0.03	0.00	0.21	0.19	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.29	0.04	0.21	0.01	0.17	0.21	0.10
N7	0.00	0.00	0.07	0.18	0.00	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.27	0.02	0.42	0.01	0.29	0.26	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.23	0.01	0.17	0.22	0.10
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.13	0.07	0.08	0.06	0.13	0.08	0.21	0.33	0.25	0.03	0.02	0.00	0.30	0.07	0.17	0.10	0.34	0.21	0.17
O3'	0.04	0.34	0.06	0.00	0.24	0.04	0.27	0.16	0.30	0.24	0.33	0.38	0.29	0.27	0.16	0.30	0.00	0.04	0.24	0.32	0.47	0.45	0.32
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.07	0.04	0.00	0.13	0.04	0.10	0.38	0.20
O5'	0.08	0.26	0.24	0.33	0.27	0.03	0.36	0.01	0.38	0.36	0.33	0.23	0.21	0.42	0.23	0.17	0.24	0.13	0.00	0.43	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.32	0.04	0.43	0.00	0.33	0.33	0.33
OP1	0.10	0.20	0.32	0.42	0.19	0.14	0.26	0.11	0.28	0.24	0.25	0.18	0.17	0.29	0.17	0.34	0.47	0.10	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.22	0.23	0.23	0.22	0.24	0.25	0.29	0.28	0.23	0.25	0.22	0.21	0.26	0.22	0.21	0.45	0.38	0.01	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.15	0.20	0.30	0.14	0.03	0.23	0.01	0.27	0.19	0.22	0.13	0.10	0.27	0.10	0.17	0.32	0.20	0.01	0.33	0.00	0.00	0.00