Doublet Group distance statistics: 50814

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.008
O4	A	0, 0.004, 0.022, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O3'	A	0, -0.017, 0.155, 0.327, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.155 std_dev=0.172
C3'	B	0, -0.034, 0.185, 0.404, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.185 std_dev=0.219
O5'	A	0, 0.058, 0.295, 0.533, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.295 std_dev=0.237
O3'	B	0, 0.102, 0.366, 0.631, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.366 std_dev=0.265
OP2	B	0, 0.100, 0.371, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.371 std_dev=0.272
C3'	A	0, 0.032, 0.333, 0.634, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.333 std_dev=0.301
C8	B	0, 0.048, 0.391, 0.735, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.391 std_dev=0.344
N7	B	0, 0.091, 0.437, 0.783, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.437 std_dev=0.346
C5	B	0, 0.064, 0.416, 0.768, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.416 std_dev=0.352
O4'	A	0, -0.093, 0.260, 0.614, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.260 std_dev=0.353
C2'	A	0, -0.074, 0.282, 0.638, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.282 std_dev=0.356
C4	B	0, -0.012, 0.367, 0.746, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.367 std_dev=0.379
N9	B	0, -0.010, 0.377, 0.765, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.377 std_dev=0.388
P	A	0, 0.048, 0.438, 0.828, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.438 std_dev=0.390
C4'	B	0, 0.067, 0.458, 0.848, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.458 std_dev=0.391
OP2	A	0, 0.123, 0.514, 0.905, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.514 std_dev=0.391
C6	B	0, 0.084, 0.528, 0.973, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.528 std_dev=0.444
P	B	0, 0.053, 0.512, 0.971, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.512 std_dev=0.459
N3	B	0, -0.075, 0.416, 0.907, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.416 std_dev=0.491
N1	B	0, 0.020, 0.522, 1.023, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.522 std_dev=0.501
C4'	A	0, -0.013, 0.495, 1.003, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.495 std_dev=0.508
C2	B	0, -0.073, 0.455, 0.984, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.455 std_dev=0.528
O6	B	0, 0.135, 0.672, 1.210, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.672 std_dev=0.537
C2'	B	0, 0.029, 0.587, 1.146, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.587 std_dev=0.558
C1'	B	0, -0.042, 0.535, 1.112, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.535 std_dev=0.577
OP1	B	0, -0.030, 0.577, 1.185, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.577 std_dev=0.608
OP1	A	0, 0.011, 0.628, 1.246, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.628 std_dev=0.618
O2'	A	0, -0.148, 0.476, 1.101, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.476 std_dev=0.624
N2	B	0, -0.138, 0.525, 1.188, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.525 std_dev=0.663
O5'	B	0, 0.068, 0.749, 1.429, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.749 std_dev=0.681
O4'	B	0, -0.072, 0.701, 1.473, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.701 std_dev=0.772
C5'	B	0, 0.009, 0.814, 1.619, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.814 std_dev=0.805
C5'	A	0, -0.029, 0.874, 1.778, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.874 std_dev=0.904
O2'	B	0, -0.186, 1.227, 2.640, 3.206 max_d=3.206 avg_d=1.227 std_dev=1.413

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.13	0.07	0.29	0.08
C2	0.01	0.00	0.10	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.05	0.01	0.10	0.08	0.13	0.37	0.09
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.09	0.01	0.08	0.17	0.00	0.01	0.03	0.01	0.47	0.22	0.15	0.30
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.39	0.21	0.08	0.26
C4	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.26	0.43	0.19
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.03	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.26	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.05	0.30	0.44	0.22
C5'	0.03	0.05	0.04	0.02	0.14	0.00	0.21	0.00	0.21	0.09	0.07	0.10	0.04	0.02	0.14	0.00	0.00	0.10	0.25	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.03	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.02	0.00	0.13	0.05	0.25	0.42	0.18
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.14	0.37	0.11
N3	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.06	0.06	0.19	0.40	0.13
O2	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.08	0.01	0.18	0.11	0.08	0.34	0.07
O2'	0.00	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01	0.17	0.04	0.20	0.01	0.12	0.33	0.00	0.02	0.02	0.01	0.53	0.31	0.22	0.37
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.08	0.02	0.00	0.03	0.03	0.23	0.17	0.09	0.17
O4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.29	0.42	0.21
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.06	0.18	0.01	0.03	0.02	0.00	0.15	0.19	0.43	0.19
O5'	0.13	0.08	0.47	0.39	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.09	0.06	0.11	0.53	0.23	0.05	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.22	0.21	0.26	0.07	0.30	0.10	0.25	0.14	0.19	0.08	0.31	0.17	0.29	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.37	0.15	0.08	0.43	0.26	0.44	0.25	0.42	0.37	0.40	0.34	0.22	0.09	0.42	0.43	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.30	0.26	0.19	0.03	0.22	0.00	0.18	0.11	0.13	0.07	0.37	0.17	0.21	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.22	0.33	0.01	0.01	0.13	0.09	0.28	0.30	0.31	0.32	0.26	0.08	0.12	0.21	0.87	0.14	0.16	0.51	0.41	0.04	0.19	0.25
C2	0.39	0.07	0.14	0.03	0.16	0.21	0.12	0.38	0.08	0.42	0.13	0.12	0.06	0.30	0.33	0.55	0.16	0.35	0.36	0.13	0.14	0.16	0.13
C2'	0.37	0.04	0.47	0.07	0.12	0.18	0.04	0.33	0.12	0.34	0.13	0.07	0.07	0.18	0.27	0.98	0.15	0.15	0.49	0.23	0.07	0.08	0.21
C3'	0.40	0.12	0.55	0.15	0.09	0.23	0.00	0.38	0.20	0.35	0.22	0.16	0.03	0.17	0.28	1.09	0.22	0.17	0.43	0.33	0.04	0.04	0.13
C4	0.50	0.07	0.10	0.09	0.19	0.17	0.08	0.22	0.03	0.28	0.02	0.05	0.16	0.12	0.33	0.63	0.13	0.41	0.34	0.09	0.26	0.18	0.10
C4'	0.50	0.18	0.62	0.24	0.09	0.31	0.02	0.44	0.27	0.42	0.31	0.24	0.03	0.19	0.34	1.22	0.32	0.28	0.32	0.43	0.23	0.13	0.07
C5	0.46	0.04	0.28	0.08	0.08	0.08	0.06	0.11	0.16	0.19	0.13	0.04	0.08	0.03	0.25	1.02	0.10	0.25	0.48	0.23	0.18	0.22	0.17
C5'	0.74	0.08	0.89	0.49	0.28	0.53	0.15	0.62	0.13	0.59	0.16	0.10	0.22	0.32	0.54	1.54	0.51	0.49	0.16	0.29	0.58	0.46	0.37
C6	0.41	0.12	0.35	0.04	0.03	0.08	0.11	0.13	0.24	0.22	0.23	0.13	0.02	0.03	0.22	1.04	0.11	0.18	0.54	0.33	0.08	0.22	0.22
N1	0.38	0.14	0.28	0.02	0.06	0.15	0.04	0.27	0.22	0.34	0.23	0.17	0.02	0.14	0.26	0.83	0.14	0.23	0.47	0.30	0.07	0.19	0.20
N3	0.44	0.05	0.05	0.06	0.23	0.23	0.17	0.36	0.04	0.40	0.02	0.03	0.15	0.27	0.37	0.43	0.16	0.44	0.30	0.06	0.22	0.16	0.09
O2	0.34	0.08	0.09	0.02	0.18	0.25	0.20	0.48	0.06	0.45	0.12	0.16	0.05	0.40	0.33	0.40	0.18	0.37	0.31	0.09	0.12	0.14	0.12
O2'	0.15	0.04	0.25	0.14	0.04	0.05	0.03	0.17	0.08	0.15	0.08	0.05	0.02	0.08	0.11	0.66	0.06	0.09	0.72	0.13	0.45	0.35	0.52
O3'	0.23	0.30	0.38	0.03	0.08	0.09	0.15	0.27	0.36	0.22	0.40	0.35	0.16	0.08	0.13	0.88	0.12	0.05	0.58	0.48	0.25	0.21	0.34
O4	0.52	0.17	0.09	0.12	0.24	0.19	0.13	0.20	0.06	0.24	0.09	0.17	0.25	0.12	0.34	0.39	0.14	0.50	0.24	0.03	0.34	0.16	0.04
O4'	0.44	0.25	0.46	0.12	0.03	0.23	0.08	0.35	0.33	0.38	0.37	0.31	0.06	0.15	0.28	1.07	0.24	0.25	0.39	0.46	0.16	0.04	0.08
O5'	0.31	0.30	0.46	0.07	0.13	0.08	0.30	0.14	0.48	0.04	0.45	0.32	0.15	0.22	0.08	1.25	0.08	0.04	0.73	0.62	0.19	0.31	0.40
OP1	0.78	0.10	1.02	0.53	0.27	0.43	0.07	0.31	0.16	0.41	0.11	0.09	0.27	0.13	0.49	1.83	0.55	0.41	0.16	0.35	0.41	0.31	0.21
OP2	0.85	0.32	0.98	0.43	0.43	0.38	0.25	0.21	0.14	0.50	0.18	0.33	0.45	0.26	0.59	1.83	0.46	0.48	0.26	0.14	0.33	0.17	0.08
P	0.65	0.04	0.80	0.31	0.17	0.25	0.07	0.14	0.23	0.30	0.18	0.04	0.17	0.07	0.37	1.64	0.36	0.29	0.38	0.40	0.20	0.06	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.01	0.03	0.04	0.07	0.06	0.01	0.01	0.01	0.28	0.01	0.31	0.00	0.22	0.51	0.23
C2	0.05	0.00	0.20	0.08	0.00	0.41	0.01	0.76	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.43	0.35	0.40	0.01	0.00	0.03	0.27	0.11
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.09	0.02	0.03	0.26	0.07	0.12	0.15	0.25	0.19	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.89	0.07	0.35
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.22	0.02	0.13	0.08	0.19	0.09	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.68	0.04	0.26
C4	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.23	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.23	0.22	0.28	0.00	0.03	0.42	0.27
C4'	0.00	0.41	0.02	0.00	0.23	0.00	0.15	0.00	0.23	0.14	0.35	0.49	0.38	0.05	0.05	0.18	0.03	0.00	0.01	0.20	0.33	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.15	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.10	0.44	0.01	0.22	0.44	0.39
C5'	0.15	0.76	0.26	0.00	0.52	0.00	0.45	0.00	0.57	0.11	0.71	0.84	0.68	0.22	0.27	0.06	0.17	0.00	0.00	0.54	0.29	0.06	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.23	0.01	0.57	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.17	0.18	0.34	0.00	0.25	0.37	0.33
C8	0.03	0.00	0.12	0.22	0.00	0.14	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.04	0.18	0.77	0.03	0.23	0.58	0.55
N1	0.04	0.00	0.15	0.02	0.00	0.35	0.01	0.71	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.27	0.30	0.14	0.00	0.12	0.29	0.20
N2	0.07	0.00	0.25	0.13	0.00	0.49	0.01	0.84	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.59	0.42	0.47	0.16	0.01	0.10	0.20	0.02
N3	0.06	0.00	0.19	0.08	0.00	0.38	0.01	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.35	0.41	0.04	0.00	0.09	0.33	0.12
N7	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.05	0.00	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.03	0.09	0.70	0.03	0.36	0.53	0.55
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.05	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.15	0.01	0.46	0.01	0.01	0.51	0.35
O2'	0.01	0.43	0.00	0.00	0.12	0.18	0.06	0.06	0.05	0.42	0.27	0.59	0.41	0.33	0.11	0.00	0.03	0.11	0.06	0.04	1.00	0.07	0.33
O3'	0.28	0.35	0.01	0.00	0.23	0.03	0.13	0.17	0.17	0.04	0.27	0.42	0.35	0.03	0.15	0.03	0.00	0.29	0.10	0.14	0.59	0.04	0.19
O4'	0.01	0.40	0.01	0.01	0.22	0.00	0.10	0.00	0.18	0.18	0.30	0.47	0.41	0.09	0.01	0.11	0.29	0.00	0.45	0.14	0.15	0.76	0.52
O5'	0.31	0.01	0.09	0.10	0.28	0.01	0.44	0.00	0.34	0.77	0.14	0.16	0.04	0.70	0.46	0.06	0.10	0.45	0.00	0.40	0.02	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.20	0.01	0.54	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.14	0.14	0.40	0.00	0.35	0.36	0.39
OP1	0.22	0.03	0.89	0.68	0.03	0.33	0.22	0.29	0.25	0.23	0.12	0.10	0.09	0.36	0.01	1.00	0.59	0.15	0.02	0.35	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.27	0.07	0.04	0.42	0.21	0.44	0.06	0.37	0.58	0.29	0.20	0.33	0.53	0.51	0.07	0.04	0.76	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.11	0.35	0.26	0.27	0.03	0.39	0.00	0.33	0.55	0.20	0.02	0.12	0.55	0.35	0.33	0.19	0.52	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00