Doublet Group distance statistics: 50815

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, -0.001, 0.012, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.002, 0.024, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.001, 0.159, 0.316, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.159 std_dev=0.158
C2	B	0, 0.070, 0.238, 0.407, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.238 std_dev=0.169
N3	B	0, 0.080, 0.275, 0.470, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.275 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.084, 0.291, 0.499, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.291 std_dev=0.208
C2'	A	0, -0.010, 0.203, 0.416, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.203 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.092, 0.317, 0.543, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.317 std_dev=0.226
C4'	A	0, 0.031, 0.271, 0.510, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.271 std_dev=0.239
N2	B	0, 0.057, 0.318, 0.578, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.318 std_dev=0.261
C5	B	0, 0.090, 0.355, 0.619, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.355 std_dev=0.265
C6	B	0, 0.089, 0.367, 0.646, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.367 std_dev=0.279
O2'	A	0, -0.020, 0.261, 0.542, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.261 std_dev=0.281
C3'	A	0, 0.011, 0.310, 0.608, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.310 std_dev=0.298
N9	B	0, 0.106, 0.435, 0.763, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.435 std_dev=0.328
N7	B	0, 0.074, 0.445, 0.816, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.445 std_dev=0.371
C8	B	0, 0.083, 0.472, 0.861, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.472 std_dev=0.389
C1'	B	0, 0.121, 0.511, 0.900, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.511 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.056, 0.452, 0.847, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.452 std_dev=0.396
C2'	B	0, 0.104, 0.511, 0.919, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.511 std_dev=0.407
O6	B	0, 0.093, 0.511, 0.928, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.511 std_dev=0.418
C5'	A	0, 0.051, 0.472, 0.893, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.472 std_dev=0.421
O3'	A	0, 0.017, 0.460, 0.904, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.460 std_dev=0.443
O4'	B	0, 0.142, 0.645, 1.148, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.645 std_dev=0.503
P	A	0, 0.047, 0.638, 1.229, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.638 std_dev=0.591
OP1	A	0, 0.096, 0.764, 1.432, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.764 std_dev=0.668
OP2	A	0, 0.013, 0.719, 1.424, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.719 std_dev=0.706
C4'	B	0, 0.075, 0.957, 1.840, 2.130 max_d=2.130 avg_d=0.957 std_dev=0.883
O2'	B	0, -0.052, 0.868, 1.787, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.868 std_dev=0.919
O5'	B	0, -0.031, 0.939, 1.910, 2.275 max_d=2.275 avg_d=0.939 std_dev=0.970
C3'	B	0, 0.000, 1.051, 2.101, 2.486 max_d=2.486 avg_d=1.051 std_dev=1.050
C5'	B	0, 0.026, 1.103, 2.180, 2.564 max_d=2.564 avg_d=1.103 std_dev=1.077
OP2	B	0, -0.116, 1.005, 2.126, 2.570 max_d=2.570 avg_d=1.005 std_dev=1.121
P	B	0, -0.063, 1.078, 2.219, 2.657 max_d=2.657 avg_d=1.078 std_dev=1.141
OP1	B	0, -0.098, 1.243, 2.584, 3.105 max_d=3.105 avg_d=1.243 std_dev=1.341
O3'	B	0, -0.112, 1.543, 3.197, 3.838 max_d=3.838 avg_d=1.543 std_dev=1.655

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.05
C2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.14	0.01	0.01	0.16	0.16	0.11	0.13
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.00	0.07	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.09	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.16	0.14	0.12	0.14
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.01	0.14	0.12	0.10	0.13
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.07	0.06	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00
C6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.01	0.13	0.10	0.06	0.10
N1	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.14	0.12	0.07	0.10
N3	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.01	0.18	0.17	0.13	0.15
O2	0.02	0.00	0.19	0.18	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.23	0.01	0.03	0.16	0.17	0.11	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.15	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03
O3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.11	0.23	0.01	0.00	0.03	0.01	0.16	0.08	0.12	0.13
O4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.15	0.14	0.12	0.14
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.04
O5'	0.07	0.16	0.02	0.08	0.16	0.01	0.14	0.00	0.13	0.14	0.18	0.16	0.03	0.16	0.15	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.08	0.16	0.02	0.01	0.14	0.06	0.12	0.08	0.10	0.12	0.17	0.17	0.01	0.08	0.14	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.02	0.11	0.05	0.07	0.12	0.03	0.10	0.02	0.06	0.07	0.13	0.11	0.05	0.12	0.12	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.13	0.03	0.06	0.14	0.01	0.13	0.00	0.10	0.10	0.15	0.12	0.03	0.13	0.14	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.03	0.21	0.08	0.03	0.09	0.11	0.07	0.20	0.04	0.15	0.06	0.08	0.12	0.04	0.88	0.34	0.10	0.08	0.28	0.12	0.10	0.08
C2	0.11	0.15	0.23	0.14	0.04	0.14	0.11	0.16	0.20	0.01	0.23	0.15	0.04	0.07	0.03	0.89	0.38	0.11	0.18	0.23	0.26	0.25	0.21
C2'	0.11	0.06	0.18	0.08	0.07	0.09	0.06	0.06	0.09	0.06	0.08	0.09	0.10	0.06	0.08	0.77	0.39	0.09	0.10	0.14	0.13	0.13	0.11
C3'	0.05	0.11	0.07	0.12	0.11	0.11	0.17	0.17	0.24	0.11	0.22	0.07	0.06	0.16	0.09	0.68	0.18	0.09	0.11	0.29	0.08	0.09	0.12
C4	0.06	0.17	0.05	0.22	0.16	0.12	0.17	0.04	0.18	0.11	0.19	0.14	0.15	0.13	0.13	0.63	0.18	0.04	0.04	0.16	0.13	0.20	0.11
C4'	0.04	0.12	0.11	0.11	0.14	0.10	0.26	0.17	0.35	0.19	0.28	0.03	0.06	0.27	0.12	0.78	0.16	0.08	0.15	0.47	0.12	0.17	0.18
C5	0.07	0.09	0.05	0.31	0.14	0.19	0.20	0.16	0.21	0.18	0.15	0.04	0.08	0.22	0.14	0.64	0.26	0.08	0.14	0.22	0.07	0.06	0.09
C5'	0.16	0.22	0.01	0.28	0.28	0.27	0.41	0.35	0.51	0.34	0.39	0.12	0.17	0.43	0.26	0.70	0.05	0.22	0.34	0.65	0.31	0.37	0.37
C6	0.03	0.05	0.10	0.19	0.09	0.11	0.18	0.11	0.23	0.14	0.15	0.02	0.02	0.20	0.09	0.75	0.07	0.04	0.10	0.29	0.06	0.07	0.09
N1	0.07	0.07	0.18	0.03	0.05	0.04	0.15	0.04	0.23	0.07	0.20	0.02	0.01	0.14	0.03	0.85	0.21	0.06	0.06	0.29	0.11	0.11	0.08
N3	0.06	0.20	0.19	0.06	0.10	0.08	0.12	0.14	0.18	0.02	0.23	0.20	0.13	0.06	0.03	0.83	0.21	0.07	0.19	0.18	0.28	0.31	0.24
O2	0.18	0.16	0.29	0.32	0.02	0.26	0.08	0.27	0.18	0.06	0.24	0.20	0.03	0.03	0.08	0.93	0.65	0.18	0.28	0.22	0.36	0.32	0.29
O2'	0.22	0.18	0.25	0.21	0.16	0.21	0.10	0.16	0.08	0.13	0.10	0.24	0.22	0.09	0.17	0.83	0.57	0.20	0.20	0.11	0.21	0.19	0.18
O3'	0.07	0.09	0.05	0.13	0.09	0.12	0.12	0.20	0.16	0.09	0.15	0.06	0.06	0.11	0.08	0.61	0.21	0.11	0.11	0.19	0.10	0.10	0.13
O4	0.16	0.19	0.08	0.39	0.21	0.23	0.16	0.09	0.14	0.15	0.17	0.18	0.21	0.12	0.21	0.41	0.45	0.12	0.03	0.09	0.14	0.28	0.13
O4'	0.05	0.08	0.17	0.04	0.10	0.03	0.23	0.07	0.33	0.15	0.25	0.02	0.02	0.24	0.07	0.87	0.20	0.03	0.08	0.45	0.05	0.10	0.10
O5'	0.29	0.28	0.14	0.48	0.38	0.44	0.50	0.52	0.56	0.45	0.42	0.16	0.27	0.53	0.38	0.52	0.31	0.35	0.49	0.69	0.47	0.50	0.51
OP1	0.38	0.34	0.21	0.62	0.46	0.58	0.57	0.70	0.62	0.56	0.47	0.23	0.34	0.63	0.47	0.44	0.47	0.48	0.67	0.76	0.68	0.72	0.73
OP2	0.45	0.39	0.26	0.73	0.53	0.67	0.66	0.77	0.69	0.65	0.51	0.27	0.41	0.73	0.55	0.37	0.65	0.54	0.75	0.85	0.73	0.76	0.78
P	0.37	0.34	0.20	0.61	0.46	0.57	0.59	0.66	0.64	0.57	0.47	0.21	0.34	0.65	0.47	0.47	0.49	0.46	0.65	0.80	0.64	0.68	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.22	0.00	0.17	0.02	0.17	0.24	0.18
C2	0.04	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.27	0.06	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02
C2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.13	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.23	0.05	0.26	0.35	0.27
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.18	0.00	0.29	0.01	0.27	0.39	0.19	0.04	0.08	0.39	0.23	0.03	0.01	0.02	0.16	0.31	0.07	0.14	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.18	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.33	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02
C4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.19	0.11	0.05	0.06	0.19	0.11	0.29	0.02	0.00	0.02	0.15	0.04	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.29	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.37	0.09	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.06
C5'	0.02	0.14	0.13	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.21	0.21	0.19	0.12	0.11	0.24	0.13	0.14	0.14	0.01	0.00	0.23	0.09	0.01	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.27	0.01	0.13	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.43	0.05	0.02	0.09	0.01	0.09	0.06	0.09
C8	0.04	0.00	0.04	0.39	0.01	0.19	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.30	0.05	0.08	0.02	0.04	0.06	0.02
N1	0.03	0.01	0.02	0.19	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.43	0.12	0.04	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06
N2	0.05	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.38	0.40	0.08	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03
N3	0.04	0.00	0.01	0.08	0.00	0.06	0.02	0.11	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.34	0.30	0.06	0.03	0.03	0.04	0.08	0.04
N7	0.03	0.01	0.05	0.39	0.01	0.19	0.00	0.24	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.30	0.30	0.04	0.13	0.02	0.10	0.04	0.09
N9	0.01	0.01	0.01	0.23	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.19	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.12	0.06
O2'	0.03	0.39	0.00	0.03	0.33	0.29	0.37	0.14	0.43	0.19	0.43	0.38	0.34	0.30	0.19	0.00	0.04	0.25	0.08	0.45	0.07	0.34	0.13
O3'	0.22	0.27	0.03	0.01	0.10	0.02	0.09	0.14	0.05	0.30	0.12	0.40	0.30	0.30	0.02	0.04	0.00	0.14	0.38	0.14	0.48	0.44	0.44
O4'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.08	0.06	0.04	0.01	0.25	0.14	0.00	0.23	0.02	0.19	0.26	0.21
O5'	0.17	0.02	0.23	0.16	0.01	0.02	0.08	0.00	0.09	0.08	0.06	0.02	0.03	0.13	0.03	0.08	0.38	0.23	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.05	0.31	0.02	0.15	0.01	0.23	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.45	0.14	0.02	0.13	0.00	0.13	0.11	0.13
OP1	0.17	0.02	0.26	0.07	0.01	0.04	0.06	0.09	0.09	0.04	0.06	0.03	0.04	0.10	0.04	0.07	0.48	0.19	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.04	0.35	0.14	0.07	0.03	0.02	0.01	0.06	0.06	0.03	0.05	0.08	0.04	0.12	0.34	0.44	0.26	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.02	0.27	0.13	0.02	0.02	0.06	0.01	0.09	0.02	0.06	0.03	0.04	0.09	0.06	0.13	0.44	0.21	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00