sequences=8
<param>
maxmove=0.1
pval=0.1
usescval=false
complexatt=true
cooling=1.0
currcool=1.0
attfactor=10.0
attvalpow=1
repfactor=10.0
repvalpow=1
dampening=1.0
minattract=1.0
cluster2d=false
blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500
formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb
showinfo=true
zoom=1.0
dotsize=0
ovalsize=10
groupsize=4
usefoldchange=false
avgfoldchange=false
colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9;
colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23):
</param>
<rotmtx>
1.0;0.0;0.0;
0.0;1.0;0.0;
0.0;0.0;1.0;
</rotmtx>
<seq>
>3CME-0270-0356
X
>1VQO-0270-0356
X
>3CMA-0270-0356
X
>1VQP-0270-0356
X
>1VQL-0270-0356
X
>1VQM-0270-0356
X
>1VQN-0270-0356
X
>1VQK-0270-0356
X
</seq>
<hsp>
0 1:0.465706630414
0 2:0.646547353364
0 3:0.521117511281
0 4:0.53944047974
0 5:0.794699074223
0 6:0.601236091753
0 7:0.615442997896
1 2:0.826458302711
1 3:0.436685817647
1 4:0.362157974341
1 5:0.459989271185
1 6:0.483542817033
1 7:0.418664385845
2 3:0.584492748508
2 4:0.6045600842
2 5:0.999998627491
2 6:0.760035333296
2 7:0.782905564433
3 4:0.146338562569
3 5:0.480607759345
3 6:0.34823913186
3 7:0.420057624747
4 5:0.43128653019
4 6:0.350763904905
4 7:0.347635164483
5 6:0.384021812439
5 7:0.390351663756
6 7:0.209070023504
</hsp>