Doublet Group distance statistics: 50840

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C4'	B	0, 0.000, 0.206, 0.412, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.206 std_dev=0.206
O2'	A	0, 0.000, 0.232, 0.463, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.232 std_dev=0.232
C2'	A	0, 0.000, 0.299, 0.599, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.299 std_dev=0.299
O4'	A	0, 0.000, 0.334, 0.667, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.334 std_dev=0.334
C5'	B	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.000, 0.372, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C4	B	0, 0.000, 0.393, 0.786, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.393 std_dev=0.393
O4'	B	0, 0.000, 0.448, 0.896, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.448 std_dev=0.448
N9	B	0, 0.000, 0.465, 0.930, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.465 std_dev=0.465
C8	B	0, 0.000, 0.471, 0.942, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.471 std_dev=0.471
N7	B	0, 0.000, 0.490, 0.981, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.490 std_dev=0.490
C6	B	0, 0.000, 0.504, 1.007, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.504 std_dev=0.504
N1	B	0, 0.000, 0.521, 1.042, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.521 std_dev=0.521
O3'	B	0, 0.000, 0.534, 1.069, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C3'	A	0, 0.000, 0.549, 1.098, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.549 std_dev=0.549
C2	B	0, 0.000, 0.561, 1.122, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.561 std_dev=0.561
C4'	A	0, 0.000, 0.561, 1.122, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.561 std_dev=0.561
N3	B	0, 0.000, 0.567, 1.135, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.567 std_dev=0.567
C3'	B	0, 0.000, 0.626, 1.252, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.626 std_dev=0.626
P	B	0, 0.000, 0.682, 1.364, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.682 std_dev=0.682
O5'	B	0, 0.000, 0.694, 1.387, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.694 std_dev=0.694
O6	B	0, 0.000, 0.709, 1.418, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.709 std_dev=0.709
C1'	B	0, 0.000, 0.712, 1.423, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.712 std_dev=0.712
O3'	A	0, 0.000, 0.746, 1.491, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.746 std_dev=0.746
N2	B	0, 0.000, 0.796, 1.591, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.796 std_dev=0.796
O5'	A	0, 0.000, 0.927, 1.853, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.927 std_dev=0.927
C5'	A	0, 0.000, 0.930, 1.859, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.930 std_dev=0.930
C2'	B	0, 0.000, 1.086, 2.172, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.086 std_dev=1.086
OP1	B	0, 0.000, 1.248, 2.495, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.248 std_dev=1.248
P	A	0, 0.000, 1.281, 2.561, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.281 std_dev=1.281
OP2	A	0, 0.000, 1.300, 2.600, 2.600 max_d=2.600 avg_d=1.300 std_dev=1.300
OP1	A	0, 0.000, 1.595, 3.190, 3.190 max_d=3.190 avg_d=1.595 std_dev=1.595
O2'	B	0, 0.000, 1.645, 3.291, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.645 std_dev=1.645
OP2	B	0, 0.000, 2.026, 4.053, 4.053 max_d=4.053 avg_d=2.026 std_dev=2.026

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02
C2	0.01	0.00	0.08	0.14	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.02	0.22	0.24	0.22	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.14	0.09	0.19	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03
C4	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.27	0.31	0.33	0.30
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.08	0.00	0.06	0.01	0.04	0.04	0.08	0.08	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.23	0.25	0.26	0.26
C5'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.17	0.01	0.15	0.00	0.11	0.09	0.16	0.19	0.11	0.03	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.07	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.16	0.15	0.12	0.16
N1	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.16	0.16	0.12	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.02	0.27	0.31	0.30	0.27
N4	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.01	0.29	0.37	0.39	0.35
O2	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.21	0.03	0.20	0.23	0.20	0.18
O2'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03
O3'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.05	0.03	0.15	0.10	0.21	0.00	0.00	0.02	0.09	0.04	0.06	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03
O5'	0.05	0.22	0.00	0.04	0.27	0.01	0.23	0.01	0.16	0.16	0.27	0.29	0.20	0.02	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.06	0.24	0.03	0.01	0.31	0.03	0.25	0.04	0.15	0.16	0.31	0.37	0.23	0.00	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.22	0.01	0.03	0.33	0.04	0.26	0.02	0.12	0.12	0.30	0.39	0.20	0.03	0.06	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.20	0.01	0.03	0.30	0.03	0.26	0.02	0.16	0.13	0.27	0.35	0.18	0.03	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.12	0.20	0.22	0.06	0.04	0.24	0.01	0.32	0.21	0.12	0.37	0.12	0.32	0.07	0.01	0.17	0.12	0.09	0.49	0.41	0.70	0.18
C2	0.03	0.04	0.30	0.29	0.09	0.03	0.24	0.01	0.35	0.16	0.28	0.13	0.04	0.27	0.06	0.10	0.22	0.10	0.11	0.47	0.29	0.61	0.17
C2'	0.27	0.12	0.11	0.02	0.30	0.26	0.43	0.18	0.47	0.43	0.30	0.11	0.15	0.50	0.32	0.37	0.07	0.36	0.05	0.58	0.55	0.66	0.05
C3'	0.30	0.13	0.20	0.09	0.31	0.28	0.42	0.18	0.43	0.45	0.26	0.08	0.17	0.51	0.35	0.48	0.15	0.36	0.04	0.53	0.58	0.72	0.07
C4	0.05	0.07	0.35	0.31	0.08	0.01	0.24	0.01	0.35	0.15	0.28	0.04	0.02	0.26	0.04	0.15	0.25	0.08	0.11	0.46	0.25	0.59	0.18
C4'	0.03	0.14	0.06	0.14	0.07	0.05	0.23	0.02	0.25	0.25	0.05	0.36	0.10	0.34	0.10	0.16	0.08	0.11	0.12	0.42	0.45	0.85	0.23
C5	0.05	0.02	0.31	0.29	0.08	0.02	0.24	0.01	0.34	0.18	0.24	0.14	0.05	0.29	0.06	0.12	0.23	0.09	0.10	0.48	0.31	0.63	0.18
C5'	0.01	0.12	0.05	0.13	0.05	0.03	0.21	0.05	0.23	0.22	0.05	0.32	0.10	0.31	0.09	0.17	0.06	0.08	0.15	0.38	0.42	0.90	0.27
C6	0.03	0.03	0.26	0.26	0.08	0.04	0.25	0.02	0.34	0.20	0.20	0.22	0.07	0.31	0.07	0.07	0.20	0.11	0.09	0.49	0.36	0.65	0.17
N1	0.02	0.03	0.25	0.25	0.08	0.04	0.25	0.02	0.35	0.20	0.21	0.24	0.07	0.30	0.07	0.06	0.20	0.11	0.09	0.49	0.36	0.65	0.17
N3	0.05	0.10	0.35	0.31	0.09	0.02	0.24	0.01	0.35	0.14	0.30	0.01	0.00	0.25	0.05	0.15	0.25	0.08	0.12	0.46	0.23	0.57	0.17
N4	0.07	0.10	0.39	0.34	0.08	0.01	0.22	0.00	0.34	0.12	0.29	0.02	0.00	0.23	0.03	0.20	0.28	0.06	0.13	0.45	0.20	0.56	0.18
O2	0.03	0.06	0.30	0.28	0.09	0.03	0.24	0.01	0.36	0.16	0.30	0.13	0.03	0.25	0.06	0.09	0.22	0.10	0.11	0.45	0.27	0.60	0.18
O2'	0.22	0.03	0.08	0.02	0.22	0.21	0.37	0.12	0.39	0.40	0.13	0.28	0.05	0.47	0.27	0.32	0.01	0.31	0.01	0.55	0.54	0.72	0.10
O3'	0.45	0.20	0.41	0.25	0.42	0.40	0.50	0.26	0.45	0.57	0.28	0.00	0.28	0.60	0.48	0.71	0.30	0.48	0.11	0.50	0.67	0.73	0.01
O4'	0.09	0.21	0.24	0.26	0.02	0.03	0.18	0.06	0.25	0.17	0.03	0.46	0.21	0.29	0.01	0.07	0.21	0.03	0.14	0.46	0.41	0.77	0.24
O5'	0.12	0.03	0.02	0.05	0.17	0.14	0.30	0.06	0.34	0.30	0.19	0.15	0.03	0.38	0.19	0.26	0.03	0.19	0.06	0.46	0.47	0.79	0.18
OP1	0.16	0.06	0.11	0.03	0.20	0.17	0.32	0.07	0.34	0.34	0.20	0.11	0.07	0.41	0.23	0.37	0.11	0.20	0.05	0.45	0.51	0.83	0.18
OP2	0.10	0.08	0.02	0.06	0.18	0.14	0.31	0.08	0.37	0.29	0.25	0.07	0.06	0.38	0.18	0.22	0.04	0.17	0.05	0.48	0.45	0.73	0.16
P	0.06	0.00	0.03	0.09	0.12	0.09	0.26	0.02	0.31	0.26	0.17	0.17	0.01	0.34	0.13	0.20	0.00	0.12	0.10	0.43	0.43	0.83	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.20	0.23	0.02
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.02	0.10	0.19	0.01	0.17	0.71	0.27
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.06	0.04	0.10	0.13	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.26	0.08	0.14
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.18	0.00	0.24	0.01	0.24	0.22	0.21	0.10	0.12	0.26	0.16	0.03	0.01	0.00	0.06	0.26	0.05	0.01	0.12
C4	0.02	0.00	0.07	0.18	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.08	0.05	0.25	0.01	0.16	0.74	0.30
C4'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.07	0.20	0.00	0.14	0.08	0.20	0.07	0.15	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.10	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.24	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.18	0.02	0.38	0.01	0.11	1.04	0.47
C5'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.00	0.24	0.00	0.22	0.35	0.12	0.07	0.00	0.37	0.16	0.13	0.04	0.00	0.00	0.26	0.29	0.24	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.24	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.18	0.04	0.38	0.00	0.10	1.12	0.51
C8	0.01	0.00	0.04	0.22	0.00	0.20	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.20	0.07	0.43	0.02	0.13	0.95	0.46
N1	0.02	0.00	0.10	0.21	0.00	0.00	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.20	0.11	0.07	0.30	0.02	0.12	0.95	0.41
N2	0.05	0.00	0.13	0.10	0.01	0.14	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.05	0.14	0.12	0.03	0.19	0.60	0.20
N3	0.03	0.00	0.11	0.12	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.01	0.10	0.14	0.00	0.19	0.57	0.19
N7	0.01	0.00	0.00	0.26	0.01	0.20	0.00	0.37	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.24	0.05	0.49	0.02	0.08	1.20	0.59
N9	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.24	0.01	0.17	0.62	0.25
O2'	0.00	0.18	0.00	0.03	0.17	0.15	0.20	0.13	0.22	0.14	0.20	0.17	0.16	0.18	0.12	0.00	0.02	0.13	0.09	0.23	0.09	0.09	0.04
O3'	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.00	0.18	0.04	0.18	0.20	0.11	0.05	0.01	0.24	0.09	0.02	0.00	0.02	0.11	0.21	0.19	0.07	0.07
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.07	0.07	0.14	0.10	0.05	0.00	0.13	0.02	0.00	0.06	0.04	0.16	0.05	0.01
O5'	0.04	0.19	0.01	0.06	0.25	0.00	0.38	0.00	0.38	0.43	0.30	0.12	0.14	0.49	0.24	0.09	0.11	0.06	0.00	0.43	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.26	0.01	0.10	0.01	0.26	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.23	0.21	0.04	0.43	0.00	0.08	1.27	0.59
OP1	0.20	0.17	0.26	0.05	0.16	0.08	0.11	0.29	0.10	0.13	0.12	0.19	0.19	0.08	0.17	0.09	0.19	0.16	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.71	0.08	0.01	0.74	0.10	1.04	0.24	1.12	0.95	0.95	0.60	0.57	1.20	0.62	0.09	0.07	0.05	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.27	0.14	0.12	0.30	0.04	0.47	0.01	0.51	0.46	0.41	0.20	0.19	0.59	0.25	0.04	0.07	0.01	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00