Doublet Group distance statistics: 50841

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.000, 0.094, 0.188, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.094 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.000, 0.431, 0.862, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.431 std_dev=0.431
N2	B	0, 0.000, 0.450, 0.900, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.450 std_dev=0.450
O4'	A	0, 0.000, 0.471, 0.943, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.471 std_dev=0.471
C2	B	0, 0.000, 0.480, 0.959, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.480 std_dev=0.480
N1	B	0, 0.000, 0.483, 0.966, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.483 std_dev=0.483
C2'	A	0, 0.000, 0.517, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.517 std_dev=0.517
N3	B	0, 0.000, 0.528, 1.056, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C6	B	0, 0.000, 0.528, 1.056, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.528 std_dev=0.528
O6	B	0, 0.000, 0.552, 1.104, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.552 std_dev=0.552
C5	B	0, 0.000, 0.556, 1.113, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.556 std_dev=0.556
C4	B	0, 0.000, 0.569, 1.139, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.569 std_dev=0.569
N7	B	0, 0.000, 0.599, 1.198, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.599 std_dev=0.599
C1'	B	0, 0.000, 0.605, 1.210, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.605 std_dev=0.605
N9	B	0, 0.000, 0.625, 1.251, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.625 std_dev=0.625
C8	B	0, 0.000, 0.642, 1.284, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.642 std_dev=0.642
C4'	A	0, 0.000, 0.791, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.791 std_dev=0.791
C3'	A	0, 0.000, 0.838, 1.676, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.838 std_dev=0.838
O3'	A	0, 0.000, 1.214, 2.428, 2.428 max_d=2.428 avg_d=1.214 std_dev=1.214
O4'	B	0, 0.000, 1.275, 2.550, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.275 std_dev=1.275
C5'	A	0, 0.000, 1.279, 2.558, 2.558 max_d=2.558 avg_d=1.279 std_dev=1.279
O5'	A	0, 0.000, 1.598, 3.195, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.598 std_dev=1.598
P	A	0, 0.000, 1.620, 3.241, 3.241 max_d=3.241 avg_d=1.620 std_dev=1.620
OP1	A	0, 0.000, 1.657, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.657 std_dev=1.657
C2'	B	0, 0.000, 1.664, 3.328, 3.328 max_d=3.328 avg_d=1.664 std_dev=1.664
C4'	B	0, 0.000, 1.920, 3.841, 3.841 max_d=3.841 avg_d=1.920 std_dev=1.920
O3'	B	0, 0.000, 1.921, 3.842, 3.842 max_d=3.842 avg_d=1.921 std_dev=1.921
C3'	B	0, 0.000, 1.939, 3.878, 3.878 max_d=3.878 avg_d=1.939 std_dev=1.939
O2'	B	0, 0.000, 2.184, 4.367, 4.367 max_d=4.367 avg_d=2.184 std_dev=2.184
OP2	A	0, 0.000, 2.407, 4.814, 4.814 max_d=4.814 avg_d=2.407 std_dev=2.407
C5'	B	0, 0.000, 3.353, 6.707, 6.707 max_d=6.707 avg_d=3.353 std_dev=3.353
O5'	B	0, 0.000, 3.818, 7.636, 7.636 max_d=7.636 avg_d=3.818 std_dev=3.818
P	B	0, 0.000, 5.315, 10.630, 10.630 max_d=10.630 avg_d=5.315 std_dev=5.315
OP1	B	0, 0.000, 5.930, 11.859, 11.859 max_d=11.859 avg_d=5.930 std_dev=5.930
OP2	B	0, 0.000, 5.977, 11.954, 11.954 max_d=11.954 avg_d=5.977 std_dev=5.977

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.00	0.05	0.07	0.59	0.20
C2	0.03	0.00	0.19	0.22	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.25	0.05	0.14	0.10	0.65	0.19
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03	0.15	0.06	0.33	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.51	0.10
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.09	0.20	0.14	0.31	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.47	0.03
C4	0.00	0.01	0.05	0.13	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.13	0.08	0.87	0.29
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.14	0.37	0.05
C5	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	1.05	0.39
C5'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.06	0.09	0.02	0.01	0.00	0.19	0.34	0.00
C6	0.01	0.00	0.10	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	1.02	0.40
N1	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.07	0.05	0.77	0.27
N3	0.01	0.01	0.15	0.20	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.25	0.07	0.18	0.13	0.70	0.20
N4	0.00	0.02	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.20	0.04	0.13	0.08	0.90	0.30
O2	0.08	0.00	0.33	0.31	0.01	0.10	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.23	0.36	0.03	0.13	0.09	0.51	0.15
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.01	0.09	0.05	0.09	0.07	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.02	0.09	0.13	0.02	0.45	0.16
O3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.17	0.01	0.05	0.02	0.02	0.09	0.25	0.20	0.36	0.02	0.00	0.01	0.05	0.27	0.30	0.08
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.04	0.03	0.09	0.01	0.00	0.06	0.04	0.53	0.20
O5'	0.05	0.14	0.00	0.01	0.13	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.18	0.13	0.13	0.13	0.05	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.07	0.10	0.15	0.22	0.08	0.14	0.01	0.19	0.01	0.05	0.13	0.08	0.09	0.02	0.27	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.59	0.65	0.51	0.47	0.87	0.37	1.05	0.34	1.02	0.77	0.70	0.90	0.51	0.45	0.30	0.53	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.19	0.10	0.03	0.29	0.05	0.39	0.00	0.40	0.27	0.20	0.30	0.15	0.16	0.08	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.12	0.17	0.51	0.11	0.13	0.11	0.28	0.12	0.09	0.13	0.09	0.11	0.08	0.10	0.13	0.27	0.17	0.00	0.12	0.37	0.51	0.39
C2	0.07	0.05	0.36	0.74	0.01	0.35	0.01	0.69	0.00	0.02	0.03	0.07	0.03	0.03	0.01	0.03	0.46	0.06	0.47	0.02	0.17	0.25	0.24
C2'	0.14	0.15	0.35	0.72	0.16	0.45	0.14	0.60	0.12	0.17	0.12	0.16	0.17	0.15	0.17	0.01	0.46	0.21	0.31	0.07	0.04	0.32	0.09
C3'	0.25	0.20	0.40	0.79	0.24	0.56	0.22	0.72	0.16	0.27	0.15	0.19	0.24	0.24	0.26	0.06	0.53	0.34	0.47	0.10	0.23	0.21	0.07
C4	0.01	0.01	0.43	0.90	0.03	0.58	0.02	1.07	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.60	0.10	0.91	0.01	0.74	0.88	0.82
C4'	0.00	0.03	0.20	0.52	0.01	0.20	0.02	0.29	0.02	0.06	0.04	0.04	0.00	0.06	0.03	0.08	0.31	0.01	0.03	0.03	0.33	0.65	0.43
C5	0.07	0.06	0.33	0.79	0.03	0.49	0.05	0.92	0.07	0.01	0.08	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.50	0.05	0.74	0.08	0.57	0.59	0.60
C5'	0.03	0.03	0.23	0.56	0.03	0.24	0.04	0.36	0.00	0.10	0.04	0.05	0.00	0.10	0.06	0.06	0.34	0.03	0.13	0.01	0.23	0.54	0.31
C6	0.12	0.11	0.24	0.67	0.09	0.34	0.10	0.69	0.12	0.07	0.13	0.09	0.09	0.07	0.08	0.12	0.39	0.05	0.47	0.13	0.24	0.17	0.24
N1	0.13	0.11	0.24	0.63	0.09	0.27	0.08	0.55	0.10	0.06	0.12	0.10	0.09	0.06	0.08	0.09	0.37	0.10	0.31	0.09	0.02	0.02	0.03
N3	0.01	0.02	0.47	0.90	0.06	0.54	0.06	0.99	0.05	0.09	0.03	0.01	0.05	0.08	0.07	0.12	0.61	0.07	0.80	0.05	0.57	0.75	0.68
N4	0.01	0.01	0.48	0.97	0.05	0.69	0.04	1.26	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.06	0.06	0.10	0.67	0.16	1.13	0.00	1.03	1.26	1.15
O2	0.09	0.06	0.35	0.68	0.01	0.24	0.04	0.50	0.07	0.04	0.01	0.11	0.05	0.07	0.00	0.06	0.40	0.15	0.26	0.12	0.10	0.01	0.02
O2'	0.03	0.01	0.13	0.44	0.01	0.15	0.02	0.18	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.17	0.22	0.02	0.15	0.06	0.47	0.90	0.63
O3'	0.40	0.29	0.45	0.83	0.36	0.68	0.33	0.79	0.25	0.39	0.24	0.28	0.35	0.36	0.39	0.12	0.59	0.53	0.55	0.17	0.36	0.26	0.12
O4'	0.18	0.18	0.11	0.42	0.15	0.02	0.13	0.13	0.14	0.10	0.17	0.18	0.16	0.09	0.13	0.16	0.20	0.25	0.13	0.12	0.55	0.70	0.57
O5'	0.17	0.22	0.05	0.32	0.15	0.07	0.10	0.02	0.12	0.04	0.20	0.26	0.19	0.02	0.11	0.18	0.12	0.26	0.24	0.08	0.71	0.92	0.73
OP1	0.18	0.21	0.05	0.36	0.16	0.02	0.14	0.07	0.17	0.09	0.20	0.22	0.18	0.09	0.14	0.22	0.16	0.23	0.16	0.16	0.59	0.84	0.63
OP2	0.14	0.27	0.42	0.72	0.21	0.26	0.20	0.33	0.22	0.18	0.26	0.32	0.25	0.18	0.19	0.21	0.58	0.03	0.09	0.20	0.51	0.54	0.41
P	0.09	0.03	0.16	0.45	0.04	0.03	0.04	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.29	0.18	0.17	0.04	0.70	0.86	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.04	0.08	0.07	0.01	0.00	0.03	0.24	0.01	0.31	0.02	0.20	0.34	0.36
C2	0.06	0.00	0.42	0.72	0.00	0.29	0.01	0.49	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.42	0.12	0.17	0.04	0.13	0.01	0.08
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.21	0.01	0.09	0.21	0.19	0.23	0.33	0.49	0.40	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.62	0.16	0.54	0.59	0.62
C3'	0.00	0.72	0.00	0.00	0.42	0.01	0.30	0.01	0.44	0.09	0.61	0.83	0.67	0.03	0.13	0.02	0.01	0.01	0.26	0.40	0.32	0.00	0.18
C4	0.03	0.00	0.21	0.42	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.06	0.20	0.03	0.35	0.53	0.48
C4'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.15	0.00	0.07	0.01	0.14	0.10	0.22	0.34	0.28	0.06	0.02	0.23	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.31	0.06
C5	0.01	0.01	0.09	0.30	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03	0.39	0.03	0.56	0.96	0.79
C5'	0.09	0.49	0.21	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.12	0.35	0.33	0.66	0.44	0.28	0.11	0.01	0.20	0.02	0.00	0.05	0.36	0.28	0.01
C6	0.00	0.02	0.19	0.44	0.02	0.14	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.07	0.20	0.04	0.25	0.02	0.52	0.83	0.68
C8	0.03	0.01	0.23	0.09	0.00	0.10	0.01	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.23	0.04	0.76	0.04	0.70	1.35	1.08
N1	0.04	0.02	0.33	0.61	0.01	0.22	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.35	0.09	0.00	0.02	0.32	0.38	0.35
N2	0.08	0.01	0.49	0.83	0.01	0.34	0.01	0.66	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.55	0.16	0.38	0.05	0.04	0.36	0.19
N3	0.07	0.01	0.40	0.67	0.01	0.28	0.01	0.44	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.34	0.13	0.12	0.05	0.12	0.02	0.10
N7	0.01	0.01	0.13	0.03	0.01	0.06	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.12	0.01	0.70	0.03	0.77	1.45	1.13
N9	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.00	0.45	0.04	0.43	0.75	0.66
O2'	0.03	0.13	0.00	0.02	0.02	0.23	0.13	0.01	0.07	0.32	0.04	0.21	0.13	0.29	0.12	0.00	0.04	0.17	0.38	0.10	0.20	0.36	0.36
O3'	0.24	0.42	0.00	0.01	0.13	0.01	0.07	0.20	0.20	0.23	0.35	0.55	0.34	0.12	0.09	0.04	0.00	0.19	0.04	0.19	0.04	0.48	0.15
O4'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.09	0.16	0.13	0.01	0.00	0.17	0.19	0.00	0.05	0.02	0.03	0.11	0.00
O5'	0.31	0.17	0.62	0.26	0.20	0.01	0.39	0.00	0.25	0.76	0.00	0.38	0.12	0.70	0.45	0.38	0.04	0.05	0.00	0.32	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.04	0.16	0.40	0.03	0.12	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.04	0.10	0.19	0.02	0.32	0.00	0.62	1.05	0.82
OP1	0.20	0.13	0.54	0.32	0.35	0.12	0.56	0.36	0.52	0.70	0.32	0.04	0.12	0.77	0.43	0.20	0.04	0.03	0.02	0.62	0.00	0.00	0.01
OP2	0.34	0.01	0.59	0.00	0.53	0.31	0.96	0.28	0.83	1.35	0.38	0.36	0.02	1.45	0.75	0.36	0.48	0.11	0.02	1.05	0.00	0.00	0.00
P	0.36	0.08	0.62	0.18	0.48	0.06	0.79	0.01	0.68	1.08	0.35	0.19	0.10	1.13	0.66	0.36	0.15	0.00	0.00	0.82	0.01	0.00	0.00