sequences=7
<param>
maxmove=0.1
pval=0.1
usescval=false
complexatt=true
cooling=1.0
currcool=1.0
attfactor=10.0
attvalpow=1
repfactor=10.0
repvalpow=1
dampening=1.0
minattract=1.0
cluster2d=false
blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500
formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb
showinfo=true
zoom=1.0
dotsize=0
ovalsize=10
groupsize=4
usefoldchange=false
avgfoldchange=false
colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9;
colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23):
</param>
<rotmtx>
1.0;0.0;0.0;
0.0;1.0;0.0;
0.0;0.0;1.0;
</rotmtx>
<seq>
>2VQE-A171-A213
X
>2VQF-A171-A213
X
>2UUB-A171-A213
X
>1XMQ-A171-A213
X
>2UUA-A171-A213
X
>2UXC-A171-A213
X
>1N32-A171-A213
X
</seq>
<hsp>
0 1:0.199888269403
0 2:1.0
0 3:0.818170661982
0 4:0.6348152125
0 5:0.702347294141
0 6:0.574851103645
1 2:0.861160659685
1 3:0.7267982209
1 4:0.594524367981
1 5:0.63873932707
1 6:0.574426715388
2 3:0.494531889457
2 4:0.892444685768
2 5:0.619183941342
2 6:0.880544755033
3 4:0.583064419721
3 5:0.414152644121
3 6:0.560598535014
4 5:0.479410935449
4 6:0.504200561311
5 6:0.3388154083
</hsp>