Doublet Group distance statistics: 50851

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.003, 0.020, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.001, 0.023, 0.046, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.004, 0.030, 0.055, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.030 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.002, 0.036, 0.069, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.036 std_dev=0.034
C8	A	0, -0.003, 0.043, 0.088, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.043 std_dev=0.046
O4	B	0, 0.201, 0.461, 0.722, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.461 std_dev=0.260
C4	B	0, 0.209, 0.521, 0.832, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.521 std_dev=0.311
C2'	A	0, -0.080, 0.243, 0.567, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.243 std_dev=0.324
O4'	A	0, -0.058, 0.278, 0.615, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.278 std_dev=0.337
N3	B	0, 0.240, 0.585, 0.929, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.585 std_dev=0.345
C5	B	0, 0.218, 0.575, 0.933, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.575 std_dev=0.358
C3'	A	0, -0.118, 0.271, 0.660, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.271 std_dev=0.389
C2	B	0, 0.258, 0.674, 1.090, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.674 std_dev=0.416
C6	B	0, 0.267, 0.688, 1.110, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.688 std_dev=0.421
C4'	A	0, -0.070, 0.352, 0.774, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.352 std_dev=0.422
O2	B	0, 0.286, 0.730, 1.174, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.730 std_dev=0.444
N1	B	0, 0.276, 0.729, 1.183, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.729 std_dev=0.454
P	A	0, 0.211, 0.670, 1.130, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.670 std_dev=0.459
C1'	B	0, 0.312, 0.849, 1.385, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.849 std_dev=0.537
C2'	B	0, 0.365, 0.921, 1.477, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.921 std_dev=0.556
O3'	A	0, -0.220, 0.350, 0.921, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.350 std_dev=0.571
O5'	A	0, 0.173, 0.747, 1.321, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.747 std_dev=0.574
C5'	A	0, -0.007, 0.582, 1.170, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.582 std_dev=0.588
O4'	B	0, 0.257, 0.859, 1.462, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.859 std_dev=0.603
O2'	B	0, 0.443, 1.068, 1.693, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.068 std_dev=0.625
C3'	B	0, 0.233, 0.873, 1.512, 2.433 max_d=2.433 avg_d=0.873 std_dev=0.640
O2'	A	0, -0.177, 0.480, 1.137, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.480 std_dev=0.657
C4'	B	0, 0.273, 0.941, 1.608, 2.653 max_d=2.653 avg_d=0.941 std_dev=0.667
O3'	B	0, 0.290, 0.964, 1.638, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.964 std_dev=0.674
C5'	B	0, 0.310, 1.028, 1.747, 2.884 max_d=2.884 avg_d=1.028 std_dev=0.719
P	B	0, 0.220, 0.981, 1.742, 3.054 max_d=3.054 avg_d=0.981 std_dev=0.761
OP1	B	0, 0.298, 1.064, 1.830, 3.147 max_d=3.147 avg_d=1.064 std_dev=0.766
O5'	B	0, 0.305, 1.081, 1.856, 3.128 max_d=3.128 avg_d=1.081 std_dev=0.776
OP1	A	0, 0.288, 1.070, 1.852, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.070 std_dev=0.782
OP2	B	0, 0.047, 0.864, 1.681, 3.098 max_d=3.098 avg_d=0.864 std_dev=0.817
OP2	A	0, 0.289, 1.210, 2.130, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.210 std_dev=0.921

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.21	0.01	0.34	0.47	0.14
C2	0.03	0.00	0.16	0.08	0.00	0.10	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.25	0.16	0.21	0.00	0.39	0.55	0.15
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.12	0.05	0.12	0.11	0.20	0.17	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.39	0.03	0.39	0.62	0.38
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.03	0.15	0.17	0.12	0.06	0.07	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.22	0.16	0.20	0.47	0.25
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.16	0.07	0.25	0.01	0.48	0.58	0.13
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.15	0.05	0.15	0.10	0.13	0.05	0.18	0.01	0.01	0.03	0.06	0.25	0.32	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.09	0.03	0.30	0.01	0.61	0.66	0.13
C5'	0.05	0.12	0.12	0.03	0.08	0.01	0.12	0.00	0.11	0.20	0.09	0.16	0.12	0.20	0.09	0.09	0.15	0.03	0.02	0.13	0.36	0.42	0.03
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.12	0.04	0.29	0.00	0.61	0.66	0.13
C8	0.02	0.01	0.12	0.17	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.05	0.14	0.35	0.01	0.66	0.69	0.15
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.20	0.10	0.25	0.00	0.50	0.60	0.13
N2	0.03	0.00	0.20	0.06	0.01	0.15	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.31	0.20	0.20	0.00	0.31	0.51	0.17
N3	0.03	0.00	0.17	0.07	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.26	0.16	0.21	0.01	0.36	0.53	0.15
N7	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.06	0.11	0.35	0.01	0.72	0.72	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.03	0.28	0.01	0.49	0.58	0.14
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.12	0.18	0.23	0.09	0.21	0.30	0.14	0.20	0.15	0.32	0.15	0.00	0.03	0.13	0.32	0.27	0.31	0.51	0.30
O3'	0.20	0.25	0.02	0.01	0.16	0.01	0.09	0.15	0.12	0.05	0.20	0.31	0.26	0.06	0.10	0.03	0.00	0.12	0.09	0.10	0.15	0.29	0.05
O4'	0.00	0.16	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.03	0.04	0.14	0.10	0.20	0.16	0.11	0.03	0.13	0.12	0.00	0.13	0.04	0.40	0.37	0.08
O5'	0.21	0.21	0.39	0.22	0.25	0.03	0.30	0.02	0.29	0.35	0.25	0.20	0.21	0.35	0.28	0.32	0.09	0.13	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.00	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.04	0.31	0.00	0.69	0.70	0.13
OP1	0.34	0.39	0.39	0.20	0.48	0.25	0.61	0.36	0.61	0.66	0.50	0.31	0.36	0.72	0.49	0.31	0.15	0.40	0.02	0.69	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.55	0.62	0.47	0.58	0.32	0.66	0.42	0.66	0.69	0.60	0.51	0.53	0.72	0.58	0.51	0.29	0.37	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.15	0.38	0.25	0.13	0.02	0.13	0.03	0.13	0.15	0.13	0.17	0.15	0.15	0.14	0.30	0.05	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.18	0.17	0.18	0.17	0.19	0.15	0.31	0.15	0.16	0.18	0.18	0.17	0.18	0.20	0.18	0.20	0.20	0.40	0.19
C2	0.17	0.18	0.18	0.17	0.18	0.20	0.18	0.38	0.18	0.17	0.19	0.18	0.20	0.17	0.20	0.18	0.27	0.12	0.34	0.12
C2'	0.18	0.21	0.18	0.18	0.22	0.20	0.17	0.27	0.17	0.18	0.24	0.23	0.18	0.18	0.25	0.21	0.22	0.31	0.53	0.32
C3'	0.15	0.17	0.15	0.11	0.17	0.13	0.16	0.23	0.15	0.16	0.18	0.18	0.16	0.11	0.18	0.15	0.33	0.09	0.26	0.10
C4	0.13	0.15	0.14	0.14	0.17	0.16	0.14	0.33	0.13	0.14	0.17	0.16	0.15	0.15	0.20	0.14	0.24	0.14	0.36	0.14
C4'	0.13	0.14	0.13	0.10	0.15	0.12	0.13	0.22	0.13	0.13	0.15	0.14	0.13	0.10	0.17	0.14	0.34	0.14	0.30	0.15
C5	0.11	0.14	0.13	0.12	0.17	0.15	0.13	0.34	0.11	0.12	0.16	0.15	0.12	0.13	0.20	0.12	0.25	0.14	0.36	0.12
C5'	0.23	0.21	0.22	0.18	0.19	0.21	0.20	0.25	0.21	0.22	0.20	0.22	0.23	0.17	0.19	0.25	0.47	0.27	0.35	0.29
C6	0.11	0.12	0.12	0.11	0.15	0.17	0.12	0.38	0.11	0.11	0.14	0.13	0.12	0.12	0.18	0.12	0.28	0.11	0.33	0.10
C8	0.13	0.16	0.14	0.14	0.18	0.15	0.15	0.29	0.13	0.14	0.18	0.17	0.13	0.14	0.21	0.13	0.24	0.20	0.39	0.17
N1	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.19	0.15	0.40	0.15	0.14	0.15	0.14	0.16	0.15	0.18	0.15	0.28	0.12	0.33	0.11
N2	0.21	0.22	0.21	0.21	0.22	0.23	0.21	0.40	0.21	0.22	0.22	0.22	0.25	0.20	0.23	0.21	0.28	0.14	0.33	0.14
N3	0.17	0.18	0.17	0.16	0.18	0.18	0.16	0.35	0.16	0.17	0.19	0.18	0.19	0.17	0.21	0.17	0.24	0.13	0.35	0.13
N7	0.12	0.15	0.13	0.12	0.18	0.14	0.14	0.31	0.12	0.13	0.18	0.16	0.12	0.13	0.21	0.12	0.25	0.18	0.37	0.15
N9	0.14	0.16	0.15	0.15	0.18	0.16	0.14	0.30	0.13	0.14	0.18	0.17	0.14	0.16	0.20	0.15	0.22	0.18	0.38	0.17
O2'	0.58	0.49	0.54	0.56	0.42	0.62	0.44	0.65	0.51	0.53	0.45	0.51	0.57	0.57	0.39	0.64	0.50	0.72	0.90	0.73
O3'	0.19	0.21	0.19	0.23	0.23	0.22	0.19	0.34	0.19	0.19	0.23	0.21	0.18	0.23	0.28	0.19	0.14	0.15	0.39	0.16
O4'	0.14	0.17	0.16	0.15	0.18	0.13	0.15	0.24	0.14	0.15	0.18	0.17	0.15	0.15	0.21	0.15	0.31	0.17	0.33	0.16
O5'	0.32	0.25	0.31	0.34	0.25	0.38	0.28	0.49	0.31	0.29	0.24	0.24	0.32	0.35	0.24	0.35	0.33	0.39	0.42	0.34
O6	0.11	0.13	0.11	0.08	0.15	0.18	0.12	0.41	0.11	0.11	0.15	0.14	0.10	0.09	0.19	0.12	0.30	0.11	0.32	0.09
OP1	0.69	0.62	0.70	0.73	0.61	0.76	0.67	0.78	0.69	0.67	0.60	0.61	0.69	0.73	0.56	0.75	0.90	0.90	0.90	0.87
OP2	0.69	0.58	0.68	0.75	0.58	0.80	0.66	0.93	0.70	0.66	0.55	0.55	0.70	0.77	0.56	0.74	0.83	0.90	0.90	0.88
P	0.15	0.11	0.13	0.15	0.11	0.19	0.11	0.32	0.13	0.12	0.12	0.11	0.16	0.16	0.14	0.15	0.21	0.16	0.23	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.25	0.21	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.01	0.20	0.20	0.25	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.27	0.17	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.02	0.08	0.10	0.15	0.16	0.01	0.00	0.14	0.02	0.17	0.30	0.15	0.12
C4	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.14	0.01	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.00	0.02	0.28	0.14	0.27	0.08
C4'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.14	0.00	0.15	0.01	0.13	0.08	0.11	0.05	0.03	0.01	0.14	0.00	0.03	0.24	0.26	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.15	0.00	0.36	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.03	0.30	0.13	0.27	0.08
C5'	0.04	0.21	0.01	0.02	0.35	0.01	0.36	0.00	0.30	0.21	0.28	0.15	0.03	0.02	0.37	0.02	0.01	0.24	0.35	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.13	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.27	0.16	0.27	0.07
N1	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.20	0.20	0.25	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.11	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.02	0.24	0.18	0.26	0.07
O2	0.02	0.00	0.10	0.16	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.01	0.15	0.23	0.24	0.05
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.06	0.00	0.04	0.07	0.07	0.10	0.24	0.25	0.09
O3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.13	0.01	0.11	0.02	0.08	0.07	0.13	0.13	0.04	0.00	0.14	0.01	0.12	0.28	0.17	0.06
O4	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.14	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.02	0.30	0.13	0.26	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.13	0.23	0.21	0.05
O5'	0.14	0.20	0.12	0.17	0.28	0.03	0.30	0.01	0.27	0.20	0.24	0.15	0.10	0.12	0.30	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02
OP1	0.25	0.20	0.27	0.30	0.14	0.24	0.13	0.24	0.16	0.20	0.18	0.23	0.24	0.28	0.13	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.25	0.17	0.15	0.27	0.26	0.27	0.35	0.27	0.25	0.26	0.24	0.25	0.17	0.26	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.07	0.12	0.08	0.06	0.08	0.01	0.07	0.06	0.07	0.05	0.09	0.06	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00