Doublet Group distance statistics: 50858

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 0, 9, 29, 22, 7, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.016, 0.032, 0.047, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.037 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.014, 0.041, 0.067, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.041 std_dev=0.026
C5	B	0, 0.281, 0.417, 0.554, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.417 std_dev=0.136
N7	B	0, 0.496, 0.649, 0.802, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.649 std_dev=0.153
C4	B	0, 0.442, 0.602, 0.763, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.602 std_dev=0.161
O6	B	0, 0.336, 0.523, 0.710, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.523 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.485, 0.686, 0.887, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.686 std_dev=0.201
C6	B	0, 0.110, 0.316, 0.522, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.316 std_dev=0.206
N3	B	0, 0.316, 0.524, 0.733, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.524 std_dev=0.208
C2'	A	0, 0.438, 0.660, 0.883, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.660 std_dev=0.223
N9	B	0, 0.735, 0.962, 1.189, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.962 std_dev=0.227
C8	B	0, 0.729, 0.973, 1.216, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.973 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.167, 0.414, 0.660, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.414 std_dev=0.247
O4'	A	0, 0.420, 0.674, 0.927, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.674 std_dev=0.254
C2	B	0, 0.062, 0.337, 0.613, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.337 std_dev=0.276
C4'	A	0, 0.774, 1.088, 1.403, 1.477 max_d=1.477 avg_d=1.088 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.964, 1.282, 1.600, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.282 std_dev=0.318
N2	B	0, 0.177, 0.495, 0.812, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.495 std_dev=0.318
C3'	A	0, 0.818, 1.140, 1.462, 1.503 max_d=1.503 avg_d=1.140 std_dev=0.322
O3'	A	0, 1.149, 1.572, 1.994, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.572 std_dev=0.422
O2'	B	0, 1.351, 1.819, 2.288, 2.720 max_d=2.720 avg_d=1.819 std_dev=0.469
C5'	A	0, 1.297, 1.834, 2.370, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.834 std_dev=0.537
O5'	A	0, 1.371, 1.922, 2.473, 2.620 max_d=2.620 avg_d=1.922 std_dev=0.551
C2'	B	0, 1.505, 2.190, 2.874, 2.991 max_d=2.991 avg_d=2.190 std_dev=0.685
P	A	0, 1.782, 2.496, 3.210, 3.463 max_d=3.463 avg_d=2.496 std_dev=0.714
OP2	A	0, 1.997, 2.822, 3.647, 3.928 max_d=3.928 avg_d=2.822 std_dev=0.825
OP1	A	0, 1.882, 2.721, 3.560, 4.359 max_d=4.359 avg_d=2.721 std_dev=0.839
O4'	B	0, 1.672, 2.591, 3.510, 3.437 max_d=3.437 avg_d=2.591 std_dev=0.919
C3'	B	0, 2.079, 3.286, 4.494, 4.298 max_d=4.298 avg_d=3.286 std_dev=1.208
O3'	B	0, 2.334, 3.587, 4.840, 4.670 max_d=4.670 avg_d=3.587 std_dev=1.253
C4'	B	0, 2.152, 3.496, 4.840, 4.596 max_d=4.596 avg_d=3.496 std_dev=1.344
O5'	B	0, 2.895, 4.555, 6.215, 5.818 max_d=5.818 avg_d=4.555 std_dev=1.660
C5'	B	0, 2.787, 4.625, 6.463, 6.052 max_d=6.052 avg_d=4.625 std_dev=1.838
OP2	B	0, 3.275, 5.142, 7.008, 6.581 max_d=6.581 avg_d=5.142 std_dev=1.867
P	B	0, 3.429, 5.361, 7.292, 6.876 max_d=6.876 avg_d=5.361 std_dev=1.931
OP1	B	0, 4.231, 6.420, 8.610, 8.256 max_d=8.256 avg_d=6.420 std_dev=2.189

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.19	0.01	0.19	0.24	0.18
C2	0.03	0.00	0.28	0.22	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.29	0.16	0.25	0.01	0.24	0.33	0.23
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.02	0.09	0.03	0.15	0.10	0.23	0.32	0.27	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.12	0.12	0.18	0.21	0.12
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.02	0.19	0.19	0.21	0.25	0.20	0.18	0.11	0.02	0.01	0.01	0.14	0.19	0.22	0.19	0.14
C4	0.01	0.01	0.15	0.15	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.15	0.08	0.27	0.01	0.25	0.34	0.25
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.14	0.06	0.11	0.07	0.13	0.06	0.11	0.02	0.00	0.01	0.09	0.12	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.13	0.05	0.32	0.01	0.31	0.41	0.30
C5'	0.04	0.16	0.03	0.02	0.15	0.00	0.20	0.00	0.21	0.23	0.18	0.18	0.13	0.25	0.14	0.08	0.05	0.01	0.01	0.24	0.22	0.26	0.01
C6	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.08	0.31	0.00	0.31	0.42	0.29
C8	0.01	0.01	0.10	0.19	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.08	0.39	0.01	0.37	0.40	0.37
N1	0.02	0.00	0.23	0.21	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.25	0.13	0.28	0.01	0.26	0.38	0.25
N2	0.04	0.01	0.32	0.25	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.33	0.36	0.19	0.24	0.01	0.24	0.32	0.22
N3	0.02	0.01	0.27	0.20	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.26	0.15	0.24	0.01	0.22	0.31	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.13	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.16	0.04	0.39	0.01	0.39	0.47	0.38
N9	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.28	0.01	0.26	0.31	0.26
O2'	0.02	0.27	0.00	0.02	0.14	0.11	0.11	0.08	0.15	0.12	0.22	0.33	0.25	0.10	0.06	0.00	0.07	0.09	0.12	0.14	0.19	0.20	0.11
O3'	0.07	0.29	0.03	0.01	0.15	0.02	0.13	0.05	0.18	0.17	0.25	0.36	0.26	0.16	0.07	0.07	0.00	0.04	0.23	0.18	0.33	0.26	0.25
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.08	0.13	0.19	0.15	0.04	0.01	0.09	0.04	0.00	0.20	0.07	0.23	0.24	0.20
O5'	0.19	0.25	0.12	0.14	0.27	0.01	0.32	0.01	0.31	0.39	0.28	0.24	0.24	0.39	0.28	0.12	0.23	0.20	0.00	0.33	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.12	0.19	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.07	0.33	0.00	0.34	0.47	0.32
OP1	0.19	0.24	0.18	0.22	0.25	0.12	0.31	0.22	0.31	0.37	0.26	0.24	0.22	0.39	0.26	0.19	0.33	0.23	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.33	0.21	0.19	0.34	0.21	0.41	0.26	0.42	0.40	0.38	0.32	0.31	0.47	0.31	0.20	0.26	0.24	0.02	0.47	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.23	0.12	0.14	0.25	0.04	0.30	0.01	0.29	0.37	0.25	0.22	0.22	0.38	0.26	0.11	0.25	0.20	0.00	0.32	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.11	0.16	0.64	0.11	0.59	0.10	0.84	0.11	0.15	0.12	0.12	0.10	0.12	0.14	0.59	0.55	0.37	0.72	0.13	1.10	1.10	0.99
C2	0.16	0.10	0.14	0.55	0.10	0.45	0.10	0.62	0.10	0.17	0.11	0.10	0.09	0.14	0.14	0.48	0.36	0.29	0.54	0.14	0.78	0.87	0.76
C2'	0.21	0.32	0.33	0.36	0.26	0.30	0.28	0.51	0.33	0.21	0.34	0.33	0.29	0.24	0.23	0.76	0.29	0.18	0.43	0.36	0.82	0.81	0.69
C3'	0.20	0.25	0.34	0.42	0.23	0.37	0.23	0.58	0.26	0.20	0.27	0.26	0.24	0.22	0.21	0.75	0.41	0.21	0.47	0.28	0.87	0.82	0.72
C4	0.15	0.10	0.16	0.59	0.09	0.58	0.09	0.83	0.11	0.15	0.12	0.11	0.09	0.11	0.13	0.61	0.48	0.39	0.70	0.15	1.03	1.07	0.97
C4'	0.21	0.15	0.21	0.74	0.17	0.67	0.15	0.91	0.14	0.19	0.14	0.16	0.16	0.16	0.19	0.56	0.71	0.42	0.76	0.13	1.17	1.11	1.02
C5	0.15	0.12	0.22	0.58	0.10	0.65	0.10	0.93	0.13	0.13	0.14	0.12	0.10	0.10	0.12	0.69	0.49	0.47	0.78	0.17	1.12	1.14	1.07
C5'	0.36	0.28	0.31	0.91	0.30	0.86	0.28	1.12	0.25	0.32	0.26	0.29	0.30	0.29	0.33	0.53	0.94	0.59	0.93	0.22	1.36	1.24	1.18
C6	0.15	0.12	0.23	0.54	0.10	0.63	0.11	0.90	0.15	0.13	0.15	0.13	0.10	0.10	0.12	0.69	0.43	0.47	0.75	0.20	1.02	1.08	1.02
C8	0.16	0.11	0.22	0.61	0.10	0.70	0.09	1.00	0.12	0.13	0.13	0.12	0.10	0.10	0.12	0.72	0.58	0.49	0.84	0.16	1.25	1.20	1.15
N1	0.15	0.11	0.16	0.53	0.09	0.52	0.09	0.72	0.13	0.15	0.13	0.11	0.09	0.10	0.12	0.57	0.35	0.36	0.60	0.18	0.83	0.90	0.83
N2	0.17	0.11	0.17	0.52	0.14	0.34	0.13	0.46	0.11	0.19	0.11	0.11	0.12	0.18	0.17	0.38	0.30	0.21	0.41	0.12	0.62	0.73	0.60
N3	0.16	0.10	0.14	0.58	0.11	0.49	0.10	0.69	0.10	0.16	0.11	0.11	0.10	0.13	0.14	0.51	0.42	0.31	0.59	0.13	0.88	0.95	0.83
N7	0.16	0.12	0.26	0.59	0.10	0.72	0.10	1.04	0.14	0.13	0.15	0.13	0.11	0.10	0.12	0.76	0.56	0.53	0.87	0.18	1.27	1.23	1.19
N9	0.15	0.10	0.17	0.62	0.10	0.62	0.09	0.89	0.11	0.14	0.12	0.11	0.09	0.11	0.13	0.64	0.54	0.42	0.76	0.14	1.13	1.12	1.04
O2'	0.23	0.33	0.30	0.38	0.27	0.30	0.28	0.48	0.32	0.23	0.35	0.34	0.29	0.24	0.24	0.70	0.25	0.22	0.44	0.35	0.82	0.84	0.70
O3'	0.27	0.36	0.42	0.29	0.32	0.23	0.33	0.41	0.36	0.27	0.38	0.37	0.34	0.29	0.29	0.81	0.27	0.18	0.34	0.38	0.75	0.69	0.58
O4'	0.31	0.23	0.25	0.86	0.26	0.80	0.24	1.06	0.21	0.29	0.21	0.23	0.25	0.26	0.29	0.50	0.81	0.55	0.91	0.20	1.29	1.26	1.17
O5'	0.22	0.24	0.32	0.58	0.23	0.59	0.23	0.86	0.24	0.22	0.24	0.24	0.23	0.22	0.22	0.78	0.63	0.37	0.69	0.25	1.08	0.94	0.90
O6	0.15	0.15	0.32	0.50	0.12	0.70	0.14	1.01	0.18	0.12	0.18	0.16	0.13	0.12	0.12	0.78	0.43	0.55	0.83	0.22	1.09	1.13	1.12
OP1	0.32	0.28	0.37	0.78	0.28	0.81	0.26	1.08	0.25	0.28	0.26	0.29	0.29	0.26	0.29	0.73	0.90	0.55	0.84	0.23	1.26	1.05	1.05
OP2	0.39	0.38	0.47	0.76	0.38	0.83	0.37	1.11	0.37	0.38	0.37	0.38	0.38	0.38	0.38	0.84	0.90	0.60	0.85	0.37	1.25	1.02	1.05
P	0.24	0.24	0.30	0.73	0.22	0.77	0.22	1.06	0.22	0.22	0.23	0.25	0.23	0.22	0.23	0.73	0.84	0.50	0.82	0.23	1.25	1.05	1.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.35	0.01	0.18	0.02	0.25	0.18	0.14
C2	0.03	0.00	0.36	0.19	0.01	0.19	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.38	0.31	0.23	0.01	0.22	0.31	0.17
C2'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.20	0.01	0.12	0.16	0.18	0.15	0.29	0.42	0.35	0.07	0.03	0.00	0.05	0.03	0.52	0.15	0.59	0.61	0.51
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.23	0.00	0.31	0.02	0.32	0.31	0.26	0.16	0.16	0.35	0.21	0.02	0.01	0.01	0.27	0.36	0.44	0.20	0.24
C4	0.02	0.01	0.20	0.23	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.24	0.16	0.20	0.01	0.21	0.31	0.21
C4'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.05	0.26	0.11	0.28	0.19	0.22	0.09	0.25	0.03	0.00	0.01	0.08	0.24	0.15	0.09
C5	0.01	0.01	0.12	0.31	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.15	0.08	0.24	0.01	0.29	0.45	0.32
C5'	0.05	0.19	0.16	0.02	0.07	0.01	0.15	0.00	0.11	0.33	0.11	0.29	0.19	0.31	0.11	0.09	0.19	0.01	0.01	0.16	0.17	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.18	0.32	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.18	0.15	0.24	0.00	0.29	0.49	0.33
C8	0.01	0.01	0.15	0.31	0.01	0.26	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.11	0.17	0.28	0.01	0.34	0.42	0.38
N1	0.03	0.00	0.29	0.26	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.28	0.25	0.22	0.01	0.22	0.40	0.24
N2	0.04	0.00	0.42	0.16	0.01	0.28	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.35	0.47	0.37	0.26	0.01	0.26	0.27	0.17
N3	0.03	0.01	0.35	0.16	0.00	0.19	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.40	0.30	0.23	0.01	0.23	0.25	0.16
N7	0.01	0.01	0.07	0.35	0.00	0.22	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.14	0.08	0.31	0.01	0.40	0.53	0.44
N9	0.00	0.01	0.03	0.21	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.18	0.01	0.18	0.01	0.21	0.27	0.20
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.08	0.25	0.22	0.09	0.16	0.43	0.10	0.35	0.22	0.40	0.20	0.00	0.08	0.16	0.31	0.22	0.48	0.59	0.37
O3'	0.35	0.38	0.05	0.01	0.24	0.03	0.15	0.19	0.18	0.11	0.28	0.47	0.40	0.14	0.18	0.08	0.00	0.22	0.16	0.16	0.31	0.20	0.14
O4'	0.01	0.31	0.03	0.01	0.16	0.00	0.08	0.01	0.15	0.17	0.25	0.37	0.30	0.08	0.01	0.16	0.22	0.00	0.07	0.12	0.26	0.18	0.20
O5'	0.18	0.23	0.52	0.27	0.20	0.01	0.24	0.01	0.24	0.28	0.22	0.26	0.23	0.31	0.18	0.31	0.16	0.07	0.00	0.28	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.36	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.16	0.12	0.28	0.00	0.36	0.58	0.40
OP1	0.25	0.22	0.59	0.44	0.21	0.24	0.29	0.17	0.29	0.34	0.22	0.26	0.23	0.40	0.21	0.48	0.31	0.26	0.01	0.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.31	0.61	0.20	0.31	0.15	0.45	0.25	0.49	0.42	0.40	0.27	0.25	0.53	0.27	0.59	0.20	0.18	0.02	0.58	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.51	0.24	0.21	0.09	0.32	0.01	0.33	0.38	0.24	0.17	0.16	0.44	0.20	0.37	0.14	0.20	0.00	0.40	0.01	0.01	0.00