Doublet Group distance statistics: 50862

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 1, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.002, 0.026, 0.051, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.026, 0.052, 0.077, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.052 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.032 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.009, 0.039, 0.068, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.039 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.010, 0.056, 0.102, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.056 std_dev=0.046
N7	A	0, -0.003, 0.049, 0.101, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.049 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.000, 0.058, 0.115, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.058 std_dev=0.058
OP2	B	0, 0.295, 0.497, 0.699, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.497 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.267, 0.550, 0.833, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.550 std_dev=0.283
C4	B	0, 0.276, 0.563, 0.850, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.563 std_dev=0.287
C8	B	0, 0.214, 0.507, 0.800, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.507 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.235, 0.533, 0.832, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.533 std_dev=0.298
P	B	0, 0.257, 0.559, 0.860, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.559 std_dev=0.301
N7	B	0, 0.199, 0.505, 0.810, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.505 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.256, 0.578, 0.900, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.578 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.304, 0.627, 0.950, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.627 std_dev=0.323
C2'	B	0, 0.300, 0.641, 0.982, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.641 std_dev=0.341
C1'	B	0, 0.281, 0.628, 0.975, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.628 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.300, 0.654, 1.008, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.654 std_dev=0.354
C6	B	0, 0.223, 0.579, 0.934, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.579 std_dev=0.356
N1	B	0, 0.259, 0.624, 0.989, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.624 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.257, 0.638, 1.020, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.638 std_dev=0.382
O4'	B	0, 0.249, 0.635, 1.021, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.635 std_dev=0.386
O5'	B	0, 0.134, 0.535, 0.936, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.535 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.215, 0.617, 1.018, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.617 std_dev=0.402
O4'	A	0, -0.038, 0.369, 0.777, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.369 std_dev=0.408
O6	B	0, 0.213, 0.628, 1.042, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.628 std_dev=0.415
N2	B	0, 0.313, 0.741, 1.168, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.741 std_dev=0.428
C2'	A	0, -0.033, 0.397, 0.828, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.397 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.370, 0.802, 1.234, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.802 std_dev=0.432
OP2	A	0, 0.173, 0.614, 1.056, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.614 std_dev=0.441
C5'	B	0, 0.131, 0.581, 1.031, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.581 std_dev=0.450
P	A	0, 0.110, 0.591, 1.072, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.591 std_dev=0.481
OP1	B	0, 0.306, 0.796, 1.285, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.796 std_dev=0.489
O5'	A	0, 0.035, 0.530, 1.024, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.530 std_dev=0.495
OP1	A	0, 0.165, 0.699, 1.233, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.699 std_dev=0.534
O2'	A	0, 0.018, 0.657, 1.295, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.657 std_dev=0.639
C4'	A	0, -0.142, 0.607, 1.357, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.607 std_dev=0.750
C3'	A	0, -0.166, 0.651, 1.469, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.651 std_dev=0.818
C5'	A	0, -0.125, 0.781, 1.687, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.781 std_dev=0.906
O3'	A	0, -0.247, 1.014, 2.275, 3.315 max_d=3.315 avg_d=1.014 std_dev=1.261

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.26	0.01	0.32	0.04	0.30	0.23	0.22
C2	0.04	0.00	0.37	0.39	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.14	0.36	0.03	0.34	0.34	0.31
C2'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.21	0.03	0.14	0.16	0.21	0.14	0.31	0.42	0.35	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.57	0.20	0.63	0.55	0.55
C3'	0.02	0.39	0.01	0.00	0.36	0.01	0.44	0.02	0.49	0.31	0.46	0.36	0.32	0.41	0.26	0.02	0.01	0.03	0.28	0.54	0.42	0.17	0.23
C4	0.02	0.01	0.21	0.36	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.15	0.07	0.39	0.03	0.35	0.33	0.32
C4'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.18	0.17	0.14	0.08	0.08	0.19	0.10	0.31	0.02	0.00	0.03	0.21	0.14	0.24	0.05
C5	0.02	0.01	0.14	0.44	0.01	0.17	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.27	0.28	0.03	0.43	0.02	0.40	0.39	0.38
C5'	0.06	0.14	0.16	0.02	0.15	0.01	0.21	0.00	0.23	0.20	0.19	0.13	0.12	0.24	0.12	0.15	0.20	0.01	0.01	0.28	0.25	0.34	0.01
C6	0.03	0.02	0.21	0.49	0.02	0.18	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.26	0.34	0.06	0.42	0.01	0.40	0.41	0.39
C8	0.01	0.02	0.14	0.31	0.01	0.17	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.32	0.20	0.08	0.45	0.03	0.40	0.35	0.37
N1	0.03	0.01	0.31	0.46	0.01	0.14	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.18	0.28	0.10	0.40	0.02	0.38	0.38	0.36
N2	0.05	0.01	0.42	0.36	0.01	0.08	0.02	0.13	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.20	0.17	0.34	0.05	0.32	0.33	0.29
N3	0.04	0.01	0.35	0.32	0.01	0.08	0.01	0.12	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.13	0.34	0.03	0.31	0.30	0.28
N7	0.02	0.01	0.08	0.41	0.01	0.19	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.35	0.31	0.05	0.46	0.04	0.43	0.41	0.42
N9	0.01	0.01	0.03	0.26	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.08	0.01	0.39	0.04	0.35	0.30	0.30
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.18	0.31	0.27	0.15	0.26	0.32	0.18	0.18	0.13	0.35	0.20	0.00	0.03	0.21	0.30	0.30	0.39	0.50	0.35
O3'	0.26	0.19	0.03	0.01	0.15	0.02	0.28	0.20	0.34	0.20	0.28	0.20	0.16	0.31	0.08	0.03	0.00	0.18	0.22	0.43	0.35	0.37	0.26
O4'	0.01	0.14	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.10	0.17	0.13	0.05	0.01	0.21	0.18	0.00	0.17	0.05	0.14	0.18	0.07
O5'	0.32	0.36	0.57	0.28	0.39	0.03	0.43	0.01	0.42	0.45	0.40	0.34	0.34	0.46	0.39	0.30	0.22	0.17	0.00	0.43	0.01	0.01	0.01
O6	0.04	0.03	0.20	0.54	0.03	0.21	0.02	0.28	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.30	0.43	0.05	0.43	0.00	0.42	0.44	0.42
OP1	0.30	0.34	0.63	0.42	0.35	0.14	0.40	0.25	0.40	0.40	0.38	0.32	0.31	0.43	0.35	0.39	0.35	0.14	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.34	0.55	0.17	0.33	0.24	0.39	0.34	0.41	0.35	0.38	0.33	0.30	0.41	0.30	0.50	0.37	0.18	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.31	0.55	0.23	0.32	0.05	0.38	0.01	0.39	0.37	0.36	0.29	0.28	0.42	0.30	0.35	0.26	0.07	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.27	0.27	0.19	0.27	0.16	0.27	0.11	0.28	0.27	0.28	0.29	0.27	0.26	0.27	0.28	0.19	0.24	0.09	0.28	0.10	0.07	0.08
C2	0.15	0.21	0.16	0.11	0.15	0.09	0.18	0.05	0.26	0.13	0.25	0.22	0.16	0.15	0.13	0.15	0.11	0.18	0.06	0.32	0.06	0.05	0.06
C2'	0.65	0.59	0.66	0.60	0.64	0.57	0.61	0.50	0.56	0.63	0.56	0.58	0.63	0.62	0.65	0.67	0.59	0.63	0.46	0.51	0.43	0.39	0.46
C3'	0.49	0.35	0.47	0.46	0.41	0.50	0.37	0.51	0.32	0.48	0.33	0.37	0.39	0.41	0.46	0.48	0.44	0.55	0.47	0.31	0.56	0.49	0.56
C4	0.16	0.20	0.18	0.12	0.16	0.09	0.18	0.05	0.23	0.16	0.23	0.22	0.17	0.16	0.16	0.17	0.12	0.17	0.06	0.27	0.14	0.09	0.07
C4'	0.31	0.31	0.28	0.20	0.30	0.24	0.29	0.21	0.30	0.31	0.31	0.34	0.30	0.28	0.30	0.30	0.18	0.33	0.15	0.32	0.18	0.14	0.21
C5	0.14	0.20	0.16	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.23	0.13	0.23	0.21	0.16	0.14	0.13	0.14	0.11	0.18	0.11	0.28	0.23	0.15	0.15
C5'	0.33	0.31	0.30	0.23	0.31	0.26	0.30	0.23	0.31	0.33	0.31	0.34	0.31	0.30	0.32	0.32	0.21	0.35	0.18	0.32	0.20	0.17	0.23
C6	0.17	0.20	0.16	0.14	0.15	0.17	0.18	0.18	0.24	0.13	0.24	0.21	0.16	0.16	0.13	0.15	0.13	0.22	0.17	0.29	0.27	0.19	0.20
C8	0.16	0.22	0.18	0.12	0.18	0.09	0.19	0.08	0.24	0.16	0.25	0.24	0.19	0.17	0.16	0.17	0.12	0.16	0.08	0.27	0.22	0.13	0.12
N1	0.17	0.22	0.16	0.13	0.17	0.15	0.21	0.14	0.27	0.14	0.26	0.23	0.18	0.18	0.14	0.15	0.11	0.21	0.12	0.32	0.17	0.13	0.14
N2	0.15	0.24	0.16	0.12	0.17	0.10	0.23	0.08	0.31	0.13	0.29	0.24	0.18	0.19	0.14	0.16	0.12	0.18	0.12	0.37	0.10	0.10	0.13
N3	0.17	0.20	0.19	0.13	0.16	0.10	0.17	0.06	0.23	0.18	0.23	0.22	0.17	0.16	0.17	0.19	0.13	0.18	0.08	0.28	0.07	0.05	0.06
N7	0.14	0.20	0.16	0.12	0.15	0.12	0.18	0.13	0.23	0.13	0.24	0.22	0.16	0.15	0.13	0.15	0.11	0.17	0.12	0.27	0.27	0.16	0.17
N9	0.18	0.23	0.21	0.13	0.20	0.09	0.20	0.05	0.24	0.20	0.25	0.25	0.20	0.19	0.19	0.20	0.13	0.18	0.05	0.26	0.14	0.09	0.07
O2'	0.46	0.66	0.49	0.40	0.58	0.34	0.58	0.29	0.65	0.44	0.68	0.68	0.62	0.49	0.50	0.51	0.40	0.39	0.28	0.69	0.17	0.16	0.24
O3'	0.41	0.56	0.38	0.33	0.44	0.40	0.45	0.42	0.56	0.38	0.60	0.62	0.49	0.39	0.40	0.40	0.31	0.45	0.38	0.65	0.45	0.34	0.46
O4'	0.26	0.33	0.25	0.16	0.30	0.16	0.31	0.15	0.35	0.28	0.35	0.36	0.31	0.29	0.27	0.26	0.16	0.23	0.15	0.38	0.18	0.16	0.13
O5'	0.19	0.29	0.19	0.19	0.23	0.21	0.23	0.27	0.29	0.21	0.31	0.33	0.25	0.21	0.20	0.19	0.20	0.21	0.33	0.31	0.43	0.40	0.35
O6	0.22	0.22	0.19	0.19	0.18	0.25	0.20	0.28	0.26	0.16	0.25	0.22	0.18	0.19	0.17	0.20	0.18	0.29	0.26	0.30	0.39	0.25	0.30
OP1	0.19	0.27	0.17	0.17	0.20	0.21	0.20	0.28	0.26	0.19	0.29	0.32	0.22	0.18	0.18	0.18	0.18	0.23	0.33	0.28	0.44	0.40	0.36
OP2	0.31	0.33	0.29	0.26	0.30	0.30	0.31	0.35	0.33	0.31	0.35	0.36	0.31	0.29	0.30	0.29	0.24	0.34	0.37	0.34	0.48	0.42	0.42
P	0.21	0.32	0.20	0.17	0.26	0.21	0.27	0.28	0.32	0.23	0.35	0.36	0.28	0.23	0.22	0.21	0.18	0.23	0.32	0.35	0.44	0.39	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.05	0.10	0.11	0.09
C2	0.05	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.13	0.08	0.14	0.04	0.15	0.13	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.07	0.11	0.09	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.13	0.10	0.07
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.02	0.13	0.12	0.11	0.11	0.09	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.16	0.08	0.06
C4	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.04	0.15	0.03	0.14	0.09	0.08
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.13	0.06	0.06	0.05	0.13	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.12	0.11	0.06	0.05
C5	0.03	0.02	0.04	0.12	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.08	0.11	0.03	0.22	0.03	0.21	0.17	0.15
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.13	0.07	0.07	0.21	0.10	0.04	0.03	0.02	0.01	0.20	0.10	0.02	0.02
C6	0.04	0.03	0.06	0.13	0.02	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.11	0.13	0.04	0.24	0.01	0.24	0.22	0.18
C8	0.03	0.02	0.05	0.12	0.01	0.13	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.08	0.22	0.04	0.18	0.09	0.11
N1	0.04	0.01	0.07	0.11	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.13	0.06	0.20	0.03	0.20	0.18	0.14
N2	0.06	0.01	0.11	0.11	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.16	0.10	0.12	0.05	0.13	0.11	0.08
N3	0.05	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.12	0.09	0.11	0.03	0.12	0.08	0.07
N7	0.03	0.02	0.04	0.13	0.01	0.13	0.00	0.21	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.13	0.06	0.27	0.04	0.24	0.19	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.13	0.05	0.12	0.06	0.06
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.09	0.05	0.08	0.04	0.11	0.03	0.13	0.18	0.14	0.04	0.03	0.00	0.04	0.06	0.04	0.11	0.14	0.07	0.04
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.13	0.12	0.13	0.16	0.12	0.13	0.07	0.04	0.00	0.02	0.09	0.15	0.20	0.09	0.06
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.10	0.09	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.09	0.06	0.12	0.17	0.14
O5'	0.06	0.14	0.05	0.06	0.15	0.03	0.22	0.01	0.24	0.22	0.20	0.12	0.11	0.27	0.13	0.04	0.09	0.09	0.00	0.28	0.03	0.01	0.01
O6	0.05	0.04	0.07	0.14	0.03	0.12	0.03	0.20	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.11	0.15	0.06	0.28	0.00	0.29	0.27	0.22
OP1	0.10	0.15	0.13	0.16	0.14	0.11	0.21	0.10	0.24	0.18	0.20	0.13	0.12	0.24	0.12	0.14	0.20	0.12	0.03	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.13	0.10	0.08	0.09	0.06	0.17	0.02	0.22	0.09	0.18	0.11	0.08	0.19	0.06	0.07	0.09	0.17	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.09	0.07	0.06	0.08	0.05	0.15	0.02	0.18	0.11	0.14	0.08	0.07	0.19	0.06	0.04	0.06	0.14	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00