Doublet Group distance statistics: 50864

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.018
O6	A	0, -0.003, 0.023, 0.050, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.023 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.006, 0.032, 0.070, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.032 std_dev=0.038
N7	B	0, 0.059, 0.276, 0.493, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.276 std_dev=0.217
O2'	A	0, -0.066, 0.153, 0.372, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.153 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.051, 0.271, 0.492, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.271 std_dev=0.220
O4'	A	0, -0.045, 0.189, 0.423, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.189 std_dev=0.234
C2'	A	0, -0.063, 0.171, 0.406, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.171 std_dev=0.235
O6	B	0, 0.065, 0.312, 0.558, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.312 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.035, 0.292, 0.549, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.292 std_dev=0.257
C8	B	0, 0.060, 0.337, 0.613, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.337 std_dev=0.277
C4	B	0, 0.023, 0.312, 0.601, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.312 std_dev=0.289
N9	B	0, 0.041, 0.345, 0.649, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.345 std_dev=0.304
O5'	A	0, -0.133, 0.228, 0.589, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.228 std_dev=0.361
C2'	B	0, -0.035, 0.330, 0.695, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.330 std_dev=0.365
P	A	0, -0.136, 0.234, 0.605, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.234 std_dev=0.371
OP2	A	0, -0.076, 0.299, 0.674, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.299 std_dev=0.375
C4'	A	0, -0.075, 0.300, 0.675, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.300 std_dev=0.375
OP1	A	0, -0.124, 0.255, 0.633, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.255 std_dev=0.379
N1	B	0, -0.046, 0.338, 0.721, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.338 std_dev=0.383
C3'	A	0, -0.076, 0.312, 0.699, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.312 std_dev=0.387
N3	B	0, -0.034, 0.353, 0.741, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.353 std_dev=0.388
C1'	B	0, 0.029, 0.425, 0.821, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.425 std_dev=0.396
C2	B	0, -0.078, 0.359, 0.797, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.359 std_dev=0.437
C3'	B	0, -0.068, 0.370, 0.809, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.370 std_dev=0.438
O4'	B	0, 0.083, 0.584, 1.085, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.584 std_dev=0.501
O3'	A	0, -0.030, 0.474, 0.979, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.474 std_dev=0.504
O3'	B	0, -0.028, 0.510, 1.048, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.510 std_dev=0.538
O2'	B	0, -0.034, 0.525, 1.085, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.525 std_dev=0.559
N2	B	0, -0.146, 0.424, 0.994, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.424 std_dev=0.570
C4'	B	0, -0.044, 0.566, 1.176, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.566 std_dev=0.610
C5'	A	0, -0.189, 0.479, 1.147, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.479 std_dev=0.668
O5'	B	0, 0.068, 0.748, 1.428, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.748 std_dev=0.680
C5'	B	0, 0.042, 0.819, 1.597, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.819 std_dev=0.777
OP2	B	0, 0.022, 0.894, 1.766, 2.384 max_d=2.384 avg_d=0.894 std_dev=0.872
P	B	0, -0.014, 0.867, 1.749, 2.417 max_d=2.417 avg_d=0.867 std_dev=0.881
OP1	B	0, 0.056, 1.117, 2.178, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.117 std_dev=1.061

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.13	0.04
C2	0.02	0.00	0.14	0.21	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.24	0.03	0.20	0.01	0.13	0.07	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.09	0.18	0.14	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.03	0.22	0.07	0.16
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.00	0.08	0.03	0.11	0.08	0.17	0.26	0.20	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.30	0.09	0.30	0.05	0.23
C4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.14	0.07	0.12
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.09	0.13	0.10	0.03	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.06	0.04	0.23	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.27	0.01	0.19	0.08	0.18
C5'	0.03	0.19	0.03	0.03	0.15	0.00	0.15	0.00	0.17	0.06	0.19	0.21	0.17	0.11	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.16	0.08	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.02	0.29	0.00	0.20	0.10	0.20
C8	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.28	0.02	0.20	0.06	0.18
N1	0.01	0.00	0.09	0.17	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.19	0.02	0.25	0.02	0.17	0.07	0.17
N2	0.04	0.00	0.18	0.26	0.01	0.13	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.30	0.04	0.16	0.01	0.10	0.09	0.10
N3	0.02	0.00	0.14	0.20	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.21	0.03	0.16	0.01	0.11	0.09	0.09
N7	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.31	0.03	0.22	0.11	0.22
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.19	0.01	0.14	0.07	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.11	0.10	0.05
O3'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.12	0.03	0.08	0.03	0.12	0.09	0.19	0.30	0.21	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.26	0.11	0.32	0.05	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.01	0.04	0.24	0.08
O5'	0.08	0.20	0.21	0.30	0.21	0.02	0.27	0.01	0.29	0.28	0.25	0.16	0.16	0.31	0.19	0.06	0.26	0.08	0.00	0.32	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.11	0.01	0.32	0.00	0.24	0.15	0.24
OP1	0.08	0.13	0.22	0.30	0.14	0.04	0.19	0.08	0.20	0.20	0.17	0.10	0.11	0.22	0.14	0.11	0.32	0.04	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.07	0.07	0.05	0.07	0.23	0.08	0.33	0.10	0.06	0.07	0.09	0.09	0.11	0.07	0.10	0.05	0.24	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.12	0.16	0.23	0.12	0.02	0.18	0.01	0.20	0.18	0.17	0.10	0.09	0.22	0.11	0.05	0.24	0.08	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.13	0.14	0.11	0.15	0.14	0.14	0.30	0.12	0.17	0.12	0.14	0.15	0.15	0.18	0.21	0.15	0.18	0.42	0.10	0.62	0.66	0.58
C2	0.19	0.07	0.17	0.09	0.14	0.12	0.10	0.22	0.03	0.19	0.02	0.06	0.12	0.15	0.19	0.23	0.10	0.20	0.34	0.10	0.46	0.52	0.45
C2'	0.13	0.07	0.13	0.21	0.11	0.20	0.10	0.36	0.06	0.15	0.05	0.07	0.10	0.12	0.14	0.18	0.25	0.17	0.49	0.03	0.65	0.69	0.62
C3'	0.17	0.13	0.16	0.28	0.15	0.27	0.15	0.43	0.14	0.18	0.13	0.12	0.14	0.17	0.17	0.17	0.30	0.21	0.56	0.14	0.70	0.74	0.67
C4	0.18	0.13	0.14	0.11	0.16	0.15	0.14	0.30	0.11	0.19	0.11	0.13	0.15	0.16	0.19	0.20	0.15	0.19	0.42	0.09	0.59	0.63	0.56
C4'	0.12	0.06	0.11	0.16	0.10	0.19	0.09	0.36	0.06	0.14	0.05	0.06	0.08	0.11	0.13	0.16	0.19	0.17	0.47	0.06	0.65	0.68	0.62
C5	0.17	0.14	0.12	0.14	0.16	0.17	0.15	0.34	0.13	0.18	0.13	0.14	0.16	0.17	0.18	0.17	0.18	0.20	0.46	0.12	0.62	0.65	0.59
C5'	0.14	0.16	0.10	0.24	0.15	0.27	0.15	0.45	0.17	0.15	0.17	0.16	0.15	0.15	0.15	0.10	0.26	0.20	0.56	0.18	0.71	0.74	0.70
C6	0.17	0.12	0.11	0.14	0.15	0.17	0.14	0.33	0.11	0.18	0.11	0.12	0.14	0.16	0.17	0.15	0.18	0.19	0.45	0.09	0.58	0.62	0.56
C8	0.17	0.17	0.12	0.15	0.17	0.19	0.16	0.37	0.16	0.19	0.17	0.18	0.17	0.17	0.19	0.17	0.20	0.20	0.48	0.16	0.69	0.70	0.64
N1	0.17	0.08	0.13	0.10	0.14	0.13	0.11	0.26	0.04	0.18	0.04	0.08	0.12	0.15	0.18	0.18	0.13	0.19	0.38	0.04	0.49	0.54	0.48
N2	0.22	0.04	0.22	0.11	0.13	0.14	0.08	0.16	0.08	0.21	0.07	0.05	0.11	0.15	0.21	0.29	0.10	0.22	0.26	0.21	0.36	0.45	0.37
N3	0.19	0.09	0.17	0.09	0.15	0.13	0.12	0.24	0.06	0.19	0.06	0.09	0.14	0.15	0.19	0.24	0.11	0.19	0.36	0.07	0.51	0.57	0.49
N7	0.18	0.17	0.11	0.16	0.17	0.20	0.17	0.38	0.16	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.19	0.16	0.21	0.21	0.49	0.16	0.69	0.70	0.64
N9	0.17	0.15	0.14	0.13	0.16	0.16	0.15	0.32	0.13	0.18	0.13	0.15	0.16	0.16	0.18	0.20	0.17	0.19	0.44	0.12	0.64	0.67	0.59
O2'	0.14	0.13	0.12	0.13	0.14	0.12	0.12	0.28	0.11	0.14	0.12	0.14	0.14	0.13	0.15	0.22	0.17	0.14	0.41	0.09	0.59	0.64	0.55
O3'	0.20	0.18	0.20	0.31	0.19	0.29	0.19	0.44	0.19	0.21	0.18	0.18	0.19	0.20	0.20	0.20	0.33	0.23	0.57	0.20	0.70	0.75	0.68
O4'	0.18	0.11	0.16	0.07	0.15	0.13	0.13	0.28	0.10	0.18	0.09	0.11	0.14	0.15	0.18	0.23	0.10	0.19	0.39	0.07	0.60	0.63	0.56
O5'	0.39	0.40	0.34	0.13	0.40	0.20	0.40	0.14	0.40	0.40	0.40	0.41	0.40	0.40	0.41	0.41	0.06	0.38	0.22	0.39	0.48	0.47	0.40
O6	0.16	0.12	0.08	0.18	0.14	0.20	0.13	0.37	0.11	0.17	0.11	0.12	0.13	0.15	0.16	0.12	0.22	0.19	0.49	0.10	0.60	0.62	0.59
OP1	0.31	0.33	0.27	0.06	0.32	0.13	0.31	0.16	0.32	0.31	0.33	0.34	0.32	0.31	0.32	0.34	0.02	0.29	0.27	0.31	0.51	0.49	0.44
OP2	0.18	0.20	0.13	0.06	0.18	0.07	0.18	0.24	0.18	0.19	0.20	0.21	0.19	0.18	0.19	0.20	0.13	0.19	0.35	0.18	0.54	0.51	0.48
P	0.31	0.32	0.26	0.06	0.32	0.13	0.31	0.17	0.31	0.31	0.32	0.33	0.32	0.31	0.32	0.33	0.02	0.30	0.28	0.31	0.52	0.49	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.35	0.20
C2	0.01	0.00	0.12	0.10	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.08	0.19	0.01	0.14	0.31	0.16
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.08	0.09	0.14	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.13	0.18	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.15	0.18	0.12	0.11	0.09	0.19	0.09	0.01	0.01	0.02	0.07	0.17	0.23	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.08	0.04	0.22	0.01	0.18	0.32	0.20
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.07	0.14	0.04	0.05	0.03	0.14	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.18	0.10
C5	0.01	0.00	0.03	0.14	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.02	0.32	0.01	0.27	0.35	0.27
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.18	0.25	0.12	0.07	0.05	0.27	0.13	0.04	0.04	0.00	0.01	0.22	0.13	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.03	0.33	0.01	0.28	0.35	0.27
C8	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.14	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.18	0.06	0.35	0.01	0.30	0.35	0.30
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.06	0.27	0.01	0.21	0.32	0.21
N2	0.01	0.00	0.14	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.22	0.17	0.10	0.16	0.02	0.10	0.29	0.14
N3	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.12	0.07	0.15	0.01	0.11	0.31	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.19	0.01	0.14	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.04	0.39	0.01	0.35	0.39	0.35
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.21	0.01	0.18	0.33	0.20
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.11	0.04	0.08	0.04	0.10	0.07	0.15	0.22	0.19	0.06	0.04	0.00	0.02	0.05	0.05	0.09	0.18	0.18	0.07
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.04	0.14	0.18	0.13	0.17	0.12	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.12	0.17	0.38	0.14	0.16
O4'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.06	0.10	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.02	0.12	0.43	0.28
O5'	0.06	0.19	0.03	0.07	0.22	0.01	0.32	0.01	0.33	0.35	0.27	0.16	0.15	0.39	0.21	0.05	0.12	0.06	0.00	0.37	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.02	0.37	0.00	0.33	0.38	0.32
OP1	0.07	0.14	0.13	0.23	0.18	0.11	0.27	0.13	0.28	0.30	0.21	0.10	0.11	0.35	0.18	0.18	0.38	0.12	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.31	0.18	0.06	0.32	0.18	0.35	0.05	0.35	0.35	0.32	0.29	0.31	0.39	0.33	0.18	0.14	0.43	0.02	0.38	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.16	0.08	0.05	0.20	0.10	0.27	0.02	0.27	0.30	0.21	0.14	0.16	0.35	0.20	0.07	0.16	0.28	0.01	0.32	0.00	0.00	0.00