Doublet Group distance statistics: 50870

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 7, 10, 9, 13, 8, 3, 0, 4, 18, 20, 22, 17, 11, 13, 5, 8, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.008, 0.025, 0.043, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.009, 0.029, 0.048, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.031 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.011, 0.032, 0.054, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.017, 0.047, 0.076, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.047 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.013, 0.043, 0.074, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.043 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.021, 0.055, 0.089, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.055 std_dev=0.034
N7	B	0, 0.373, 0.602, 0.831, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.602 std_dev=0.229
C2'	A	0, -0.009, 0.222, 0.453, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.222 std_dev=0.231
O4'	A	0, -0.045, 0.199, 0.444, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.199 std_dev=0.244
C8	B	0, 0.398, 0.660, 0.922, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.660 std_dev=0.262
O2'	A	0, 0.136, 0.412, 0.687, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.412 std_dev=0.276
C5	B	0, 0.457, 0.779, 1.101, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.779 std_dev=0.322
OP2	B	0, 0.167, 0.516, 0.865, 2.262 max_d=2.262 avg_d=0.516 std_dev=0.349
N9	B	0, 0.492, 0.859, 1.227, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.859 std_dev=0.368
C3'	B	0, 0.440, 0.829, 1.218, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.829 std_dev=0.389
C4'	A	0, -0.064, 0.329, 0.722, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.329 std_dev=0.393
C4	B	0, 0.539, 0.938, 1.337, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.938 std_dev=0.399
N6	B	0, 0.358, 0.758, 1.159, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.758 std_dev=0.400
C6	B	0, 0.480, 0.882, 1.284, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.882 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.161, 0.565, 0.969, 2.741 max_d=2.741 avg_d=0.565 std_dev=0.404
O3'	B	0, 0.521, 0.939, 1.358, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.939 std_dev=0.419
C3'	A	0, -0.068, 0.360, 0.787, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.360 std_dev=0.427
C2'	B	0, 0.587, 1.045, 1.503, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.045 std_dev=0.458
C1'	B	0, 0.543, 1.018, 1.493, 1.991 max_d=1.991 avg_d=1.018 std_dev=0.475
C4'	B	0, 0.354, 0.831, 1.308, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.831 std_dev=0.477
O4'	B	0, 0.444, 0.929, 1.415, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.929 std_dev=0.485
O5'	B	0, 0.164, 0.650, 1.136, 2.641 max_d=2.641 avg_d=0.650 std_dev=0.486
C5'	B	0, 0.238, 0.727, 1.217, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.727 std_dev=0.490
P	B	0, 0.144, 0.638, 1.133, 2.872 max_d=2.872 avg_d=0.638 std_dev=0.494
C5'	A	0, -0.001, 0.506, 1.012, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.506 std_dev=0.507
N3	B	0, 0.648, 1.177, 1.706, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.177 std_dev=0.529
N1	B	0, 0.598, 1.148, 1.699, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.148 std_dev=0.550
O2'	B	0, 0.653, 1.233, 1.813, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.233 std_dev=0.580
P	A	0, 0.092, 0.676, 1.260, 3.941 max_d=3.941 avg_d=0.676 std_dev=0.584
C2	B	0, 0.678, 1.271, 1.865, 2.654 max_d=2.654 avg_d=1.271 std_dev=0.594
OP2	A	0, 0.077, 0.692, 1.306, 3.929 max_d=3.929 avg_d=0.692 std_dev=0.614
O3'	A	0, -0.129, 0.513, 1.154, 3.097 max_d=3.097 avg_d=0.513 std_dev=0.642
OP1	B	0, 0.154, 0.822, 1.490, 3.788 max_d=3.788 avg_d=0.822 std_dev=0.668
OP1	A	0, 0.092, 0.821, 1.550, 4.823 max_d=4.823 avg_d=0.821 std_dev=0.729

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.10	0.00	0.18	0.03	0.16	0.25	0.18
C2	0.04	0.00	0.20	0.17	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.14	0.21	0.02	0.23	0.37	0.27
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.02	0.08	0.10	0.12	0.08	0.17	0.23	0.19	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.25	0.11	0.26	0.34	0.27
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.16	0.00	0.21	0.02	0.22	0.18	0.20	0.16	0.14	0.21	0.13	0.02	0.01	0.02	0.12	0.25	0.18	0.09	0.10
C4	0.02	0.01	0.11	0.16	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.07	0.21	0.02	0.23	0.35	0.26
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.06	0.10	0.07	0.12	0.06	0.17	0.02	0.00	0.02	0.09	0.09	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.21	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.04	0.23	0.02	0.27	0.39	0.29
C5'	0.07	0.16	0.10	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.20	0.22	0.18	0.16	0.14	0.24	0.14	0.08	0.11	0.02	0.01	0.23	0.15	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.22	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.06	0.23	0.01	0.29	0.41	0.30
C8	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.15	0.08	0.23	0.02	0.26	0.35	0.27
N1	0.03	0.01	0.17	0.20	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.16	0.11	0.22	0.01	0.26	0.40	0.29
N2	0.05	0.01	0.23	0.16	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.17	0.21	0.03	0.23	0.36	0.27
N3	0.04	0.01	0.19	0.14	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.12	0.13	0.21	0.01	0.22	0.34	0.25
N7	0.02	0.01	0.05	0.21	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.19	0.05	0.24	0.03	0.30	0.40	0.30
N9	0.01	0.02	0.02	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.21	0.02	0.21	0.32	0.23
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.09	0.17	0.13	0.08	0.13	0.19	0.13	0.20	0.13	0.18	0.10	0.00	0.05	0.10	0.15	0.15	0.14	0.31	0.18
O3'	0.10	0.13	0.04	0.01	0.10	0.02	0.16	0.11	0.18	0.15	0.16	0.15	0.12	0.19	0.08	0.05	0.00	0.07	0.18	0.22	0.31	0.22	0.21
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.08	0.11	0.17	0.13	0.05	0.01	0.10	0.07	0.00	0.11	0.06	0.11	0.13	0.09
O5'	0.18	0.21	0.25	0.12	0.21	0.02	0.23	0.01	0.23	0.23	0.22	0.21	0.21	0.24	0.21	0.15	0.18	0.11	0.00	0.24	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.11	0.25	0.02	0.09	0.02	0.23	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.15	0.22	0.06	0.24	0.00	0.32	0.44	0.33
OP1	0.16	0.23	0.26	0.18	0.23	0.09	0.27	0.15	0.29	0.26	0.26	0.23	0.22	0.30	0.21	0.14	0.31	0.11	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.37	0.34	0.09	0.35	0.08	0.39	0.14	0.41	0.35	0.40	0.36	0.34	0.40	0.32	0.31	0.22	0.13	0.02	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.27	0.27	0.10	0.26	0.03	0.29	0.02	0.30	0.27	0.29	0.27	0.25	0.30	0.23	0.18	0.21	0.09	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.27	0.17	0.14	0.22	0.18	0.22	0.19	0.26	0.20	0.29	0.24	0.29	0.20	0.20	0.18	0.14	0.21	0.20	0.20	0.16	0.18
C2	0.17	0.17	0.14	0.14	0.15	0.18	0.16	0.19	0.19	0.15	0.19	0.16	0.23	0.15	0.16	0.15	0.14	0.21	0.18	0.15	0.14	0.16
C2'	0.43	0.46	0.40	0.37	0.43	0.41	0.41	0.41	0.42	0.41	0.45	0.45	0.42	0.40	0.42	0.41	0.36	0.44	0.42	0.38	0.32	0.39
C3'	0.30	0.32	0.25	0.23	0.27	0.31	0.26	0.34	0.29	0.29	0.32	0.29	0.31	0.27	0.29	0.27	0.21	0.35	0.33	0.39	0.30	0.37
C4	0.18	0.20	0.15	0.14	0.17	0.18	0.17	0.21	0.21	0.17	0.22	0.18	0.24	0.16	0.17	0.15	0.13	0.21	0.18	0.20	0.16	0.18
C4'	0.20	0.34	0.17	0.14	0.24	0.17	0.24	0.19	0.32	0.20	0.37	0.29	0.35	0.21	0.21	0.18	0.15	0.22	0.18	0.25	0.17	0.19
C5	0.18	0.18	0.14	0.14	0.16	0.20	0.16	0.24	0.20	0.16	0.20	0.17	0.24	0.15	0.16	0.15	0.15	0.23	0.19	0.25	0.19	0.22
C5'	0.23	0.35	0.20	0.20	0.25	0.22	0.25	0.25	0.33	0.24	0.38	0.29	0.37	0.23	0.22	0.21	0.22	0.25	0.15	0.35	0.22	0.22
C6	0.19	0.18	0.16	0.17	0.16	0.23	0.16	0.26	0.19	0.16	0.19	0.17	0.24	0.16	0.17	0.17	0.18	0.26	0.21	0.27	0.22	0.25
C8	0.18	0.22	0.15	0.13	0.18	0.19	0.19	0.22	0.23	0.18	0.25	0.19	0.27	0.17	0.17	0.15	0.13	0.22	0.18	0.26	0.18	0.21
N1	0.19	0.18	0.16	0.16	0.17	0.21	0.17	0.24	0.20	0.16	0.19	0.17	0.24	0.17	0.17	0.16	0.17	0.24	0.20	0.21	0.19	0.21
N2	0.16	0.18	0.15	0.15	0.16	0.17	0.18	0.18	0.20	0.15	0.20	0.17	0.24	0.17	0.16	0.15	0.15	0.19	0.20	0.13	0.13	0.15
N3	0.18	0.19	0.15	0.14	0.17	0.17	0.17	0.19	0.20	0.17	0.21	0.18	0.23	0.16	0.17	0.16	0.13	0.20	0.19	0.16	0.14	0.16
N7	0.18	0.20	0.14	0.14	0.16	0.20	0.17	0.24	0.21	0.16	0.22	0.17	0.25	0.16	0.16	0.15	0.15	0.24	0.19	0.28	0.20	0.23
N9	0.19	0.23	0.16	0.14	0.19	0.18	0.19	0.21	0.23	0.19	0.25	0.20	0.27	0.18	0.18	0.16	0.13	0.22	0.18	0.22	0.16	0.19
O2'	0.40	0.54	0.40	0.36	0.46	0.36	0.46	0.34	0.52	0.38	0.56	0.50	0.53	0.40	0.41	0.40	0.36	0.39	0.40	0.27	0.24	0.31
O3'	0.28	0.37	0.24	0.20	0.28	0.25	0.29	0.29	0.35	0.28	0.39	0.32	0.40	0.28	0.27	0.26	0.19	0.29	0.28	0.38	0.26	0.33
O4'	0.19	0.29	0.17	0.17	0.22	0.18	0.23	0.20	0.29	0.20	0.32	0.25	0.33	0.21	0.19	0.18	0.19	0.20	0.21	0.26	0.22	0.20
O5'	0.13	0.30	0.15	0.17	0.19	0.11	0.21	0.13	0.29	0.15	0.33	0.24	0.34	0.17	0.15	0.14	0.21	0.12	0.24	0.21	0.21	0.19
O6	0.22	0.18	0.18	0.20	0.17	0.27	0.17	0.31	0.20	0.17	0.19	0.18	0.24	0.17	0.19	0.20	0.22	0.29	0.24	0.33	0.25	0.30
OP1	0.15	0.35	0.18	0.20	0.22	0.15	0.23	0.17	0.32	0.17	0.37	0.28	0.35	0.19	0.17	0.17	0.26	0.14	0.26	0.28	0.26	0.22
OP2	0.26	0.29	0.29	0.32	0.26	0.29	0.28	0.30	0.31	0.29	0.32	0.26	0.36	0.30	0.26	0.28	0.37	0.26	0.33	0.40	0.36	0.33
P	0.19	0.31	0.22	0.25	0.23	0.21	0.25	0.23	0.31	0.22	0.35	0.26	0.36	0.23	0.20	0.21	0.30	0.18	0.27	0.33	0.29	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.06	0.16	0.10
C2	0.03	0.00	0.19	0.19	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.09	0.19	0.12	0.18	0.13
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.09	0.15	0.19	0.07	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.11	0.11	0.05
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.01	0.09	0.02	0.13	0.10	0.17	0.18	0.12	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.14	0.19	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.10	0.11	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.05	0.19	0.11	0.17	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.14	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.24	0.15	0.21	0.15
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.11	0.09	0.07	0.12	0.12	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.15	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.05	0.25	0.17	0.23	0.17
C8	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.12	0.07	0.24	0.14	0.18	0.14
N1	0.02	0.01	0.15	0.17	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.21	0.07	0.22	0.15	0.21	0.15
N3	0.03	0.01	0.19	0.18	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.09	0.17	0.10	0.17	0.11
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.15	0.05	0.28	0.22	0.26	0.20
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.10	0.05	0.27	0.19	0.23	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.18	0.09	0.16	0.10
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.07	0.13	0.15	0.07	0.06	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.09	0.12	0.08
O3'	0.02	0.24	0.03	0.01	0.12	0.02	0.10	0.05	0.15	0.12	0.21	0.21	0.15	0.10	0.05	0.05	0.00	0.02	0.13	0.26	0.10	0.13
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.07	0.09	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.10	0.21	0.15
O5'	0.09	0.19	0.11	0.14	0.19	0.01	0.24	0.01	0.25	0.24	0.22	0.17	0.28	0.27	0.18	0.05	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.12	0.11	0.19	0.11	0.08	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15	0.10	0.22	0.19	0.09	0.09	0.26	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.18	0.11	0.08	0.17	0.14	0.21	0.14	0.23	0.18	0.21	0.17	0.26	0.23	0.16	0.12	0.10	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.13	0.05	0.08	0.11	0.06	0.15	0.02	0.17	0.14	0.15	0.11	0.20	0.18	0.10	0.08	0.13	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00