Doublet Group distance statistics: 50876

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.027, 0.050, 0.074, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.036 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.017, 0.044, 0.072, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.044 std_dev=0.028
O4'	A	0, -0.083, 0.218, 0.518, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.218 std_dev=0.301
C2'	A	0, -0.067, 0.256, 0.579, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.256 std_dev=0.323
O2'	A	0, 0.015, 0.338, 0.661, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.338 std_dev=0.323
C2	B	0, 0.313, 0.729, 1.146, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.729 std_dev=0.416
N1	B	0, 0.244, 0.683, 1.123, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.683 std_dev=0.439
C4	B	0, 0.259, 0.713, 1.167, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.713 std_dev=0.454
C4'	A	0, -0.091, 0.369, 0.828, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.369 std_dev=0.459
C5	B	0, 0.226, 0.705, 1.184, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.705 std_dev=0.479
N3	B	0, 0.281, 0.763, 1.244, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.763 std_dev=0.482
C3'	A	0, -0.101, 0.404, 0.910, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.404 std_dev=0.505
N9	B	0, 0.267, 0.773, 1.279, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.773 std_dev=0.506
C6	B	0, 0.205, 0.715, 1.225, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.715 std_dev=0.510
C8	B	0, 0.225, 0.778, 1.332, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.778 std_dev=0.553
C2'	B	0, 0.266, 0.851, 1.435, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.851 std_dev=0.585
C1'	B	0, 0.269, 0.859, 1.450, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.859 std_dev=0.591
C3'	B	0, 0.340, 0.934, 1.527, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.934 std_dev=0.594
OP2	A	0, 0.094, 0.689, 1.284, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.689 std_dev=0.595
O5'	B	0, 0.253, 0.849, 1.445, 2.109 max_d=2.109 avg_d=0.849 std_dev=0.596
N7	B	0, 0.163, 0.760, 1.357, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.760 std_dev=0.597
P	A	0, 0.048, 0.684, 1.320, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.684 std_dev=0.636
O4'	B	0, 0.337, 0.984, 1.631, 2.170 max_d=2.170 avg_d=0.984 std_dev=0.647
C4'	B	0, 0.367, 1.017, 1.668, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.017 std_dev=0.651
OP1	A	0, 0.132, 0.802, 1.472, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.802 std_dev=0.670
O3'	B	0, 0.377, 1.052, 1.727, 2.235 max_d=2.235 avg_d=1.052 std_dev=0.675
C5'	B	0, 0.395, 1.070, 1.745, 1.956 max_d=1.956 avg_d=1.070 std_dev=0.675
O5'	A	0, -0.116, 0.573, 1.262, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.573 std_dev=0.689
O2'	B	0, 0.208, 0.920, 1.632, 2.616 max_d=2.616 avg_d=0.920 std_dev=0.712
N6	B	0, 0.104, 0.828, 1.553, 2.117 max_d=2.117 avg_d=0.828 std_dev=0.724
O3'	A	0, -0.119, 0.617, 1.353, 2.550 max_d=2.550 avg_d=0.617 std_dev=0.736
C5'	A	0, -0.153, 0.619, 1.392, 2.773 max_d=2.773 avg_d=0.619 std_dev=0.773
OP2	B	0, 0.009, 0.805, 1.601, 2.668 max_d=2.668 avg_d=0.805 std_dev=0.796
P	B	0, -0.077, 0.853, 1.783, 2.981 max_d=2.981 avg_d=0.853 std_dev=0.930
OP1	B	0, -0.065, 1.169, 2.403, 3.959 max_d=3.959 avg_d=1.169 std_dev=1.234

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.16	0.01	0.07	0.29	0.14
C2	0.02	0.00	0.25	0.26	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.35	0.07	0.30	0.01	0.15	0.25	0.16
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.01	0.09	0.01	0.13	0.10	0.20	0.30	0.25	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.21	0.11	0.23	0.12	0.04
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.15	0.00	0.11	0.01	0.15	0.16	0.22	0.32	0.25	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.26	0.13	0.38	0.05	0.15
C4	0.01	0.01	0.14	0.15	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.18	0.04	0.33	0.01	0.15	0.23	0.15
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.07	0.09	0.07	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.15	0.28	0.11
C5	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.04	0.44	0.01	0.25	0.28	0.25
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.14	0.12	0.10	0.09	0.16	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.16	0.27	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.05	0.45	0.01	0.28	0.32	0.29
C8	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.04	0.46	0.01	0.22	0.22	0.21
N1	0.02	0.00	0.20	0.22	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.30	0.07	0.38	0.01	0.22	0.28	0.24
N2	0.03	0.01	0.30	0.32	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.31	0.44	0.08	0.25	0.02	0.12	0.24	0.14
N3	0.02	0.00	0.25	0.25	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.32	0.07	0.26	0.01	0.10	0.24	0.12
N7	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.02	0.51	0.01	0.30	0.30	0.31
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.32	0.01	0.11	0.23	0.11
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.12	0.04	0.08	0.04	0.13	0.08	0.20	0.31	0.23	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.12	0.15	0.19	0.10
O3'	0.02	0.35	0.03	0.01	0.18	0.02	0.14	0.02	0.20	0.17	0.30	0.44	0.32	0.14	0.07	0.04	0.00	0.02	0.19	0.18	0.49	0.09	0.19
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.07	0.08	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.05	0.13	0.43	0.26
O5'	0.16	0.30	0.21	0.26	0.33	0.02	0.44	0.01	0.45	0.46	0.38	0.25	0.26	0.51	0.32	0.07	0.19	0.10	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.05	0.50	0.00	0.34	0.37	0.36
OP1	0.07	0.15	0.23	0.38	0.15	0.15	0.25	0.27	0.28	0.22	0.22	0.12	0.10	0.30	0.11	0.15	0.49	0.13	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.25	0.12	0.05	0.23	0.28	0.28	0.27	0.32	0.22	0.28	0.24	0.24	0.30	0.23	0.19	0.09	0.43	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.16	0.04	0.15	0.15	0.11	0.25	0.02	0.29	0.21	0.24	0.14	0.12	0.31	0.11	0.10	0.19	0.26	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.21	0.25	0.27	0.23	0.36	0.20	0.33	0.22	0.31	0.23	0.22	0.28	0.23	0.30	0.29	0.27	0.46	0.38	0.35	0.27	0.21
C2	0.32	0.30	0.23	0.25	0.26	0.32	0.26	0.29	0.33	0.26	0.34	0.27	0.41	0.22	0.27	0.26	0.28	0.41	0.36	0.29	0.20	0.15
C2'	0.62	0.49	0.52	0.53	0.50	0.61	0.43	0.55	0.41	0.52	0.45	0.52	0.41	0.42	0.56	0.57	0.53	0.70	0.58	0.55	0.53	0.50
C3'	0.66	0.57	0.53	0.50	0.56	0.60	0.47	0.53	0.47	0.53	0.52	0.60	0.44	0.43	0.59	0.59	0.49	0.73	0.54	0.55	0.51	0.49
C4	0.33	0.27	0.22	0.24	0.24	0.32	0.23	0.29	0.29	0.27	0.31	0.25	0.37	0.22	0.27	0.27	0.26	0.42	0.32	0.36	0.22	0.17
C4'	0.44	0.31	0.29	0.28	0.33	0.40	0.27	0.35	0.26	0.37	0.29	0.33	0.27	0.29	0.38	0.34	0.26	0.53	0.37	0.38	0.30	0.26
C5	0.33	0.30	0.21	0.21	0.27	0.31	0.27	0.28	0.32	0.26	0.33	0.28	0.39	0.24	0.28	0.26	0.24	0.42	0.25	0.41	0.20	0.18
C5'	0.41	0.33	0.24	0.21	0.32	0.35	0.27	0.30	0.27	0.33	0.31	0.34	0.28	0.26	0.36	0.29	0.17	0.50	0.28	0.40	0.23	0.22
C6	0.33	0.33	0.21	0.20	0.30	0.30	0.30	0.26	0.35	0.27	0.36	0.31	0.41	0.27	0.29	0.26	0.24	0.42	0.21	0.43	0.18	0.22
C8	0.33	0.27	0.22	0.22	0.24	0.32	0.23	0.29	0.28	0.26	0.30	0.25	0.35	0.22	0.27	0.26	0.23	0.42	0.27	0.41	0.23	0.17
N1	0.33	0.33	0.21	0.22	0.29	0.30	0.31	0.26	0.36	0.27	0.36	0.31	0.42	0.27	0.29	0.26	0.26	0.41	0.26	0.36	0.20	0.19
N2	0.30	0.30	0.24	0.28	0.25	0.32	0.26	0.28	0.34	0.26	0.35	0.27	0.42	0.21	0.26	0.26	0.30	0.39	0.43	0.21	0.21	0.16
N3	0.33	0.27	0.24	0.26	0.23	0.34	0.22	0.30	0.29	0.28	0.30	0.24	0.37	0.21	0.27	0.27	0.28	0.42	0.38	0.31	0.21	0.17
N7	0.33	0.30	0.21	0.20	0.27	0.30	0.26	0.28	0.31	0.26	0.32	0.28	0.38	0.24	0.28	0.26	0.22	0.42	0.23	0.44	0.21	0.19
N9	0.33	0.25	0.23	0.24	0.23	0.33	0.21	0.30	0.26	0.27	0.28	0.24	0.34	0.21	0.28	0.27	0.25	0.43	0.32	0.37	0.24	0.18
O2'	0.68	0.49	0.58	0.60	0.54	0.67	0.47	0.61	0.41	0.60	0.44	0.54	0.38	0.49	0.62	0.62	0.60	0.76	0.66	0.57	0.57	0.56
O3'	0.84	0.77	0.71	0.67	0.74	0.77	0.63	0.68	0.62	0.68	0.70	0.80	0.55	0.57	0.76	0.79	0.65	0.90	0.69	0.68	0.66	0.65
O4'	0.29	0.20	0.19	0.19	0.19	0.29	0.17	0.26	0.21	0.26	0.23	0.18	0.27	0.20	0.24	0.21	0.18	0.40	0.30	0.33	0.22	0.13
O5'	0.29	0.17	0.28	0.33	0.16	0.35	0.17	0.36	0.20	0.27	0.22	0.15	0.27	0.22	0.23	0.28	0.36	0.39	0.48	0.34	0.50	0.32
O6	0.34	0.35	0.21	0.18	0.32	0.29	0.33	0.25	0.37	0.29	0.37	0.33	0.41	0.30	0.31	0.27	0.23	0.42	0.20	0.49	0.19	0.29
OP1	0.28	0.20	0.18	0.18	0.19	0.26	0.18	0.24	0.21	0.23	0.22	0.20	0.25	0.19	0.23	0.20	0.17	0.38	0.31	0.30	0.36	0.15
OP2	0.33	0.44	0.23	0.21	0.36	0.27	0.37	0.26	0.44	0.30	0.47	0.39	0.49	0.33	0.33	0.24	0.20	0.37	0.25	0.43	0.34	0.25
P	0.24	0.31	0.15	0.15	0.24	0.21	0.25	0.21	0.32	0.21	0.35	0.27	0.37	0.22	0.23	0.16	0.16	0.32	0.24	0.37	0.31	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.14	0.11	0.49	0.16
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.38	0.21	0.48	0.16
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.25	0.19	0.42	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.11	0.13	0.11	0.10	0.13	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.31	0.31	0.36	0.15
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.37	0.19	0.48	0.15
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.07	0.03	0.01	0.02	0.15	0.41	0.11
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.03	0.45	0.29	0.48	0.23
C5'	0.04	0.11	0.02	0.03	0.11	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.13	0.10	0.16	0.16	0.11	0.07	0.05	0.01	0.01	0.16	0.33	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.04	0.47	0.33	0.50	0.26
C8	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.42	0.22	0.46	0.18
N1	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.44	0.29	0.49	0.22
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.33	0.16	0.48	0.13
N6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.20	0.05	0.50	0.40	0.52	0.33
N7	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.20	0.05	0.47	0.32	0.47	0.27
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.32	0.14	0.48	0.12
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.04	0.02	0.00	0.07	0.06	0.11	0.22	0.41	0.12
O3'	0.03	0.13	0.03	0.01	0.09	0.03	0.15	0.05	0.17	0.16	0.15	0.12	0.20	0.20	0.07	0.07	0.00	0.03	0.27	0.40	0.33	0.19
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.06	0.03	0.00	0.10	0.25	0.54	0.30
O5'	0.14	0.38	0.25	0.31	0.37	0.02	0.45	0.01	0.47	0.42	0.44	0.33	0.50	0.47	0.32	0.11	0.27	0.10	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.11	0.21	0.19	0.31	0.19	0.15	0.29	0.16	0.33	0.22	0.29	0.16	0.40	0.32	0.14	0.22	0.40	0.25	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.49	0.48	0.42	0.36	0.48	0.41	0.48	0.33	0.50	0.46	0.49	0.48	0.52	0.47	0.48	0.41	0.33	0.54	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.16	0.07	0.15	0.15	0.11	0.23	0.03	0.26	0.18	0.22	0.13	0.33	0.27	0.12	0.12	0.19	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00