Doublet Group distance statistics: 50877

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.015, 0.036, 0.058, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.036 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.013, 0.038, 0.064, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.038 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.022, 0.047, 0.073, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.047 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.040 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.012, 0.039, 0.067, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.018, 0.054, 0.089, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.054 std_dev=0.036
N2	A	0, 0.028, 0.069, 0.111, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.069 std_dev=0.042
O6	A	0, 0.010, 0.056, 0.103, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.056 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.013, 0.061, 0.109, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.061 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.076, 0.178, 0.281, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.178 std_dev=0.102
O4'	A	0, 0.106, 0.209, 0.312, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.209 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.060, 0.205, 0.351, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.205 std_dev=0.146
C4'	A	0, 0.147, 0.342, 0.536, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.342 std_dev=0.195
C3'	A	0, 0.132, 0.329, 0.526, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.329 std_dev=0.197
C5'	A	0, 0.222, 0.502, 0.783, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.502 std_dev=0.281
N6	B	0, 0.322, 0.619, 0.917, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.619 std_dev=0.297
O5'	A	0, 0.213, 0.531, 0.849, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.531 std_dev=0.318
O3'	A	0, 0.172, 0.494, 0.817, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.494 std_dev=0.322
N1	B	0, 0.479, 0.804, 1.128, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.804 std_dev=0.324
C6	B	0, 0.390, 0.720, 1.050, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.720 std_dev=0.330
C2	B	0, 0.575, 0.967, 1.358, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.967 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.518, 0.937, 1.357, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.937 std_dev=0.419
OP2	B	0, 0.553, 0.987, 1.420, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.987 std_dev=0.433
C4	B	0, 0.644, 1.119, 1.594, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.119 std_dev=0.475
P	B	0, 0.710, 1.192, 1.673, 1.669 max_d=1.669 avg_d=1.192 std_dev=0.481
N3	B	0, 0.606, 1.097, 1.589, 1.563 max_d=1.563 avg_d=1.097 std_dev=0.492
P	A	0, 0.306, 0.818, 1.330, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.818 std_dev=0.512
OP1	B	0, 0.682, 1.209, 1.736, 1.845 max_d=1.845 avg_d=1.209 std_dev=0.527
O5'	B	0, 0.831, 1.359, 1.886, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.359 std_dev=0.527
N7	B	0, 0.587, 1.129, 1.671, 1.839 max_d=1.839 avg_d=1.129 std_dev=0.542
N9	B	0, 0.833, 1.403, 1.972, 2.016 max_d=2.016 avg_d=1.403 std_dev=0.570
OP1	A	0, 0.310, 0.889, 1.467, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.889 std_dev=0.578
OP2	A	0, 0.572, 1.184, 1.795, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.184 std_dev=0.612
C8	B	0, 0.805, 1.418, 2.031, 2.115 max_d=2.115 avg_d=1.418 std_dev=0.613
O4'	B	0, 1.061, 1.737, 2.414, 2.332 max_d=2.332 avg_d=1.737 std_dev=0.676
C1'	B	0, 1.011, 1.690, 2.368, 2.261 max_d=2.261 avg_d=1.690 std_dev=0.679
C5'	B	0, 1.080, 1.772, 2.464, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.772 std_dev=0.692
C3'	B	0, 1.132, 1.837, 2.542, 2.616 max_d=2.616 avg_d=1.837 std_dev=0.705
C2'	B	0, 1.099, 1.807, 2.515, 2.416 max_d=2.416 avg_d=1.807 std_dev=0.708
C4'	B	0, 1.148, 1.866, 2.584, 2.623 max_d=2.623 avg_d=1.866 std_dev=0.718
O3'	B	0, 1.274, 2.095, 2.915, 3.003 max_d=3.003 avg_d=2.095 std_dev=0.820
O2'	B	0, 1.152, 2.010, 2.867, 2.901 max_d=2.901 avg_d=2.010 std_dev=0.858

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.35	0.13
C2	0.06	0.00	0.11	0.12	0.02	0.07	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.14	0.07	0.12	0.03	0.09	0.36	0.13
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.09	0.14	0.11	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.12	0.07	0.13	0.24	0.02
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.13	0.11	0.12	0.14	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.22	0.15	0.20	0.21	0.10
C4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.14	0.01	0.09	0.36	0.13
C4'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.05	0.10	0.07	0.10	0.04	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.09	0.26	0.04
C5	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.04	0.23	0.01	0.16	0.36	0.16
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.07	0.08	0.06	0.14	0.05	0.08	0.04	0.02	0.01	0.14	0.09	0.22	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.17	0.04	0.24	0.01	0.18	0.36	0.18
C8	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.24	0.02	0.14	0.35	0.14
N1	0.04	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.15	0.05	0.18	0.02	0.14	0.36	0.15
N2	0.08	0.01	0.14	0.14	0.03	0.10	0.03	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.15	0.17	0.09	0.10	0.04	0.10	0.37	0.14
N3	0.06	0.01	0.11	0.11	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.10	0.12	0.06	0.09	0.02	0.08	0.37	0.14
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.29	0.02	0.20	0.35	0.19
N9	0.01	0.03	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.12	0.01	0.07	0.36	0.12
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.08	0.05	0.05	0.08	0.15	0.10	0.05	0.02	0.00	0.06	0.06	0.04	0.05	0.14	0.27	0.08
O3'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.09	0.02	0.14	0.04	0.17	0.13	0.15	0.17	0.12	0.17	0.07	0.06	0.00	0.02	0.25	0.21	0.31	0.21	0.19
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.09	0.06	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.05	0.10	0.37	0.18
O5'	0.05	0.12	0.12	0.22	0.14	0.01	0.23	0.01	0.24	0.24	0.18	0.10	0.09	0.29	0.12	0.04	0.25	0.12	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.21	0.05	0.29	0.00	0.25	0.39	0.23
OP1	0.05	0.09	0.13	0.20	0.09	0.09	0.16	0.09	0.18	0.14	0.14	0.10	0.08	0.20	0.07	0.14	0.31	0.10	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.36	0.24	0.21	0.36	0.26	0.36	0.22	0.36	0.35	0.36	0.37	0.37	0.35	0.36	0.27	0.21	0.37	0.01	0.39	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.13	0.02	0.10	0.13	0.04	0.16	0.02	0.18	0.14	0.15	0.14	0.14	0.19	0.12	0.08	0.19	0.18	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.29	0.14	0.13	0.17	0.10	0.20	0.11	0.31	0.11	0.34	0.22	0.39	0.15	0.11	0.13	0.14	0.13	0.14	0.16	0.16	0.14
C2	0.20	0.29	0.23	0.21	0.24	0.20	0.29	0.18	0.34	0.21	0.33	0.25	0.39	0.27	0.21	0.22	0.20	0.22	0.22	0.17	0.17	0.17
C2'	0.15	0.32	0.14	0.14	0.21	0.10	0.23	0.10	0.31	0.15	0.35	0.26	0.38	0.20	0.16	0.15	0.16	0.13	0.15	0.12	0.15	0.12
C3'	0.16	0.31	0.15	0.16	0.21	0.12	0.22	0.12	0.29	0.17	0.33	0.26	0.34	0.21	0.17	0.16	0.18	0.14	0.17	0.13	0.19	0.13
C4	0.18	0.30	0.21	0.20	0.23	0.18	0.27	0.17	0.35	0.18	0.35	0.24	0.43	0.24	0.18	0.20	0.20	0.20	0.18	0.17	0.18	0.16
C4'	0.10	0.27	0.09	0.10	0.15	0.07	0.16	0.08	0.24	0.09	0.30	0.21	0.29	0.12	0.10	0.09	0.13	0.10	0.14	0.13	0.15	0.12
C5	0.20	0.29	0.23	0.22	0.23	0.20	0.28	0.20	0.35	0.21	0.34	0.24	0.43	0.27	0.20	0.21	0.23	0.23	0.20	0.19	0.21	0.17
C5'	0.09	0.27	0.10	0.11	0.15	0.07	0.16	0.09	0.24	0.10	0.29	0.20	0.28	0.13	0.09	0.09	0.14	0.09	0.14	0.13	0.16	0.12
C6	0.22	0.28	0.25	0.24	0.24	0.23	0.29	0.22	0.34	0.24	0.33	0.24	0.41	0.30	0.22	0.23	0.25	0.25	0.23	0.19	0.23	0.18
C8	0.16	0.29	0.20	0.20	0.21	0.18	0.25	0.17	0.33	0.18	0.34	0.23	0.42	0.23	0.17	0.19	0.20	0.19	0.18	0.19	0.20	0.17
N1	0.22	0.28	0.25	0.24	0.25	0.22	0.29	0.21	0.34	0.24	0.32	0.24	0.39	0.30	0.22	0.24	0.23	0.25	0.24	0.18	0.20	0.18
N2	0.21	0.28	0.23	0.21	0.24	0.20	0.28	0.20	0.32	0.21	0.31	0.25	0.34	0.27	0.21	0.22	0.19	0.23	0.27	0.19	0.18	0.19
N3	0.18	0.30	0.21	0.19	0.24	0.17	0.28	0.16	0.35	0.18	0.35	0.25	0.42	0.24	0.19	0.20	0.18	0.20	0.19	0.16	0.17	0.15
N7	0.19	0.29	0.23	0.22	0.22	0.20	0.27	0.20	0.34	0.20	0.34	0.24	0.43	0.26	0.19	0.21	0.23	0.22	0.20	0.20	0.22	0.18
N9	0.15	0.30	0.19	0.18	0.21	0.16	0.25	0.16	0.34	0.16	0.35	0.24	0.42	0.21	0.16	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.16
O2'	0.17	0.32	0.14	0.14	0.20	0.11	0.18	0.10	0.26	0.13	0.33	0.27	0.30	0.15	0.16	0.16	0.16	0.15	0.16	0.12	0.13	0.12
O3'	0.23	0.35	0.19	0.20	0.24	0.18	0.21	0.18	0.26	0.21	0.33	0.31	0.27	0.22	0.21	0.22	0.21	0.20	0.21	0.17	0.22	0.17
O4'	0.10	0.27	0.14	0.13	0.15	0.11	0.18	0.13	0.27	0.11	0.32	0.20	0.34	0.13	0.10	0.14	0.15	0.13	0.15	0.17	0.17	0.15
O5'	0.15	0.28	0.18	0.19	0.17	0.18	0.20	0.20	0.29	0.17	0.33	0.21	0.36	0.19	0.14	0.17	0.19	0.19	0.19	0.27	0.25	0.23
O6	0.24	0.28	0.27	0.27	0.26	0.25	0.30	0.25	0.35	0.27	0.33	0.25	0.41	0.31	0.24	0.25	0.28	0.28	0.26	0.22	0.26	0.21
OP1	0.12	0.29	0.16	0.18	0.17	0.14	0.19	0.16	0.27	0.15	0.32	0.23	0.31	0.17	0.13	0.15	0.19	0.14	0.17	0.21	0.21	0.18
OP2	0.30	0.43	0.35	0.35	0.37	0.29	0.41	0.31	0.47	0.37	0.48	0.37	0.54	0.42	0.33	0.33	0.36	0.24	0.33	0.31	0.33	0.31
P	0.12	0.29	0.18	0.17	0.19	0.13	0.23	0.15	0.30	0.18	0.34	0.22	0.37	0.21	0.15	0.16	0.18	0.11	0.17	0.19	0.19	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.07	0.18	0.07
C2	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.15	0.17	0.07	0.11	0.10	0.13	0.10
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.08	0.11	0.14	0.06	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.08	0.22	0.06
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.11	0.01	0.14	0.02	0.15	0.17	0.14	0.13	0.16	0.17	0.09	0.02	0.00	0.02	0.15	0.11	0.19	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.04	0.12	0.09	0.14	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.05	0.03	0.09	0.11	0.05	0.09	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.17	0.14	0.17	0.14
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.14	0.07	0.04	0.13	0.15	0.06	0.09	0.03	0.02	0.01	0.08	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.17	0.04	0.17	0.15	0.17	0.15
C8	0.03	0.03	0.08	0.17	0.01	0.11	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.19	0.06	0.19	0.15	0.19	0.16
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.12	0.17	0.05	0.14	0.12	0.15	0.12
N3	0.03	0.01	0.14	0.13	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.07	0.10	0.09	0.13	0.09
N6	0.03	0.02	0.06	0.16	0.01	0.09	0.02	0.13	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.19	0.04	0.20	0.20	0.22	0.19
N7	0.03	0.02	0.07	0.17	0.01	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.21	0.05	0.21	0.19	0.21	0.19
N9	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.11	0.09	0.16	0.08
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.07	0.09	0.04	0.09	0.07	0.06	0.12	0.14	0.07	0.05	0.01	0.00	0.07	0.08	0.07	0.09	0.17	0.07
O3'	0.02	0.17	0.03	0.00	0.11	0.01	0.16	0.03	0.17	0.19	0.17	0.15	0.19	0.21	0.08	0.07	0.00	0.02	0.18	0.14	0.18	0.10
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	0.04	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.13	0.11	0.18	0.12
O5'	0.07	0.11	0.08	0.15	0.12	0.02	0.17	0.01	0.17	0.19	0.14	0.10	0.20	0.21	0.11	0.07	0.18	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.07	0.14	0.08	0.15	0.15	0.12	0.09	0.20	0.19	0.09	0.09	0.14	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.13	0.22	0.19	0.14	0.15	0.17	0.14	0.17	0.19	0.15	0.13	0.22	0.21	0.16	0.17	0.18	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.06	0.08	0.09	0.04	0.14	0.02	0.15	0.16	0.12	0.09	0.19	0.19	0.08	0.07	0.10	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00