Doublet Group distance statistics: 50882

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N2	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.000, 0.194, 0.389, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.194 std_dev=0.194
C2'	A	0, 0.000, 0.222, 0.444, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.222 std_dev=0.222
P	A	0, 0.000, 0.227, 0.454, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.227 std_dev=0.227
O5'	A	0, 0.000, 0.239, 0.478, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.239 std_dev=0.239
O2'	A	0, 0.000, 0.248, 0.495, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.248 std_dev=0.248
OP1	A	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.284 std_dev=0.284
OP2	A	0, 0.000, 0.288, 0.576, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C4'	A	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
C3'	A	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
C5'	A	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
OP2	B	0, 0.000, 0.524, 1.049, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.524
OP1	B	0, 0.000, 0.577, 1.155, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.577 std_dev=0.577
O3'	A	0, 0.000, 0.624, 1.248, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.624 std_dev=0.624
C2'	B	0, 0.000, 0.626, 1.251, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.626 std_dev=0.626
P	B	0, 0.000, 0.635, 1.269, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.635 std_dev=0.635
O2'	B	0, 0.000, 0.731, 1.463, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.731 std_dev=0.731
C3'	B	0, 0.000, 0.734, 1.468, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.734 std_dev=0.734
O5'	B	0, 0.000, 0.771, 1.541, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.771 std_dev=0.771
C4	B	0, 0.000, 0.780, 1.559, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.780 std_dev=0.780
N9	B	0, 0.000, 0.797, 1.594, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.797 std_dev=0.797
C1'	B	0, 0.000, 0.798, 1.595, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.798 std_dev=0.797
N3	B	0, 0.000, 0.805, 1.609, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.805 std_dev=0.805
C5	B	0, 0.000, 0.861, 1.722, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.861 std_dev=0.861
O3'	B	0, 0.000, 0.900, 1.801, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.900 std_dev=0.900
N7	B	0, 0.000, 0.925, 1.851, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.925 std_dev=0.925
C8	B	0, 0.000, 0.930, 1.861, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.930 std_dev=0.930
C2	B	0, 0.000, 0.969, 1.939, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.969 std_dev=0.969
C6	B	0, 0.000, 0.973, 1.946, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.973 std_dev=0.973
O4'	B	0, 0.000, 1.022, 2.045, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.022 std_dev=1.022
N1	B	0, 0.000, 1.053, 2.106, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.053 std_dev=1.053
N6	B	0, 0.000, 1.082, 2.164, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.082 std_dev=1.082
C4'	B	0, 0.000, 1.082, 2.165, 2.165 max_d=2.165 avg_d=1.082 std_dev=1.082
C5'	B	0, 0.000, 1.380, 2.760, 2.760 max_d=2.760 avg_d=1.380 std_dev=1.380

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02
C2	0.01	0.00	0.13	0.11	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.19	0.05	0.08	0.01	0.10	0.13	0.08
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.03	0.10	0.01	0.12	0.14	0.12	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.10	0.18	0.08	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.04	0.09	0.01	0.11	0.12	0.10	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.22	0.08	0.13
C4	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.04	0.08	0.02	0.10	0.11	0.07
C4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.04	0.10	0.01	0.13	0.15	0.10
C5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.08	0.06	0.05	0.11	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.10	0.00	0.13	0.16	0.11
C8	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.12	0.10	0.08
N1	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.05	0.09	0.00	0.12	0.15	0.10
N2	0.01	0.00	0.14	0.12	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.22	0.05	0.07	0.01	0.10	0.12	0.07
N3	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.17	0.04	0.06	0.01	0.09	0.10	0.06
N7	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.11	0.02	0.15	0.16	0.12
N9	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.06	0.02	0.09	0.08	0.05
O2'	0.02	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.13	0.15	0.13	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.14	0.06	0.06
O3'	0.02	0.19	0.03	0.00	0.12	0.03	0.11	0.07	0.15	0.01	0.19	0.22	0.17	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.34	0.11	0.20
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.06
O5'	0.03	0.08	0.07	0.09	0.08	0.02	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.06	0.11	0.06	0.05	0.12	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.09	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.15	0.03	0.10	0.00	0.15	0.18	0.12
OP1	0.06	0.10	0.18	0.22	0.10	0.06	0.13	0.01	0.13	0.12	0.12	0.10	0.09	0.15	0.09	0.14	0.34	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.13	0.08	0.08	0.11	0.01	0.15	0.01	0.16	0.10	0.15	0.12	0.10	0.16	0.08	0.06	0.11	0.04	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.09	0.13	0.07	0.03	0.10	0.02	0.11	0.08	0.10	0.07	0.06	0.12	0.05	0.06	0.20	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.51	0.19	0.41	0.40	0.39	0.59	0.38	0.78	0.21	0.57	0.13	0.31	0.12	0.52	0.50	0.42	0.29	0.58	0.10	0.02	0.05	0.07
C2	0.38	0.01	0.38	0.40	0.16	0.51	0.01	0.67	0.16	0.28	0.12	0.14	0.34	0.07	0.30	0.40	0.34	0.42	0.07	0.04	0.03	0.01
C2'	0.69	0.29	0.57	0.57	0.55	0.78	0.56	0.98	0.35	0.77	0.21	0.43	0.26	0.73	0.68	0.59	0.46	0.79	0.26	0.15	0.16	0.21
C3'	0.74	0.32	0.60	0.60	0.58	0.83	0.58	1.03	0.39	0.80	0.26	0.46	0.31	0.75	0.71	0.63	0.49	0.84	0.32	0.19	0.20	0.26
C4	0.44	0.04	0.40	0.42	0.24	0.57	0.16	0.76	0.04	0.43	0.07	0.18	0.21	0.29	0.38	0.42	0.35	0.51	0.14	0.04	0.08	0.10
C4'	0.62	0.33	0.48	0.45	0.52	0.67	0.53	0.86	0.40	0.68	0.30	0.43	0.35	0.65	0.61	0.50	0.32	0.70	0.16	0.04	0.08	0.12
C5	0.41	0.02	0.40	0.44	0.17	0.59	0.07	0.77	0.13	0.36	0.14	0.12	0.30	0.19	0.33	0.43	0.40	0.48	0.22	0.10	0.18	0.18
C5'	0.56	0.29	0.43	0.40	0.46	0.62	0.46	0.80	0.34	0.61	0.25	0.38	0.29	0.57	0.55	0.45	0.27	0.64	0.12	0.02	0.04	0.08
C6	0.35	0.07	0.38	0.43	0.09	0.56	0.04	0.73	0.21	0.24	0.20	0.06	0.39	0.03	0.24	0.42	0.43	0.42	0.25	0.11	0.22	0.21
C8	0.46	0.04	0.41	0.43	0.25	0.61	0.19	0.81	0.00	0.46	0.06	0.17	0.14	0.34	0.40	0.43	0.37	0.54	0.21	0.10	0.16	0.18
N1	0.34	0.06	0.37	0.42	0.08	0.52	0.08	0.68	0.23	0.19	0.19	0.07	0.41	0.04	0.22	0.40	0.41	0.38	0.18	0.04	0.11	0.11
N2	0.34	0.02	0.36	0.37	0.13	0.44	0.05	0.56	0.18	0.17	0.11	0.14	0.35	0.07	0.24	0.37	0.30	0.35	0.04	0.12	0.17	0.12
N3	0.44	0.08	0.39	0.39	0.25	0.54	0.16	0.71	0.03	0.42	0.04	0.21	0.22	0.28	0.39	0.40	0.31	0.49	0.07	0.03	0.01	0.02
N7	0.43	0.02	0.41	0.45	0.19	0.61	0.10	0.80	0.09	0.40	0.13	0.12	0.25	0.24	0.35	0.44	0.41	0.51	0.25	0.14	0.21	0.22
N9	0.47	0.08	0.40	0.41	0.29	0.59	0.24	0.78	0.05	0.49	0.01	0.22	0.09	0.39	0.43	0.42	0.33	0.54	0.14	0.05	0.09	0.11
O2'	0.72	0.41	0.57	0.54	0.64	0.75	0.67	0.94	0.53	0.80	0.38	0.53	0.52	0.80	0.72	0.58	0.42	0.79	0.21	0.12	0.12	0.16
O3'	0.91	0.49	0.75	0.73	0.76	0.99	0.76	1.19	0.58	0.98	0.43	0.63	0.51	0.93	0.89	0.79	0.62	1.03	0.44	0.29	0.29	0.37
O4'	0.49	0.24	0.37	0.34	0.40	0.54	0.40	0.72	0.28	0.54	0.20	0.33	0.22	0.50	0.48	0.38	0.22	0.55	0.05	0.04	0.01	0.03
O5'	0.48	0.13	0.38	0.38	0.33	0.58	0.31	0.77	0.16	0.51	0.07	0.25	0.08	0.44	0.45	0.41	0.28	0.56	0.13	0.00	0.07	0.10
O6	0.31	0.11	0.37	0.43	0.04	0.54	0.10	0.69	0.26	0.17	0.24	0.02	0.43	0.04	0.19	0.41	0.46	0.37	0.31	0.18	0.31	0.29
OP1	0.41	0.04	0.33	0.34	0.25	0.53	0.24	0.72	0.09	0.45	0.01	0.16	0.03	0.38	0.37	0.35	0.26	0.49	0.10	0.01	0.05	0.08
OP2	0.36	0.03	0.31	0.33	0.17	0.51	0.14	0.70	0.03	0.38	0.10	0.09	0.12	0.28	0.31	0.34	0.27	0.45	0.13	0.00	0.07	0.10
P	0.43	0.08	0.36	0.37	0.27	0.56	0.25	0.74	0.10	0.46	0.02	0.19	0.03	0.38	0.40	0.39	0.29	0.52	0.14	0.02	0.09	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.22	0.22	0.13	0.23
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.40	0.38	0.43	0.45
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.09	0.01	0.04	0.06	0.09	0.04	0.00	0.00	0.01	0.14	0.08	0.04	0.11
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.10	0.15	0.06	0.00	0.13	0.16	0.07	0.02	0.01	0.00	0.09	0.04	0.04	0.04
C4	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.42	0.39	0.38	0.44
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01
C5	0.00	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.53	0.52	0.53	0.56
C5'	0.06	0.10	0.03	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.10	0.10	0.10	0.08	0.09	0.10	0.02	0.06	0.03	0.01	0.22	0.26	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.54	0.55	0.59	0.60
C8	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.18	0.02	0.53	0.50	0.42	0.52
N1	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.48	0.48	0.53	0.54
N3	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.35	0.32	0.34	0.39
N6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.19	0.02	0.60	0.64	0.68	0.67
N7	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.21	0.02	0.59	0.59	0.58	0.62
N9	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.39	0.36	0.29	0.39
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.06	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03
O3'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.14	0.06	0.14	0.18	0.08	0.01	0.19	0.21	0.08	0.04	0.00	0.02	0.07	0.13	0.13	0.10
O4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.18	0.25	0.08	0.22
O5'	0.22	0.40	0.14	0.09	0.42	0.01	0.53	0.01	0.54	0.53	0.48	0.35	0.60	0.59	0.39	0.03	0.07	0.18	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.38	0.08	0.04	0.39	0.08	0.52	0.22	0.55	0.50	0.48	0.32	0.64	0.59	0.36	0.00	0.13	0.25	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.43	0.04	0.04	0.38	0.12	0.53	0.26	0.59	0.42	0.53	0.34	0.68	0.58	0.29	0.03	0.13	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.23	0.45	0.11	0.04	0.44	0.01	0.56	0.01	0.60	0.52	0.54	0.39	0.67	0.62	0.39	0.03	0.10	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00