Doublet Group distance statistics: 50887

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 13, 8, 2, 0, 4, 3, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.019, 0.026, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.014, 0.023, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.021, 0.032, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.030, 0.044, 0.058, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.044 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.032, 0.052, 0.072, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.042, 0.064, 0.087, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.064 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.073, 0.104, 0.135, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.104 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.009, 0.040, 0.072, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.040 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.070, 0.104, 0.138, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.104 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.250, 0.362, 0.475, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.362 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.304, 0.434, 0.564, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.434 std_dev=0.130
C5	B	0, 0.556, 0.723, 0.889, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.723 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.541, 0.725, 0.908, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.725 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.872, 1.085, 1.298, 1.381 max_d=1.381 avg_d=1.085 std_dev=0.213
C2	B	0, 0.799, 1.043, 1.287, 1.391 max_d=1.391 avg_d=1.043 std_dev=0.244
O2'	A	0, 1.203, 1.466, 1.729, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.466 std_dev=0.263
C6	B	0, 0.711, 1.006, 1.300, 1.598 max_d=1.598 avg_d=1.006 std_dev=0.294
O4	B	0, 1.324, 1.628, 1.933, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.628 std_dev=0.304
C3'	A	0, 1.346, 1.658, 1.970, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.658 std_dev=0.312
N3	B	0, 1.044, 1.363, 1.683, 1.818 max_d=1.818 avg_d=1.363 std_dev=0.319
N1	B	0, 0.522, 0.858, 1.194, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.858 std_dev=0.336
C5'	A	0, 1.391, 1.741, 2.092, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.741 std_dev=0.350
O2	B	0, 1.016, 1.395, 1.774, 1.921 max_d=1.921 avg_d=1.395 std_dev=0.379
O5'	A	0, 1.111, 1.572, 2.033, 2.419 max_d=2.419 avg_d=1.572 std_dev=0.461
O3'	A	0, 2.483, 3.030, 3.577, 3.666 max_d=3.666 avg_d=3.030 std_dev=0.547
C1'	B	0, 0.770, 1.327, 1.884, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.327 std_dev=0.557
O2'	B	0, 1.231, 1.841, 2.450, 3.116 max_d=3.116 avg_d=1.841 std_dev=0.609
C2'	B	0, 0.708, 1.351, 1.994, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.351 std_dev=0.643
O4'	B	0, 1.402, 2.060, 2.718, 3.397 max_d=3.397 avg_d=2.060 std_dev=0.658
C3'	B	0, 2.129, 2.922, 3.715, 4.439 max_d=4.439 avg_d=2.922 std_dev=0.793
OP2	A	0, 2.902, 3.741, 4.579, 5.381 max_d=5.381 avg_d=3.741 std_dev=0.838
C4'	B	0, 2.406, 3.264, 4.122, 4.890 max_d=4.890 avg_d=3.264 std_dev=0.858
P	A	0, 1.523, 2.466, 3.408, 4.527 max_d=4.527 avg_d=2.466 std_dev=0.942
O3'	B	0, 3.246, 4.213, 5.180, 5.922 max_d=5.922 avg_d=4.213 std_dev=0.967
C5'	B	0, 3.245, 4.241, 5.236, 5.962 max_d=5.962 avg_d=4.241 std_dev=0.995
O5'	B	0, 3.184, 4.224, 5.264, 6.134 max_d=6.134 avg_d=4.224 std_dev=1.040
P	B	0, 3.185, 4.257, 5.330, 6.017 max_d=6.017 avg_d=4.257 std_dev=1.073
OP2	B	0, 4.175, 5.275, 6.375, 6.809 max_d=6.809 avg_d=5.275 std_dev=1.100
OP1	B	0, 1.674, 2.917, 4.159, 5.555 max_d=5.555 avg_d=2.917 std_dev=1.243
OP1	A	0, 3.459, 4.746, 6.032, 7.115 max_d=7.115 avg_d=4.746 std_dev=1.286

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.11	0.70	0.21
C2	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.10	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.09	0.18	0.02	0.16	0.69	0.30
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.08	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.22	0.05	0.21	0.82	0.22
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.11	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.04	0.44	0.50	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.05	0.23	0.02	0.28	0.91	0.45
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07	0.14	0.10	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.39	0.30	0.17
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.04	0.32	0.01	0.57	1.15	0.69
C5'	0.06	0.09	0.08	0.03	0.12	0.01	0.19	0.00	0.18	0.28	0.12	0.10	0.07	0.28	0.15	0.07	0.02	0.02	0.01	0.21	0.20	0.39	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.13	0.06	0.31	0.00	0.57	1.09	0.67
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.12	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.05	0.37	0.02	0.68	1.38	0.83
N1	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.07	0.24	0.01	0.35	0.87	0.48
N2	0.04	0.01	0.07	0.11	0.01	0.14	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.15	0.24	0.10	0.15	0.03	0.20	0.54	0.22
N3	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.08	0.17	0.02	0.14	0.66	0.25
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.04	0.39	0.02	0.82	1.43	0.92
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.25	0.02	0.30	0.99	0.49
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.09	0.11	0.15	0.11	0.09	0.05	0.00	0.05	0.02	0.24	0.09	0.26	0.86	0.23
O3'	0.07	0.20	0.02	0.01	0.12	0.01	0.10	0.02	0.13	0.04	0.17	0.24	0.19	0.05	0.07	0.05	0.00	0.04	0.11	0.12	0.61	0.30	0.26
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.04	0.02	0.02	0.04	0.00	0.09	0.05	0.18	0.45	0.18
O5'	0.15	0.18	0.22	0.18	0.23	0.03	0.32	0.01	0.31	0.37	0.24	0.15	0.17	0.39	0.25	0.24	0.11	0.09	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.09	0.12	0.05	0.35	0.00	0.74	1.19	0.80
OP1	0.11	0.16	0.21	0.44	0.28	0.39	0.57	0.20	0.57	0.68	0.35	0.20	0.14	0.82	0.30	0.26	0.61	0.18	0.02	0.74	0.00	0.01	0.01
OP2	0.70	0.69	0.82	0.50	0.91	0.30	1.15	0.39	1.09	1.38	0.87	0.54	0.66	1.43	0.99	0.86	0.30	0.45	0.02	1.19	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.30	0.22	0.15	0.45	0.17	0.69	0.02	0.67	0.83	0.48	0.22	0.25	0.92	0.49	0.23	0.26	0.18	0.01	0.80	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.13	0.14	0.10	0.12	0.21	0.11	0.26	0.14	0.15	0.12	0.13	0.17	0.09	0.15	0.23	0.12	0.12	0.40	0.14
C2	0.08	0.14	0.09	0.11	0.14	0.10	0.07	0.21	0.08	0.09	0.17	0.17	0.09	0.14	0.19	0.09	0.15	0.25	0.86	0.36
C2'	0.29	0.16	0.22	0.17	0.10	0.34	0.10	0.40	0.18	0.21	0.11	0.18	0.26	0.13	0.16	0.36	0.10	0.35	0.31	0.23
C3'	0.42	0.31	0.35	0.28	0.18	0.44	0.19	0.44	0.30	0.34	0.23	0.34	0.39	0.23	0.15	0.48	0.11	0.11	0.08	0.08
C4	0.11	0.14	0.09	0.09	0.15	0.14	0.09	0.24	0.10	0.11	0.17	0.15	0.10	0.11	0.20	0.15	0.11	0.19	0.68	0.26
C4'	0.42	0.33	0.34	0.24	0.23	0.36	0.24	0.30	0.32	0.36	0.28	0.35	0.39	0.20	0.20	0.43	0.21	0.43	0.14	0.22
C5	0.12	0.16	0.10	0.10	0.16	0.15	0.10	0.24	0.11	0.12	0.19	0.19	0.11	0.11	0.19	0.14	0.10	0.19	0.67	0.24
C5'	0.53	0.40	0.47	0.36	0.26	0.50	0.26	0.40	0.37	0.43	0.33	0.44	0.55	0.34	0.21	0.56	0.17	0.45	0.26	0.24
C6	0.12	0.18	0.11	0.11	0.16	0.13	0.10	0.23	0.10	0.12	0.21	0.22	0.11	0.12	0.19	0.12	0.10	0.21	0.77	0.29
C8	0.16	0.15	0.13	0.10	0.16	0.19	0.11	0.25	0.13	0.13	0.17	0.16	0.15	0.10	0.19	0.19	0.13	0.15	0.44	0.14
N1	0.10	0.17	0.10	0.11	0.15	0.10	0.08	0.21	0.09	0.11	0.20	0.21	0.10	0.14	0.18	0.10	0.13	0.24	0.85	0.34
N2	0.08	0.14	0.10	0.13	0.12	0.09	0.08	0.19	0.08	0.09	0.16	0.17	0.10	0.17	0.16	0.09	0.19	0.29	0.93	0.41
N3	0.09	0.12	0.08	0.09	0.14	0.12	0.08	0.22	0.09	0.09	0.15	0.13	0.08	0.12	0.20	0.12	0.13	0.23	0.79	0.33
N7	0.14	0.16	0.12	0.10	0.16	0.17	0.11	0.24	0.12	0.13	0.19	0.19	0.14	0.10	0.19	0.17	0.11	0.16	0.54	0.18
N9	0.14	0.13	0.11	0.09	0.15	0.17	0.11	0.25	0.12	0.12	0.15	0.14	0.13	0.10	0.19	0.18	0.11	0.15	0.52	0.19
O2'	0.24	0.15	0.19	0.17	0.17	0.32	0.13	0.43	0.15	0.18	0.14	0.17	0.22	0.14	0.25	0.33	0.19	0.68	0.55	0.42
O3'	0.40	0.35	0.33	0.24	0.26	0.36	0.25	0.35	0.32	0.36	0.30	0.38	0.34	0.18	0.23	0.43	0.11	0.08	0.06	0.10
O4'	0.22	0.20	0.18	0.14	0.17	0.19	0.16	0.19	0.19	0.20	0.18	0.21	0.21	0.14	0.16	0.23	0.29	0.32	0.13	0.15
O5'	0.38	0.27	0.34	0.25	0.21	0.36	0.20	0.28	0.26	0.29	0.23	0.29	0.42	0.26	0.20	0.39	0.23	0.58	0.26	0.30
O6	0.13	0.20	0.12	0.11	0.16	0.13	0.10	0.23	0.11	0.13	0.22	0.24	0.12	0.13	0.18	0.13	0.10	0.21	0.77	0.28
OP1	1.51	1.17	1.53	1.42	0.78	1.55	0.81	1.32	1.08	1.25	0.95	1.27	1.71	1.49	0.61	1.54	0.76	0.29	0.36	0.43
OP2	0.91	0.66	0.82	0.61	0.36	0.79	0.34	0.54	0.51	0.68	0.49	0.77	1.05	0.62	0.34	0.90	0.18	0.68	0.49	0.43
P	1.09	0.83	1.05	0.91	0.52	1.05	0.55	0.85	0.76	0.89	0.66	0.90	1.22	0.94	0.41	1.10	0.31	0.33	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.17	0.26	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.02	0.15	0.13	0.57	0.26
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.13	0.00	0.01	0.05	0.01	0.13	0.14	0.23	0.17
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.13	0.06	0.09	0.13	0.02	0.01	0.13	0.01	0.17	0.17	0.12	0.14
C4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.04	0.22	0.15	0.68	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.14	0.10	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.15	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.17	0.01	0.04	0.25	0.15	0.56	0.23
C5'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.13	0.11	0.06	0.04	0.15	0.02	0.01	0.16	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.15	0.01	0.04	0.23	0.16	0.43	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.15	0.15	0.44	0.20
N3	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.02	0.18	0.14	0.66	0.29
O2	0.03	0.01	0.13	0.13	0.02	0.06	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.15	0.03	0.03	0.15	0.13	0.57	0.28
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.06	0.12	0.00	0.03	0.04	0.03	0.06	0.15	0.11	0.09
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.14	0.01	0.17	0.04	0.15	0.06	0.10	0.15	0.03	0.00	0.16	0.01	0.16	0.18	0.20	0.11
O4	0.02	0.02	0.05	0.13	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.16	0.00	0.04	0.23	0.17	0.72	0.30
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.11	0.23	0.12	0.08
O5'	0.09	0.15	0.13	0.17	0.22	0.02	0.25	0.01	0.23	0.15	0.18	0.15	0.06	0.16	0.23	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.17	0.13	0.14	0.17	0.15	0.14	0.15	0.16	0.16	0.15	0.14	0.13	0.15	0.18	0.17	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.57	0.23	0.12	0.68	0.10	0.56	0.22	0.43	0.44	0.66	0.57	0.11	0.20	0.72	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.26	0.17	0.14	0.28	0.04	0.23	0.01	0.18	0.20	0.29	0.28	0.09	0.11	0.30	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00