Doublet Group distance statistics: 50889

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 12, 6, 1, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.002, 0.021, 0.041, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.021 std_dev=0.019
C5	A	0, -0.001, 0.023, 0.048, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C4	A	0, -0.002, 0.028, 0.057, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.028 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.004, 0.034, 0.064, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.034 std_dev=0.030
N9	A	0, -0.002, 0.028, 0.058, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.028 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N7	A	0, -0.002, 0.045, 0.091, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.045 std_dev=0.047
C8	A	0, -0.004, 0.052, 0.107, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.052 std_dev=0.055
N3	B	0, 0.188, 0.322, 0.457, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.322 std_dev=0.134
C2	B	0, 0.174, 0.312, 0.450, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.312 std_dev=0.138
N1	B	0, 0.147, 0.288, 0.429, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.288 std_dev=0.141
C6	B	0, 0.098, 0.264, 0.429, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.264 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.149, 0.317, 0.484, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.317 std_dev=0.168
O2	B	0, 0.196, 0.364, 0.533, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.364 std_dev=0.168
C5	B	0, 0.083, 0.278, 0.474, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.278 std_dev=0.195
O4	B	0, 0.150, 0.361, 0.571, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.361 std_dev=0.211
C1'	B	0, 0.113, 0.336, 0.559, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.336 std_dev=0.223
C2'	B	0, 0.152, 0.379, 0.606, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.379 std_dev=0.227
C3'	B	0, 0.072, 0.398, 0.724, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.398 std_dev=0.326
C2'	A	0, -0.172, 0.157, 0.486, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.157 std_dev=0.329
O4'	A	0, -0.220, 0.122, 0.463, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.122 std_dev=0.341
O3'	B	0, 0.114, 0.464, 0.815, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.464 std_dev=0.351
C3'	A	0, -0.230, 0.200, 0.629, 2.522 max_d=2.522 avg_d=0.200 std_dev=0.430
O3'	A	0, -0.163, 0.291, 0.745, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.291 std_dev=0.454
C4'	A	0, -0.293, 0.195, 0.684, 2.862 max_d=2.862 avg_d=0.195 std_dev=0.489
O2'	A	0, -0.238, 0.268, 0.774, 2.919 max_d=2.919 avg_d=0.268 std_dev=0.506
O4'	B	0, -0.113, 0.397, 0.906, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.397 std_dev=0.510
O2'	B	0, 0.009, 0.553, 1.098, 2.403 max_d=2.403 avg_d=0.553 std_dev=0.544
C4'	B	0, -0.140, 0.432, 1.003, 2.542 max_d=2.542 avg_d=0.432 std_dev=0.571
O5'	A	0, -0.346, 0.348, 1.043, 4.130 max_d=4.130 avg_d=0.348 std_dev=0.694
C5'	A	0, -0.438, 0.310, 1.059, 4.418 max_d=4.418 avg_d=0.310 std_dev=0.748
OP2	A	0, -0.251, 0.518, 1.287, 4.598 max_d=4.598 avg_d=0.518 std_dev=0.769
P	A	0, -0.315, 0.482, 1.280, 4.780 max_d=4.780 avg_d=0.482 std_dev=0.798
OP1	A	0, -0.330, 0.615, 1.561, 5.682 max_d=5.682 avg_d=0.615 std_dev=0.946
C5'	B	0, -0.475, 0.545, 1.564, 4.301 max_d=4.301 avg_d=0.545 std_dev=1.019
O5'	B	0, -0.539, 0.589, 1.717, 4.740 max_d=4.740 avg_d=0.589 std_dev=1.128
P	B	0, -0.957, 0.709, 2.374, 6.753 max_d=6.753 avg_d=0.709 std_dev=1.665
OP2	B	0, -1.151, 0.884, 2.919, 8.240 max_d=8.240 avg_d=0.884 std_dev=2.035
OP1	B	0, -1.229, 0.924, 3.077, 8.523 max_d=8.523 avg_d=0.924 std_dev=2.153

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.12	0.01	0.06	0.02	0.20	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.19	0.13	0.01	0.12	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.15	0.20	0.10	0.02	0.15	0.21	0.12
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.09	0.11	0.10	0.15	0.22	0.18	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.18	0.10	0.42	0.35	0.31
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.12	0.00	0.15	0.02	0.16	0.13	0.15	0.12	0.11	0.15	0.09	0.03	0.01	0.01	0.07	0.18	0.32	0.16	0.18
C4	0.02	0.01	0.10	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.10	0.10	0.01	0.13	0.20	0.12
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.14	0.07	0.17	0.11	0.12	0.04	0.13	0.02	0.00	0.02	0.04	0.15	0.04	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.04	0.14	0.01	0.17	0.29	0.20
C5'	0.03	0.16	0.09	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.07	0.16	0.11	0.21	0.15	0.15	0.05	0.07	0.09	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.16	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.07	0.14	0.01	0.19	0.33	0.22
C8	0.01	0.02	0.10	0.13	0.01	0.14	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.08	0.12	0.20	0.02	0.17	0.23	0.21
N1	0.02	0.01	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.15	0.11	0.01	0.15	0.28	0.17
N2	0.04	0.01	0.22	0.12	0.01	0.17	0.02	0.21	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.26	0.18	0.24	0.12	0.02	0.18	0.20	0.12
N3	0.03	0.01	0.18	0.11	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.13	0.19	0.10	0.01	0.16	0.17	0.11
N7	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.10	0.07	0.21	0.02	0.24	0.33	0.28
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.10	0.01	0.12	0.15	0.10
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.07	0.13	0.10	0.07	0.10	0.22	0.13	0.26	0.18	0.20	0.08	0.00	0.05	0.11	0.14	0.12	0.44	0.42	0.32
O3'	0.12	0.15	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.09	0.13	0.08	0.14	0.18	0.13	0.10	0.06	0.05	0.00	0.08	0.11	0.15	0.24	0.14	0.12
O4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.12	0.15	0.24	0.19	0.07	0.01	0.11	0.08	0.00	0.05	0.05	0.09	0.08	0.06
O5'	0.06	0.10	0.18	0.07	0.10	0.02	0.14	0.01	0.14	0.20	0.11	0.12	0.10	0.21	0.10	0.14	0.11	0.05	0.00	0.16	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.18	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.15	0.05	0.16	0.00	0.25	0.39	0.28
OP1	0.20	0.15	0.42	0.32	0.13	0.15	0.17	0.07	0.19	0.17	0.15	0.18	0.16	0.24	0.12	0.44	0.24	0.09	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.21	0.35	0.16	0.20	0.04	0.29	0.02	0.33	0.23	0.28	0.20	0.17	0.33	0.15	0.42	0.14	0.08	0.03	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.31	0.18	0.12	0.05	0.20	0.02	0.22	0.21	0.17	0.12	0.11	0.28	0.10	0.32	0.12	0.06	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.12	0.19	0.22	0.14	0.47	0.12	0.70	0.15	0.15	0.12	0.12	0.19	0.24	0.18	0.48	0.63	0.59	0.95	0.73
C2	0.12	0.08	0.13	0.21	0.09	0.34	0.16	0.55	0.16	0.12	0.09	0.09	0.23	0.20	0.10	0.30	0.62	0.52	1.26	0.76
C2'	0.31	0.28	0.16	0.21	0.28	0.58	0.27	0.85	0.29	0.29	0.28	0.28	0.22	0.16	0.29	0.59	0.83	0.83	1.14	0.96
C3'	0.19	0.09	0.13	0.19	0.10	0.60	0.08	0.95	0.12	0.12	0.08	0.10	0.19	0.15	0.14	0.56	0.92	1.17	1.24	1.18
C4	0.17	0.09	0.13	0.23	0.09	0.45	0.14	0.69	0.17	0.14	0.09	0.08	0.20	0.22	0.12	0.42	0.71	0.69	1.30	0.88
C4'	0.18	0.19	0.23	0.12	0.24	0.48	0.20	0.77	0.16	0.17	0.22	0.19	0.21	0.11	0.28	0.49	0.63	0.82	0.78	0.78
C5	0.16	0.09	0.14	0.24	0.09	0.46	0.15	0.74	0.17	0.13	0.08	0.08	0.24	0.23	0.10	0.42	0.77	0.82	1.42	0.99
C5'	0.15	0.20	0.23	0.07	0.25	0.47	0.20	0.77	0.15	0.16	0.24	0.20	0.24	0.09	0.29	0.47	0.63	0.93	0.77	0.81
C6	0.13	0.08	0.14	0.23	0.09	0.42	0.16	0.69	0.17	0.12	0.08	0.08	0.27	0.23	0.09	0.37	0.76	0.79	1.47	0.98
C8	0.21	0.11	0.17	0.25	0.10	0.53	0.13	0.82	0.18	0.16	0.10	0.11	0.21	0.26	0.12	0.50	0.79	0.89	1.31	1.00
N1	0.12	0.08	0.14	0.22	0.10	0.36	0.17	0.61	0.17	0.11	0.09	0.09	0.26	0.22	0.10	0.32	0.68	0.65	1.39	0.88
N2	0.12	0.11	0.15	0.21	0.12	0.27	0.17	0.44	0.16	0.13	0.11	0.12	0.24	0.20	0.12	0.23	0.52	0.37	1.16	0.64
N3	0.15	0.08	0.12	0.21	0.09	0.38	0.14	0.59	0.17	0.13	0.09	0.08	0.19	0.20	0.12	0.36	0.62	0.52	1.20	0.75
N7	0.18	0.10	0.15	0.25	0.09	0.51	0.14	0.81	0.18	0.15	0.09	0.10	0.23	0.25	0.10	0.47	0.82	0.93	1.43	1.05
N9	0.20	0.11	0.16	0.24	0.10	0.49	0.12	0.75	0.17	0.15	0.10	0.11	0.19	0.24	0.14	0.48	0.73	0.73	1.21	0.89
O2'	0.42	0.40	0.26	0.17	0.40	0.54	0.40	0.73	0.40	0.40	0.40	0.40	0.29	0.13	0.40	0.65	0.60	0.48	0.72	0.59
O3'	0.21	0.16	0.20	0.22	0.17	0.65	0.16	1.06	0.17	0.17	0.16	0.16	0.23	0.17	0.20	0.59	1.03	1.41	1.18	1.33
O4'	0.25	0.27	0.26	0.22	0.31	0.47	0.28	0.70	0.24	0.25	0.30	0.27	0.23	0.21	0.35	0.49	0.57	0.60	0.77	0.66
O5'	0.17	0.15	0.21	0.12	0.15	0.51	0.14	0.84	0.15	0.15	0.15	0.15	0.26	0.09	0.17	0.50	0.76	1.10	1.06	1.00
O6	0.12	0.08	0.15	0.24	0.10	0.42	0.16	0.71	0.17	0.11	0.09	0.09	0.30	0.23	0.09	0.37	0.79	0.86	1.53	1.03
OP1	0.35	0.34	0.42	0.35	0.29	0.57	0.29	0.86	0.32	0.34	0.32	0.35	0.44	0.35	0.28	0.56	0.78	1.27	0.99	1.02
OP2	0.25	0.20	0.25	0.26	0.18	0.58	0.20	0.91	0.23	0.22	0.19	0.21	0.30	0.25	0.17	0.55	0.87	1.27	1.29	1.15
P	0.23	0.20	0.28	0.22	0.17	0.53	0.17	0.84	0.20	0.21	0.19	0.21	0.32	0.21	0.17	0.51	0.75	1.15	1.05	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.05	0.16	0.05
C2	0.02	0.00	0.14	0.16	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.01	0.09	0.16	0.12	0.47	0.15
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.13	0.03	0.10	0.25	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.15	0.08	0.05
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.14	0.00	0.10	0.02	0.08	0.09	0.17	0.21	0.02	0.01	0.15	0.01	0.07	0.25	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.03	0.26	0.10	0.74	0.28
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.05	0.06	0.07	0.09	0.03	0.10	0.00	0.01	0.12	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.01	0.09	0.28	0.09	0.69	0.28
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.17	0.01	0.22	0.00	0.20	0.09	0.10	0.09	0.09	0.03	0.18	0.01	0.01	0.11	0.19	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.08	0.01	0.12	0.01	0.20	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.09	0.01	0.12	0.23	0.08	0.50	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.01	0.15	0.07	0.38	0.13
N3	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.01	0.06	0.22	0.12	0.63	0.22
O2	0.04	0.00	0.25	0.21	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.24	0.02	0.16	0.14	0.15	0.40	0.13
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.10	0.09	0.15	0.09	0.14	0.05	0.04	0.17	0.00	0.05	0.10	0.09	0.06	0.23	0.06	0.07
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.15	0.03	0.11	0.03	0.09	0.09	0.19	0.24	0.05	0.00	0.17	0.02	0.12	0.41	0.20	0.11
O4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.17	0.00	0.03	0.28	0.11	0.82	0.31
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.06	0.16	0.09	0.02	0.03	0.00	0.07	0.10	0.10	0.05
O5'	0.07	0.16	0.04	0.07	0.26	0.01	0.28	0.01	0.23	0.15	0.22	0.14	0.06	0.12	0.28	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.12	0.15	0.25	0.10	0.12	0.09	0.11	0.08	0.07	0.12	0.15	0.23	0.41	0.11	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.47	0.08	0.08	0.74	0.12	0.69	0.19	0.50	0.38	0.63	0.40	0.06	0.20	0.82	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.15	0.05	0.06	0.28	0.03	0.28	0.02	0.21	0.13	0.22	0.13	0.07	0.11	0.31	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00