Doublet Group distance statistics: 50890

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 7, 4, 5, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.028, 0.050, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.028 std_dev=0.021
O6	A	0, -0.001, 0.026, 0.053, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.026 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.035 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.006, 0.047, 0.088, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.047 std_dev=0.041
C4	B	0, 0.211, 0.398, 0.585, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.398 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.207, 0.402, 0.597, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.402 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.181, 0.397, 0.613, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.397 std_dev=0.216
N3	B	0, 0.176, 0.434, 0.692, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.434 std_dev=0.258
C3'	B	0, 0.197, 0.457, 0.716, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.457 std_dev=0.260
O4	B	0, 0.173, 0.459, 0.745, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.459 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.253, 0.550, 0.847, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.550 std_dev=0.297
N1	B	0, 0.152, 0.461, 0.770, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.461 std_dev=0.309
C2	B	0, 0.110, 0.485, 0.860, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.485 std_dev=0.375
C2'	A	0, -0.167, 0.230, 0.627, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.230 std_dev=0.397
O4'	A	0, -0.244, 0.164, 0.571, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.164 std_dev=0.407
C2'	B	0, 0.112, 0.539, 0.966, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.539 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.073, 0.564, 1.056, 2.321 max_d=2.321 avg_d=0.564 std_dev=0.492
C3'	A	0, -0.156, 0.362, 0.881, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.362 std_dev=0.519
C4'	B	0, 0.074, 0.618, 1.162, 2.440 max_d=2.440 avg_d=0.618 std_dev=0.544
C4'	A	0, -0.224, 0.335, 0.895, 2.640 max_d=2.640 avg_d=0.335 std_dev=0.560
O2	B	0, -0.018, 0.583, 1.183, 2.607 max_d=2.607 avg_d=0.583 std_dev=0.601
O4'	B	0, 0.016, 0.652, 1.289, 2.783 max_d=2.783 avg_d=0.652 std_dev=0.636
O2'	A	0, -0.224, 0.435, 1.094, 2.948 max_d=2.948 avg_d=0.435 std_dev=0.659
O3'	A	0, -0.187, 0.508, 1.204, 2.705 max_d=2.705 avg_d=0.508 std_dev=0.696
O2'	B	0, -0.007, 0.779, 1.565, 3.374 max_d=3.374 avg_d=0.779 std_dev=0.786
C5'	B	0, -0.115, 0.711, 1.537, 3.431 max_d=3.431 avg_d=0.711 std_dev=0.826
C5'	A	0, -0.360, 0.489, 1.337, 4.170 max_d=4.170 avg_d=0.489 std_dev=0.849
O5'	B	0, -0.154, 0.808, 1.771, 4.178 max_d=4.178 avg_d=0.808 std_dev=0.963
O5'	A	0, -0.490, 0.580, 1.650, 5.817 max_d=5.817 avg_d=0.580 std_dev=1.070
P	B	0, -0.441, 0.916, 2.272, 5.747 max_d=5.747 avg_d=0.916 std_dev=1.357
P	A	0, -0.616, 0.763, 2.142, 7.555 max_d=7.555 avg_d=0.763 std_dev=1.379
OP1	B	0, -0.606, 1.015, 2.637, 7.218 max_d=7.218 avg_d=1.015 std_dev=1.621
OP2	A	0, -0.805, 0.881, 2.566, 9.467 max_d=9.467 avg_d=0.881 std_dev=1.685
OP1	A	0, -0.732, 0.978, 2.688, 9.218 max_d=9.218 avg_d=0.978 std_dev=1.710
OP2	B	0, -0.746, 1.049, 2.843, 7.517 max_d=7.517 avg_d=1.049 std_dev=1.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.16	0.01	0.07	0.30	0.18
C2	0.02	0.00	0.28	0.21	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.10	0.18	0.18	0.01	0.09	0.44	0.20
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.01	0.09	0.14	0.14	0.11	0.22	0.33	0.27	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.12	0.17	0.35	0.23
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.20	0.01	0.26	0.01	0.28	0.21	0.26	0.19	0.17	0.25	0.16	0.02	0.01	0.02	0.14	0.31	0.18	0.07	0.10
C4	0.01	0.00	0.15	0.20	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.09	0.29	0.01	0.13	0.55	0.32
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.14	0.06	0.15	0.10	0.13	0.06	0.22	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.11	0.02
C5	0.00	0.00	0.09	0.26	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.04	0.44	0.01	0.28	0.78	0.48
C5'	0.05	0.10	0.14	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.17	0.05	0.15	0.10	0.17	0.06	0.08	0.15	0.01	0.01	0.10	0.08	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.28	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.10	0.07	0.42	0.01	0.26	0.80	0.48
C8	0.01	0.01	0.11	0.21	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.08	0.11	0.54	0.02	0.40	0.83	0.57
N1	0.01	0.00	0.22	0.26	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.13	0.30	0.01	0.13	0.63	0.33
N2	0.03	0.00	0.33	0.19	0.01	0.15	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.15	0.22	0.09	0.01	0.17	0.32	0.12
N3	0.02	0.00	0.27	0.17	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.13	0.18	0.15	0.01	0.08	0.38	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.25	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.12	0.06	0.57	0.02	0.43	0.96	0.63
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.05	0.01	0.33	0.01	0.19	0.55	0.35
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.13	0.22	0.19	0.08	0.18	0.28	0.18	0.31	0.22	0.28	0.14	0.00	0.03	0.14	0.17	0.20	0.18	0.35	0.18
O3'	0.20	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.15	0.10	0.08	0.08	0.15	0.13	0.12	0.05	0.03	0.00	0.13	0.19	0.14	0.38	0.13	0.21
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.13	0.22	0.18	0.06	0.01	0.14	0.13	0.00	0.16	0.05	0.04	0.25	0.15
O5'	0.16	0.18	0.19	0.14	0.29	0.01	0.44	0.01	0.42	0.54	0.30	0.09	0.15	0.57	0.33	0.17	0.19	0.16	0.00	0.50	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.12	0.31	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.14	0.05	0.50	0.00	0.34	0.94	0.57
OP1	0.07	0.09	0.17	0.18	0.13	0.07	0.28	0.08	0.26	0.40	0.13	0.17	0.08	0.43	0.19	0.18	0.38	0.04	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.44	0.35	0.07	0.55	0.11	0.78	0.15	0.80	0.83	0.63	0.32	0.38	0.96	0.55	0.35	0.13	0.25	0.02	0.94	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.20	0.23	0.10	0.32	0.02	0.48	0.01	0.48	0.57	0.33	0.12	0.17	0.63	0.35	0.18	0.21	0.15	0.00	0.57	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.17	0.22	0.13	0.18	0.37	0.17	0.46	0.21	0.21	0.16	0.17	0.31	0.12	0.23	0.52	0.81	0.94	1.22	1.03
C2	0.11	0.16	0.16	0.09	0.15	0.18	0.11	0.22	0.12	0.11	0.19	0.19	0.29	0.10	0.21	0.24	0.69	0.60	1.24	0.87
C2'	0.15	0.31	0.39	0.17	0.41	0.23	0.33	0.44	0.21	0.22	0.39	0.32	0.45	0.15	0.46	0.29	0.78	1.11	1.35	1.13
C3'	0.38	0.18	0.22	0.22	0.14	0.68	0.15	0.93	0.24	0.26	0.13	0.20	0.36	0.20	0.21	0.79	1.17	1.60	1.59	1.53
C4	0.17	0.15	0.19	0.09	0.18	0.28	0.15	0.36	0.17	0.15	0.18	0.15	0.31	0.09	0.24	0.39	0.79	0.83	1.31	1.00
C4'	0.49	0.37	0.31	0.23	0.26	0.60	0.28	0.72	0.36	0.41	0.31	0.40	0.41	0.18	0.24	0.82	0.85	1.23	1.09	1.09
C5	0.16	0.15	0.19	0.08	0.17	0.28	0.14	0.38	0.16	0.14	0.18	0.16	0.33	0.09	0.23	0.38	0.81	0.89	1.37	1.05
C5'	0.55	0.42	0.33	0.24	0.28	0.67	0.29	0.80	0.39	0.45	0.34	0.46	0.44	0.18	0.24	0.89	0.83	1.29	1.05	1.06
C6	0.12	0.16	0.18	0.08	0.16	0.24	0.13	0.32	0.14	0.12	0.19	0.19	0.33	0.09	0.22	0.31	0.78	0.81	1.37	1.01
C8	0.22	0.15	0.22	0.11	0.18	0.37	0.16	0.48	0.19	0.18	0.17	0.15	0.33	0.11	0.24	0.49	0.84	1.05	1.36	1.10
N1	0.10	0.16	0.17	0.09	0.15	0.19	0.11	0.25	0.12	0.11	0.20	0.20	0.31	0.10	0.20	0.25	0.72	0.68	1.31	0.93
N2	0.09	0.17	0.15	0.10	0.13	0.12	0.09	0.16	0.09	0.10	0.19	0.21	0.27	0.12	0.19	0.15	0.61	0.45	1.14	0.76
N3	0.15	0.15	0.18	0.09	0.17	0.22	0.13	0.27	0.15	0.14	0.18	0.16	0.29	0.10	0.24	0.32	0.72	0.66	1.23	0.90
N7	0.18	0.14	0.21	0.09	0.18	0.34	0.16	0.45	0.18	0.15	0.18	0.15	0.34	0.10	0.24	0.44	0.84	1.02	1.40	1.10
N9	0.22	0.15	0.21	0.10	0.18	0.34	0.16	0.43	0.19	0.18	0.17	0.15	0.32	0.10	0.24	0.47	0.82	0.95	1.31	1.05
O2'	0.42	0.51	0.59	0.41	0.53	0.24	0.52	0.21	0.48	0.48	0.53	0.51	0.61	0.36	0.52	0.23	0.46	0.72	1.09	0.77
O3'	0.59	0.43	0.30	0.37	0.33	0.87	0.41	1.13	0.52	0.51	0.35	0.43	0.42	0.29	0.28	1.02	1.38	1.74	1.61	1.71
O4'	0.46	0.37	0.30	0.21	0.28	0.50	0.29	0.55	0.37	0.40	0.31	0.39	0.38	0.17	0.25	0.72	0.77	0.96	1.02	0.95
O5'	0.74	0.52	0.53	0.51	0.29	0.93	0.32	1.05	0.48	0.58	0.38	0.58	0.67	0.47	0.23	1.10	1.06	1.49	1.26	1.27
O6	0.11	0.16	0.19	0.08	0.16	0.23	0.13	0.33	0.13	0.11	0.20	0.21	0.34	0.09	0.21	0.30	0.79	0.84	1.40	1.03
OP1	0.81	0.67	0.60	0.49	0.45	0.89	0.43	0.97	0.55	0.68	0.56	0.75	0.74	0.44	0.38	1.12	0.86	1.36	1.00	1.04
OP2	0.96	0.62	0.71	0.76	0.28	1.25	0.36	1.37	0.57	0.71	0.41	0.71	0.91	0.78	0.20	1.35	1.31	1.67	1.50	1.46
P	0.81	0.58	0.57	0.54	0.31	0.99	0.34	1.09	0.51	0.63	0.43	0.65	0.74	0.51	0.23	1.16	1.04	1.45	1.18	1.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.20	0.06	0.32	0.20
C2	0.02	0.00	0.14	0.14	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.01	0.08	0.30	0.07	0.54	0.30
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.06	0.09	0.04	0.13	0.22	0.00	0.03	0.09	0.01	0.12	0.10	0.21	0.13
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.02	0.10	0.07	0.14	0.17	0.01	0.01	0.14	0.02	0.15	0.16	0.12	0.13
C4	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.00	0.03	0.39	0.11	0.76	0.42
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.05	0.11	0.03	0.06	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.01	0.06	0.42	0.15	0.77	0.45
C5'	0.04	0.11	0.06	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.11	0.09	0.13	0.10	0.06	0.08	0.16	0.02	0.01	0.13	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.01	0.08	0.39	0.15	0.65	0.40
N1	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.31	0.08	0.52	0.31
N3	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.16	0.01	0.07	0.35	0.09	0.66	0.36
O2	0.04	0.01	0.22	0.17	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.20	0.20	0.03	0.13	0.25	0.09	0.46	0.25
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.12	0.11	0.13	0.06	0.12	0.07	0.13	0.20	0.00	0.06	0.14	0.08	0.08	0.08	0.12	0.07
O3'	0.07	0.14	0.03	0.01	0.13	0.03	0.10	0.08	0.08	0.05	0.16	0.20	0.06	0.00	0.15	0.06	0.26	0.22	0.17	0.23
O4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.15	0.00	0.04	0.40	0.12	0.82	0.44
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.07	0.13	0.08	0.06	0.04	0.00	0.24	0.10	0.30	0.22
O5'	0.20	0.30	0.12	0.15	0.39	0.01	0.42	0.01	0.39	0.31	0.35	0.25	0.08	0.26	0.40	0.24	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.07	0.10	0.16	0.11	0.07	0.15	0.13	0.15	0.08	0.09	0.09	0.08	0.22	0.12	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.54	0.21	0.12	0.76	0.10	0.77	0.17	0.65	0.52	0.66	0.46	0.12	0.17	0.82	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.30	0.13	0.13	0.42	0.02	0.45	0.01	0.40	0.31	0.36	0.25	0.07	0.23	0.44	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00