Doublet Group distance statistics: 50891

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 3, 5, 2, 4, 6, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.018, 0.025, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.016, 0.028, 0.041, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.016, 0.030, 0.043, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.038 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.011, 0.035, 0.058, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.035 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.019, 0.047, 0.074, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.047 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.023, 0.058, 0.093, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.058 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.030, 0.070, 0.109, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.070 std_dev=0.040
O4'	A	0, -0.015, 0.116, 0.246, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.116 std_dev=0.131
OP2	B	0, 0.176, 0.308, 0.440, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.308 std_dev=0.132
P	B	0, 0.185, 0.322, 0.459, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.322 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.033, 0.172, 0.310, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.172 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.171, 0.340, 0.510, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.340 std_dev=0.169
C6	B	0, 0.188, 0.379, 0.569, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.379 std_dev=0.190
C5	B	0, 0.213, 0.408, 0.602, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.408 std_dev=0.194
O3'	A	0, 0.472, 0.684, 0.896, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.684 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.238, 0.453, 0.667, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.453 std_dev=0.215
C2'	B	0, 0.192, 0.412, 0.631, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.412 std_dev=0.220
N1	B	0, 0.192, 0.417, 0.643, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.417 std_dev=0.225
O4	B	0, 0.268, 0.496, 0.724, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.496 std_dev=0.228
C2'	A	0, -0.115, 0.122, 0.358, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.122 std_dev=0.236
O5'	B	0, 0.151, 0.388, 0.625, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.388 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.189, 0.430, 0.671, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.430 std_dev=0.241
OP1	B	0, 0.310, 0.555, 0.800, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.555 std_dev=0.245
P	A	0, 0.276, 0.522, 0.769, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.522 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.245, 0.494, 0.743, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.494 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.278, 0.532, 0.787, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.532 std_dev=0.254
OP2	A	0, 0.365, 0.619, 0.874, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.619 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.178, 0.434, 0.689, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.434 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.276, 0.536, 0.795, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.536 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.193, 0.456, 0.719, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.456 std_dev=0.263
C5'	A	0, 0.074, 0.341, 0.607, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.341 std_dev=0.267
OP1	A	0, 0.322, 0.601, 0.880, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.601 std_dev=0.279
O3'	B	0, 0.202, 0.482, 0.763, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.482 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.226, 0.518, 0.810, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.518 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.237, 0.540, 0.843, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.540 std_dev=0.303
O2	B	0, 0.361, 0.679, 0.997, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.679 std_dev=0.318
C5'	B	0, 0.302, 0.653, 1.004, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.653 std_dev=0.351
O2'	A	0, 0.064, 0.445, 0.826, 2.155 max_d=2.155 avg_d=0.445 std_dev=0.381

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.06	0.02	0.07	0.11	0.07
C2	0.03	0.00	0.14	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.12	0.05	0.09	0.01	0.07	0.12	0.07
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.10	0.03	0.11	0.09	0.19	0.14	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.03	0.21	0.22	0.19
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.09	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.09	0.02	0.08	0.12	0.08
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.10	0.01	0.09	0.13	0.09
C5'	0.02	0.05	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.06	0.06	0.04	0.04	0.07	0.05	0.05	0.05	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.11	0.01	0.09	0.13	0.09
C8	0.01	0.01	0.11	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.07	0.04	0.10	0.02	0.10	0.14	0.10
N1	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.10	0.01	0.08	0.12	0.08
N2	0.04	0.00	0.19	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.13	0.06	0.08	0.02	0.07	0.11	0.07
N3	0.03	0.01	0.14	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.12	0.06	0.08	0.01	0.07	0.12	0.07
N7	0.01	0.01	0.08	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.03	0.11	0.02	0.10	0.14	0.11
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.09	0.02	0.08	0.12	0.09
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.04	0.08	0.07	0.05	0.05	0.18	0.09	0.27	0.18	0.17	0.06	0.00	0.07	0.05	0.18	0.09	0.23	0.29	0.21
O3'	0.11	0.12	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.05	0.09	0.07	0.11	0.13	0.12	0.07	0.09	0.07	0.00	0.09	0.03	0.09	0.08	0.04	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.03	0.11	0.13	0.12
O5'	0.06	0.09	0.18	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.11	0.10	0.10	0.08	0.08	0.11	0.09	0.18	0.03	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.09	0.03	0.11	0.00	0.10	0.13	0.10
OP1	0.07	0.07	0.21	0.09	0.08	0.06	0.09	0.07	0.09	0.10	0.08	0.07	0.07	0.10	0.08	0.23	0.08	0.11	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.12	0.22	0.05	0.12	0.05	0.13	0.01	0.13	0.14	0.12	0.11	0.12	0.14	0.12	0.29	0.04	0.13	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.19	0.04	0.08	0.03	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.21	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.11	0.07	0.07	0.13	0.07	0.11	0.09	0.09	0.09	0.13	0.11	0.07	0.08	0.16	0.08	0.08	0.14	0.14	0.11
C2	0.10	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.13	0.10
C2'	0.31	0.33	0.30	0.28	0.33	0.28	0.33	0.27	0.32	0.32	0.33	0.33	0.30	0.26	0.34	0.30	0.23	0.22	0.25	0.21
C3'	0.15	0.17	0.15	0.15	0.18	0.14	0.17	0.15	0.16	0.16	0.18	0.16	0.14	0.15	0.20	0.13	0.11	0.13	0.16	0.10
C4	0.08	0.09	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.12	0.07	0.09	0.12	0.13	0.10
C4'	0.08	0.11	0.09	0.10	0.13	0.09	0.12	0.12	0.10	0.09	0.12	0.10	0.08	0.11	0.16	0.08	0.10	0.11	0.14	0.09
C5	0.08	0.09	0.08	0.07	0.10	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.10	0.10	0.08	0.08	0.11	0.08	0.09	0.13	0.13	0.10
C5'	0.08	0.11	0.09	0.10	0.13	0.10	0.11	0.13	0.10	0.09	0.12	0.11	0.08	0.12	0.16	0.08	0.10	0.11	0.15	0.09
C6	0.10	0.11	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.09	0.12	0.13	0.10
C8	0.07	0.09	0.06	0.06	0.10	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07	0.10	0.09	0.06	0.08	0.13	0.06	0.08	0.14	0.14	0.10
N1	0.11	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.10	0.12	0.13	0.10
N2	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.13	0.11	0.11	0.12	0.11
N3	0.08	0.09	0.08	0.08	0.10	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.10	0.09	0.08	0.09	0.12	0.08	0.10	0.12	0.13	0.10
N7	0.07	0.09	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.12	0.07	0.08	0.14	0.14	0.10
N9	0.07	0.09	0.06	0.07	0.11	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.06	0.08	0.14	0.06	0.08	0.13	0.14	0.11
O2'	0.54	0.54	0.50	0.47	0.51	0.50	0.54	0.49	0.55	0.54	0.52	0.54	0.51	0.43	0.47	0.55	0.44	0.36	0.39	0.38
O3'	0.16	0.15	0.18	0.17	0.14	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.15	0.15	0.16	0.18	0.14	0.15	0.15	0.13	0.16	0.12
O4'	0.10	0.11	0.11	0.12	0.13	0.11	0.10	0.13	0.09	0.10	0.12	0.12	0.10	0.13	0.15	0.10	0.15	0.17	0.17	0.15
O5'	0.09	0.12	0.10	0.11	0.14	0.10	0.12	0.12	0.10	0.10	0.14	0.12	0.09	0.12	0.17	0.08	0.10	0.11	0.13	0.08
O6	0.11	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.11	0.11	0.10	0.13	0.14	0.11
OP1	0.12	0.14	0.13	0.13	0.15	0.13	0.14	0.15	0.13	0.13	0.15	0.14	0.11	0.13	0.17	0.12	0.12	0.16	0.17	0.13
OP2	0.10	0.10	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.14	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.15	0.12	0.10	0.12	0.10	0.12	0.08
P	0.09	0.10	0.10	0.11	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10	0.10	0.12	0.10	0.09	0.13	0.14	0.09	0.11	0.11	0.13	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01	0.07	0.11	0.13	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.13	0.09	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.15	0.11	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.08	0.11	0.16	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.09	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.08	0.11	0.15	0.11
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.07	0.09	0.12	0.09
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.09	0.10	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.01	0.08	0.11	0.15	0.10
O2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.02	0.07	0.12	0.13	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.06	0.00	0.04	0.05	0.03	0.05	0.14	0.09	0.07
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.03	0.05	0.02	0.06	0.09	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.19	0.14	0.12
O4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.08	0.12	0.17	0.13
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.07	0.08	0.06
O5'	0.04	0.07	0.04	0.05	0.08	0.02	0.08	0.01	0.07	0.06	0.08	0.07	0.05	0.06	0.08	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.11	0.13	0.15	0.11	0.09	0.11	0.06	0.09	0.09	0.11	0.12	0.14	0.19	0.12	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.13	0.09	0.11	0.16	0.04	0.15	0.02	0.12	0.10	0.15	0.13	0.09	0.14	0.17	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.07	0.09	0.11	0.03	0.11	0.02	0.09	0.07	0.10	0.09	0.07	0.12	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00