Doublet Group distance statistics: 50896

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 2, 3, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.014, 0.023, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.019, 0.033, 0.048, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.020, 0.038, 0.056, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.019, 0.039, 0.060, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.039 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.035, 0.060, 0.086, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.060 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.025, 0.060, 0.095, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.060 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.024, 0.072, 0.120, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.072 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.093, 0.216, 0.340, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.216 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.115, 0.264, 0.412, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.264 std_dev=0.148
C3'	A	0, 0.237, 0.410, 0.584, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.410 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.219, 0.411, 0.602, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.411 std_dev=0.192
C4'	A	0, 0.264, 0.489, 0.715, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.489 std_dev=0.225
C8	B	0, 0.237, 0.532, 0.826, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.532 std_dev=0.294
N7	B	0, 0.249, 0.544, 0.839, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.544 std_dev=0.295
C5'	A	0, 0.373, 0.672, 0.970, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.672 std_dev=0.299
P	B	0, 0.289, 0.627, 0.965, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.627 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.375, 0.719, 1.062, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.719 std_dev=0.343
O4'	B	0, 0.441, 0.789, 1.137, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.789 std_dev=0.348
C5	B	0, 0.413, 0.764, 1.115, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.764 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.425, 0.785, 1.145, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.785 std_dev=0.360
C4'	B	0, 0.384, 0.746, 1.108, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.746 std_dev=0.362
O5'	A	0, 0.526, 0.889, 1.252, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.889 std_dev=0.363
C2'	B	0, 0.326, 0.696, 1.066, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.696 std_dev=0.370
O6	B	0, 0.511, 0.886, 1.260, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.886 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.319, 0.697, 1.075, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.697 std_dev=0.378
C6	B	0, 0.520, 0.908, 1.296, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.908 std_dev=0.388
P	A	0, 0.613, 1.001, 1.389, 1.441 max_d=1.441 avg_d=1.001 std_dev=0.388
C4	B	0, 0.471, 0.861, 1.251, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.861 std_dev=0.390
OP1	A	0, 0.583, 0.976, 1.369, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.976 std_dev=0.393
O3'	B	0, 0.426, 0.821, 1.215, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.821 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.394, 0.797, 1.199, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.797 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.500, 0.936, 1.373, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.936 std_dev=0.436
N1	B	0, 0.651, 1.110, 1.569, 1.658 max_d=1.658 avg_d=1.110 std_dev=0.459
N3	B	0, 0.600, 1.066, 1.532, 1.687 max_d=1.687 avg_d=1.066 std_dev=0.466
O3'	A	0, 0.321, 0.806, 1.291, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.806 std_dev=0.485
OP2	A	0, 0.733, 1.223, 1.713, 1.765 max_d=1.765 avg_d=1.223 std_dev=0.490
C2	B	0, 0.679, 1.171, 1.663, 1.803 max_d=1.803 avg_d=1.171 std_dev=0.492
N2	B	0, 0.786, 1.344, 1.902, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.344 std_dev=0.558
O5'	B	0, 0.265, 0.871, 1.477, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.871 std_dev=0.606
OP1	B	0, 0.463, 1.121, 1.780, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.121 std_dev=0.659
OP2	B	0, 0.398, 1.269, 2.140, 2.292 max_d=2.292 avg_d=1.269 std_dev=0.871

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.28	0.00	0.05	0.02	0.22	0.08	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.42	0.11	0.12	0.01	0.17	0.08	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.14	0.02	0.10	0.05	0.18	0.14	0.05
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.02	0.07	0.05	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.04	0.21	0.21	0.13
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.33	0.06	0.11	0.01	0.18	0.06	0.06
C4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.12	0.09	0.09	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.18	0.10	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.27	0.05	0.14	0.01	0.19	0.09	0.08
C5'	0.04	0.15	0.08	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.16	0.13	0.16	0.17	0.13	0.15	0.09	0.07	0.10	0.02	0.01	0.18	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.31	0.07	0.15	0.00	0.19	0.09	0.08
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.15	0.06	0.15	0.02	0.21	0.11	0.10
N1	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.38	0.09	0.13	0.01	0.18	0.08	0.07
N2	0.03	0.00	0.04	0.07	0.01	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.47	0.13	0.13	0.01	0.18	0.10	0.10
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.42	0.11	0.11	0.01	0.17	0.07	0.08
N7	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.06	0.17	0.02	0.20	0.12	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.25	0.02	0.10	0.02	0.20	0.08	0.07
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.09	0.02	0.13	0.07	0.14	0.12	0.13	0.11	0.09	0.14	0.08	0.00	0.17	0.02	0.10	0.16	0.24	0.21	0.10
O3'	0.28	0.42	0.14	0.02	0.33	0.03	0.27	0.10	0.31	0.15	0.38	0.47	0.42	0.18	0.25	0.17	0.00	0.19	0.28	0.28	0.42	0.56	0.40
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.09	0.13	0.11	0.06	0.02	0.02	0.19	0.00	0.02	0.07	0.21	0.09	0.12
O5'	0.05	0.12	0.10	0.09	0.11	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.13	0.13	0.11	0.17	0.10	0.10	0.28	0.02	0.00	0.18	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.28	0.07	0.18	0.00	0.19	0.11	0.10
OP1	0.22	0.17	0.18	0.21	0.18	0.18	0.19	0.07	0.19	0.21	0.18	0.18	0.17	0.20	0.20	0.24	0.42	0.21	0.03	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.08	0.14	0.21	0.06	0.10	0.09	0.02	0.09	0.11	0.08	0.10	0.07	0.12	0.08	0.21	0.56	0.09	0.02	0.11	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.08	0.05	0.13	0.06	0.09	0.08	0.02	0.08	0.10	0.07	0.10	0.08	0.10	0.07	0.10	0.40	0.12	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.13	0.19	0.14	0.14	0.16	0.14	0.21	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.14	0.22	0.13	0.19	0.59	0.17	0.20	0.55	0.23
C2	0.07	0.11	0.08	0.04	0.07	0.10	0.09	0.18	0.13	0.05	0.13	0.11	0.08	0.08	0.06	0.11	0.05	0.15	0.64	0.17	0.18	0.71	0.30
C2'	0.17	0.15	0.24	0.20	0.16	0.18	0.15	0.20	0.15	0.16	0.15	0.16	0.17	0.15	0.17	0.27	0.18	0.19	0.50	0.16	0.21	0.56	0.23
C3'	0.06	0.06	0.14	0.08	0.06	0.10	0.07	0.14	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.06	0.17	0.05	0.11	0.26	0.11	0.42	0.17	0.03
C4	0.09	0.12	0.14	0.08	0.11	0.12	0.12	0.18	0.14	0.10	0.13	0.12	0.11	0.12	0.10	0.17	0.09	0.16	0.64	0.17	0.18	0.66	0.26
C4'	0.12	0.15	0.21	0.14	0.16	0.09	0.18	0.08	0.18	0.19	0.16	0.15	0.15	0.20	0.16	0.23	0.10	0.09	0.37	0.20	0.57	0.07	0.12
C5	0.09	0.13	0.13	0.09	0.10	0.10	0.12	0.15	0.15	0.09	0.14	0.13	0.11	0.11	0.10	0.16	0.09	0.15	0.64	0.18	0.22	0.64	0.25
C5'	0.17	0.21	0.24	0.18	0.22	0.13	0.24	0.15	0.25	0.24	0.23	0.21	0.21	0.26	0.21	0.24	0.13	0.13	0.34	0.27	0.78	0.09	0.18
C6	0.08	0.13	0.11	0.07	0.09	0.08	0.11	0.14	0.15	0.08	0.15	0.14	0.10	0.09	0.08	0.13	0.07	0.13	0.66	0.18	0.19	0.67	0.26
C8	0.12	0.14	0.18	0.13	0.13	0.14	0.13	0.17	0.15	0.12	0.14	0.14	0.13	0.13	0.13	0.20	0.12	0.17	0.58	0.17	0.32	0.55	0.19
N1	0.07	0.12	0.08	0.04	0.08	0.07	0.10	0.15	0.14	0.06	0.14	0.13	0.09	0.07	0.06	0.11	0.05	0.13	0.66	0.18	0.17	0.70	0.29
N2	0.09	0.10	0.06	0.06	0.07	0.11	0.08	0.21	0.12	0.06	0.12	0.11	0.08	0.05	0.07	0.09	0.06	0.16	0.62	0.16	0.23	0.72	0.32
N3	0.08	0.11	0.10	0.06	0.09	0.12	0.11	0.20	0.13	0.08	0.12	0.11	0.09	0.11	0.08	0.14	0.07	0.17	0.64	0.17	0.17	0.70	0.30
N7	0.11	0.13	0.16	0.11	0.12	0.12	0.13	0.15	0.15	0.11	0.15	0.14	0.12	0.12	0.11	0.18	0.11	0.16	0.61	0.18	0.30	0.58	0.21
N9	0.12	0.13	0.17	0.12	0.13	0.14	0.13	0.18	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.12	0.20	0.12	0.18	0.61	0.17	0.23	0.60	0.23
O2'	0.30	0.25	0.38	0.34	0.26	0.29	0.22	0.28	0.20	0.25	0.22	0.26	0.27	0.21	0.28	0.41	0.33	0.28	0.58	0.19	0.13	0.84	0.43
O3'	0.26	0.31	0.21	0.13	0.32	0.24	0.38	0.33	0.39	0.38	0.36	0.28	0.29	0.41	0.31	0.23	0.11	0.31	0.04	0.42	0.06	0.05	0.00
O4'	0.15	0.17	0.23	0.15	0.19	0.13	0.22	0.14	0.22	0.23	0.20	0.17	0.17	0.24	0.19	0.25	0.13	0.13	0.55	0.24	0.37	0.34	0.13
O5'	0.13	0.14	0.21	0.16	0.16	0.10	0.18	0.16	0.18	0.19	0.15	0.15	0.15	0.20	0.16	0.21	0.12	0.09	0.26	0.20	0.88	0.25	0.27
O6	0.08	0.14	0.11	0.07	0.10	0.08	0.11	0.12	0.15	0.08	0.16	0.15	0.11	0.09	0.08	0.13	0.08	0.12	0.66	0.19	0.21	0.66	0.26
OP1	0.14	0.18	0.19	0.16	0.17	0.13	0.17	0.29	0.17	0.17	0.17	0.20	0.18	0.17	0.17	0.17	0.10	0.13	0.35	0.17	0.57	0.24	0.20
OP2	0.17	0.18	0.25	0.23	0.16	0.18	0.14	0.30	0.13	0.16	0.15	0.21	0.19	0.16	0.17	0.24	0.19	0.15	0.36	0.13	0.67	0.34	0.26
P	0.10	0.12	0.18	0.15	0.11	0.11	0.11	0.23	0.10	0.13	0.10	0.14	0.13	0.13	0.11	0.17	0.10	0.08	0.33	0.11	0.73	0.27	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.30	0.03	0.60	0.55	0.31
C2	0.05	0.00	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.08	0.41	0.02	0.58	0.67	0.37
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.04	0.79	0.65	0.42
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.03	0.78	0.47	0.29
C4	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.04	0.46	0.02	0.56	0.66	0.38
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.11	0.08	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.48	0.32	0.12
C5	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.54	0.02	0.50	0.71	0.39
C5'	0.07	0.08	0.10	0.03	0.09	0.01	0.14	0.00	0.13	0.18	0.10	0.08	0.07	0.19	0.11	0.10	0.03	0.03	0.01	0.16	0.34	0.21	0.01
C6	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.09	0.03	0.54	0.01	0.50	0.73	0.40
C8	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.06	0.57	0.02	0.48	0.69	0.39
N1	0.04	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.06	0.48	0.01	0.54	0.71	0.39
N2	0.06	0.00	0.05	0.07	0.01	0.11	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.15	0.11	0.38	0.02	0.61	0.66	0.37
N3	0.05	0.00	0.04	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.09	0.39	0.02	0.60	0.64	0.37
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.59	0.02	0.45	0.73	0.40
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.46	0.02	0.56	0.64	0.37
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.10	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.23	0.07	0.87	0.70	0.44
O3'	0.06	0.12	0.02	0.01	0.08	0.03	0.07	0.03	0.09	0.05	0.11	0.15	0.11	0.06	0.06	0.04	0.00	0.07	0.21	0.09	0.75	0.42	0.19
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.06	0.11	0.09	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.23	0.03	0.43	0.37	0.18
O5'	0.30	0.41	0.28	0.12	0.46	0.02	0.54	0.01	0.54	0.57	0.48	0.38	0.39	0.59	0.46	0.23	0.21	0.23	0.00	0.58	0.04	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.09	0.03	0.58	0.00	0.46	0.76	0.40
OP1	0.60	0.58	0.79	0.78	0.56	0.48	0.50	0.34	0.50	0.48	0.54	0.61	0.60	0.45	0.56	0.87	0.75	0.43	0.04	0.46	0.00	0.01	0.01
OP2	0.55	0.67	0.65	0.47	0.66	0.32	0.71	0.21	0.73	0.69	0.71	0.66	0.64	0.73	0.64	0.70	0.42	0.37	0.02	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.37	0.42	0.29	0.38	0.12	0.39	0.01	0.40	0.39	0.39	0.37	0.37	0.40	0.37	0.44	0.19	0.18	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00