Doublet Group distance statistics: 50897

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 2, 2, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.011, 0.032, 0.054, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.032 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.037 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.002, 0.025, 0.048, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.025 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.011, 0.036, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.014, 0.041, 0.069, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.041 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.021, 0.054, 0.087, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.054 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.065, 0.219, 0.372, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.219 std_dev=0.154
C2'	A	0, 0.070, 0.237, 0.403, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.237 std_dev=0.166
O2'	A	0, 0.138, 0.360, 0.582, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.360 std_dev=0.222
C4'	A	0, 0.055, 0.284, 0.514, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.284 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.100, 0.367, 0.633, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.367 std_dev=0.267
N7	B	0, 0.529, 0.898, 1.267, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.898 std_dev=0.369
C5'	A	0, 0.144, 0.542, 0.940, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.542 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.592, 0.996, 1.400, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.996 std_dev=0.404
O6	B	0, 0.420, 0.824, 1.229, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.824 std_dev=0.405
O5'	A	0, 0.269, 0.712, 1.155, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.712 std_dev=0.443
C6	B	0, 0.501, 0.946, 1.391, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.946 std_dev=0.445
O3'	A	0, 0.115, 0.581, 1.047, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.581 std_dev=0.466
C8	B	0, 0.511, 1.037, 1.563, 1.962 max_d=1.962 avg_d=1.037 std_dev=0.526
C4	B	0, 0.682, 1.214, 1.746, 1.654 max_d=1.654 avg_d=1.214 std_dev=0.532
P	A	0, 0.420, 0.965, 1.511, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.965 std_dev=0.545
OP2	A	0, 0.546, 1.127, 1.707, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.127 std_dev=0.581
N9	B	0, 0.647, 1.246, 1.844, 2.202 max_d=2.202 avg_d=1.246 std_dev=0.599
N1	B	0, 0.541, 1.144, 1.747, 1.889 max_d=1.889 avg_d=1.144 std_dev=0.603
N3	B	0, 0.757, 1.393, 2.030, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.393 std_dev=0.636
C2	B	0, 0.666, 1.343, 2.020, 2.056 max_d=2.056 avg_d=1.343 std_dev=0.677
C5'	B	0, 0.801, 1.535, 2.268, 2.860 max_d=2.860 avg_d=1.535 std_dev=0.734
C1'	B	0, 0.725, 1.480, 2.236, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.480 std_dev=0.755
O4'	B	0, 0.436, 1.221, 2.006, 2.828 max_d=2.828 avg_d=1.221 std_dev=0.785
N2	B	0, 0.697, 1.528, 2.359, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.528 std_dev=0.831
C3'	B	0, 0.988, 1.834, 2.679, 3.302 max_d=3.302 avg_d=1.834 std_dev=0.846
C2'	B	0, 1.051, 1.901, 2.750, 3.306 max_d=3.306 avg_d=1.901 std_dev=0.849
OP1	A	0, 0.291, 1.151, 2.012, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.151 std_dev=0.861
C4'	B	0, 0.596, 1.476, 2.356, 3.130 max_d=3.130 avg_d=1.476 std_dev=0.880
O5'	B	0, 0.535, 1.495, 2.455, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.495 std_dev=0.960
O2'	B	0, 1.302, 2.303, 3.303, 3.882 max_d=3.882 avg_d=2.303 std_dev=1.001
O3'	B	0, 1.316, 2.340, 3.365, 3.977 max_d=3.977 avg_d=2.340 std_dev=1.024
OP2	B	0, 0.633, 1.705, 2.776, 3.862 max_d=3.862 avg_d=1.705 std_dev=1.072
P	B	0, 0.578, 1.677, 2.777, 3.788 max_d=3.788 avg_d=1.677 std_dev=1.100
OP1	B	0, 0.662, 2.184, 3.707, 5.928 max_d=5.928 avg_d=2.184 std_dev=1.523

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.03	0.13	0.33	0.13
C2	0.05	0.00	0.16	0.13	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.19	0.08	0.18	0.01	0.16	0.49	0.22
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.12	0.19	0.16	0.07	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.13	0.38	0.15
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.18	0.11	0.16	0.12	0.16	0.08	0.01	0.01	0.01	0.17	0.11	0.23	0.39	0.23
C4	0.03	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.04	0.18	0.01	0.16	0.48	0.21
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.08	0.03	0.06	0.04	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.15	0.21	0.06
C5	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.03	0.19	0.01	0.23	0.52	0.26
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.13	0.09	0.06	0.06	0.14	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.13	0.20	0.15	0.01
C6	0.03	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.04	0.19	0.00	0.25	0.53	0.27
C8	0.02	0.01	0.09	0.18	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.23	0.06	0.19	0.01	0.20	0.48	0.23
N1	0.04	0.00	0.12	0.11	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.06	0.19	0.01	0.21	0.52	0.25
N2	0.06	0.00	0.19	0.16	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.23	0.25	0.10	0.18	0.01	0.15	0.49	0.21
N3	0.05	0.00	0.16	0.12	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.18	0.08	0.17	0.00	0.14	0.47	0.20
N7	0.02	0.00	0.07	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.23	0.05	0.20	0.01	0.27	0.53	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.17	0.01	0.14	0.43	0.19
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.05	0.06	0.05	0.10	0.06	0.15	0.23	0.18	0.05	0.02	0.00	0.12	0.06	0.08	0.09	0.15	0.34	0.13
O3'	0.03	0.19	0.05	0.01	0.11	0.02	0.15	0.05	0.15	0.23	0.16	0.25	0.18	0.23	0.08	0.12	0.00	0.02	0.34	0.18	0.41	0.51	0.37
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.10	0.08	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.18	0.03	0.26	0.23	0.16
O5'	0.12	0.18	0.07	0.17	0.18	0.02	0.19	0.01	0.19	0.19	0.19	0.18	0.17	0.20	0.17	0.08	0.34	0.18	0.00	0.19	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.03	0.19	0.00	0.30	0.53	0.29
OP1	0.13	0.16	0.13	0.23	0.16	0.15	0.23	0.20	0.25	0.20	0.21	0.15	0.14	0.27	0.14	0.15	0.41	0.26	0.02	0.30	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.49	0.38	0.39	0.48	0.21	0.52	0.15	0.53	0.48	0.52	0.49	0.47	0.53	0.43	0.34	0.51	0.23	0.02	0.53	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.22	0.15	0.23	0.21	0.06	0.26	0.01	0.27	0.23	0.25	0.21	0.20	0.27	0.19	0.13	0.37	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.29	0.37	0.50	0.28	0.48	0.29	0.60	0.32	0.32	0.32	0.29	0.28	0.30	0.31	0.34	0.54	0.39	0.82	0.37	1.52	1.17	1.13
C2	0.22	0.17	0.21	0.22	0.16	0.24	0.16	0.32	0.16	0.25	0.19	0.20	0.16	0.22	0.21	0.22	0.22	0.27	0.70	0.20	1.44	0.93	0.97
C2'	0.28	0.24	0.29	0.39	0.22	0.38	0.23	0.49	0.26	0.24	0.26	0.25	0.23	0.21	0.24	0.29	0.44	0.34	0.64	0.31	1.38	1.11	1.00
C3'	0.26	0.24	0.28	0.36	0.22	0.35	0.22	0.44	0.26	0.21	0.26	0.24	0.22	0.21	0.23	0.28	0.42	0.32	0.54	0.31	1.24	1.07	0.88
C4	0.23	0.20	0.25	0.32	0.17	0.32	0.18	0.41	0.22	0.24	0.23	0.21	0.17	0.20	0.21	0.23	0.34	0.29	0.72	0.28	1.43	0.99	1.00
C4'	0.34	0.31	0.39	0.52	0.30	0.51	0.31	0.63	0.34	0.32	0.33	0.31	0.30	0.30	0.32	0.37	0.57	0.41	0.72	0.38	1.43	1.18	1.04
C5	0.23	0.18	0.24	0.30	0.16	0.30	0.16	0.40	0.19	0.23	0.21	0.21	0.16	0.19	0.20	0.23	0.32	0.29	0.68	0.24	1.37	0.95	0.95
C5'	0.36	0.34	0.40	0.51	0.33	0.51	0.33	0.62	0.37	0.34	0.37	0.35	0.33	0.33	0.34	0.39	0.56	0.42	0.67	0.41	1.37	1.13	0.97
C6	0.22	0.19	0.22	0.25	0.16	0.27	0.16	0.35	0.18	0.24	0.21	0.22	0.16	0.20	0.20	0.22	0.26	0.28	0.66	0.20	1.35	0.90	0.91
C8	0.27	0.22	0.31	0.42	0.21	0.41	0.21	0.52	0.25	0.27	0.25	0.23	0.20	0.23	0.25	0.28	0.45	0.34	0.72	0.30	1.38	1.03	1.00
N1	0.23	0.19	0.22	0.22	0.18	0.25	0.17	0.33	0.17	0.25	0.21	0.22	0.17	0.22	0.22	0.22	0.22	0.28	0.67	0.19	1.38	0.91	0.93
N2	0.25	0.18	0.23	0.21	0.20	0.25	0.19	0.32	0.16	0.29	0.19	0.20	0.18	0.27	0.24	0.24	0.21	0.30	0.70	0.16	1.43	0.92	0.97
N3	0.22	0.19	0.23	0.27	0.16	0.27	0.16	0.35	0.21	0.23	0.22	0.21	0.16	0.19	0.20	0.22	0.28	0.27	0.73	0.27	1.48	0.98	1.02
N7	0.24	0.19	0.27	0.35	0.17	0.36	0.18	0.46	0.21	0.24	0.23	0.21	0.17	0.20	0.22	0.25	0.38	0.31	0.68	0.26	1.34	0.97	0.95
N9	0.27	0.23	0.31	0.41	0.22	0.40	0.23	0.50	0.26	0.27	0.27	0.24	0.21	0.24	0.25	0.28	0.44	0.34	0.76	0.32	1.44	1.07	1.05
O2'	0.27	0.23	0.30	0.44	0.20	0.42	0.21	0.56	0.26	0.20	0.26	0.24	0.21	0.19	0.22	0.29	0.51	0.34	0.76	0.31	1.51	1.29	1.17
O3'	0.31	0.29	0.31	0.36	0.28	0.33	0.29	0.38	0.31	0.27	0.31	0.30	0.28	0.28	0.28	0.31	0.42	0.35	0.47	0.35	1.13	1.10	0.80
O4'	0.43	0.39	0.47	0.59	0.39	0.58	0.39	0.70	0.41	0.42	0.41	0.39	0.38	0.40	0.41	0.44	0.62	0.49	0.84	0.44	1.52	1.20	1.13
O5'	0.35	0.34	0.38	0.50	0.31	0.50	0.32	0.63	0.37	0.32	0.38	0.36	0.32	0.31	0.32	0.37	0.55	0.41	0.70	0.42	1.40	1.14	1.01
O6	0.22	0.21	0.22	0.24	0.17	0.27	0.17	0.36	0.18	0.24	0.22	0.24	0.17	0.21	0.21	0.22	0.25	0.28	0.64	0.20	1.30	0.88	0.88
OP1	0.37	0.43	0.42	0.55	0.37	0.53	0.38	0.67	0.43	0.36	0.46	0.45	0.38	0.36	0.36	0.39	0.62	0.42	0.66	0.48	1.39	1.18	1.01
OP2	0.54	0.49	0.56	0.66	0.51	0.66	0.50	0.76	0.49	0.53	0.49	0.49	0.50	0.51	0.53	0.55	0.70	0.58	0.75	0.49	1.28	1.02	0.95
P	0.38	0.38	0.41	0.53	0.36	0.53	0.36	0.65	0.40	0.37	0.41	0.40	0.36	0.35	0.36	0.39	0.57	0.44	0.70	0.44	1.38	1.10	0.99

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.29	0.02	0.49	0.40	0.32
C2	0.04	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.51	0.01	0.86	0.65	0.62
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.06	0.38	0.33	0.21
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.10	0.10	0.11	0.14	0.11	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.24	0.10	0.35	0.33	0.18
C4	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.52	0.01	0.85	0.62	0.61
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.09	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.24	0.22	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.61	0.01	1.03	0.72	0.74
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.19	0.18	0.14	0.13	0.21	0.12	0.03	0.03	0.01	0.01	0.23	0.30	0.32	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.63	0.00	1.08	0.77	0.78
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.02	0.61	0.01	0.95	0.64	0.66
N1	0.03	0.00	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.58	0.01	0.99	0.73	0.72
N2	0.04	0.00	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.03	0.47	0.01	0.81	0.62	0.58
N3	0.04	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.46	0.01	0.77	0.58	0.54
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.66	0.01	1.11	0.73	0.78
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.49	0.01	0.76	0.55	0.53
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.02	0.08	0.10	0.07	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.07	0.32	0.21	0.09
O3'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.07	0.02	0.09	0.03	0.10	0.10	0.12	0.17	0.12	0.11	0.04	0.03	0.00	0.01	0.30	0.11	0.50	0.33	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.26	0.02	0.39	0.40	0.27
O5'	0.29	0.51	0.21	0.24	0.52	0.01	0.61	0.01	0.63	0.61	0.58	0.47	0.46	0.66	0.49	0.07	0.30	0.26	0.00	0.66	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.66	0.00	1.17	0.83	0.85
OP1	0.49	0.86	0.38	0.35	0.85	0.24	1.03	0.30	1.08	0.95	0.99	0.81	0.77	1.11	0.76	0.32	0.50	0.39	0.01	1.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.65	0.33	0.33	0.62	0.22	0.72	0.32	0.77	0.64	0.73	0.62	0.58	0.73	0.55	0.21	0.33	0.40	0.02	0.83	0.01	0.00	0.01
P	0.32	0.62	0.21	0.18	0.61	0.06	0.74	0.02	0.78	0.66	0.72	0.58	0.54	0.78	0.53	0.09	0.25	0.27	0.00	0.85	0.00	0.01	0.00