Doublet Group distance statistics: 50899

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.006, 0.024, 0.043, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.072, 0.159, 0.246, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.159 std_dev=0.087
O2'	A	0, 0.147, 0.286, 0.425, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.286 std_dev=0.139
O4'	A	0, 0.002, 0.190, 0.378, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.190 std_dev=0.188
C2	B	0, 0.220, 0.415, 0.611, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.415 std_dev=0.195
N2	B	0, 0.212, 0.430, 0.649, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.430 std_dev=0.218
C5	B	0, 0.273, 0.502, 0.732, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.502 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.193, 0.431, 0.669, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.431 std_dev=0.238
N3	B	0, 0.172, 0.422, 0.672, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.422 std_dev=0.250
N7	B	0, 0.301, 0.559, 0.816, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.559 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.222, 0.491, 0.761, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.491 std_dev=0.270
C8	B	0, 0.208, 0.511, 0.814, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.511 std_dev=0.303
O2'	B	0, 0.357, 0.673, 0.988, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.673 std_dev=0.316
N9	B	0, 0.147, 0.463, 0.780, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.463 std_dev=0.316
C2'	B	0, 0.314, 0.631, 0.949, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.631 std_dev=0.317
C6	B	0, 0.223, 0.555, 0.887, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.555 std_dev=0.332
C1'	B	0, 0.226, 0.576, 0.927, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.576 std_dev=0.351
C3'	A	0, 0.027, 0.393, 0.760, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.393 std_dev=0.367
C4'	A	0, -0.023, 0.386, 0.795, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.386 std_dev=0.409
O6	B	0, 0.205, 0.696, 1.187, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.696 std_dev=0.491
C3'	B	0, 0.392, 0.890, 1.388, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.890 std_dev=0.498
O4'	B	0, 0.310, 0.812, 1.313, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.812 std_dev=0.501
O3'	B	0, 0.483, 1.008, 1.533, 1.476 max_d=1.476 avg_d=1.008 std_dev=0.525
P	B	0, 0.357, 0.904, 1.451, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.904 std_dev=0.547
O3'	A	0, 0.083, 0.633, 1.183, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.633 std_dev=0.550
OP2	B	0, 0.503, 1.071, 1.640, 1.500 max_d=1.500 avg_d=1.071 std_dev=0.568
C4'	B	0, 0.340, 0.946, 1.553, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.946 std_dev=0.607
OP1	B	0, 0.410, 1.017, 1.623, 1.777 max_d=1.777 avg_d=1.017 std_dev=0.607
C5'	A	0, 0.020, 0.630, 1.240, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.630 std_dev=0.610
O5'	A	0, 0.081, 0.757, 1.433, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.757 std_dev=0.676
C5'	B	0, 0.451, 1.237, 2.024, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.237 std_dev=0.787
O5'	B	0, 0.471, 1.288, 2.106, 2.101 max_d=2.101 avg_d=1.288 std_dev=0.818
P	A	0, 0.378, 1.237, 2.097, 2.331 max_d=2.331 avg_d=1.237 std_dev=0.860
OP1	A	0, 0.595, 1.457, 2.318, 2.409 max_d=2.409 avg_d=1.457 std_dev=0.862
OP2	A	0, 0.406, 1.367, 2.328, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.367 std_dev=0.961

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.08
C2	0.04	0.00	0.08	0.23	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.25	0.08	0.27	0.00	0.30	0.37	0.29
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.10	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.12	0.06	0.03
C3'	0.02	0.23	0.00	0.00	0.20	0.00	0.21	0.01	0.24	0.12	0.24	0.23	0.20	0.17	0.13	0.01	0.00	0.00	0.09	0.25	0.18	0.17	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.20	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.20	0.03	0.25	0.00	0.26	0.26	0.25
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.14	0.16	0.10	0.04	0.04	0.18	0.09	0.09	0.02	0.00	0.00	0.18	0.07	0.01	0.02
C5	0.02	0.00	0.03	0.21	0.00	0.14	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.23	0.01	0.33	0.01	0.36	0.37	0.36
C5'	0.03	0.15	0.01	0.01	0.18	0.01	0.27	0.00	0.29	0.28	0.23	0.11	0.11	0.33	0.16	0.08	0.02	0.01	0.01	0.34	0.03	0.00	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.24	0.00	0.14	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01	0.38	0.00	0.42	0.47	0.43
C8	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.06	0.25	0.02	0.25	0.17	0.24
N1	0.03	0.00	0.06	0.24	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.28	0.05	0.34	0.01	0.38	0.45	0.38
N2	0.04	0.00	0.10	0.23	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.26	0.10	0.25	0.01	0.28	0.37	0.27
N3	0.04	0.00	0.09	0.20	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.21	0.08	0.21	0.00	0.22	0.27	0.22
N7	0.01	0.00	0.04	0.17	0.00	0.18	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.19	0.04	0.35	0.02	0.37	0.32	0.38
N9	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.17	0.00	0.17	0.14	0.16
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.11	0.09	0.11	0.08	0.14	0.04	0.17	0.18	0.14	0.07	0.05	0.00	0.03	0.12	0.08	0.13	0.17	0.09	0.08
O3'	0.01	0.25	0.01	0.00	0.20	0.02	0.23	0.02	0.28	0.13	0.28	0.26	0.21	0.19	0.12	0.03	0.00	0.01	0.15	0.30	0.31	0.32	0.23
O4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.10	0.08	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.11	0.01	0.08	0.20	0.18
O5'	0.03	0.27	0.04	0.09	0.25	0.00	0.33	0.01	0.38	0.25	0.34	0.25	0.21	0.35	0.17	0.08	0.15	0.11	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.04	0.25	0.00	0.18	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.30	0.01	0.42	0.00	0.50	0.55	0.51
OP1	0.04	0.30	0.12	0.18	0.26	0.07	0.36	0.03	0.42	0.25	0.38	0.28	0.22	0.37	0.17	0.17	0.31	0.08	0.01	0.50	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.37	0.06	0.17	0.26	0.01	0.37	0.00	0.47	0.17	0.45	0.37	0.27	0.32	0.14	0.09	0.32	0.20	0.01	0.55	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.29	0.03	0.12	0.25	0.02	0.36	0.01	0.43	0.24	0.38	0.27	0.22	0.38	0.16	0.08	0.23	0.18	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.20	0.36	0.46	0.24	0.42	0.21	0.50	0.17	0.27	0.17	0.19	0.23	0.23	0.27	0.34	0.51	0.30	0.58	0.12	0.51	0.29	0.38
C2	0.29	0.29	0.37	0.46	0.30	0.37	0.29	0.41	0.27	0.27	0.27	0.28	0.30	0.27	0.29	0.33	0.49	0.26	0.47	0.22	0.61	0.43	0.51
C2'	0.37	0.32	0.47	0.58	0.33	0.51	0.28	0.58	0.24	0.30	0.27	0.33	0.34	0.26	0.34	0.46	0.64	0.37	0.64	0.19	0.69	0.33	0.46
C3'	0.28	0.34	0.41	0.51	0.32	0.39	0.30	0.46	0.31	0.27	0.33	0.35	0.33	0.27	0.29	0.37	0.59	0.25	0.54	0.30	0.59	0.27	0.38
C4	0.32	0.28	0.39	0.49	0.31	0.42	0.30	0.48	0.26	0.33	0.26	0.27	0.30	0.32	0.32	0.36	0.53	0.31	0.56	0.22	0.63	0.36	0.47
C4'	0.12	0.11	0.22	0.34	0.12	0.24	0.12	0.35	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.18	0.41	0.11	0.46	0.12	0.39	0.23	0.27
C5	0.32	0.30	0.39	0.48	0.32	0.41	0.32	0.47	0.30	0.33	0.29	0.29	0.31	0.33	0.33	0.35	0.52	0.31	0.54	0.28	0.65	0.34	0.47
C5'	0.11	0.15	0.20	0.33	0.15	0.21	0.18	0.30	0.19	0.16	0.17	0.14	0.14	0.19	0.14	0.16	0.40	0.09	0.44	0.22	0.36	0.21	0.26
C6	0.31	0.31	0.37	0.46	0.32	0.39	0.32	0.44	0.31	0.31	0.30	0.30	0.31	0.32	0.31	0.33	0.50	0.29	0.49	0.30	0.67	0.37	0.49
C8	0.33	0.28	0.39	0.49	0.31	0.43	0.30	0.50	0.27	0.34	0.26	0.27	0.30	0.33	0.33	0.36	0.53	0.33	0.57	0.25	0.60	0.28	0.41
N1	0.28	0.30	0.36	0.45	0.30	0.36	0.30	0.41	0.30	0.27	0.30	0.30	0.31	0.28	0.29	0.32	0.48	0.26	0.46	0.28	0.64	0.41	0.50
N2	0.25	0.28	0.34	0.43	0.27	0.33	0.25	0.36	0.24	0.20	0.25	0.28	0.29	0.19	0.24	0.31	0.47	0.21	0.40	0.17	0.57	0.47	0.50
N3	0.31	0.27	0.39	0.49	0.30	0.41	0.28	0.46	0.24	0.30	0.25	0.27	0.30	0.29	0.31	0.35	0.53	0.29	0.53	0.19	0.61	0.41	0.50
N7	0.33	0.30	0.39	0.48	0.32	0.42	0.32	0.49	0.30	0.34	0.29	0.28	0.31	0.34	0.33	0.36	0.52	0.33	0.55	0.28	0.64	0.29	0.44
N9	0.33	0.26	0.39	0.49	0.30	0.43	0.28	0.51	0.24	0.33	0.23	0.25	0.28	0.30	0.32	0.36	0.53	0.33	0.58	0.20	0.60	0.31	0.43
O2'	0.17	0.06	0.25	0.37	0.08	0.34	0.04	0.44	0.06	0.06	0.04	0.08	0.10	0.06	0.10	0.27	0.44	0.19	0.45	0.11	0.47	0.16	0.21
O3'	0.21	0.31	0.36	0.46	0.26	0.33	0.24	0.37	0.27	0.17	0.30	0.34	0.29	0.19	0.22	0.33	0.55	0.18	0.43	0.27	0.53	0.19	0.29
O4'	0.21	0.10	0.28	0.40	0.15	0.35	0.13	0.46	0.09	0.21	0.08	0.09	0.13	0.17	0.19	0.26	0.45	0.23	0.56	0.07	0.44	0.29	0.34
O5'	0.25	0.33	0.37	0.49	0.32	0.35	0.34	0.43	0.37	0.30	0.36	0.33	0.31	0.34	0.29	0.31	0.57	0.21	0.56	0.39	0.56	0.32	0.41
O6	0.30	0.31	0.36	0.45	0.32	0.38	0.32	0.43	0.32	0.30	0.31	0.30	0.31	0.31	0.31	0.32	0.48	0.28	0.48	0.32	0.68	0.37	0.49
OP1	0.20	0.32	0.34	0.49	0.29	0.32	0.33	0.42	0.37	0.27	0.36	0.32	0.29	0.32	0.25	0.27	0.59	0.15	0.56	0.41	0.59	0.37	0.44
OP2	0.35	0.49	0.49	0.62	0.45	0.44	0.48	0.52	0.52	0.40	0.52	0.50	0.45	0.45	0.40	0.42	0.72	0.29	0.66	0.55	0.74	0.49	0.58
P	0.24	0.34	0.34	0.47	0.32	0.31	0.35	0.40	0.38	0.30	0.37	0.34	0.31	0.35	0.28	0.29	0.55	0.20	0.55	0.42	0.56	0.35	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.36	0.13
C2	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.10	0.01	0.23	0.47	0.31
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.49	0.23
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.08	0.12	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.09	0.53	0.27
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.17	0.38	0.24
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.35	0.10
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.20	0.30	0.22
C5'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.18	0.18	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.25	0.32	0.26
C8	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.18	0.09
N1	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.26	0.41	0.30
N2	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.15	0.01	0.11	0.01	0.24	0.53	0.34
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.09	0.01	0.18	0.47	0.29
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.16	0.17	0.13
N9	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.13	0.32	0.16
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.52	0.21
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.09	0.15	0.10	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.08	0.07	0.15	0.62	0.31
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.25	0.26	0.06
O5'	0.03	0.10	0.03	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.06	0.09	0.11	0.09	0.07	0.05	0.02	0.08	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.08	0.00	0.28	0.27	0.24
OP1	0.14	0.23	0.06	0.09	0.17	0.14	0.20	0.18	0.25	0.13	0.26	0.24	0.18	0.16	0.13	0.06	0.15	0.25	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.47	0.49	0.53	0.38	0.35	0.30	0.18	0.32	0.18	0.41	0.53	0.47	0.17	0.32	0.52	0.62	0.26	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.31	0.23	0.27	0.24	0.10	0.22	0.01	0.26	0.09	0.30	0.34	0.29	0.13	0.16	0.21	0.31	0.06	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00