Doublet Group distance statistics: 50900

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.007, 0.033, 0.059, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.004, 0.031, 0.059, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.031 std_dev=0.027
O5'	B	0, 0.085, 0.176, 0.267, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.176 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.051, 0.189, 0.327, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.189 std_dev=0.138
C2'	A	0, 0.042, 0.190, 0.338, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.190 std_dev=0.148
O5'	A	0, 0.097, 0.264, 0.430, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.264 std_dev=0.166
C8	B	0, 0.105, 0.272, 0.439, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.272 std_dev=0.167
N7	B	0, 0.102, 0.269, 0.436, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.269 std_dev=0.167
C5	B	0, 0.092, 0.287, 0.481, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.287 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.073, 0.273, 0.473, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.273 std_dev=0.200
O6	B	0, 0.099, 0.306, 0.513, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.306 std_dev=0.207
C6	B	0, 0.087, 0.298, 0.509, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.298 std_dev=0.211
O2'	A	0, 0.070, 0.283, 0.495, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.283 std_dev=0.212
N9	B	0, 0.079, 0.294, 0.510, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.294 std_dev=0.215
P	B	0, 0.121, 0.344, 0.566, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.344 std_dev=0.223
P	A	0, 0.161, 0.395, 0.628, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.395 std_dev=0.233
C3'	A	0, 0.056, 0.290, 0.523, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.290 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.058, 0.303, 0.548, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.303 std_dev=0.245
OP2	A	0, 0.192, 0.452, 0.711, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.452 std_dev=0.260
C1'	B	0, 0.075, 0.340, 0.605, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.340 std_dev=0.265
N1	B	0, 0.048, 0.321, 0.593, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.321 std_dev=0.272
OP1	A	0, 0.160, 0.444, 0.727, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.444 std_dev=0.284
C5'	A	0, 0.129, 0.425, 0.720, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.425 std_dev=0.296
O4'	B	0, 0.202, 0.506, 0.811, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.506 std_dev=0.305
N3	B	0, 0.021, 0.351, 0.680, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.351 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.086, 0.418, 0.750, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.418 std_dev=0.332
C2	B	0, 0.025, 0.364, 0.703, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.364 std_dev=0.339
C2'	B	0, -0.014, 0.346, 0.706, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.346 std_dev=0.360
C4'	B	0, 0.236, 0.608, 0.981, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.608 std_dev=0.372
C3'	B	0, 0.154, 0.528, 0.902, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.528 std_dev=0.374
OP2	B	0, 0.096, 0.478, 0.860, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.478 std_dev=0.382
OP1	B	0, 0.140, 0.538, 0.935, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.538 std_dev=0.397
C5'	B	0, 0.332, 0.749, 1.166, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.749 std_dev=0.417
N2	B	0, -0.003, 0.424, 0.852, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.424 std_dev=0.428
O2'	B	0, -0.073, 0.379, 0.831, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.379 std_dev=0.452
O3'	B	0, 0.177, 0.642, 1.107, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.642 std_dev=0.465

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.06
C2	0.03	0.00	0.08	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.07	0.06	0.10	0.02	0.13	0.23	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.09	0.08	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.04	0.15	0.13	0.10
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.09	0.03	0.05	0.04	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.12	0.05	0.17	0.13	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.02	0.04	0.10	0.01	0.13	0.21	0.17
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.03	0.06	0.04	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.14	0.01	0.20	0.29	0.25
C5'	0.02	0.07	0.03	0.04	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.14	0.10	0.08	0.06	0.16	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.15	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.05	0.15	0.01	0.22	0.32	0.27
C8	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.06	0.14	0.00	0.18	0.23	0.22
N1	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.05	0.06	0.13	0.01	0.18	0.29	0.23
N2	0.05	0.01	0.09	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.10	0.09	0.09	0.02	0.11	0.21	0.15
N3	0.03	0.01	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.06	0.08	0.02	0.10	0.18	0.14
N7	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.06	0.18	0.01	0.23	0.31	0.28
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.11	0.16	0.14
O2'	0.02	0.16	0.01	0.04	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.03	0.14	0.18	0.14	0.03	0.01	0.00	0.07	0.04	0.11	0.09	0.19	0.13	0.12
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.05	0.11	0.05	0.10	0.07	0.10	0.04	0.07	0.00	0.01	0.12	0.06	0.22	0.16	0.14
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.09	0.06	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.06	0.05	0.08	0.06
O5'	0.04	0.10	0.10	0.12	0.10	0.02	0.14	0.00	0.15	0.14	0.13	0.09	0.08	0.18	0.09	0.11	0.12	0.04	0.00	0.18	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.06	0.06	0.18	0.00	0.26	0.37	0.31
OP1	0.05	0.13	0.15	0.17	0.13	0.05	0.20	0.05	0.22	0.18	0.18	0.11	0.10	0.23	0.11	0.19	0.22	0.05	0.02	0.26	0.00	0.03	0.01
OP2	0.09	0.23	0.13	0.13	0.21	0.03	0.29	0.01	0.32	0.23	0.29	0.21	0.18	0.31	0.16	0.13	0.16	0.08	0.01	0.37	0.03	0.00	0.00
P	0.06	0.18	0.10	0.12	0.17	0.02	0.25	0.01	0.27	0.22	0.23	0.15	0.14	0.28	0.14	0.12	0.14	0.06	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.06	0.05	0.06	0.05	0.14	0.06	0.16	0.08	0.05	0.08	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.09	0.13	0.06	0.11	0.33	0.34	0.20
C2	0.04	0.11	0.09	0.07	0.08	0.07	0.09	0.10	0.12	0.06	0.12	0.12	0.09	0.08	0.06	0.08	0.07	0.06	0.10	0.14	0.34	0.19	0.18
C2'	0.11	0.12	0.12	0.14	0.11	0.16	0.10	0.17	0.11	0.10	0.12	0.12	0.11	0.10	0.10	0.12	0.16	0.14	0.11	0.11	0.25	0.34	0.15
C3'	0.12	0.11	0.14	0.16	0.11	0.17	0.10	0.19	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.14	0.19	0.14	0.15	0.10	0.18	0.42	0.21
C4	0.04	0.06	0.03	0.04	0.04	0.11	0.05	0.13	0.08	0.03	0.09	0.07	0.04	0.05	0.02	0.03	0.06	0.10	0.09	0.12	0.34	0.24	0.17
C4'	0.10	0.10	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.12	0.11	0.12	0.10	0.10	0.12	0.11	0.10	0.14	0.10	0.10	0.14	0.23	0.48	0.28
C5	0.02	0.10	0.05	0.04	0.06	0.10	0.08	0.12	0.11	0.03	0.12	0.11	0.07	0.06	0.03	0.04	0.05	0.08	0.08	0.15	0.33	0.22	0.15
C5'	0.11	0.10	0.11	0.13	0.10	0.14	0.10	0.16	0.11	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.10	0.11	0.16	0.12	0.13	0.14	0.22	0.52	0.31
C6	0.05	0.15	0.10	0.08	0.10	0.07	0.11	0.10	0.15	0.06	0.16	0.16	0.12	0.09	0.07	0.09	0.08	0.06	0.09	0.17	0.32	0.20	0.16
C8	0.06	0.06	0.03	0.05	0.04	0.14	0.06	0.16	0.09	0.04	0.09	0.07	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.13	0.08	0.12	0.31	0.28	0.15
N1	0.06	0.15	0.11	0.08	0.11	0.06	0.11	0.10	0.15	0.07	0.16	0.16	0.12	0.09	0.08	0.11	0.09	0.05	0.10	0.17	0.34	0.18	0.17
N2	0.08	0.12	0.12	0.09	0.11	0.05	0.11	0.08	0.13	0.09	0.13	0.13	0.12	0.10	0.09	0.12	0.09	0.05	0.11	0.14	0.36	0.17	0.20
N3	0.03	0.06	0.05	0.05	0.04	0.10	0.05	0.12	0.08	0.04	0.08	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.06	0.08	0.10	0.10	0.35	0.22	0.19
N7	0.04	0.09	0.04	0.04	0.05	0.12	0.07	0.15	0.10	0.03	0.11	0.10	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.11	0.08	0.14	0.31	0.23	0.14
N9	0.07	0.05	0.03	0.05	0.03	0.14	0.05	0.16	0.07	0.04	0.07	0.05	0.03	0.04	0.04	0.06	0.08	0.13	0.08	0.11	0.33	0.29	0.17
O2'	0.18	0.20	0.19	0.20	0.19	0.20	0.18	0.20	0.19	0.17	0.20	0.20	0.19	0.17	0.18	0.19	0.22	0.17	0.15	0.18	0.25	0.38	0.18
O3'	0.19	0.19	0.22	0.25	0.19	0.22	0.17	0.23	0.16	0.18	0.18	0.19	0.19	0.16	0.19	0.20	0.27	0.19	0.23	0.14	0.20	0.51	0.29
O4'	0.09	0.10	0.07	0.06	0.09	0.12	0.10	0.13	0.12	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.08	0.11	0.04	0.15	0.32	0.42	0.26
O5'	0.09	0.10	0.09	0.09	0.10	0.12	0.10	0.12	0.12	0.10	0.12	0.10	0.10	0.10	0.09	0.09	0.11	0.10	0.06	0.14	0.19	0.46	0.24
O6	0.06	0.17	0.12	0.09	0.12	0.06	0.12	0.10	0.17	0.07	0.19	0.19	0.14	0.09	0.08	0.12	0.09	0.06	0.09	0.19	0.33	0.19	0.16
OP1	0.07	0.08	0.08	0.11	0.08	0.08	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.08	0.07	0.09	0.07	0.06	0.12	0.06	0.15	0.12	0.28	0.64	0.37
OP2	0.15	0.15	0.12	0.11	0.14	0.16	0.13	0.14	0.14	0.12	0.14	0.15	0.14	0.12	0.14	0.15	0.13	0.16	0.05	0.14	0.17	0.43	0.19
P	0.11	0.10	0.09	0.09	0.09	0.13	0.08	0.13	0.10	0.09	0.10	0.11	0.10	0.08	0.09	0.11	0.12	0.13	0.07	0.11	0.21	0.49	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.10	0.01	0.25	0.06	0.14
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.08	0.02	0.27	0.13	0.12
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.08	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.13	0.15	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.08	0.21	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.10	0.01	0.29	0.09	0.15
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.05	0.03	0.10	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.10	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.04	0.10	0.01	0.32	0.10	0.16
C5'	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.10	0.05	0.07	0.05	0.11	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.12	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.09	0.00	0.31	0.12	0.15
C8	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.07	0.14	0.01	0.35	0.13	0.22
N1	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.07	0.01	0.29	0.13	0.13
N2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.02	0.08	0.03	0.26	0.14	0.11
N3	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.09	0.02	0.27	0.11	0.13
N7	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.13	0.01	0.35	0.11	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.30	0.08	0.17
O2'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.09	0.13	0.09	0.02	0.01	0.00	0.07	0.03	0.04	0.04	0.12	0.17	0.03
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.07	0.07	0.14	0.10	0.07	0.02	0.07	0.00	0.02	0.10	0.06	0.18	0.36	0.19
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.07	0.02	0.02	0.01	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.12	0.04	0.25	0.11	0.17
O5'	0.10	0.08	0.05	0.05	0.10	0.02	0.10	0.01	0.09	0.14	0.07	0.08	0.09	0.13	0.12	0.04	0.10	0.12	0.00	0.10	0.03	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.10	0.00	0.33	0.13	0.16
OP1	0.25	0.27	0.13	0.08	0.29	0.10	0.32	0.12	0.31	0.35	0.29	0.26	0.27	0.35	0.30	0.12	0.18	0.25	0.03	0.33	0.00	0.04	0.01
OP2	0.06	0.13	0.15	0.21	0.09	0.09	0.10	0.07	0.12	0.13	0.13	0.14	0.11	0.11	0.08	0.17	0.36	0.11	0.02	0.13	0.04	0.00	0.01
P	0.14	0.12	0.05	0.07	0.15	0.03	0.16	0.01	0.15	0.22	0.13	0.11	0.13	0.20	0.17	0.03	0.19	0.17	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00