Doublet Group distance statistics: 50909

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.011, 0.031, 0.050, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.014, 0.039, 0.065, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.012, 0.043, 0.074, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.043 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.012, 0.043, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.043 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.021, 0.053, 0.085, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.053 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.008, 0.041, 0.074, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.041 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.010, 0.058, 0.105, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.058 std_dev=0.047
N9	B	0, 0.119, 0.303, 0.487, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.303 std_dev=0.184
N7	B	0, 0.102, 0.300, 0.498, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.300 std_dev=0.198
C1'	B	0, 0.127, 0.344, 0.560, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.344 std_dev=0.216
O4'	A	0, 0.027, 0.253, 0.479, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.253 std_dev=0.226
C5	B	0, 0.157, 0.397, 0.637, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.397 std_dev=0.240
C4'	A	0, 0.063, 0.317, 0.572, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.317 std_dev=0.255
C8	B	0, 0.080, 0.384, 0.687, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.384 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.190, 0.504, 0.819, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.504 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.229, 0.572, 0.915, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.572 std_dev=0.343
C2'	B	0, 0.203, 0.569, 0.935, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.569 std_dev=0.366
N6	B	0, 0.230, 0.640, 1.050, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.640 std_dev=0.410
C2'	A	0, 0.072, 0.504, 0.936, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.504 std_dev=0.432
C6	B	0, 0.237, 0.685, 1.134, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.685 std_dev=0.449
N3	B	0, 0.289, 0.871, 1.454, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.871 std_dev=0.582
C5'	A	0, 0.114, 0.747, 1.380, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.747 std_dev=0.633
C3'	A	0, 0.118, 0.778, 1.437, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.778 std_dev=0.660
O4'	B	0, 0.091, 0.758, 1.425, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.758 std_dev=0.667
N1	B	0, 0.326, 1.065, 1.803, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.065 std_dev=0.738
O2'	A	0, 0.131, 0.878, 1.624, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.878 std_dev=0.746
C3'	B	0, 0.223, 0.986, 1.749, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.986 std_dev=0.763
C2	B	0, 0.347, 1.135, 1.923, 1.882 max_d=1.882 avg_d=1.135 std_dev=0.788
O5'	A	0, 0.158, 1.012, 1.867, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.012 std_dev=0.855
C4'	B	0, 0.159, 1.043, 1.927, 1.931 max_d=1.931 avg_d=1.043 std_dev=0.884
O3'	A	0, 0.168, 1.096, 2.025, 2.022 max_d=2.022 avg_d=1.096 std_dev=0.929
O3'	B	0, 0.305, 1.401, 2.498, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.401 std_dev=1.097
P	A	0, 0.261, 1.627, 2.993, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.627 std_dev=1.366
C5'	B	0, 0.192, 1.569, 2.946, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.569 std_dev=1.377
OP2	A	0, 0.279, 1.722, 3.165, 3.178 max_d=3.178 avg_d=1.722 std_dev=1.443
OP1	A	0, 0.336, 2.127, 3.917, 3.936 max_d=3.936 avg_d=2.127 std_dev=1.790
O5'	B	0, 0.183, 2.510, 4.836, 4.844 max_d=4.844 avg_d=2.510 std_dev=2.327
P	B	0, 0.206, 3.542, 6.877, 6.876 max_d=6.876 avg_d=3.542 std_dev=3.335
OP2	B	0, 0.208, 3.598, 6.987, 6.988 max_d=6.988 avg_d=3.598 std_dev=3.389
OP1	B	0, 0.263, 3.946, 7.629, 7.628 max_d=7.628 avg_d=3.946 std_dev=3.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.18	0.02	0.15	0.23	0.15
C2	0.03	0.00	0.16	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.41	0.08	0.05	0.13	0.01	0.07	0.20	0.05
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.17	0.09	0.22	0.16	0.14	0.05	0.00	0.08	0.02	0.11	0.04	0.16	0.15	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.16	0.02	0.13	0.29	0.03	0.14	0.08	0.28	0.12	0.05	0.02	0.00	0.04	0.18	0.09	0.06	0.02
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.07	0.02	0.13	0.01	0.11	0.23	0.10
C4'	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.03	0.02	0.08	0.04	0.16	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.20	0.02	0.11	0.00	0.11	0.22	0.10
C5'	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.13	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.13	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.16	0.01	0.09	0.00	0.08	0.20	0.07
C8	0.00	0.01	0.17	0.29	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.33	0.08	0.14	0.00	0.19	0.28	0.19
N1	0.02	0.00	0.09	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.33	0.04	0.02	0.11	0.01	0.07	0.19	0.05
N2	0.03	0.00	0.22	0.14	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.49	0.18	0.07	0.13	0.01	0.05	0.19	0.04
N3	0.02	0.01	0.16	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.38	0.09	0.05	0.14	0.01	0.09	0.21	0.07
N7	0.01	0.00	0.14	0.28	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.33	0.06	0.10	0.01	0.15	0.25	0.15
N9	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.15	0.02	0.16	0.01	0.15	0.25	0.15
O2'	0.01	0.41	0.00	0.05	0.21	0.16	0.13	0.13	0.21	0.08	0.33	0.49	0.38	0.02	0.05	0.00	0.16	0.10	0.01	0.17	0.03	0.08	0.01
O3'	0.04	0.08	0.08	0.02	0.07	0.02	0.20	0.01	0.16	0.33	0.04	0.18	0.09	0.33	0.15	0.16	0.00	0.02	0.12	0.22	0.05	0.16	0.07
O4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.02	0.07	0.05	0.06	0.02	0.10	0.02	0.00	0.16	0.02	0.07	0.18	0.10
O5'	0.18	0.13	0.11	0.04	0.13	0.01	0.11	0.01	0.09	0.14	0.11	0.13	0.14	0.10	0.16	0.01	0.12	0.16	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.18	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.22	0.02	0.07	0.00	0.08	0.18	0.07
OP1	0.15	0.07	0.16	0.09	0.11	0.02	0.11	0.02	0.08	0.19	0.07	0.05	0.09	0.15	0.15	0.03	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01
OP2	0.23	0.20	0.15	0.06	0.23	0.01	0.22	0.01	0.20	0.28	0.19	0.19	0.21	0.25	0.25	0.08	0.16	0.18	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01
P	0.15	0.05	0.11	0.02	0.10	0.01	0.10	0.01	0.07	0.19	0.05	0.04	0.07	0.15	0.15	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.06	0.08	0.05	0.09	0.22	0.05	0.26	0.11	0.21	0.11	0.06	0.19	0.10	0.17	0.11	0.01	0.31	1.19	0.50	0.58	1.03
C2	0.14	0.09	0.20	0.24	0.08	0.22	0.09	0.27	0.06	0.20	0.11	0.05	0.08	0.18	0.14	0.19	0.28	0.17	1.13	0.56	0.71	0.97
C2'	0.42	0.16	0.29	0.29	0.28	0.48	0.22	0.56	0.12	0.43	0.10	0.24	0.07	0.32	0.38	0.31	0.22	0.56	1.57	1.11	1.38	1.69
C3'	0.50	0.21	0.35	0.33	0.31	0.56	0.21	0.64	0.11	0.42	0.12	0.30	0.08	0.26	0.43	0.39	0.24	0.66	1.55	1.00	1.09	1.61
C4	0.15	0.07	0.12	0.11	0.08	0.17	0.07	0.19	0.09	0.17	0.10	0.07	0.14	0.12	0.14	0.14	0.10	0.20	1.05	0.34	0.47	0.84
C4'	0.24	0.06	0.03	0.07	0.09	0.19	0.06	0.19	0.10	0.13	0.08	0.10	0.18	0.06	0.16	0.10	0.16	0.37	1.01	0.18	0.09	0.72
C5	0.15	0.09	0.11	0.07	0.10	0.12	0.08	0.12	0.08	0.15	0.10	0.10	0.11	0.11	0.14	0.13	0.06	0.16	0.92	0.11	0.24	0.64
C5'	0.03	0.14	0.21	0.35	0.13	0.15	0.20	0.20	0.22	0.15	0.19	0.10	0.26	0.23	0.09	0.14	0.43	0.05	0.35	0.63	0.74	0.10
C6	0.14	0.10	0.15	0.12	0.11	0.13	0.10	0.13	0.09	0.16	0.10	0.11	0.10	0.13	0.14	0.16	0.13	0.14	0.92	0.13	0.28	0.64
C8	0.16	0.08	0.04	0.04	0.09	0.09	0.06	0.08	0.09	0.12	0.09	0.10	0.14	0.06	0.13	0.09	0.09	0.20	0.85	0.05	0.05	0.53
N1	0.14	0.08	0.19	0.20	0.10	0.18	0.10	0.20	0.08	0.18	0.09	0.08	0.08	0.16	0.14	0.18	0.23	0.15	1.02	0.35	0.50	0.81
N2	0.14	0.12	0.24	0.32	0.07	0.26	0.09	0.33	0.05	0.21	0.14	0.05	0.04	0.20	0.14	0.21	0.38	0.17	1.18	0.73	0.89	1.08
N3	0.15	0.10	0.17	0.21	0.07	0.23	0.06	0.28	0.09	0.20	0.14	0.04	0.16	0.17	0.14	0.16	0.22	0.20	1.16	0.59	0.74	1.03
N7	0.15	0.10	0.07	0.01	0.11	0.08	0.08	0.05	0.09	0.12	0.10	0.11	0.12	0.07	0.13	0.11	0.05	0.17	0.80	0.12	0.01	0.46
N9	0.17	0.07	0.07	0.04	0.08	0.15	0.05	0.17	0.10	0.16	0.10	0.07	0.17	0.08	0.14	0.11	0.01	0.23	1.03	0.26	0.36	0.80
O2'	0.46	0.30	0.33	0.33	0.40	0.50	0.40	0.57	0.31	0.53	0.27	0.35	0.25	0.49	0.47	0.32	0.24	0.58	1.63	1.37	1.89	1.92
O3'	0.70	0.32	0.53	0.54	0.44	0.84	0.31	0.98	0.19	0.54	0.21	0.43	0.08	0.34	0.58	0.58	0.44	0.90	1.85	1.68	1.60	2.21
O4'	0.04	0.15	0.12	0.20	0.10	0.03	0.19	0.02	0.23	0.06	0.20	0.10	0.29	0.20	0.03	0.06	0.25	0.13	0.80	0.06	0.19	0.43
O5'	0.01	0.07	0.15	0.28	0.06	0.13	0.10	0.19	0.12	0.07	0.10	0.05	0.15	0.12	0.03	0.10	0.36	0.04	0.33	0.71	0.65	0.09
O6	0.14	0.13	0.15	0.11	0.13	0.10	0.12	0.09	0.11	0.15	0.13	0.13	0.11	0.13	0.14	0.17	0.11	0.12	0.84	0.01	0.15	0.52
OP1	0.35	0.32	0.49	0.61	0.34	0.52	0.34	0.61	0.33	0.36	0.32	0.33	0.31	0.36	0.35	0.46	0.70	0.36	0.45	1.62	1.38	0.97
OP2	0.11	0.09	0.23	0.35	0.10	0.28	0.12	0.36	0.12	0.13	0.11	0.09	0.13	0.14	0.11	0.20	0.43	0.13	0.03	1.15	0.95	0.48
P	0.22	0.22	0.35	0.47	0.23	0.38	0.26	0.46	0.25	0.26	0.24	0.22	0.26	0.28	0.23	0.31	0.55	0.22	0.15	1.35	1.23	0.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.25	0.16	0.31	0.02
C2	0.02	0.00	0.15	0.16	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.22	0.01	0.57	0.32	0.13	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.14	0.14	0.10	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.27	0.46	0.17	0.26
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.11	0.04	0.15	0.14	0.11	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.31	0.63	0.39	0.44
C4	0.01	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.01	0.58	0.27	0.03	0.30
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.03	0.06	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.26	0.24	0.04
C5	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.01	0.72	0.28	0.17	0.45
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.24	0.26	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.11	0.16	0.00	0.75	0.33	0.27	0.51
C8	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.70	0.20	0.07	0.35
N1	0.02	0.00	0.14	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.01	0.68	0.34	0.24	0.44
N3	0.02	0.01	0.14	0.14	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.19	0.01	0.49	0.29	0.02	0.24
N6	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.82	0.34	0.38	0.61
N7	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.78	0.24	0.15	0.49
N9	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.52	0.21	0.13	0.21
O2'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.09	0.02	0.08	0.02	0.11	0.01	0.15	0.15	0.11	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.37	0.02	0.06
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.12	0.01	0.11	0.02	0.16	0.03	0.21	0.19	0.15	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.15	0.78	0.56	0.48
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.03	0.65	0.28
O5'	0.25	0.57	0.27	0.31	0.58	0.01	0.72	0.01	0.75	0.70	0.68	0.49	0.82	0.78	0.52	0.04	0.15	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.16	0.32	0.46	0.63	0.27	0.26	0.28	0.24	0.33	0.20	0.34	0.29	0.34	0.24	0.21	0.37	0.78	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.13	0.17	0.39	0.03	0.24	0.17	0.26	0.27	0.07	0.24	0.02	0.38	0.15	0.13	0.02	0.56	0.65	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.33	0.26	0.44	0.30	0.04	0.45	0.01	0.51	0.35	0.44	0.24	0.61	0.49	0.21	0.06	0.48	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00