Doublet Group distance statistics: 50910

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.040 std_dev=0.028
N1	A	0, 0.013, 0.046, 0.079, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.046 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.013, 0.046, 0.079, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.046 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.014, 0.048, 0.082, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.048 std_dev=0.034
N9	A	0, 0.016, 0.053, 0.091, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.053 std_dev=0.038
N3	A	0, 0.016, 0.054, 0.092, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.054 std_dev=0.038
C1'	A	0, 0.016, 0.057, 0.097, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.057 std_dev=0.041
O6	A	0, 0.014, 0.055, 0.096, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.041
N2	A	0, 0.019, 0.067, 0.115, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.067 std_dev=0.048
C8	A	0, 0.020, 0.071, 0.122, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.071 std_dev=0.051
O3'	A	0, 0.065, 0.221, 0.378, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.221 std_dev=0.156
O4'	A	0, 0.078, 0.268, 0.458, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.268 std_dev=0.190
C3'	A	0, 0.085, 0.292, 0.499, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.292 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.090, 0.309, 0.527, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.309 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.152, 0.519, 0.887, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.519 std_dev=0.368
C5'	A	0, 0.174, 0.594, 1.015, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.594 std_dev=0.421
C2'	A	0, 0.176, 0.602, 1.027, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.602 std_dev=0.425
N9	B	0, 0.191, 0.652, 1.113, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.652 std_dev=0.461
O5'	A	0, 0.200, 0.683, 1.166, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.683 std_dev=0.483
O2'	B	0, 0.227, 0.774, 1.321, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.774 std_dev=0.547
C5	B	0, 0.254, 0.870, 1.486, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.870 std_dev=0.616
C4	B	0, 0.298, 1.016, 1.735, 1.534 max_d=1.534 avg_d=1.016 std_dev=0.719
C8	B	0, 0.301, 1.028, 1.755, 1.568 max_d=1.568 avg_d=1.028 std_dev=0.727
O4'	B	0, 0.309, 1.053, 1.798, 1.581 max_d=1.581 avg_d=1.053 std_dev=0.745
C2'	B	0, 0.312, 1.069, 1.826, 1.653 max_d=1.653 avg_d=1.069 std_dev=0.757
N7	B	0, 0.316, 1.080, 1.845, 1.651 max_d=1.651 avg_d=1.080 std_dev=0.764
N6	B	0, 0.327, 1.118, 1.908, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.118 std_dev=0.790
C6	B	0, 0.345, 1.177, 2.009, 1.769 max_d=1.769 avg_d=1.177 std_dev=0.832
P	A	0, 0.361, 1.232, 2.103, 1.857 max_d=1.857 avg_d=1.232 std_dev=0.871
O2'	A	0, 0.363, 1.240, 2.117, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.240 std_dev=0.877
OP1	A	0, 0.442, 1.509, 2.577, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.509 std_dev=1.068
OP2	A	0, 0.478, 1.634, 2.789, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.634 std_dev=1.155
N3	B	0, 0.510, 1.740, 2.970, 2.615 max_d=2.615 avg_d=1.740 std_dev=1.230
C3'	B	0, 0.518, 1.769, 3.021, 2.701 max_d=2.701 avg_d=1.769 std_dev=1.252
N1	B	0, 0.536, 1.830, 3.124, 2.752 max_d=2.752 avg_d=1.830 std_dev=1.294
C4'	B	0, 0.541, 1.847, 3.154, 2.788 max_d=2.788 avg_d=1.847 std_dev=1.306
O3'	B	0, 0.618, 2.114, 3.609, 3.223 max_d=3.223 avg_d=2.114 std_dev=1.495
C2	B	0, 0.620, 2.115, 3.611, 3.177 max_d=3.177 avg_d=2.115 std_dev=1.496
OP1	B	0, 0.764, 2.611, 4.457, 3.953 max_d=3.953 avg_d=2.611 std_dev=1.846
C5'	B	0, 0.899, 3.071, 5.242, 4.636 max_d=4.636 avg_d=3.071 std_dev=2.171
O5'	B	0, 1.010, 3.451, 5.891, 5.233 max_d=5.233 avg_d=3.451 std_dev=2.441
P	B	0, 1.159, 3.957, 6.755, 5.983 max_d=5.983 avg_d=3.957 std_dev=2.798
OP2	B	0, 1.676, 5.722, 9.768, 8.629 max_d=8.629 avg_d=5.722 std_dev=4.046

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.00	0.00	0.02	0.11	0.01	0.07	0.02	0.03	0.08	0.07
C2	0.04	0.00	0.11	0.07	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.06	0.01	0.13	0.01	0.13	0.29	0.20
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.10	0.00	0.12	0.06	0.16	0.12	0.10	0.04	0.00	0.01	0.01	0.19	0.03	0.14	0.15	0.18
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.14	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.16	0.28	0.22
C4'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.08	0.06	0.04	0.00	0.14	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.21	0.00	0.26	0.40	0.31
C5'	0.02	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.11	0.15	0.07	0.01	0.02	0.16	0.08	0.03	0.13	0.02	0.01	0.14	0.06	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.21	0.00	0.28	0.45	0.33
C8	0.00	0.01	0.12	0.02	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.09	0.04	0.22	0.00	0.27	0.34	0.29
N1	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.17	0.01	0.21	0.38	0.27
N2	0.05	0.00	0.16	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.05	0.01	0.10	0.01	0.08	0.26	0.17
N3	0.04	0.01	0.12	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.02	0.11	0.01	0.09	0.23	0.16
N7	0.00	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.09	0.03	0.24	0.01	0.33	0.45	0.35
N9	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.15	0.01	0.15	0.22	0.19
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.00	0.14	0.08	0.03	0.05	0.18	0.04	0.21	0.14	0.17	0.07	0.00	0.05	0.08	0.14	0.09	0.09	0.20	0.15
O3'	0.11	0.06	0.01	0.01	0.08	0.04	0.09	0.13	0.08	0.09	0.07	0.05	0.07	0.09	0.09	0.05	0.00	0.06	0.10	0.09	0.28	0.24	0.19
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.06	0.04
O5'	0.07	0.13	0.19	0.02	0.15	0.02	0.21	0.01	0.21	0.22	0.17	0.10	0.11	0.24	0.15	0.14	0.10	0.06	0.00	0.24	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.24	0.00	0.35	0.52	0.38
OP1	0.03	0.13	0.14	0.08	0.16	0.07	0.26	0.06	0.28	0.27	0.21	0.08	0.09	0.33	0.15	0.09	0.28	0.08	0.01	0.35	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.29	0.15	0.14	0.28	0.07	0.40	0.04	0.45	0.34	0.38	0.26	0.23	0.45	0.22	0.20	0.24	0.06	0.02	0.52	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.20	0.18	0.07	0.22	0.03	0.31	0.01	0.33	0.29	0.27	0.17	0.16	0.35	0.19	0.15	0.19	0.04	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.47	0.11	0.45	0.14	0.52	0.13	0.82	0.38	0.29	0.53	0.31	0.41	0.21	0.09	0.03	0.48	0.35	0.94	0.42	0.96	0.95
C2	0.18	0.17	0.24	0.53	0.08	0.43	0.15	0.68	0.02	0.32	0.18	0.07	0.07	0.33	0.19	0.01	0.53	0.26	0.92	0.28	0.88	0.87
C2'	0.04	0.84	0.11	0.34	0.42	0.49	0.35	0.89	0.63	0.17	0.86	0.65	0.57	0.07	0.11	0.25	0.40	0.27	1.02	0.63	1.32	1.18
C3'	0.04	0.70	0.07	0.35	0.35	0.58	0.31	0.96	0.54	0.19	0.71	0.55	0.49	0.06	0.06	0.14	0.42	0.38	1.00	0.69	1.22	1.16
C4	0.18	0.30	0.18	0.49	0.01	0.48	0.04	0.75	0.16	0.31	0.34	0.16	0.17	0.29	0.16	0.01	0.51	0.31	0.92	0.35	0.92	0.90
C4'	0.01	0.57	0.10	0.20	0.34	0.40	0.36	0.69	0.53	0.05	0.61	0.45	0.53	0.11	0.11	0.12	0.25	0.27	0.66	0.29	0.58	0.67
C5	0.17	0.27	0.17	0.47	0.01	0.47	0.04	0.73	0.14	0.28	0.30	0.15	0.14	0.25	0.15	0.01	0.49	0.30	0.88	0.36	0.89	0.87
C5'	0.15	0.58	0.30	0.06	0.42	0.18	0.42	0.41	0.53	0.16	0.60	0.50	0.51	0.26	0.26	0.25	0.01	0.09	0.28	0.05	0.19	0.27
C6	0.17	0.21	0.19	0.48	0.04	0.44	0.08	0.70	0.06	0.28	0.22	0.10	0.05	0.26	0.16	0.01	0.50	0.28	0.88	0.33	0.86	0.85
C8	0.15	0.38	0.10	0.41	0.09	0.49	0.07	0.77	0.27	0.25	0.42	0.24	0.29	0.18	0.10	0.02	0.46	0.34	0.85	0.42	0.89	0.87
N1	0.17	0.16	0.23	0.51	0.07	0.42	0.13	0.67	0.01	0.30	0.16	0.06	0.04	0.29	0.18	0.01	0.52	0.25	0.90	0.29	0.86	0.85
N2	0.17	0.10	0.27	0.54	0.12	0.39	0.20	0.63	0.11	0.32	0.08	0.02	0.20	0.34	0.20	0.02	0.53	0.22	0.91	0.23	0.85	0.84
N3	0.18	0.26	0.22	0.52	0.05	0.46	0.11	0.72	0.08	0.34	0.29	0.12	0.06	0.34	0.19	0.02	0.53	0.29	0.94	0.30	0.91	0.90
N7	0.16	0.32	0.12	0.42	0.05	0.48	0.02	0.75	0.20	0.25	0.35	0.19	0.22	0.20	0.12	0.01	0.46	0.32	0.84	0.39	0.87	0.85
N9	0.16	0.38	0.13	0.45	0.07	0.50	0.04	0.79	0.26	0.29	0.43	0.23	0.29	0.24	0.13	0.02	0.49	0.34	0.91	0.40	0.93	0.92
O2'	0.29	1.18	0.29	0.21	0.70	0.30	0.60	0.75	0.89	0.04	1.18	0.97	0.74	0.12	0.36	0.50	0.29	0.03	0.97	0.54	1.42	1.17
O3'	0.03	0.67	0.08	0.36	0.35	0.59	0.26	0.99	0.44	0.24	0.63	0.55	0.35	0.13	0.05	0.16	0.43	0.39	1.09	0.62	1.28	1.25
O4'	0.19	0.32	0.11	0.37	0.08	0.48	0.11	0.72	0.30	0.25	0.38	0.19	0.36	0.13	0.11	0.04	0.40	0.37	0.74	0.25	0.59	0.69
O5'	0.11	0.53	0.26	0.01	0.34	0.21	0.33	0.45	0.44	0.07	0.53	0.45	0.42	0.15	0.19	0.23	0.06	0.11	0.35	0.12	0.36	0.37
O6	0.17	0.19	0.19	0.47	0.04	0.43	0.08	0.69	0.06	0.27	0.20	0.09	0.05	0.24	0.16	0.01	0.49	0.27	0.86	0.33	0.84	0.84
OP1	0.41	0.72	0.62	0.43	0.58	0.12	0.52	0.09	0.58	0.34	0.69	0.68	0.52	0.36	0.46	0.52	0.34	0.17	0.16	0.16	0.06	0.12
OP2	0.20	0.55	0.40	0.17	0.37	0.09	0.30	0.32	0.38	0.10	0.51	0.50	0.32	0.11	0.24	0.37	0.10	0.02	0.18	0.05	0.33	0.24
P	0.21	0.55	0.40	0.20	0.39	0.06	0.35	0.27	0.43	0.16	0.53	0.49	0.39	0.20	0.27	0.34	0.13	0.00	0.09	0.05	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.43	0.32	0.16
C2	0.00	0.00	0.09	0.18	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.02	0.28	0.46	0.05	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.05	0.09	0.08	0.09	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.44	0.15	0.15
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.19	0.00	0.23	0.00	0.24	0.18	0.22	0.15	0.26	0.23	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.23	0.02	0.05
C4	0.00	0.01	0.08	0.19	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.28	0.45	0.06	0.06
C4'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.10	0.06	0.04	0.10	0.11	0.06	0.04	0.06	0.01	0.01	0.07	0.25	0.08
C5	0.01	0.01	0.09	0.23	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.21	0.03	0.37	0.39	0.05	0.16
C5'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.21	0.20	0.18	0.11	0.24	0.23	0.13	0.03	0.04	0.01	0.01	0.19	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.24	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.23	0.04	0.39	0.39	0.12	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.10	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.16	0.02	0.31	0.39	0.15	0.07
N1	0.01	0.01	0.09	0.22	0.01	0.06	0.02	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.20	0.04	0.35	0.43	0.11	0.16
N3	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.12	0.01	0.23	0.47	0.05	0.03
N6	0.02	0.01	0.09	0.26	0.02	0.10	0.02	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.26	0.04	0.44	0.33	0.19	0.26
N7	0.02	0.01	0.07	0.23	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.21	0.03	0.40	0.34	0.03	0.18
N9	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.22	0.44	0.17	0.02
O2'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.09	0.04	0.08	0.03	0.11	0.04	0.13	0.13	0.10	0.06	0.06	0.00	0.03	0.05	0.01	0.33	0.17	0.11
O3'	0.04	0.16	0.02	0.01	0.15	0.06	0.21	0.04	0.23	0.16	0.20	0.12	0.26	0.21	0.11	0.03	0.00	0.05	0.03	0.08	0.08	0.02
O4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.29	0.46	0.20
O5'	0.02	0.28	0.01	0.02	0.28	0.01	0.37	0.01	0.39	0.31	0.35	0.23	0.44	0.40	0.22	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.43	0.46	0.44	0.23	0.45	0.07	0.39	0.19	0.39	0.39	0.43	0.47	0.33	0.34	0.44	0.33	0.08	0.29	0.02	0.00	0.01	0.02
OP2	0.32	0.05	0.15	0.02	0.06	0.25	0.05	0.22	0.12	0.15	0.11	0.05	0.19	0.03	0.17	0.17	0.08	0.46	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.09	0.15	0.05	0.06	0.08	0.16	0.01	0.20	0.07	0.16	0.03	0.26	0.18	0.02	0.11	0.02	0.20	0.00	0.02	0.01	0.00