Doublet Group distance statistics: 50938

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, -0.002, 0.006, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O2	A	0, -0.003, 0.023, 0.049, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.023 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.113, 0.368, 0.623, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.368 std_dev=0.255
C2'	A	0, 0.119, 0.397, 0.674, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.397 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.115, 0.422, 0.729, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.422 std_dev=0.307
C4'	A	0, 0.124, 0.483, 0.842, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.483 std_dev=0.359
O5'	B	0, 0.264, 0.648, 1.032, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.648 std_dev=0.384
OP2	B	0, 0.191, 0.580, 0.969, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.580 std_dev=0.389
P	B	0, 0.194, 0.592, 0.989, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.592 std_dev=0.398
O3'	A	0, 0.001, 0.406, 0.811, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.406 std_dev=0.405
C8	B	0, 0.388, 0.810, 1.231, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.810 std_dev=0.421
N7	B	0, 0.360, 0.781, 1.203, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.781 std_dev=0.422
N9	B	0, 0.415, 0.842, 1.270, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.842 std_dev=0.428
C4	B	0, 0.373, 0.811, 1.248, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.811 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.413, 0.858, 1.302, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.858 std_dev=0.445
C5	B	0, 0.350, 0.798, 1.247, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.798 std_dev=0.449
OP1	B	0, 0.126, 0.586, 1.045, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.586 std_dev=0.459
C5'	B	0, 0.462, 0.935, 1.407, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.935 std_dev=0.473
C1'	B	0, 0.463, 0.939, 1.415, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.939 std_dev=0.476
N3	B	0, 0.357, 0.837, 1.317, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.837 std_dev=0.480
O2'	B	0, 0.396, 0.876, 1.356, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.876 std_dev=0.480
O2'	A	0, 0.187, 0.672, 1.156, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.672 std_dev=0.484
O4'	B	0, 0.507, 1.024, 1.542, 1.349 max_d=1.349 avg_d=1.024 std_dev=0.518
C3'	B	0, 0.494, 1.017, 1.541, 1.432 max_d=1.432 avg_d=1.017 std_dev=0.524
C6	B	0, 0.336, 0.860, 1.385, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.860 std_dev=0.525
C4'	B	0, 0.517, 1.048, 1.580, 1.395 max_d=1.395 avg_d=1.048 std_dev=0.532
C2	B	0, 0.324, 0.863, 1.401, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.863 std_dev=0.539
C5'	A	0, 0.271, 0.825, 1.378, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.825 std_dev=0.554
N1	B	0, 0.326, 0.898, 1.471, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.898 std_dev=0.572
N6	B	0, 0.352, 0.928, 1.504, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.928 std_dev=0.576
O3'	B	0, 0.563, 1.190, 1.817, 1.679 max_d=1.679 avg_d=1.190 std_dev=0.627
O5'	A	0, 0.384, 1.230, 2.076, 2.218 max_d=2.218 avg_d=1.230 std_dev=0.846
P	A	0, 0.372, 1.229, 2.086, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.229 std_dev=0.857
OP2	A	0, 0.367, 1.401, 2.435, 2.886 max_d=2.886 avg_d=1.401 std_dev=1.034
OP1	A	0, 0.386, 1.610, 2.834, 3.178 max_d=3.178 avg_d=1.610 std_dev=1.224

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.20	0.01	0.00	0.13	0.11	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.19	0.01	0.04	0.17	0.17	0.29	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.07	0.14	0.00	0.03	0.04	0.03	0.09	0.09	0.12	0.08
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.08	0.05	0.08	0.03	0.01	0.00	0.11	0.01	0.16	0.11	0.15	0.12
C4	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.00	0.02	0.24	0.25	0.42	0.24
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.00	0.05	0.27	0.27	0.35	0.24
C5'	0.03	0.10	0.08	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.10	0.12	0.08	0.04	0.08	0.15	0.02	0.00	0.06	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.06	0.28	0.24	0.25	0.21
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.01	0.01	0.21	0.18	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.16	0.00	0.03	0.20	0.21	0.39	0.21
O2	0.04	0.00	0.14	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.25	0.01	0.09	0.14	0.14	0.26	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.10	0.04	0.15	0.04	0.14	0.06	0.06	0.14	0.00	0.01	0.11	0.04	0.09	0.09	0.19	0.13
O3'	0.20	0.19	0.03	0.00	0.10	0.02	0.06	0.08	0.07	0.15	0.16	0.25	0.01	0.00	0.09	0.14	0.25	0.25	0.22	0.22
O4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.00	0.02	0.23	0.27	0.48	0.26
O4'	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.03	0.09	0.04	0.14	0.02	0.00	0.15	0.13	0.07	0.04
O5'	0.13	0.17	0.09	0.16	0.24	0.02	0.27	0.00	0.28	0.21	0.20	0.14	0.09	0.25	0.23	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.17	0.09	0.11	0.25	0.04	0.27	0.06	0.24	0.18	0.21	0.14	0.09	0.25	0.27	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.29	0.12	0.15	0.42	0.13	0.35	0.16	0.25	0.22	0.39	0.26	0.19	0.22	0.48	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.08	0.12	0.24	0.03	0.24	0.01	0.21	0.16	0.21	0.15	0.13	0.22	0.26	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.40	0.20	0.18	0.32	0.17	0.36	0.15	0.43	0.22	0.44	0.35	0.48	0.30	0.25	0.27	0.19	0.19	0.20	0.17	0.24	0.18
C2	0.24	0.36	0.23	0.19	0.32	0.18	0.34	0.16	0.38	0.24	0.38	0.34	0.39	0.30	0.27	0.30	0.20	0.20	0.19	0.15	0.22	0.16
C2'	0.22	0.37	0.18	0.14	0.30	0.15	0.32	0.14	0.37	0.21	0.39	0.33	0.40	0.27	0.24	0.25	0.15	0.18	0.14	0.12	0.15	0.12
C3'	0.20	0.37	0.15	0.14	0.29	0.16	0.32	0.16	0.39	0.20	0.40	0.32	0.43	0.26	0.23	0.19	0.14	0.18	0.17	0.16	0.19	0.17
C4	0.22	0.36	0.19	0.17	0.30	0.15	0.29	0.14	0.32	0.18	0.35	0.34	0.30	0.22	0.24	0.27	0.19	0.18	0.15	0.14	0.15	0.14
C4'	0.18	0.38	0.17	0.16	0.28	0.16	0.30	0.16	0.39	0.16	0.42	0.32	0.44	0.21	0.20	0.21	0.17	0.17	0.23	0.23	0.24	0.23
C5	0.20	0.39	0.17	0.16	0.30	0.15	0.31	0.14	0.38	0.17	0.41	0.35	0.38	0.21	0.22	0.24	0.17	0.17	0.15	0.14	0.15	0.14
C5'	0.10	0.32	0.12	0.15	0.18	0.11	0.20	0.13	0.30	0.09	0.35	0.25	0.34	0.11	0.11	0.15	0.14	0.10	0.19	0.20	0.19	0.19
C6	0.21	0.40	0.18	0.16	0.31	0.15	0.34	0.14	0.42	0.19	0.43	0.36	0.44	0.25	0.24	0.25	0.18	0.18	0.17	0.14	0.18	0.14
N1	0.23	0.39	0.21	0.18	0.33	0.17	0.35	0.15	0.41	0.22	0.42	0.35	0.44	0.29	0.26	0.27	0.19	0.20	0.19	0.15	0.21	0.16
N3	0.24	0.35	0.23	0.19	0.31	0.17	0.31	0.15	0.34	0.22	0.35	0.34	0.33	0.27	0.26	0.30	0.20	0.20	0.17	0.14	0.17	0.14
O2	0.26	0.35	0.25	0.21	0.32	0.20	0.34	0.18	0.37	0.26	0.37	0.34	0.39	0.32	0.28	0.32	0.22	0.22	0.22	0.17	0.26	0.19
O2'	0.29	0.39	0.29	0.23	0.34	0.22	0.35	0.20	0.38	0.27	0.39	0.38	0.39	0.31	0.30	0.41	0.25	0.24	0.21	0.20	0.22	0.19
O3'	0.40	0.43	0.38	0.38	0.40	0.42	0.42	0.44	0.45	0.39	0.45	0.41	0.48	0.40	0.40	0.40	0.38	0.42	0.47	0.48	0.46	0.47
O4	0.22	0.33	0.19	0.17	0.27	0.16	0.22	0.15	0.24	0.16	0.29	0.33	0.21	0.18	0.22	0.27	0.19	0.18	0.15	0.16	0.18	0.17
O4'	0.21	0.42	0.21	0.20	0.31	0.18	0.34	0.18	0.44	0.19	0.46	0.36	0.49	0.25	0.23	0.26	0.21	0.19	0.27	0.27	0.29	0.27
O5'	0.25	0.13	0.31	0.32	0.17	0.28	0.16	0.27	0.11	0.28	0.12	0.15	0.07	0.24	0.23	0.35	0.33	0.27	0.32	0.26	0.23	0.28
OP1	0.29	0.10	0.33	0.35	0.23	0.33	0.27	0.32	0.20	0.37	0.11	0.15	0.23	0.37	0.30	0.34	0.35	0.33	0.36	0.30	0.24	0.31
OP2	0.36	0.43	0.40	0.42	0.37	0.37	0.34	0.37	0.35	0.33	0.41	0.42	0.32	0.32	0.35	0.36	0.41	0.34	0.35	0.36	0.40	0.36
P	0.14	0.13	0.22	0.25	0.09	0.19	0.11	0.20	0.09	0.20	0.13	0.09	0.10	0.19	0.13	0.22	0.24	0.16	0.21	0.19	0.18	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.04	0.11	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.05	0.07	0.19	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.07	0.07	0.05	0.09	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.09	0.06
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.06	0.17	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.01	0.04	0.06	0.16	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00
C6	0.02	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.13	0.08	0.01	0.03	0.06	0.17	0.08
C8	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.02	0.04	0.04	0.11	0.06
N1	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.01	0.04	0.07	0.19	0.09
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.06	0.07	0.19	0.09
N6	0.03	0.01	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.14	0.08	0.01	0.03	0.06	0.16	0.07
N7	0.02	0.02	0.08	0.06	0.01	0.02	0.00	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.05	0.02	0.04	0.05	0.13	0.07
N9	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.05	0.04	0.14	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.13	0.09	0.11	0.09	0.14	0.12	0.07	0.00	0.05	0.01	0.06	0.11	0.11	0.08
O3'	0.04	0.09	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.09	0.08	0.05	0.05	0.05	0.00	0.04	0.07	0.04	0.04	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05	0.02
O5'	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.02	0.04	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.08	0.03	0.06	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	0.05	0.04	0.11	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.09	0.02	0.17	0.02	0.16	0.02	0.17	0.11	0.19	0.19	0.16	0.13	0.14	0.11	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.06	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.08	0.06	0.09	0.09	0.07	0.07	0.07	0.08	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00