Doublet Group distance statistics: 50955

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 9, 14, 17, 11, 4, 4, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.001, 0.020, 0.040, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.002, 0.025, 0.048, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.025 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.001, 0.026, 0.050, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.026 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.006, 0.041, 0.076, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.041 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.005, 0.043, 0.081, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.043 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.002, 0.044, 0.085, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.044 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.013, 0.098, 0.184, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.098 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.036, 0.141, 0.247, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.141 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.019, 0.128, 0.237, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.128 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.053, 0.185, 0.317, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.185 std_dev=0.132
C5	B	0, 0.234, 0.387, 0.540, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.387 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.032, 0.194, 0.356, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.194 std_dev=0.162
C6	B	0, 0.232, 0.402, 0.571, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.402 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.140, 0.311, 0.482, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.311 std_dev=0.171
C4	B	0, 0.214, 0.386, 0.558, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.386 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.221, 0.407, 0.592, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.407 std_dev=0.185
OP2	B	0, 0.275, 0.474, 0.673, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.474 std_dev=0.199
P	B	0, 0.280, 0.489, 0.699, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.489 std_dev=0.210
N1	B	0, 0.218, 0.428, 0.638, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.428 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.211, 0.431, 0.651, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.431 std_dev=0.220
O5'	B	0, 0.287, 0.510, 0.733, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.510 std_dev=0.223
O4	B	0, 0.183, 0.411, 0.639, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.411 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.042, 0.282, 0.522, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.282 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.240, 0.509, 0.778, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.509 std_dev=0.269
O4'	B	0, 0.237, 0.514, 0.792, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.514 std_dev=0.278
C5'	B	0, 0.305, 0.590, 0.875, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.590 std_dev=0.285
O2	B	0, 0.188, 0.486, 0.783, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.486 std_dev=0.298
C2'	B	0, 0.284, 0.588, 0.891, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.588 std_dev=0.303
C4'	B	0, 0.288, 0.595, 0.903, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.595 std_dev=0.308
C3'	B	0, 0.288, 0.601, 0.914, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.601 std_dev=0.313
OP1	B	0, 0.304, 0.636, 0.967, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.636 std_dev=0.331
O5'	A	0, -0.022, 0.327, 0.675, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.327 std_dev=0.348
O2'	B	0, 0.293, 0.657, 1.021, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.657 std_dev=0.364
O3'	B	0, 0.297, 0.689, 1.080, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.689 std_dev=0.391
P	A	0, -0.170, 0.464, 1.098, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.464 std_dev=0.634
OP2	A	0, -0.201, 0.541, 1.283, 2.618 max_d=2.618 avg_d=0.541 std_dev=0.742
OP1	A	0, -0.209, 0.535, 1.280, 2.948 max_d=2.948 avg_d=0.535 std_dev=0.744

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.09	0.06
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.04	0.13	0.16	0.17	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.05	0.08	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.10	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.08	0.05	0.08	0.05	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.15	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.12	0.14	0.14	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.14	0.15	0.16	0.14
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.06	0.10	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.02	0.14	0.16	0.18	0.15
C8	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.12	0.12	0.11	0.11
N1	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.07	0.02	0.14	0.17	0.18	0.14
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.11	0.04	0.12	0.15	0.15	0.10
N6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.06	0.03	0.15	0.17	0.19	0.17
N7	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.14	0.14	0.15	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.11	0.11	0.08
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.03	0.06	0.04	0.07	0.04	0.09	0.09	0.08	0.05	0.03	0.00	0.05	0.03	0.05	0.13	0.09	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.07	0.11	0.06	0.08	0.03	0.05	0.00	0.01	0.07	0.19	0.13	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.07	0.12	0.09
O5'	0.06	0.13	0.05	0.06	0.12	0.01	0.14	0.01	0.14	0.12	0.14	0.12	0.15	0.14	0.10	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.16	0.13	0.15	0.14	0.08	0.15	0.06	0.16	0.12	0.17	0.15	0.17	0.14	0.11	0.13	0.19	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.17	0.10	0.10	0.14	0.04	0.16	0.02	0.18	0.11	0.18	0.15	0.19	0.15	0.11	0.09	0.13	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.07	0.08	0.11	0.03	0.14	0.01	0.15	0.11	0.14	0.10	0.17	0.14	0.08	0.06	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.13	0.18	0.19	0.11	0.12	0.14	0.11	0.11	0.11	0.11	0.18	0.18	0.26	0.12	0.10	0.12	0.14	0.16	0.13
C2	0.13	0.16	0.18	0.19	0.12	0.13	0.10	0.11	0.11	0.13	0.16	0.19	0.18	0.24	0.12	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12
C2'	0.18	0.20	0.25	0.26	0.13	0.18	0.13	0.16	0.13	0.16	0.19	0.25	0.25	0.32	0.13	0.15	0.16	0.15	0.17	0.13
C3'	0.18	0.21	0.25	0.25	0.15	0.18	0.13	0.16	0.13	0.17	0.20	0.26	0.25	0.31	0.14	0.15	0.16	0.16	0.18	0.13
C4	0.13	0.15	0.18	0.20	0.10	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.14	0.18	0.18	0.26	0.10	0.11	0.13	0.13	0.15	0.12
C4'	0.12	0.13	0.17	0.18	0.11	0.13	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.18	0.18	0.24	0.12	0.11	0.12	0.15	0.16	0.13
C5	0.14	0.16	0.21	0.23	0.12	0.16	0.11	0.14	0.12	0.14	0.16	0.19	0.20	0.28	0.12	0.13	0.15	0.15	0.16	0.13
C5'	0.12	0.14	0.17	0.18	0.10	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.12	0.18	0.18	0.24	0.10	0.11	0.13	0.17	0.17	0.13
C6	0.16	0.18	0.22	0.24	0.14	0.17	0.12	0.16	0.14	0.15	0.17	0.20	0.21	0.29	0.15	0.15	0.17	0.16	0.18	0.14
C8	0.13	0.15	0.20	0.22	0.10	0.15	0.11	0.13	0.11	0.12	0.13	0.18	0.20	0.28	0.10	0.12	0.14	0.15	0.16	0.12
N1	0.16	0.18	0.21	0.22	0.15	0.16	0.12	0.14	0.13	0.15	0.18	0.20	0.20	0.27	0.16	0.14	0.15	0.14	0.16	0.12
N3	0.12	0.14	0.17	0.18	0.09	0.12	0.11	0.10	0.10	0.11	0.13	0.18	0.17	0.23	0.09	0.10	0.11	0.12	0.15	0.12
N6	0.18	0.19	0.24	0.27	0.16	0.20	0.14	0.19	0.16	0.17	0.19	0.21	0.23	0.31	0.17	0.17	0.21	0.19	0.22	0.17
N7	0.15	0.16	0.21	0.23	0.11	0.17	0.12	0.15	0.12	0.14	0.15	0.19	0.21	0.30	0.11	0.14	0.16	0.16	0.17	0.13
N9	0.12	0.14	0.19	0.20	0.09	0.13	0.11	0.11	0.10	0.11	0.13	0.18	0.19	0.27	0.09	0.11	0.12	0.14	0.15	0.12
O2'	0.17	0.18	0.24	0.24	0.16	0.18	0.18	0.16	0.16	0.16	0.16	0.22	0.24	0.31	0.17	0.16	0.17	0.16	0.17	0.15
O3'	0.24	0.27	0.30	0.30	0.20	0.23	0.17	0.20	0.18	0.23	0.26	0.32	0.31	0.35	0.20	0.20	0.20	0.17	0.19	0.14
O4'	0.11	0.12	0.15	0.16	0.14	0.11	0.16	0.11	0.13	0.11	0.12	0.16	0.16	0.23	0.16	0.11	0.12	0.15	0.16	0.14
O5'	0.17	0.20	0.23	0.24	0.14	0.18	0.12	0.16	0.13	0.16	0.18	0.24	0.23	0.29	0.13	0.15	0.17	0.20	0.19	0.15
OP1	0.21	0.24	0.24	0.24	0.19	0.20	0.16	0.18	0.17	0.20	0.23	0.28	0.24	0.28	0.19	0.18	0.18	0.20	0.19	0.15
OP2	0.21	0.24	0.23	0.24	0.21	0.20	0.17	0.18	0.18	0.21	0.25	0.27	0.23	0.27	0.22	0.19	0.19	0.19	0.19	0.15
P	0.16	0.18	0.19	0.20	0.14	0.16	0.12	0.14	0.13	0.15	0.18	0.22	0.19	0.23	0.14	0.14	0.14	0.17	0.16	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.02	0.08	0.07	0.10	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.09	0.06	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.07	0.09	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.12	0.06	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.11	0.11	0.14	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.02	0.13	0.11	0.14	0.11
C5'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.02	0.11	0.08	0.11	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.08	0.07	0.09	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.02	0.09	0.09	0.12	0.08
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.07	0.07	0.10	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.09	0.00	0.04	0.06	0.03	0.05	0.12	0.06	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.08	0.04	0.08	0.11	0.04	0.00	0.11	0.01	0.10	0.18	0.11	0.10
O4	0.03	0.02	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.03	0.13	0.12	0.16	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.07	0.06
O5'	0.04	0.08	0.04	0.06	0.11	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.09	0.07	0.05	0.10	0.13	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.09	0.12	0.11	0.06	0.11	0.05	0.08	0.07	0.09	0.07	0.12	0.18	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.10	0.06	0.06	0.14	0.02	0.14	0.02	0.11	0.09	0.12	0.10	0.06	0.11	0.16	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.04	0.06	0.10	0.02	0.11	0.01	0.08	0.06	0.08	0.06	0.05	0.10	0.11	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00