Doublet Group distance statistics: 50957

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 9, 4, 13, 5, 3, 0, 1, 1, 2, 2, 3, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.010, 0.039, 0.067, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.039 std_dev=0.029
O4'	A	0, -0.043, 0.179, 0.400, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.179 std_dev=0.222
C2'	A	0, -0.052, 0.191, 0.434, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.191 std_dev=0.243
C4	B	0, 0.189, 0.469, 0.749, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.469 std_dev=0.280
C5	B	0, 0.177, 0.483, 0.789, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.483 std_dev=0.306
N3	B	0, 0.218, 0.548, 0.878, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.548 std_dev=0.330
N4	B	0, 0.154, 0.495, 0.837, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.495 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.045, 0.399, 0.753, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.399 std_dev=0.354
C2	B	0, 0.252, 0.616, 0.980, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.616 std_dev=0.364
OP2	A	0, 0.176, 0.555, 0.934, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.555 std_dev=0.379
O2	B	0, 0.336, 0.737, 1.138, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.737 std_dev=0.401
C4'	A	0, -0.110, 0.293, 0.695, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.293 std_dev=0.402
O2'	A	0, -0.143, 0.261, 0.666, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.261 std_dev=0.405
P	A	0, 0.104, 0.519, 0.934, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.519 std_dev=0.415
C6	B	0, 0.171, 0.596, 1.020, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.596 std_dev=0.424
C3'	A	0, -0.107, 0.326, 0.758, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.326 std_dev=0.432
N1	B	0, 0.216, 0.654, 1.092, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.654 std_dev=0.438
C5'	A	0, -0.052, 0.411, 0.873, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.411 std_dev=0.462
OP1	A	0, 0.095, 0.656, 1.217, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.656 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.246, 0.847, 1.447, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.847 std_dev=0.601
O3'	A	0, -0.144, 0.514, 1.172, 2.522 max_d=2.522 avg_d=0.514 std_dev=0.658
C2'	B	0, 0.250, 0.919, 1.588, 2.611 max_d=2.611 avg_d=0.919 std_dev=0.669
O4'	B	0, 0.190, 0.971, 1.752, 2.576 max_d=2.576 avg_d=0.971 std_dev=0.781
O2'	B	0, 0.268, 1.076, 1.884, 3.196 max_d=3.196 avg_d=1.076 std_dev=0.808
C3'	B	0, 0.208, 1.059, 1.911, 2.896 max_d=2.896 avg_d=1.059 std_dev=0.852
C4'	B	0, 0.182, 1.126, 2.071, 3.080 max_d=3.080 avg_d=1.126 std_dev=0.944
O5'	B	0, -0.009, 0.956, 1.921, 3.724 max_d=3.724 avg_d=0.956 std_dev=0.965
C5'	B	0, 0.077, 1.172, 2.266, 3.903 max_d=3.903 avg_d=1.172 std_dev=1.095
O3'	B	0, 0.173, 1.283, 2.393, 3.687 max_d=3.687 avg_d=1.283 std_dev=1.110
OP2	B	0, -0.256, 0.953, 2.162, 4.876 max_d=4.876 avg_d=0.953 std_dev=1.209
P	B	0, -0.141, 1.123, 2.386, 4.954 max_d=4.954 avg_d=1.123 std_dev=1.264
OP1	B	0, -0.362, 1.704, 3.770, 7.594 max_d=7.594 avg_d=1.704 std_dev=2.066

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.09	0.08	0.16	0.11
C2	0.02	0.00	0.17	0.21	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.06	0.07	0.08	0.11	0.07
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.11	0.08	0.10	0.13	0.16	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.25	0.24	0.34	0.27
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.20	0.00	0.25	0.02	0.27	0.20	0.25	0.17	0.29	0.25	0.16	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.08	0.20	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.03	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.04	0.11	0.12	0.07	0.18	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.25	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.16	0.01	0.11	0.11	0.12	0.09
C5'	0.03	0.04	0.11	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.07	0.03	0.12	0.12	0.05	0.07	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.27	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.17	0.02	0.13	0.13	0.14	0.11
C8	0.01	0.01	0.10	0.20	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.15	0.05	0.11	0.08	0.12	0.08
N1	0.02	0.00	0.13	0.25	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.04	0.10	0.11	0.13	0.09
N3	0.02	0.00	0.16	0.17	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.06	0.05	0.06	0.11	0.07
N6	0.02	0.01	0.07	0.29	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.22	0.02	0.16	0.17	0.18	0.14
N7	0.01	0.01	0.06	0.25	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.23	0.20	0.03	0.14	0.12	0.14	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.05	0.01	0.05	0.05	0.12	0.07
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.15	0.18	0.20	0.07	0.20	0.20	0.16	0.09	0.23	0.23	0.14	0.00	0.05	0.13	0.16	0.15	0.34	0.20
O3'	0.14	0.10	0.01	0.01	0.08	0.02	0.16	0.10	0.17	0.15	0.13	0.09	0.22	0.20	0.05	0.05	0.00	0.10	0.13	0.28	0.22	0.19
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.13	0.10	0.00	0.05	0.06	0.11	0.08
O5'	0.09	0.07	0.25	0.05	0.06	0.02	0.11	0.01	0.13	0.11	0.10	0.05	0.16	0.14	0.05	0.16	0.13	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.08	0.24	0.11	0.07	0.06	0.11	0.05	0.13	0.08	0.11	0.06	0.17	0.12	0.05	0.15	0.28	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.11	0.34	0.09	0.11	0.03	0.12	0.02	0.14	0.12	0.13	0.11	0.18	0.14	0.12	0.34	0.22	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.07	0.27	0.07	0.07	0.03	0.09	0.02	0.11	0.08	0.09	0.07	0.14	0.11	0.07	0.20	0.19	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.16	0.12	0.13	0.18	0.16	0.23	0.18	0.24	0.20	0.15	0.17	0.15	0.15	0.17	0.26	0.14	0.39	0.48	0.28
C2	0.16	0.14	0.16	0.20	0.14	0.12	0.15	0.12	0.16	0.15	0.14	0.17	0.14	0.15	0.26	0.18	0.16	0.31	0.52	0.20
C2'	0.25	0.28	0.23	0.19	0.28	0.24	0.24	0.30	0.24	0.25	0.31	0.32	0.30	0.27	0.21	0.28	0.20	0.52	0.54	0.38
C3'	0.33	0.25	0.21	0.18	0.22	0.32	0.28	0.34	0.32	0.30	0.21	0.18	0.23	0.28	0.15	0.40	0.18	0.61	0.47	0.40
C4	0.17	0.13	0.13	0.17	0.13	0.13	0.18	0.14	0.19	0.16	0.13	0.12	0.13	0.14	0.22	0.21	0.15	0.33	0.51	0.22
C4'	0.31	0.27	0.20	0.17	0.27	0.27	0.30	0.27	0.32	0.30	0.25	0.24	0.26	0.25	0.17	0.36	0.15	0.49	0.45	0.33
C5	0.16	0.13	0.14	0.19	0.13	0.12	0.16	0.12	0.18	0.15	0.13	0.12	0.13	0.14	0.25	0.20	0.16	0.30	0.52	0.18
C5'	0.31	0.27	0.19	0.17	0.26	0.26	0.30	0.26	0.31	0.30	0.25	0.24	0.26	0.24	0.17	0.36	0.14	0.47	0.46	0.32
C6	0.15	0.13	0.16	0.22	0.13	0.12	0.15	0.12	0.16	0.15	0.13	0.14	0.13	0.15	0.28	0.18	0.18	0.28	0.54	0.16
C8	0.18	0.14	0.13	0.17	0.15	0.14	0.20	0.15	0.21	0.18	0.13	0.13	0.14	0.14	0.23	0.24	0.15	0.34	0.50	0.21
N1	0.15	0.14	0.17	0.22	0.14	0.12	0.14	0.11	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.16	0.29	0.17	0.18	0.29	0.54	0.17
N3	0.17	0.13	0.14	0.17	0.13	0.13	0.18	0.13	0.19	0.16	0.13	0.13	0.13	0.14	0.22	0.20	0.14	0.33	0.50	0.23
N6	0.15	0.13	0.17	0.23	0.13	0.12	0.14	0.12	0.16	0.14	0.14	0.14	0.13	0.15	0.31	0.17	0.20	0.27	0.54	0.14
N7	0.17	0.13	0.14	0.19	0.14	0.13	0.18	0.13	0.19	0.16	0.13	0.12	0.13	0.14	0.25	0.21	0.16	0.30	0.51	0.18
N9	0.19	0.14	0.13	0.15	0.15	0.15	0.21	0.15	0.21	0.18	0.13	0.13	0.14	0.14	0.20	0.24	0.14	0.35	0.49	0.24
O2'	0.24	0.34	0.25	0.17	0.30	0.23	0.24	0.29	0.25	0.25	0.42	0.37	0.41	0.30	0.18	0.30	0.19	0.69	0.31	0.45
O3'	0.60	0.50	0.50	0.48	0.43	0.60	0.51	0.59	0.57	0.57	0.43	0.33	0.48	0.56	0.45	0.67	0.41	0.90	0.25	0.60
O4'	0.27	0.25	0.19	0.20	0.28	0.22	0.31	0.20	0.30	0.28	0.25	0.27	0.24	0.21	0.23	0.32	0.16	0.38	0.45	0.27
O5'	0.29	0.24	0.18	0.17	0.24	0.24	0.28	0.24	0.30	0.28	0.22	0.21	0.24	0.23	0.18	0.35	0.13	0.46	0.46	0.29
OP1	0.29	0.25	0.19	0.17	0.23	0.25	0.27	0.25	0.29	0.28	0.22	0.20	0.25	0.24	0.18	0.35	0.14	0.48	0.46	0.28
OP2	0.28	0.22	0.19	0.19	0.22	0.23	0.27	0.22	0.28	0.26	0.20	0.18	0.21	0.22	0.22	0.33	0.15	0.45	0.44	0.25
P	0.29	0.25	0.18	0.17	0.24	0.24	0.28	0.23	0.29	0.28	0.23	0.21	0.24	0.22	0.19	0.34	0.13	0.44	0.45	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.23	0.23	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.03	0.16	0.19	0.42	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.06	0.11	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.30	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.12	0.00	0.15	0.02	0.14	0.07	0.08	0.13	0.08	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.29	0.14
C4	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.14	0.03	0.22	0.22	0.58	0.26
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.05	0.09	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.13	0.14	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.18	0.02	0.23	0.22	0.59	0.26
C5'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.18	0.00	0.19	0.00	0.17	0.10	0.14	0.20	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.13	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.20	0.19	0.47	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.15	0.19	0.38	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.19	0.19	0.51	0.23
N4	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.23	0.25	0.64	0.28
O2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.11	0.04	0.14	0.20	0.37	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.06	0.05	0.02	0.07	0.04	0.15	0.00	0.03	0.05	0.03	0.11	0.27	0.11
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.14	0.02	0.18	0.03	0.15	0.06	0.09	0.16	0.11	0.03	0.00	0.01	0.12	0.27	0.35	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.00	0.11	0.34	0.11	0.14
O5'	0.09	0.16	0.08	0.07	0.22	0.01	0.23	0.01	0.20	0.15	0.19	0.23	0.14	0.03	0.12	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.19	0.07	0.11	0.22	0.13	0.22	0.13	0.19	0.19	0.19	0.25	0.20	0.11	0.27	0.34	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.42	0.30	0.29	0.58	0.14	0.59	0.10	0.47	0.38	0.51	0.64	0.37	0.27	0.35	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.19	0.15	0.14	0.26	0.06	0.26	0.01	0.21	0.17	0.23	0.28	0.17	0.11	0.19	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00