Doublet Group distance statistics: 50958

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 6, 7, 4, 2, 7, 4, 3, 1, 0, 3, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.041, 0.152, 0.263, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.152 std_dev=0.111
O4'	A	0, -0.004, 0.114, 0.232, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.114 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.099, 0.235, 0.372, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.235 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.068, 0.242, 0.416, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.242 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.098, 0.275, 0.451, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.275 std_dev=0.177
O5'	A	0, 0.321, 0.549, 0.777, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.549 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.139, 0.406, 0.673, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.406 std_dev=0.267
C5'	A	0, 0.151, 0.425, 0.698, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.425 std_dev=0.273
N4	B	0, 0.351, 0.637, 0.922, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.637 std_dev=0.286
C5	B	0, 0.683, 0.968, 1.254, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.968 std_dev=0.286
C4	B	0, 0.494, 0.784, 1.073, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.784 std_dev=0.289
OP2	A	0, 0.286, 0.606, 0.925, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.606 std_dev=0.319
P	A	0, 0.286, 0.609, 0.932, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.609 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.496, 0.835, 1.174, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.835 std_dev=0.339
C6	B	0, 0.807, 1.149, 1.491, 1.974 max_d=1.974 avg_d=1.149 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.672, 1.042, 1.411, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.042 std_dev=0.369
N1	B	0, 0.804, 1.180, 1.556, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.180 std_dev=0.376
O2	B	0, 0.733, 1.157, 1.582, 1.923 max_d=1.923 avg_d=1.157 std_dev=0.424
OP1	A	0, 0.251, 0.679, 1.106, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.679 std_dev=0.428
C1'	B	0, 0.961, 1.409, 1.857, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.409 std_dev=0.448
C2'	B	0, 0.878, 1.372, 1.865, 2.458 max_d=2.458 avg_d=1.372 std_dev=0.493
O2'	B	0, 0.881, 1.377, 1.874, 2.610 max_d=2.610 avg_d=1.377 std_dev=0.497
O4'	B	0, 1.110, 1.613, 2.116, 2.777 max_d=2.777 avg_d=1.613 std_dev=0.503
C4'	B	0, 1.079, 1.618, 2.158, 2.967 max_d=2.967 avg_d=1.618 std_dev=0.540
C3'	B	0, 0.893, 1.442, 1.992, 2.620 max_d=2.620 avg_d=1.442 std_dev=0.549
O5'	B	0, 1.123, 1.684, 2.246, 3.138 max_d=3.138 avg_d=1.684 std_dev=0.562
C5'	B	0, 1.168, 1.766, 2.364, 3.438 max_d=3.438 avg_d=1.766 std_dev=0.598
O3'	B	0, 0.715, 1.330, 1.945, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.330 std_dev=0.615
P	B	0, 1.052, 1.671, 2.291, 3.222 max_d=3.222 avg_d=1.671 std_dev=0.620
OP2	B	0, 0.905, 1.566, 2.227, 3.531 max_d=3.531 avg_d=1.566 std_dev=0.661
OP1	B	0, 1.292, 2.056, 2.821, 4.281 max_d=4.281 avg_d=2.056 std_dev=0.765

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.04
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.05	0.09	0.11	0.17	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.08	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.08	0.08	0.10	0.11	0.08	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.03	0.10	0.11	0.15	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.13	0.16	0.20	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.04	0.12	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.04	0.14	0.18	0.23	0.19
C8	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.14	0.14	0.15	0.14
N1	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.14	0.04	0.12	0.15	0.21	0.17
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.07	0.08	0.13	0.10
N6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.11	0.04	0.16	0.22	0.26	0.22
N7	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.16	0.19	0.22	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.09	0.11	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.11	0.08	0.14	0.14	0.11	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.10	0.07	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.06
O5'	0.04	0.09	0.04	0.04	0.10	0.01	0.13	0.01	0.14	0.14	0.12	0.07	0.16	0.16	0.09	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.11	0.07	0.09	0.11	0.03	0.16	0.03	0.18	0.14	0.15	0.08	0.22	0.19	0.09	0.05	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.17	0.08	0.07	0.15	0.03	0.20	0.01	0.23	0.15	0.21	0.13	0.26	0.22	0.11	0.06	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.05	0.05	0.12	0.03	0.17	0.02	0.19	0.14	0.17	0.10	0.22	0.19	0.09	0.04	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.19	0.22	0.28	0.22	0.31	0.28	0.43	0.27	0.23	0.18	0.21	0.18	0.19	0.29	0.26	0.50	0.69	0.66	0.63
C2	0.20	0.15	0.16	0.21	0.14	0.29	0.17	0.43	0.20	0.18	0.15	0.19	0.15	0.16	0.22	0.26	0.47	0.70	0.66	0.64
C2'	0.29	0.26	0.27	0.30	0.28	0.33	0.32	0.44	0.31	0.28	0.25	0.29	0.25	0.25	0.30	0.31	0.49	0.65	0.59	0.59
C3'	0.31	0.27	0.28	0.31	0.29	0.36	0.33	0.46	0.33	0.30	0.26	0.29	0.27	0.26	0.31	0.34	0.51	0.69	0.61	0.62
C4	0.21	0.16	0.18	0.24	0.15	0.30	0.23	0.44	0.24	0.20	0.14	0.13	0.15	0.17	0.25	0.26	0.49	0.71	0.67	0.64
C4'	0.25	0.21	0.24	0.30	0.24	0.32	0.29	0.44	0.28	0.24	0.20	0.24	0.21	0.20	0.31	0.28	0.51	0.70	0.67	0.64
C5	0.20	0.15	0.17	0.23	0.15	0.30	0.20	0.43	0.22	0.19	0.14	0.13	0.15	0.17	0.24	0.26	0.48	0.71	0.65	0.63
C5'	0.25	0.22	0.24	0.31	0.24	0.33	0.30	0.46	0.29	0.25	0.20	0.24	0.22	0.21	0.33	0.29	0.53	0.74	0.70	0.66
C6	0.20	0.15	0.17	0.22	0.14	0.29	0.17	0.42	0.20	0.18	0.14	0.15	0.15	0.17	0.23	0.26	0.45	0.69	0.62	0.61
C8	0.22	0.18	0.20	0.26	0.19	0.31	0.25	0.44	0.25	0.21	0.17	0.17	0.17	0.18	0.27	0.27	0.50	0.71	0.67	0.64
N1	0.20	0.15	0.17	0.21	0.15	0.29	0.16	0.42	0.19	0.18	0.15	0.19	0.16	0.17	0.22	0.26	0.45	0.69	0.62	0.61
N3	0.20	0.15	0.18	0.24	0.13	0.30	0.22	0.44	0.23	0.19	0.13	0.13	0.14	0.16	0.24	0.26	0.50	0.70	0.67	0.65
N6	0.20	0.15	0.17	0.22	0.14	0.29	0.16	0.42	0.19	0.18	0.15	0.15	0.15	0.18	0.24	0.26	0.43	0.68	0.58	0.58
N7	0.21	0.17	0.19	0.24	0.17	0.30	0.22	0.44	0.23	0.20	0.15	0.15	0.16	0.17	0.26	0.26	0.48	0.71	0.66	0.63
N9	0.22	0.18	0.20	0.27	0.19	0.31	0.26	0.44	0.26	0.22	0.16	0.17	0.17	0.18	0.27	0.27	0.50	0.71	0.67	0.64
O2'	0.25	0.24	0.26	0.29	0.26	0.29	0.28	0.37	0.27	0.25	0.24	0.28	0.23	0.23	0.29	0.26	0.44	0.57	0.53	0.52
O3'	0.36	0.32	0.33	0.34	0.31	0.39	0.35	0.48	0.36	0.34	0.30	0.31	0.32	0.32	0.34	0.39	0.50	0.68	0.56	0.60
O4'	0.23	0.19	0.24	0.31	0.22	0.32	0.28	0.45	0.28	0.23	0.18	0.21	0.19	0.21	0.34	0.27	0.53	0.72	0.71	0.66
O5'	0.25	0.21	0.23	0.29	0.23	0.32	0.28	0.45	0.28	0.24	0.20	0.22	0.21	0.20	0.30	0.29	0.51	0.73	0.68	0.65
OP1	0.26	0.23	0.25	0.32	0.24	0.34	0.30	0.48	0.30	0.25	0.21	0.23	0.23	0.22	0.34	0.31	0.54	0.78	0.72	0.68
OP2	0.26	0.22	0.25	0.32	0.24	0.36	0.30	0.49	0.30	0.26	0.21	0.23	0.21	0.23	0.34	0.31	0.55	0.79	0.73	0.70
P	0.27	0.23	0.26	0.34	0.25	0.37	0.32	0.51	0.32	0.27	0.21	0.24	0.22	0.23	0.36	0.32	0.57	0.81	0.76	0.72

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.17	0.21	0.23	0.21
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.04	0.04	0.11	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.05	0.10	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.20	0.30	0.30	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.03	0.20	0.30	0.29	0.29
C5'	0.04	0.09	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.13	0.09	0.11	0.14	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03	0.18	0.25	0.23	0.23
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.15	0.19	0.19	0.18
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.19	0.26	0.27	0.25
N4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.20	0.32	0.32	0.31
O2	0.03	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.04	0.16	0.18	0.21	0.18
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.03	0.05	0.10	0.06	0.06
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.03	0.09	0.03	0.06	0.07	0.11	0.03	0.00	0.01	0.06	0.13	0.10	0.06
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.07	0.10	0.11	0.07
O5'	0.09	0.17	0.05	0.04	0.20	0.02	0.20	0.01	0.18	0.15	0.19	0.20	0.16	0.05	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.12	0.21	0.09	0.09	0.30	0.08	0.30	0.07	0.25	0.19	0.26	0.32	0.18	0.10	0.13	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.23	0.07	0.05	0.30	0.03	0.29	0.02	0.23	0.19	0.27	0.32	0.21	0.06	0.10	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.21	0.07	0.05	0.28	0.03	0.29	0.02	0.23	0.18	0.25	0.31	0.18	0.06	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00