Doublet Group distance statistics: 50960

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 1, 4, 1, 4, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.009, 0.014, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.013, 0.036, 0.058, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.036 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.023, 0.046, 0.068, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.046 std_dev=0.023
C4	B	0, 0.182, 0.394, 0.606, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.394 std_dev=0.212
N4	B	0, 0.121, 0.347, 0.572, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.347 std_dev=0.226
N3	B	0, 0.222, 0.449, 0.676, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.449 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.286, 0.523, 0.760, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.523 std_dev=0.237
O4'	A	0, -0.121, 0.119, 0.359, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.119 std_dev=0.240
N1	B	0, 0.290, 0.546, 0.802, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.546 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.169, 0.426, 0.683, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.426 std_dev=0.257
C2'	A	0, -0.074, 0.190, 0.454, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.190 std_dev=0.264
O4'	B	0, 0.359, 0.644, 0.929, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.644 std_dev=0.285
O2	B	0, 0.305, 0.591, 0.877, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.591 std_dev=0.286
C6	B	0, 0.214, 0.500, 0.787, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.500 std_dev=0.287
C1'	B	0, 0.352, 0.652, 0.952, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.652 std_dev=0.300
O5'	B	0, 0.274, 0.589, 0.904, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.589 std_dev=0.315
C4'	B	0, 0.365, 0.682, 0.999, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.682 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.368, 0.689, 1.011, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.689 std_dev=0.321
C5'	B	0, 0.305, 0.640, 0.974, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.640 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.381, 0.718, 1.055, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.718 std_dev=0.337
C3'	A	0, -0.102, 0.254, 0.610, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.254 std_dev=0.356
P	B	0, 0.215, 0.595, 0.974, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.595 std_dev=0.380
O3'	B	0, 0.437, 0.822, 1.206, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.822 std_dev=0.385
C4'	A	0, -0.177, 0.211, 0.598, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.211 std_dev=0.388
O2'	B	0, 0.470, 0.873, 1.276, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.873 std_dev=0.403
O3'	A	0, -0.070, 0.378, 0.826, 2.356 max_d=2.356 avg_d=0.378 std_dev=0.448
O2'	A	0, -0.174, 0.284, 0.743, 2.359 max_d=2.359 avg_d=0.284 std_dev=0.458
OP2	B	0, 0.055, 0.548, 1.041, 2.596 max_d=2.596 avg_d=0.548 std_dev=0.493
O5'	A	0, -0.220, 0.321, 0.862, 2.744 max_d=2.744 avg_d=0.321 std_dev=0.541
C5'	A	0, -0.228, 0.316, 0.860, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.316 std_dev=0.544
P	A	0, -0.145, 0.429, 1.004, 2.933 max_d=2.933 avg_d=0.429 std_dev=0.574
OP2	A	0, -0.111, 0.479, 1.069, 2.886 max_d=2.886 avg_d=0.479 std_dev=0.590
OP1	A	0, -0.127, 0.493, 1.114, 3.241 max_d=3.241 avg_d=0.493 std_dev=0.621
OP1	B	0, -0.106, 0.753, 1.611, 4.470 max_d=4.470 avg_d=0.753 std_dev=0.858

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.05	0.05	0.20	0.06
C2	0.01	0.00	0.18	0.16	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.08	0.21	0.17	0.07	0.12
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.08	0.08	0.09	0.13	0.17	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.39	0.25
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.15	0.00	0.18	0.01	0.19	0.15	0.18	0.13	0.21	0.18	0.12	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.15	0.09
C4	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.22	0.16	0.06	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.04	0.03	0.08	0.11	0.06	0.14	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.06	0.01	0.31	0.22	0.12	0.19
C5'	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.05	0.03	0.11	0.14	0.05	0.06	0.09	0.01	0.01	0.16	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.19	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.03	0.31	0.24	0.15	0.21
C8	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.08	0.07	0.31	0.19	0.12	0.17
N1	0.01	0.00	0.13	0.18	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.06	0.27	0.21	0.12	0.17
N3	0.01	0.00	0.17	0.13	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.08	0.17	0.14	0.06	0.08
N6	0.01	0.01	0.05	0.21	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.10	0.02	0.35	0.27	0.21	0.26
N7	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.10	0.04	0.36	0.24	0.17	0.23
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.03	0.01	0.20	0.13	0.10	0.08
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.08	0.14	0.16	0.06	0.14	0.22	0.08	0.07	0.18	0.23	0.11	0.00	0.03	0.11	0.13	0.15	0.43	0.23
O3'	0.13	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.08	0.07	0.10	0.10	0.10	0.03	0.03	0.00	0.08	0.07	0.26	0.15	0.13
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.08	0.02	0.04	0.01	0.11	0.08	0.00	0.11	0.13	0.14	0.06
O5'	0.05	0.21	0.16	0.08	0.22	0.01	0.31	0.01	0.31	0.31	0.27	0.17	0.35	0.36	0.20	0.13	0.07	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.17	0.16	0.10	0.16	0.13	0.22	0.16	0.24	0.19	0.21	0.14	0.27	0.24	0.13	0.15	0.26	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.07	0.39	0.15	0.06	0.11	0.12	0.08	0.15	0.12	0.12	0.06	0.21	0.17	0.10	0.43	0.15	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.25	0.09	0.11	0.02	0.19	0.01	0.21	0.17	0.17	0.08	0.26	0.23	0.08	0.23	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.09	0.08	0.12	0.12	0.15	0.17	0.14	0.12	0.13	0.12	0.14	0.11	0.08	0.15	0.20	0.79	0.18	0.27
C2	0.14	0.11	0.13	0.13	0.12	0.18	0.13	0.24	0.15	0.13	0.12	0.16	0.11	0.13	0.13	0.19	0.25	0.88	0.14	0.32
C2'	0.25	0.32	0.27	0.25	0.27	0.20	0.19	0.14	0.20	0.26	0.33	0.27	0.37	0.29	0.26	0.21	0.11	0.59	0.32	0.10
C3'	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.08	0.13	0.08	0.07	0.07	0.06	0.09	0.09	0.06	0.10	0.15	0.71	0.21	0.20
C4	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.16	0.14	0.22	0.15	0.13	0.12	0.12	0.12	0.11	0.10	0.17	0.24	0.86	0.16	0.31
C4'	0.21	0.18	0.20	0.20	0.21	0.23	0.24	0.28	0.24	0.21	0.18	0.22	0.15	0.20	0.18	0.23	0.31	0.86	0.13	0.35
C5	0.14	0.11	0.13	0.14	0.11	0.18	0.14	0.24	0.15	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.14	0.18	0.26	0.88	0.16	0.33
C5'	0.24	0.21	0.24	0.24	0.24	0.25	0.26	0.30	0.26	0.24	0.22	0.24	0.19	0.24	0.23	0.25	0.33	0.88	0.13	0.36
C6	0.15	0.11	0.15	0.16	0.11	0.20	0.13	0.26	0.15	0.13	0.11	0.13	0.11	0.14	0.17	0.19	0.27	0.90	0.15	0.35
C8	0.14	0.12	0.12	0.12	0.12	0.16	0.16	0.22	0.16	0.13	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12	0.17	0.24	0.86	0.18	0.31
N1	0.15	0.11	0.15	0.16	0.12	0.20	0.13	0.26	0.15	0.13	0.11	0.15	0.11	0.15	0.17	0.20	0.27	0.90	0.14	0.35
N3	0.13	0.11	0.10	0.10	0.11	0.15	0.13	0.21	0.14	0.12	0.12	0.14	0.12	0.11	0.09	0.17	0.23	0.84	0.16	0.30
N6	0.16	0.11	0.16	0.18	0.11	0.21	0.13	0.27	0.15	0.14	0.11	0.13	0.11	0.16	0.20	0.20	0.28	0.88	0.15	0.35
N7	0.14	0.12	0.13	0.14	0.12	0.18	0.15	0.24	0.16	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.14	0.18	0.26	0.88	0.17	0.33
N9	0.13	0.12	0.10	0.10	0.12	0.15	0.15	0.21	0.15	0.13	0.12	0.12	0.13	0.11	0.09	0.17	0.23	0.84	0.17	0.30
O2'	0.38	0.51	0.44	0.38	0.40	0.28	0.25	0.18	0.27	0.39	0.54	0.40	0.59	0.47	0.41	0.28	0.15	0.61	0.24	0.14
O3'	0.27	0.23	0.27	0.27	0.26	0.29	0.29	0.33	0.29	0.27	0.23	0.25	0.20	0.27	0.26	0.29	0.37	0.90	0.16	0.40
O4'	0.24	0.20	0.21	0.21	0.25	0.26	0.29	0.32	0.28	0.24	0.20	0.25	0.16	0.20	0.19	0.27	0.35	0.91	0.12	0.40
O5'	0.14	0.13	0.12	0.10	0.12	0.13	0.13	0.15	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.14	0.09	0.15	0.16	0.70	0.28	0.18
OP1	0.14	0.13	0.12	0.11	0.13	0.13	0.14	0.16	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.10	0.15	0.17	0.72	0.26	0.19
OP2	0.22	0.19	0.21	0.20	0.20	0.22	0.22	0.26	0.22	0.21	0.19	0.20	0.18	0.22	0.20	0.23	0.27	0.86	0.16	0.31
P	0.17	0.16	0.16	0.15	0.16	0.17	0.17	0.20	0.18	0.17	0.16	0.16	0.15	0.17	0.14	0.18	0.22	0.79	0.22	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.14	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.03	0.09	0.34	0.13	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.14	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.04	0.03
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.06	0.05	0.12	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.11	0.51	0.24	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.12	0.51	0.24	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.18	0.19	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.03	0.10	0.38	0.16	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.29	0.11	0.09
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.10	0.44	0.19	0.12
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.12	0.57	0.28	0.15
O2	0.04	0.00	0.14	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.15	0.05	0.09	0.29	0.10	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.06	0.03	0.14	0.00	0.03	0.02	0.03	0.08	0.04	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.08	0.07	0.15	0.03	0.00	0.01	0.07	0.24	0.10	0.10
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.12	0.07
O5'	0.04	0.09	0.03	0.04	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.08	0.10	0.12	0.09	0.03	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.34	0.08	0.11	0.51	0.10	0.51	0.18	0.38	0.29	0.44	0.57	0.29	0.08	0.24	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.13	0.04	0.06	0.24	0.12	0.24	0.19	0.16	0.11	0.19	0.28	0.10	0.04	0.10	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.03	0.05	0.14	0.01	0.14	0.00	0.11	0.09	0.12	0.15	0.10	0.03	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00