Doublet Group distance statistics: 50962

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 3, 6, 9, 18, 24, 24, 24, 22, 14, 9, 4, 2, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.039 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.017, 0.041, 0.064, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.041 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.021, 0.046, 0.072, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.046 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.119, 0.221, 0.324, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.221 std_dev=0.102
O4'	A	0, 0.070, 0.204, 0.337, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.204 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.089, 0.237, 0.385, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.237 std_dev=0.148
N6	B	0, 0.651, 0.831, 1.011, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.831 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.197, 0.395, 0.593, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.395 std_dev=0.198
C4'	A	0, 0.152, 0.359, 0.565, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.359 std_dev=0.207
C5	B	0, 0.654, 0.864, 1.074, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.864 std_dev=0.210
N7	B	0, 0.751, 0.970, 1.189, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.970 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.573, 0.804, 1.035, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.804 std_dev=0.231
O5'	A	0, 0.312, 0.571, 0.830, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.571 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.737, 1.006, 1.276, 1.592 max_d=1.592 avg_d=1.006 std_dev=0.269
C8	B	0, 0.798, 1.082, 1.365, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.082 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.564, 0.858, 1.151, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.858 std_dev=0.294
O3'	A	0, 0.329, 0.630, 0.931, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.630 std_dev=0.301
N9	B	0, 0.791, 1.092, 1.393, 1.902 max_d=1.902 avg_d=1.092 std_dev=0.301
P	A	0, 0.312, 0.621, 0.931, 2.425 max_d=2.425 avg_d=0.621 std_dev=0.309
C5'	A	0, 0.250, 0.559, 0.869, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.559 std_dev=0.310
OP2	A	0, 0.302, 0.642, 0.983, 3.238 max_d=3.238 avg_d=0.642 std_dev=0.341
C2	B	0, 0.672, 1.020, 1.369, 1.770 max_d=1.770 avg_d=1.020 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.758, 1.110, 1.462, 1.867 max_d=1.867 avg_d=1.110 std_dev=0.352
C2'	B	0, 1.071, 1.447, 1.824, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.447 std_dev=0.376
C4'	B	0, 0.995, 1.400, 1.805, 2.619 max_d=2.619 avg_d=1.400 std_dev=0.405
OP1	A	0, 0.410, 0.816, 1.223, 2.913 max_d=2.913 avg_d=0.816 std_dev=0.407
C3'	B	0, 1.004, 1.425, 1.846, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.425 std_dev=0.421
O2'	B	0, 1.274, 1.729, 2.184, 3.255 max_d=3.255 avg_d=1.729 std_dev=0.455
C1'	B	0, 0.822, 1.289, 1.756, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.289 std_dev=0.467
C5'	B	0, 1.106, 1.581, 2.057, 3.285 max_d=3.285 avg_d=1.581 std_dev=0.476
O5'	B	0, 1.766, 2.297, 2.827, 3.857 max_d=3.857 avg_d=2.297 std_dev=0.531
O3'	B	0, 1.121, 1.691, 2.262, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.691 std_dev=0.570
O4'	B	0, 0.791, 1.421, 2.051, 2.894 max_d=2.894 avg_d=1.421 std_dev=0.630
OP1	B	0, 2.016, 2.769, 3.522, 4.608 max_d=4.608 avg_d=2.769 std_dev=0.753
P	B	0, 2.193, 2.984, 3.774, 5.016 max_d=5.016 avg_d=2.984 std_dev=0.790
OP2	B	0, 3.814, 4.739, 5.663, 7.028 max_d=7.028 avg_d=4.739 std_dev=0.924

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.08	0.15	0.07
C2	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.05	0.17	0.18	0.30	0.21
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.10	0.06	0.12	0.11	0.11	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.14	0.07
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.14	0.00	0.17	0.02	0.19	0.14	0.19	0.14	0.21	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.12	0.12	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.16	0.03	0.17	0.17	0.27	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.10	0.07	0.04	0.11	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.10	0.08	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.22	0.03	0.22	0.24	0.34	0.27
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.12	0.07	0.18	0.18	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.25	0.04	0.24	0.27	0.38	0.30
C8	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.18	0.03	0.21	0.21	0.27	0.24
N1	0.02	0.00	0.12	0.19	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.24	0.04	0.21	0.23	0.35	0.26
N3	0.03	0.00	0.11	0.14	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.04	0.14	0.14	0.25	0.17
N6	0.02	0.01	0.11	0.21	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.29	0.04	0.27	0.32	0.43	0.35
N7	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.23	0.03	0.25	0.28	0.36	0.31
N9	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.02	0.14	0.14	0.22	0.16
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.11	0.07	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.06	0.13	0.11	0.06
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.16	0.02	0.22	0.03	0.25	0.18	0.24	0.16	0.29	0.23	0.11	0.06	0.00	0.02	0.15	0.17	0.19	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.10	0.15	0.08
O5'	0.07	0.17	0.09	0.12	0.17	0.02	0.22	0.01	0.24	0.21	0.21	0.14	0.27	0.25	0.14	0.06	0.15	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.18	0.10	0.12	0.17	0.10	0.24	0.07	0.27	0.21	0.23	0.14	0.32	0.28	0.14	0.13	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.30	0.14	0.13	0.27	0.08	0.34	0.07	0.38	0.27	0.35	0.25	0.43	0.36	0.22	0.11	0.19	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.21	0.07	0.10	0.20	0.04	0.27	0.02	0.30	0.24	0.26	0.17	0.35	0.31	0.16	0.06	0.14	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.22	0.15	0.19	0.18	0.21	0.19	0.33	0.18	0.23	0.23	0.19	0.19	0.24	0.19	0.16	0.21	0.22	0.60	0.86	1.01	0.74
C2	0.44	0.22	0.45	0.44	0.34	0.45	0.31	0.46	0.19	0.46	0.18	0.30	0.15	0.41	0.42	0.45	0.44	0.48	0.59	0.90	0.96	0.76
C2'	0.19	0.20	0.16	0.22	0.17	0.22	0.17	0.32	0.16	0.21	0.20	0.18	0.14	0.21	0.19	0.14	0.23	0.23	0.58	0.77	0.94	0.68
C3'	0.20	0.21	0.17	0.23	0.18	0.24	0.18	0.34	0.16	0.22	0.20	0.19	0.14	0.22	0.20	0.15	0.24	0.24	0.59	0.79	0.95	0.69
C4	0.32	0.15	0.29	0.30	0.24	0.34	0.24	0.41	0.16	0.37	0.15	0.19	0.15	0.34	0.31	0.30	0.29	0.38	0.58	0.89	0.97	0.75
C4'	0.18	0.27	0.16	0.21	0.18	0.20	0.18	0.33	0.18	0.21	0.25	0.22	0.18	0.22	0.18	0.17	0.24	0.20	0.60	0.83	1.00	0.72
C5	0.40	0.16	0.38	0.40	0.28	0.44	0.27	0.48	0.16	0.43	0.15	0.22	0.14	0.38	0.37	0.38	0.39	0.47	0.60	0.94	0.95	0.78
C5'	0.17	0.27	0.16	0.21	0.18	0.21	0.18	0.34	0.18	0.22	0.25	0.22	0.18	0.22	0.18	0.16	0.24	0.21	0.61	0.87	1.02	0.75
C6	0.49	0.20	0.50	0.52	0.34	0.54	0.30	0.56	0.18	0.50	0.16	0.29	0.14	0.41	0.45	0.49	0.52	0.56	0.63	0.98	0.94	0.81
C8	0.29	0.17	0.23	0.26	0.21	0.32	0.22	0.40	0.16	0.35	0.18	0.17	0.16	0.32	0.28	0.23	0.26	0.36	0.58	0.91	0.96	0.76
N1	0.52	0.24	0.54	0.56	0.38	0.56	0.32	0.56	0.20	0.52	0.18	0.33	0.15	0.43	0.48	0.54	0.56	0.58	0.63	0.96	0.94	0.80
N3	0.33	0.17	0.31	0.30	0.26	0.33	0.26	0.39	0.17	0.36	0.15	0.22	0.14	0.34	0.32	0.32	0.29	0.36	0.58	0.87	0.98	0.74
N6	0.55	0.21	0.56	0.61	0.37	0.62	0.31	0.65	0.18	0.53	0.16	0.31	0.14	0.43	0.49	0.56	0.62	0.63	0.68	1.03	0.93	0.86
N7	0.36	0.16	0.33	0.36	0.25	0.41	0.25	0.47	0.16	0.41	0.16	0.19	0.15	0.36	0.34	0.33	0.35	0.45	0.59	0.95	0.95	0.79
N9	0.25	0.17	0.20	0.23	0.20	0.28	0.21	0.37	0.16	0.31	0.18	0.16	0.16	0.30	0.25	0.21	0.22	0.31	0.58	0.88	0.98	0.75
O2'	0.18	0.23	0.18	0.22	0.18	0.19	0.16	0.29	0.16	0.18	0.21	0.21	0.15	0.18	0.18	0.17	0.25	0.20	0.57	0.71	0.90	0.64
O3'	0.23	0.23	0.21	0.26	0.21	0.26	0.19	0.35	0.17	0.24	0.20	0.22	0.14	0.23	0.23	0.19	0.27	0.27	0.58	0.75	0.91	0.67
O4'	0.19	0.28	0.17	0.21	0.19	0.21	0.20	0.35	0.21	0.24	0.27	0.23	0.22	0.25	0.20	0.19	0.24	0.22	0.62	0.89	1.04	0.76
O5'	0.19	0.24	0.15	0.20	0.17	0.23	0.17	0.36	0.17	0.24	0.23	0.19	0.17	0.23	0.19	0.15	0.22	0.24	0.61	0.90	1.02	0.77
OP1	0.19	0.26	0.16	0.21	0.18	0.24	0.18	0.36	0.18	0.24	0.25	0.22	0.17	0.24	0.19	0.16	0.23	0.25	0.61	0.91	1.03	0.78
OP2	0.29	0.23	0.26	0.31	0.24	0.36	0.24	0.48	0.21	0.34	0.24	0.21	0.21	0.32	0.29	0.24	0.31	0.37	0.66	1.00	1.06	0.85
P	0.19	0.23	0.16	0.21	0.17	0.25	0.18	0.39	0.17	0.25	0.23	0.19	0.17	0.25	0.20	0.15	0.23	0.26	0.63	0.95	1.06	0.81

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.17	0.22	0.27	0.19
C2	0.04	0.00	0.20	0.24	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.28	0.08	0.40	0.42	0.65	0.41
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.02	0.05	0.03	0.08	0.11	0.15	0.20	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.25	0.22	0.17
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.15	0.00	0.13	0.03	0.17	0.10	0.22	0.22	0.16	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.25	0.34	0.19	0.21
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.04	0.41	0.41	0.60	0.41
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.08	0.06	0.12	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.17	0.20	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.51	0.57	0.78	0.55
C5'	0.04	0.15	0.03	0.03	0.17	0.01	0.24	0.00	0.25	0.27	0.20	0.11	0.29	0.30	0.16	0.05	0.03	0.02	0.01	0.18	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.19	0.03	0.54	0.62	0.85	0.59
C8	0.02	0.02	0.11	0.10	0.01	0.11	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.12	0.08	0.50	0.52	0.65	0.52
N1	0.03	0.00	0.15	0.22	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.25	0.06	0.48	0.54	0.78	0.52
N3	0.03	0.01	0.20	0.22	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.25	0.08	0.35	0.35	0.54	0.34
N6	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.12	0.01	0.29	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.18	0.04	0.59	0.74	0.97	0.68
N7	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.12	0.01	0.30	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.11	0.06	0.56	0.66	0.83	0.63
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.36	0.35	0.49	0.36
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.10	0.13	0.06	0.08	0.03	0.00	0.05	0.05	0.07	0.25	0.19	0.09
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.16	0.02	0.13	0.03	0.19	0.12	0.25	0.25	0.18	0.11	0.06	0.05	0.00	0.02	0.21	0.47	0.26	0.24
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06	0.08	0.04	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.10	0.29	0.26	0.22
O5'	0.17	0.40	0.19	0.25	0.41	0.02	0.51	0.01	0.54	0.50	0.48	0.35	0.59	0.56	0.36	0.07	0.21	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.42	0.25	0.34	0.41	0.17	0.57	0.18	0.62	0.52	0.54	0.35	0.74	0.66	0.35	0.25	0.47	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.65	0.22	0.19	0.60	0.20	0.78	0.25	0.85	0.65	0.78	0.54	0.97	0.83	0.49	0.19	0.26	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.41	0.17	0.21	0.41	0.07	0.55	0.02	0.59	0.52	0.52	0.34	0.68	0.63	0.36	0.09	0.24	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00