Doublet Group distance statistics: 50963

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 17, 9, 13, 13, 2, 6, 6, 3, 6, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.011, 0.028, 0.046, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.029 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.011, 0.031, 0.050, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.021, 0.042, 0.063, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.042 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.014, 0.039, 0.064, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.039 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.016, 0.043, 0.069, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.043 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.009, 0.125, 0.241, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.125 std_dev=0.116
C2'	A	0, 0.035, 0.166, 0.297, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.166 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.047, 0.229, 0.412, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.229 std_dev=0.182
C6	B	0, 0.178, 0.368, 0.558, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.368 std_dev=0.190
O2'	A	0, 0.075, 0.268, 0.462, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.268 std_dev=0.194
N6	B	0, 0.121, 0.319, 0.517, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.319 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.044, 0.244, 0.445, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.244 std_dev=0.201
C5	B	0, 0.168, 0.395, 0.623, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.395 std_dev=0.227
N1	B	0, 0.182, 0.435, 0.688, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.435 std_dev=0.253
C4	B	0, 0.193, 0.475, 0.757, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.475 std_dev=0.282
N7	B	0, 0.116, 0.406, 0.697, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.406 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.207, 0.502, 0.798, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.502 std_dev=0.296
N3	B	0, 0.220, 0.527, 0.835, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.527 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.049, 0.359, 0.669, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.359 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.057, 0.383, 0.709, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.383 std_dev=0.326
N9	B	0, 0.172, 0.528, 0.883, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.528 std_dev=0.356
C8	B	0, 0.125, 0.492, 0.858, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.492 std_dev=0.367
O5'	A	0, 0.075, 0.455, 0.835, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.455 std_dev=0.380
P	A	0, 0.141, 0.567, 0.993, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.567 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.190, 0.627, 1.064, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.627 std_dev=0.437
OP2	A	0, 0.117, 0.600, 1.084, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.600 std_dev=0.483
C2'	B	0, 0.222, 0.707, 1.192, 2.261 max_d=2.261 avg_d=0.707 std_dev=0.485
O4'	B	0, 0.216, 0.702, 1.187, 2.359 max_d=2.359 avg_d=0.702 std_dev=0.486
OP1	A	0, 0.169, 0.662, 1.154, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.662 std_dev=0.492
C3'	B	0, 0.278, 0.801, 1.325, 2.417 max_d=2.417 avg_d=0.801 std_dev=0.523
C4'	B	0, 0.259, 0.807, 1.355, 2.529 max_d=2.529 avg_d=0.807 std_dev=0.548
O2'	B	0, 0.258, 0.830, 1.401, 2.471 max_d=2.471 avg_d=0.830 std_dev=0.571
O3'	B	0, 0.359, 0.957, 1.555, 2.784 max_d=2.784 avg_d=0.957 std_dev=0.598
C5'	B	0, 0.266, 0.943, 1.619, 2.800 max_d=2.800 avg_d=0.943 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.324, 1.427, 2.530, 3.873 max_d=3.873 avg_d=1.427 std_dev=1.103
P	B	0, 0.346, 1.686, 3.026, 4.219 max_d=4.219 avg_d=1.686 std_dev=1.340
OP2	B	0, 0.226, 1.582, 2.937, 4.312 max_d=4.312 avg_d=1.582 std_dev=1.356
OP1	B	0, 0.413, 1.953, 3.492, 5.619 max_d=5.619 avg_d=1.953 std_dev=1.539

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.13	0.16	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.05	0.24	0.19	0.24	0.18
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.09	0.12	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.15	0.18	0.16	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.08	0.12	0.08	0.09	0.09	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.17	0.23	0.12	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.25	0.19	0.22	0.18
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.04	0.08	0.09	0.04	0.07	0.04	0.01	0.01	0.10	0.17	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.31	0.25	0.28	0.25
C5'	0.05	0.12	0.05	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.18	0.20	0.15	0.10	0.21	0.22	0.13	0.05	0.06	0.02	0.01	0.14	0.20	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.32	0.27	0.32	0.27
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.13	0.05	0.32	0.24	0.22	0.23
N1	0.03	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.11	0.04	0.28	0.24	0.29	0.23
N3	0.04	0.01	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.05	0.21	0.17	0.21	0.15
N6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.10	0.04	0.35	0.32	0.37	0.33
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.35	0.29	0.30	0.29
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.24	0.17	0.18	0.15
O2'	0.02	0.16	0.01	0.03	0.09	0.07	0.08	0.05	0.11	0.06	0.14	0.15	0.10	0.06	0.04	0.00	0.06	0.04	0.08	0.13	0.15	0.07
O3'	0.03	0.14	0.03	0.01	0.07	0.04	0.08	0.06	0.09	0.13	0.11	0.13	0.10	0.13	0.05	0.06	0.00	0.03	0.16	0.28	0.16	0.16
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.04	0.03	0.00	0.13	0.14	0.23	0.15
O5'	0.14	0.24	0.15	0.17	0.25	0.01	0.31	0.01	0.32	0.32	0.28	0.21	0.35	0.35	0.24	0.08	0.16	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.13	0.19	0.18	0.23	0.19	0.10	0.25	0.14	0.27	0.24	0.24	0.17	0.32	0.29	0.17	0.13	0.28	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.24	0.16	0.12	0.22	0.17	0.28	0.20	0.32	0.22	0.29	0.21	0.37	0.30	0.18	0.15	0.16	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.11	0.13	0.18	0.05	0.25	0.03	0.27	0.23	0.23	0.15	0.33	0.29	0.15	0.07	0.16	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.18	0.19	0.16	0.20	0.17	0.31	0.16	0.19	0.17	0.16	0.16	0.19	0.17	0.21	0.22	0.18	1.07	1.25	1.23	1.20
C2	0.16	0.14	0.20	0.28	0.14	0.26	0.13	0.40	0.13	0.16	0.14	0.14	0.16	0.14	0.15	0.18	0.33	0.18	1.12	1.28	1.24	1.25
C2'	0.20	0.25	0.21	0.24	0.21	0.24	0.20	0.35	0.21	0.20	0.25	0.23	0.20	0.20	0.20	0.22	0.25	0.22	1.05	1.21	1.16	1.16
C3'	0.21	0.25	0.21	0.24	0.21	0.26	0.20	0.37	0.20	0.21	0.24	0.23	0.18	0.20	0.21	0.21	0.25	0.23	1.06	1.24	1.17	1.18
C4	0.16	0.13	0.18	0.24	0.13	0.24	0.13	0.38	0.13	0.17	0.14	0.13	0.14	0.16	0.15	0.17	0.28	0.18	1.12	1.30	1.27	1.26
C4'	0.18	0.21	0.19	0.20	0.18	0.21	0.18	0.32	0.18	0.19	0.20	0.19	0.17	0.19	0.18	0.21	0.22	0.19	1.08	1.26	1.24	1.21
C5	0.18	0.13	0.20	0.28	0.14	0.28	0.13	0.43	0.13	0.18	0.14	0.13	0.14	0.16	0.17	0.18	0.33	0.21	1.14	1.35	1.29	1.31
C5'	0.16	0.19	0.18	0.21	0.16	0.21	0.16	0.35	0.16	0.18	0.19	0.18	0.15	0.18	0.17	0.20	0.23	0.18	1.09	1.29	1.26	1.23
C6	0.20	0.14	0.23	0.32	0.15	0.33	0.14	0.47	0.13	0.19	0.14	0.15	0.15	0.16	0.19	0.21	0.38	0.23	1.15	1.37	1.28	1.32
C8	0.17	0.15	0.19	0.24	0.15	0.25	0.15	0.39	0.14	0.19	0.16	0.15	0.15	0.17	0.17	0.18	0.27	0.20	1.13	1.34	1.29	1.29
N1	0.19	0.15	0.24	0.33	0.16	0.32	0.14	0.46	0.14	0.19	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.22	0.39	0.22	1.15	1.35	1.28	1.31
N3	0.15	0.13	0.18	0.23	0.13	0.22	0.12	0.35	0.12	0.16	0.13	0.12	0.14	0.15	0.14	0.17	0.27	0.16	1.09	1.25	1.22	1.22
N6	0.23	0.15	0.26	0.36	0.17	0.37	0.15	0.52	0.14	0.22	0.15	0.17	0.15	0.17	0.21	0.25	0.43	0.27	1.15	1.40	1.26	1.33
N7	0.18	0.14	0.20	0.27	0.15	0.28	0.14	0.43	0.13	0.19	0.15	0.14	0.14	0.17	0.17	0.18	0.31	0.21	1.14	1.37	1.29	1.31
N9	0.16	0.15	0.18	0.22	0.15	0.22	0.15	0.36	0.14	0.18	0.16	0.14	0.15	0.17	0.16	0.18	0.25	0.18	1.10	1.30	1.26	1.25
O2'	0.20	0.25	0.19	0.22	0.21	0.23	0.20	0.32	0.21	0.20	0.25	0.23	0.19	0.20	0.20	0.21	0.23	0.22	1.01	1.17	1.12	1.11
O3'	0.29	0.35	0.27	0.30	0.29	0.33	0.26	0.42	0.27	0.27	0.33	0.33	0.22	0.25	0.28	0.26	0.30	0.32	1.07	1.24	1.15	1.17
O4'	0.19	0.19	0.20	0.21	0.18	0.21	0.19	0.32	0.18	0.20	0.19	0.18	0.18	0.20	0.19	0.24	0.23	0.19	1.08	1.28	1.27	1.23
O5'	0.20	0.20	0.20	0.19	0.19	0.20	0.19	0.29	0.19	0.22	0.20	0.19	0.19	0.22	0.20	0.24	0.21	0.21	0.98	1.18	1.18	1.13
OP1	0.20	0.25	0.22	0.22	0.21	0.21	0.20	0.32	0.22	0.21	0.25	0.23	0.21	0.21	0.20	0.25	0.25	0.20	1.00	1.22	1.20	1.15
OP2	0.19	0.20	0.21	0.23	0.17	0.23	0.18	0.37	0.18	0.22	0.20	0.18	0.19	0.21	0.19	0.23	0.26	0.19	0.98	1.22	1.17	1.15
P	0.16	0.19	0.19	0.21	0.15	0.20	0.16	0.33	0.16	0.19	0.19	0.16	0.16	0.18	0.16	0.21	0.24	0.17	1.02	1.25	1.22	1.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.25	0.34	0.24	0.22
C2	0.03	0.00	0.19	0.20	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.25	0.05	0.58	0.68	0.61	0.60
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.10	0.10	0.14	0.19	0.08	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.31	0.41	0.20	0.28
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.14	0.16	0.17	0.19	0.15	0.14	0.06	0.02	0.01	0.02	0.39	0.46	0.17	0.33
C4	0.02	0.01	0.10	0.12	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.03	0.62	0.67	0.54	0.60
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.08	0.07	0.12	0.13	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.19	0.33	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.10	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.03	0.80	0.85	0.76	0.80
C5'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.16	0.01	0.22	0.00	0.23	0.25	0.19	0.12	0.27	0.27	0.15	0.06	0.05	0.02	0.01	0.22	0.42	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03	0.82	0.91	0.85	0.86
C8	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.13	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.17	0.04	0.80	0.77	0.58	0.74
N1	0.02	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.04	0.72	0.82	0.77	0.75
N3	0.03	0.00	0.19	0.19	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.23	0.05	0.49	0.58	0.48	0.50
N6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.17	0.04	0.92	1.03	1.00	0.98
N7	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.04	0.90	0.93	0.82	0.90
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.57	0.59	0.41	0.51
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.11	0.06	0.08	0.06	0.12	0.07	0.17	0.20	0.11	0.06	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.26	0.21	0.10
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.13	0.02	0.12	0.05	0.16	0.17	0.21	0.23	0.17	0.16	0.06	0.05	0.00	0.02	0.27	0.41	0.19	0.26
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.13	0.26	0.37	0.14
O5'	0.25	0.58	0.31	0.39	0.62	0.02	0.80	0.01	0.82	0.80	0.72	0.49	0.92	0.90	0.57	0.09	0.27	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.68	0.41	0.46	0.67	0.19	0.85	0.22	0.91	0.77	0.82	0.58	1.03	0.93	0.59	0.26	0.41	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.61	0.20	0.17	0.54	0.33	0.76	0.42	0.85	0.58	0.77	0.48	1.00	0.82	0.41	0.21	0.19	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.60	0.28	0.33	0.60	0.04	0.80	0.02	0.86	0.74	0.75	0.50	0.98	0.90	0.51	0.10	0.26	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00