Doublet Group distance statistics: 50964

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 11, 15, 15, 3, 2, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.018, 0.025, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.015, 0.023, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.028, 0.036, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.036 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.032, 0.043, 0.054, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.043 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.027, 0.038, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.038 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.035, 0.047, 0.058, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.047 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.042, 0.058, 0.074, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.058 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.050, 0.067, 0.084, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.067 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.055, 0.078, 0.101, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.078 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.055, 0.079, 0.103, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.079 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.075, 0.106, 0.137, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.106 std_dev=0.031
C6	B	0, 0.395, 0.571, 0.748, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.571 std_dev=0.176
C2'	A	0, 0.183, 0.360, 0.537, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.360 std_dev=0.177
N3	B	0, 0.634, 0.823, 1.012, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.823 std_dev=0.189
O4'	A	0, 0.299, 0.492, 0.685, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.492 std_dev=0.193
N6	B	0, 0.274, 0.480, 0.687, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.480 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.569, 0.776, 0.982, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.776 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.427, 0.642, 0.857, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.642 std_dev=0.215
C2	B	0, 0.573, 0.797, 1.021, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.797 std_dev=0.224
C4	B	0, 0.641, 0.875, 1.110, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.875 std_dev=0.234
N7	B	0, 0.862, 1.104, 1.345, 1.668 max_d=1.668 avg_d=1.104 std_dev=0.241
N1	B	0, 0.454, 0.706, 0.958, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.706 std_dev=0.252
N9	B	0, 0.959, 1.242, 1.526, 1.945 max_d=1.945 avg_d=1.242 std_dev=0.284
C3'	A	0, 0.310, 0.598, 0.885, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.598 std_dev=0.288
C8	B	0, 1.094, 1.393, 1.692, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.393 std_dev=0.299
C4'	A	0, 0.316, 0.618, 0.920, 2.622 max_d=2.622 avg_d=0.618 std_dev=0.302
O5'	A	0, 0.619, 0.931, 1.243, 2.715 max_d=2.715 avg_d=0.931 std_dev=0.312
OP2	A	0, 0.381, 0.725, 1.070, 2.671 max_d=2.671 avg_d=0.725 std_dev=0.344
C1'	B	0, 1.144, 1.489, 1.834, 2.313 max_d=2.313 avg_d=1.489 std_dev=0.345
O3'	A	0, 0.405, 0.772, 1.138, 3.224 max_d=3.224 avg_d=0.772 std_dev=0.367
P	A	0, 0.441, 0.818, 1.196, 3.104 max_d=3.104 avg_d=0.818 std_dev=0.377
C2'	B	0, 0.921, 1.299, 1.678, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.299 std_dev=0.378
O2'	B	0, 0.977, 1.372, 1.766, 2.484 max_d=2.484 avg_d=1.372 std_dev=0.395
C5'	A	0, 0.432, 0.844, 1.255, 3.543 max_d=3.543 avg_d=0.844 std_dev=0.412
O4'	B	0, 1.532, 1.950, 2.368, 2.997 max_d=2.997 avg_d=1.950 std_dev=0.418
C3'	B	0, 1.220, 1.664, 2.108, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.664 std_dev=0.444
OP2	B	0, 0.992, 1.458, 1.924, 4.120 max_d=4.120 avg_d=1.458 std_dev=0.466
C4'	B	0, 1.576, 2.047, 2.519, 3.542 max_d=3.542 avg_d=2.047 std_dev=0.471
OP1	A	0, 0.468, 0.947, 1.425, 4.023 max_d=4.023 avg_d=0.947 std_dev=0.479
P	B	0, 1.385, 1.899, 2.413, 4.532 max_d=4.532 avg_d=1.899 std_dev=0.514
O3'	B	0, 1.431, 1.948, 2.466, 3.708 max_d=3.708 avg_d=1.948 std_dev=0.517
O5'	B	0, 1.686, 2.210, 2.734, 4.276 max_d=4.276 avg_d=2.210 std_dev=0.524
C5'	B	0, 1.872, 2.408, 2.944, 4.457 max_d=4.457 avg_d=2.408 std_dev=0.536
OP1	B	0, 1.620, 2.215, 2.810, 5.130 max_d=5.130 avg_d=2.215 std_dev=0.595

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.07	0.08	0.10	0.08
C2	0.02	0.00	0.15	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.06	0.14	0.15	0.21	0.17
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.06	0.07	0.06	0.11	0.15	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.18	0.16
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.02	0.16	0.10	0.16	0.12	0.16	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.05
C4	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.03	0.14	0.16	0.20	0.17
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.08	0.05	0.03	0.08	0.09	0.04	0.08	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.02	0.19	0.22	0.26	0.23
C5'	0.03	0.06	0.06	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.08	0.05	0.14	0.14	0.07	0.03	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.03	0.20	0.23	0.29	0.24
C8	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.05	0.05	0.19	0.21	0.22	0.21
N1	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.04	0.17	0.20	0.26	0.21
N3	0.01	0.00	0.15	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.06	0.12	0.13	0.18	0.14
N6	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.09	0.03	0.23	0.28	0.33	0.28
N7	0.01	0.00	0.03	0.13	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.07	0.04	0.22	0.25	0.28	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.13	0.14	0.16	0.14
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.08	0.11	0.03	0.11	0.14	0.08	0.08	0.14	0.15	0.07	0.00	0.03	0.06	0.12	0.15	0.21	0.14
O3'	0.09	0.07	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.09	0.07	0.03	0.03	0.00	0.06	0.03	0.11	0.07	0.05
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.06	0.06	0.00	0.06	0.08	0.09	0.07
O5'	0.07	0.14	0.14	0.04	0.14	0.01	0.19	0.01	0.20	0.19	0.17	0.12	0.23	0.22	0.13	0.12	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.15	0.16	0.09	0.16	0.05	0.22	0.06	0.23	0.21	0.20	0.13	0.28	0.25	0.14	0.15	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.21	0.18	0.04	0.20	0.03	0.26	0.01	0.29	0.22	0.26	0.18	0.33	0.28	0.16	0.21	0.07	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.16	0.05	0.17	0.02	0.23	0.01	0.24	0.21	0.21	0.14	0.28	0.26	0.14	0.14	0.05	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.16	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.13	0.17	0.13	0.13	0.14	0.17	0.15	0.18	0.13	0.15	0.10	0.12	0.12	0.11
C2	0.18	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.12	0.14	0.19	0.14	0.15	0.14	0.17	0.18	0.17	0.14	0.19	0.10	0.12	0.13	0.10
C2'	0.27	0.25	0.29	0.25	0.27	0.24	0.28	0.22	0.28	0.29	0.26	0.25	0.29	0.29	0.27	0.31	0.25	0.26	0.20	0.18	0.17	0.18
C3'	0.15	0.12	0.16	0.14	0.14	0.14	0.16	0.14	0.14	0.19	0.13	0.12	0.17	0.20	0.16	0.18	0.13	0.16	0.13	0.15	0.15	0.14
C4	0.17	0.14	0.16	0.14	0.15	0.14	0.15	0.12	0.14	0.18	0.14	0.14	0.14	0.17	0.17	0.17	0.13	0.18	0.10	0.13	0.12	0.11
C4'	0.14	0.17	0.14	0.12	0.14	0.12	0.14	0.10	0.15	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.12	0.13	0.09	0.12	0.13	0.10
C5	0.19	0.15	0.18	0.16	0.16	0.17	0.16	0.15	0.15	0.19	0.15	0.16	0.15	0.18	0.18	0.18	0.16	0.20	0.13	0.16	0.15	0.14
C5'	0.14	0.19	0.15	0.14	0.15	0.12	0.15	0.11	0.16	0.15	0.19	0.17	0.16	0.15	0.14	0.16	0.14	0.14	0.11	0.13	0.13	0.11
C6	0.20	0.15	0.19	0.18	0.17	0.18	0.17	0.17	0.15	0.20	0.15	0.16	0.15	0.19	0.19	0.19	0.18	0.21	0.15	0.18	0.17	0.16
C8	0.17	0.14	0.17	0.15	0.16	0.15	0.16	0.13	0.15	0.19	0.15	0.15	0.15	0.18	0.17	0.18	0.15	0.18	0.12	0.16	0.14	0.13
N1	0.20	0.15	0.18	0.17	0.17	0.18	0.16	0.15	0.15	0.20	0.15	0.16	0.15	0.18	0.19	0.19	0.18	0.21	0.14	0.16	0.16	0.14
N3	0.16	0.14	0.15	0.12	0.15	0.13	0.15	0.11	0.14	0.17	0.14	0.14	0.14	0.17	0.16	0.17	0.12	0.17	0.09	0.11	0.11	0.09
N6	0.22	0.16	0.21	0.21	0.18	0.21	0.17	0.20	0.15	0.21	0.15	0.17	0.15	0.19	0.20	0.21	0.22	0.23	0.18	0.23	0.21	0.20
N7	0.19	0.15	0.18	0.17	0.16	0.17	0.16	0.15	0.15	0.20	0.15	0.15	0.15	0.18	0.18	0.19	0.17	0.20	0.13	0.18	0.16	0.15
N9	0.16	0.14	0.16	0.14	0.15	0.14	0.15	0.12	0.14	0.18	0.14	0.14	0.14	0.17	0.16	0.18	0.13	0.17	0.10	0.13	0.13	0.11
O2'	0.31	0.39	0.35	0.29	0.34	0.26	0.34	0.20	0.39	0.30	0.41	0.36	0.42	0.31	0.32	0.38	0.30	0.27	0.18	0.14	0.13	0.13
O3'	0.14	0.15	0.13	0.12	0.13	0.12	0.13	0.10	0.12	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.13	0.16	0.12	0.13	0.10	0.11	0.14	0.10
O4'	0.15	0.19	0.15	0.13	0.16	0.13	0.16	0.12	0.17	0.16	0.19	0.17	0.17	0.16	0.16	0.16	0.13	0.15	0.11	0.13	0.13	0.11
O5'	0.13	0.15	0.13	0.11	0.12	0.13	0.13	0.14	0.13	0.16	0.15	0.13	0.13	0.15	0.13	0.14	0.10	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15
OP1	0.13	0.17	0.13	0.11	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.15	0.16	0.14	0.13	0.15	0.13	0.14	0.10	0.15	0.15	0.17	0.16	0.16
OP2	0.16	0.14	0.14	0.12	0.13	0.17	0.14	0.19	0.13	0.19	0.14	0.12	0.13	0.18	0.16	0.15	0.10	0.19	0.19	0.22	0.20	0.21
P	0.13	0.15	0.12	0.10	0.12	0.13	0.12	0.15	0.13	0.16	0.15	0.13	0.13	0.15	0.13	0.13	0.08	0.15	0.15	0.18	0.17	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.11	0.06
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.08	0.09	0.11	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.08	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.06	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.09	0.08	0.11	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.12	0.11	0.13	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.06	0.03	0.10	0.11	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.12	0.12	0.14	0.11
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.14	0.10	0.12	0.09
N1	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.10	0.10	0.13	0.09
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.07	0.07	0.11	0.07
N6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.15	0.14	0.15	0.13
N7	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.15	0.12	0.14	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.06	0.11	0.06
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.08	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.12	0.05	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.12	0.08
O5'	0.03	0.08	0.03	0.03	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.07	0.15	0.15	0.08	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.09	0.06	0.08	0.08	0.05	0.11	0.05	0.12	0.10	0.10	0.07	0.14	0.12	0.06	0.07	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.11	0.08	0.06	0.11	0.06	0.13	0.02	0.14	0.12	0.13	0.11	0.15	0.14	0.11	0.07	0.05	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.08	0.04	0.03	0.07	0.03	0.10	0.01	0.11	0.09	0.09	0.07	0.13	0.12	0.06	0.03	0.05	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00